Protein–RNA interactions for Protein: Q6IRT3

Parpbp, PCNA-interacting partner, mousemouse

Predictions only

Length 573 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ParpbpQ6IRT3 Lrriq4-203ENSMUST00000172350 1797 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
ParpbpQ6IRT3 Hmbox1-203ENSMUST00000175744 1771 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
ParpbpQ6IRT3 Pprc1-203ENSMUST00000111899 5246 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
ParpbpQ6IRT3 Adsl-204ENSMUST00000164806 1595 ntTSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
ParpbpQ6IRT3 2010016I18Rik-204ENSMUST00000190356 1562 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
ParpbpQ6IRT3 Stum-201ENSMUST00000136521 6506 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
ParpbpQ6IRT3 Bean1-204ENSMUST00000171018 3386 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
ParpbpQ6IRT3 A930001A20Rik-201ENSMUST00000182586 1366 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
ParpbpQ6IRT3 P2ry1-203ENSMUST00000193943 2203 ntAPPRIS P1 BASIC15.93■□□□□ 0.14
ParpbpQ6IRT3 Echdc2-204ENSMUST00000116309 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
ParpbpQ6IRT3 Ube2a-208ENSMUST00000202812 719 ntTSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
ParpbpQ6IRT3 Arfip2-212ENSMUST00000209550 1141 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
ParpbpQ6IRT3 Arfip2-214ENSMUST00000210911 938 ntTSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
ParpbpQ6IRT3 Id1-201ENSMUST00000038368 934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
ParpbpQ6IRT3 Coro7-202ENSMUST00000090480 1147 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
ParpbpQ6IRT3 Cops9-201ENSMUST00000097642 438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
ParpbpQ6IRT3 Trp73-203ENSMUST00000105643 1916 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
ParpbpQ6IRT3 Eml1-203ENSMUST00000109860 4160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
ParpbpQ6IRT3 Nrxn1-206ENSMUST00000160800 5683 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
ParpbpQ6IRT3 Col17a1-201ENSMUST00000026045 5588 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
ParpbpQ6IRT3 Cdv3-207ENSMUST00000190226 3107 ntTSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
ParpbpQ6IRT3 Klhl5-204ENSMUST00000204097 3149 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
ParpbpQ6IRT3 Pigu-201ENSMUST00000077626 1636 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
ParpbpQ6IRT3 Zbtb24-201ENSMUST00000080771 2844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
ParpbpQ6IRT3 Gbe1-206ENSMUST00000170464 2736 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
ParpbpQ6IRT3 Arhgef25-212ENSMUST00000222006 1896 ntTSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
ParpbpQ6IRT3 Dlk2-202ENSMUST00000166280 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
ParpbpQ6IRT3 Scube2-202ENSMUST00000106728 2890 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
ParpbpQ6IRT3 AC121598.2-201ENSMUST00000228376 2325 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
ParpbpQ6IRT3 Sgsm2-202ENSMUST00000081799 4873 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
ParpbpQ6IRT3 Snrnp48-201ENSMUST00000091641 1785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
ParpbpQ6IRT3 Fam171a2-201ENSMUST00000049057 3118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
ParpbpQ6IRT3 Rara-204ENSMUST00000107475 2469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
ParpbpQ6IRT3 Plekha4-206ENSMUST00000211155 2044 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
ParpbpQ6IRT3 Sfrp2-201ENSMUST00000029625 2003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
ParpbpQ6IRT3 Tm2d3-202ENSMUST00000065574 1478 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
ParpbpQ6IRT3 Acvr2a-201ENSMUST00000063886 5686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
ParpbpQ6IRT3 Scamp4-201ENSMUST00000079883 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
ParpbpQ6IRT3 Lrig3-201ENSMUST00000074807 4016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
ParpbpQ6IRT3 Kif21a-204ENSMUST00000109287 6124 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
ParpbpQ6IRT3 Kif21a-205ENSMUST00000109288 6142 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
ParpbpQ6IRT3 Mthfsl-201ENSMUST00000113110 801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
ParpbpQ6IRT3 Mthfs-203ENSMUST00000118870 705 ntTSL 3 BASIC15.92■□□□□ 0.14
ParpbpQ6IRT3 Pgap3-205ENSMUST00000128897 1264 ntTSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
ParpbpQ6IRT3 B430219N15Rik-201ENSMUST00000147230 835 ntTSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
ParpbpQ6IRT3 Mir5122-201ENSMUST00000175004 89 ntBASIC15.92■□□□□ 0.14
ParpbpQ6IRT3 D330020A13Rik-201ENSMUST00000181956 1069 ntAPPRIS P1 BASIC15.92■□□□□ 0.14
ParpbpQ6IRT3 Mrps12-201ENSMUST00000056078 722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
ParpbpQ6IRT3 Mthfs-201ENSMUST00000085256 816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
