Protein–RNA interactions for Protein: Q6IFX3

Krt40, Keratin, type I cytoskeletal 40, mousemouse

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Length 439 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Krt40Q6IFX3 Cdkl3-207ENSMUST00000109080 2749 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
Krt40Q6IFX3 Ppt2-205ENSMUST00000169067 1392 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.95■□□□□ 0.79
Krt40Q6IFX3 Zfp655-206ENSMUST00000200039 1765 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
Krt40Q6IFX3 Rbpms2-201ENSMUST00000055844 1987 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
Krt40Q6IFX3 Csnk1e-203ENSMUST00000122044 3174 ntTSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
Krt40Q6IFX3 Mfsd13a-202ENSMUST00000128041 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
Krt40Q6IFX3 Lrrc43-202ENSMUST00000121444 2016 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
Krt40Q6IFX3 Galnt1-206ENSMUST00000170243 4108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
Krt40Q6IFX3 Ankle2-201ENSMUST00000031474 5215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
Krt40Q6IFX3 Ndor1-202ENSMUST00000114349 2336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
Krt40Q6IFX3 Ankra2-203ENSMUST00000123924 2328 ntTSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
Krt40Q6IFX3 Spats2l-212ENSMUST00000170139 2315 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.95■□□□□ 0.78
Krt40Q6IFX3 Dvl3-204ENSMUST00000171774 2319 ntTSL 5 BASIC19.95■□□□□ 0.78
Krt40Q6IFX3 Dohh-202ENSMUST00000121047 946 ntTSL 2 BASIC19.95■□□□□ 0.78
Krt40Q6IFX3 Sytl3-204ENSMUST00000159880 1296 ntTSL 5 BASIC19.95■□□□□ 0.78
Krt40Q6IFX3 Gm17807-201ENSMUST00000186869 298 ntBASIC19.95■□□□□ 0.78
Krt40Q6IFX3 Ighv6-1-201ENSMUST00000193612 343 ntBASIC19.95■□□□□ 0.78
Krt40Q6IFX3 Gm29707-201ENSMUST00000196325 491 ntBASIC19.95■□□□□ 0.78
Krt40Q6IFX3 Mrpl49-201ENSMUST00000007482 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
Krt40Q6IFX3 Ddx59-201ENSMUST00000027655 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
Krt40Q6IFX3 Zkscan4-202ENSMUST00000225845 1506 ntBASIC19.95■□□□□ 0.78
Krt40Q6IFX3 Ebf3-201ENSMUST00000033378 4838 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
Krt40Q6IFX3 Slc16a7-205ENSMUST00000210780 2562 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.94■□□□□ 0.78
Krt40Q6IFX3 Tox2-205ENSMUST00000165937 1675 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.94■□□□□ 0.78
Krt40Q6IFX3 Rragd-203ENSMUST00000098190 5008 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.94■□□□□ 0.78
Krt40Q6IFX3 Secisbp2-202ENSMUST00000110044 1915 ntTSL 2 BASIC19.94■□□□□ 0.78
Krt40Q6IFX3 Bmt2-201ENSMUST00000045235 4143 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
Krt40Q6IFX3 Rmdn3-201ENSMUST00000094695 2249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
Krt40Q6IFX3 Blmh-201ENSMUST00000021197 2497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
Krt40Q6IFX3 Mycn-202ENSMUST00000130990 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
Krt40Q6IFX3 B4galt3-205ENSMUST00000126699 1758 ntTSL 5 BASIC19.94■□□□□ 0.78
Krt40Q6IFX3 Gm15794-201ENSMUST00000120182 631 ntBASIC19.94■□□□□ 0.78
Krt40Q6IFX3 Gm18421-201ENSMUST00000204122 625 ntBASIC19.94■□□□□ 0.78
Krt40Q6IFX3 Gm45631-201ENSMUST00000210318 1244 ntTSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
Krt40Q6IFX3 Krt10-202ENSMUST00000211768 557 ntTSL 3 BASIC19.94■□□□□ 0.78
Krt40Q6IFX3 Panx2-203ENSMUST00000162424 3391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
Krt40Q6IFX3 Pi4k2b-201ENSMUST00000031081 3139 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
Krt40Q6IFX3 Prdm6-201ENSMUST00000091900 2601 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
Krt40Q6IFX3 Lrch3-201ENSMUST00000023491 5536 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
Krt40Q6IFX3 Acot1-201ENSMUST00000168120 2272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
Krt40Q6IFX3 Aebp2-202ENSMUST00000087614 3727 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
Krt40Q6IFX3 Nr1h3-202ENSMUST00000111354 1738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
Krt40Q6IFX3 Wdr55-201ENSMUST00000049323 1498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
Krt40Q6IFX3 Tril-201ENSMUST00000127748 5363 ntAPPRIS P1 BASIC19.93■□□□□ 0.78
Krt40Q6IFX3 Rad23a-202ENSMUST00000109761 1842 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
Krt40Q6IFX3 Dpy30-201ENSMUST00000112571 790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.93■□□□□ 0.78
Krt40Q6IFX3 Blvrb-204ENSMUST00000133750 509 ntTSL 2 BASIC19.93■□□□□ 0.78
Krt40Q6IFX3 Gm27357-201ENSMUST00000183754 135 ntBASIC19.93■□□□□ 0.78
Krt40Q6IFX3 Senp2-201ENSMUST00000023561 4499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