ParpbpQ6IRT3 Klhl29-201ENSMUST00000020958 7041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
ParpbpQ6IRT3 2810425M01Rik-201ENSMUST00000180790 1850 ntTSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
ParpbpQ6IRT3 Hps4-201ENSMUST00000035279 2836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
ParpbpQ6IRT3 Slc26a10-205ENSMUST00000222911 3067 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
ParpbpQ6IRT3 Ankrd22-201ENSMUST00000025686 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
ParpbpQ6IRT3 Scarf2-201ENSMUST00000012161 3302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
ParpbpQ6IRT3 Pomp-201ENSMUST00000031654 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
ParpbpQ6IRT3 Mtmr12-201ENSMUST00000038172 6840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
ParpbpQ6IRT3 Fam57b-201ENSMUST00000079423 2328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
ParpbpQ6IRT3 Dbn1-202ENSMUST00000109921 2378 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
ParpbpQ6IRT3 Gm15635-204ENSMUST00000208024 2539 ntBASIC15.91■□□□□ 0.14
ParpbpQ6IRT3 4930519A11Rik-201ENSMUST00000181381 1523 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
ParpbpQ6IRT3 Osgin2-201ENSMUST00000037198 2658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
ParpbpQ6IRT3 Crct1-202ENSMUST00000107301 460 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
ParpbpQ6IRT3 Zpbp2-205ENSMUST00000107513 1240 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
ParpbpQ6IRT3 Rcbtb2-217ENSMUST00000167401 868 ntTSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
ParpbpQ6IRT3 AL672049.1-201ENSMUST00000197943 91 ntBASIC15.91■□□□□ 0.14
ParpbpQ6IRT3 Nme2-202ENSMUST00000072566 734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
ParpbpQ6IRT3 Rex1bd-201ENSMUST00000075175 671 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
ParpbpQ6IRT3 Mms22l-202ENSMUST00000108222 4478 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
ParpbpQ6IRT3 Tbc1d12-201ENSMUST00000037302 4209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
ParpbpQ6IRT3 Nrxn1-217ENSMUST00000174337 3021 ntTSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
ParpbpQ6IRT3 9930012K11Rik-205ENSMUST00000153871 1983 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
ParpbpQ6IRT3 Lin9-203ENSMUST00000192561 3160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
ParpbpQ6IRT3 Atf7-209ENSMUST00000184485 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
ParpbpQ6IRT3 Gramd4-204ENSMUST00000138134 4292 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
ParpbpQ6IRT3 Gm1043-204ENSMUST00000207866 4296 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
ParpbpQ6IRT3 Fam110a-204ENSMUST00000109865 1853 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
ParpbpQ6IRT3 Nedd4l-202ENSMUST00000163516 8163 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
ParpbpQ6IRT3 Tia1-203ENSMUST00000095754 1789 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
ParpbpQ6IRT3 Gm6598-201ENSMUST00000202719 2615 ntBASIC15.9■□□□□ 0.14
ParpbpQ6IRT3 Nfkbib-201ENSMUST00000032815 2061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
ParpbpQ6IRT3 Cep68-204ENSMUST00000162811 2788 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
ParpbpQ6IRT3 Lrig2-207ENSMUST00000199070 5991 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
ParpbpQ6IRT3 Nfib-204ENSMUST00000107246 3075 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
ParpbpQ6IRT3 Rcbtb2-226ENSMUST00000171767 2692 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
ParpbpQ6IRT3 Insig2-203ENSMUST00000159085 1252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
ParpbpQ6IRT3 Cox7a2l-202ENSMUST00000167741 1147 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
ParpbpQ6IRT3 Utf1-201ENSMUST00000168457 1227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
ParpbpQ6IRT3 Gm5417-201ENSMUST00000079706 384 ntBASIC15.9■□□□□ 0.14
ParpbpQ6IRT3 Mterf1a-202ENSMUST00000117463 2413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
ParpbpQ6IRT3 Npas3-203ENSMUST00000223057 2724 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
ParpbpQ6IRT3 Ubp1-202ENSMUST00000084885 3850 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
ParpbpQ6IRT3 Gprc5c-203ENSMUST00000122967 1709 ntTSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
ParpbpQ6IRT3 Sharpin-201ENSMUST00000023211 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
ParpbpQ6IRT3 Gm21974-201ENSMUST00000126662 2037 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
ParpbpQ6IRT3 E2f2-201ENSMUST00000061721 4739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
ParpbpQ6IRT3 Anp32a-201ENSMUST00000085519 2113 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
ParpbpQ6IRT3 Ddn-201ENSMUST00000075444 3740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
ParpbpQ6IRT3 6330411D24Rik-201ENSMUST00000211105 1568 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
ParpbpQ6IRT3 Kcnab3-201ENSMUST00000018614 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 24.7 ms