Krt40Q6IFX3 Zdhhc24-201ENSMUST00000006632 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
Krt40Q6IFX3 Rtn4-204ENSMUST00000102842 2257 ntTSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
Krt40Q6IFX3 Gm37811-201ENSMUST00000192416 2601 ntBASIC19.93■□□□□ 0.78
Krt40Q6IFX3 Proser2-201ENSMUST00000054254 2061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
Krt40Q6IFX3 Anapc5-218ENSMUST00000200645 2404 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
Krt40Q6IFX3 Nmnat3-201ENSMUST00000112935 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
Krt40Q6IFX3 Gm10489-201ENSMUST00000180511 1466 ntTSL 2 BASIC19.92■□□□□ 0.78
Krt40Q6IFX3 Zbtb7a-201ENSMUST00000048128 5938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
Krt40Q6IFX3 Pdgfa-202ENSMUST00000076095 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
Krt40Q6IFX3 B3gnt9-202ENSMUST00000136822 2516 ntAPPRIS P1 BASIC19.92■□□□□ 0.78
Krt40Q6IFX3 Rps27a-202ENSMUST00000102845 791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
Krt40Q6IFX3 Olfr129-201ENSMUST00000122318 993 ntBASIC19.92■□□□□ 0.78
Krt40Q6IFX3 Hotairm1-202ENSMUST00000132559 713 ntTSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
Krt40Q6IFX3 Gm26620-201ENSMUST00000180542 817 ntAPPRIS P1 BASIC19.92■□□□□ 0.78
Krt40Q6IFX3 Gpsm3-201ENSMUST00000038244 1343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
Krt40Q6IFX3 Plpbp-202ENSMUST00000098851 1368 ntTSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
Krt40Q6IFX3 Itsn2-201ENSMUST00000062580 5987 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.92■□□□□ 0.78
Krt40Q6IFX3 Bmp8a-201ENSMUST00000040496 2405 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
Krt40Q6IFX3 Satb1-211ENSMUST00000152830 5993 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC19.92■□□□□ 0.78
Krt40Q6IFX3 Eral1-201ENSMUST00000021183 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
Krt40Q6IFX3 Zfp264-201ENSMUST00000208656 1563 ntBASIC19.91■□□□□ 0.78
Krt40Q6IFX3 Rab1a-201ENSMUST00000020358 2827 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
Krt40Q6IFX3 Gm42417-201ENSMUST00000191849 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
Krt40Q6IFX3 Hspa1l-201ENSMUST00000007248 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
Krt40Q6IFX3 Hist1h2bc-201ENSMUST00000018246 1156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
Krt40Q6IFX3 Gm28402-201ENSMUST00000188574 373 ntTSL 3 BASIC19.91■□□□□ 0.78
Krt40Q6IFX3 Tmem270-201ENSMUST00000047305 932 ntTSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
Krt40Q6IFX3 Hist1h2ba-201ENSMUST00000052776 384 ntAPPRIS P1 BASIC19.91■□□□□ 0.78
Krt40Q6IFX3 4930455H04Rik-201ENSMUST00000117592 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
Krt40Q6IFX3 Tigd3-201ENSMUST00000055911 2114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
Krt40Q6IFX3 H2-DMb1-201ENSMUST00000114232 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
Krt40Q6IFX3 Osbpl1a-203ENSMUST00000118313 2893 ntTSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
Krt40Q6IFX3 Nsun5-201ENSMUST00000000940 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
Krt40Q6IFX3 Fbxw5-201ENSMUST00000015239 2388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
Krt40Q6IFX3 Mag-201ENSMUST00000040548 2419 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
Krt40Q6IFX3 Celf3-208ENSMUST00000198316 2505 ntTSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
Krt40Q6IFX3 Cep83-201ENSMUST00000020212 3639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
Krt40Q6IFX3 Gm38534-201ENSMUST00000206566 1909 ntTSL 5 BASIC19.9■□□□□ 0.78
Krt40Q6IFX3 Cbx6-203ENSMUST00000109627 5806 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
Krt40Q6IFX3 Auh-202ENSMUST00000110031 3235 ntTSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
Krt40Q6IFX3 Slc6a8-206ENSMUST00000164449 2151 ntTSL 5 BASIC19.9■□□□□ 0.78
Krt40Q6IFX3 Tedc2-201ENSMUST00000024930 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
Krt40Q6IFX3 Gm28033-201ENSMUST00000184224 96 ntBASIC19.9■□□□□ 0.78
Krt40Q6IFX3 Gm18669-201ENSMUST00000216049 778 ntBASIC19.9■□□□□ 0.78
Krt40Q6IFX3 Gmnn-201ENSMUST00000006898 1127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
Krt40Q6IFX3 Rcn1-201ENSMUST00000006128 2720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
Krt40Q6IFX3 St7l-201ENSMUST00000059271 5728 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
Krt40Q6IFX3 Casp3-201ENSMUST00000093517 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
Krt40Q6IFX3 Zpbp2-203ENSMUST00000107509 1577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
Krt40Q6IFX3 Sult2b1-204ENSMUST00000209739 1858 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.9■□□□□ 0.78
Krt40Q6IFX3 Cxadr-201ENSMUST00000023572 5734 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
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