Protein–RNA interactions for Protein: Q6IE21

Otud6a, OTU domain-containing protein 6A, mousemouse

Predictions only

Length 290 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Otud6aQ6IE21 Gm42642-201ENSMUST00000200683 355 ntBASIC16.14■□□□□ 0.17
Otud6aQ6IE21 Olfr718-ps1-204ENSMUST00000218872 963 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Otud6aQ6IE21 Mrpl40-201ENSMUST00000023391 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Otud6aQ6IE21 Gar1-201ENSMUST00000029643 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Otud6aQ6IE21 Med26-201ENSMUST00000058534 2997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Otud6aQ6IE21 Magi1-202ENSMUST00000089317 7209 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Otud6aQ6IE21 Ubr2-202ENSMUST00000113337 7633 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Otud6aQ6IE21 Ogfod2-202ENSMUST00000119269 1474 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Otud6aQ6IE21 Gas2-201ENSMUST00000051912 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Otud6aQ6IE21 Klhl40-201ENSMUST00000098272 2370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Otud6aQ6IE21 Smox-202ENSMUST00000110179 1320 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Otud6aQ6IE21 Mapt-202ENSMUST00000106988 2202 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Otud6aQ6IE21 Txndc15-201ENSMUST00000021959 1527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Otud6aQ6IE21 Adcy5-201ENSMUST00000114913 7007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Otud6aQ6IE21 Nes-201ENSMUST00000090973 6126 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Otud6aQ6IE21 Rab5c-202ENSMUST00000107364 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Otud6aQ6IE21 Rell1-204ENSMUST00000154169 3241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Otud6aQ6IE21 Sppl3-201ENSMUST00000031530 3204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Otud6aQ6IE21 Tcf3-207ENSMUST00000105343 2920 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Otud6aQ6IE21 Pcmt1-208ENSMUST00000162606 2757 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Otud6aQ6IE21 Gpsm1-202ENSMUST00000066936 3384 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Otud6aQ6IE21 Paxbp1-202ENSMUST00000118522 3973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Otud6aQ6IE21 Wnt16-203ENSMUST00000148639 1168 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Otud6aQ6IE21 Gm38165-201ENSMUST00000191654 486 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Otud6aQ6IE21 Nr2c2ap-202ENSMUST00000211898 1078 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Otud6aQ6IE21 CT030146.1-201ENSMUST00000220919 217 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
Otud6aQ6IE21 Grifin-201ENSMUST00000042993 613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Otud6aQ6IE21 Lhx2-203ENSMUST00000143783 1696 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Otud6aQ6IE21 Ggnbp2-201ENSMUST00000018547 2478 ntTSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Otud6aQ6IE21 Tmem5-205ENSMUST00000140299 4793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Otud6aQ6IE21 Gm29394-202ENSMUST00000176935 1326 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Otud6aQ6IE21 B3galt6-201ENSMUST00000052185 3184 ntAPPRIS P1 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Otud6aQ6IE21 Chst5-201ENSMUST00000034430 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Otud6aQ6IE21 Il23a-201ENSMUST00000026449 1360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Otud6aQ6IE21 Spi1-201ENSMUST00000002180 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Otud6aQ6IE21 Zfyve19-201ENSMUST00000090174 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Otud6aQ6IE21 Bend5-201ENSMUST00000030274 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Otud6aQ6IE21 Ankrd44-210ENSMUST00000179030 6140 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Otud6aQ6IE21 A930001C03Rik-204ENSMUST00000154407 1402 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Otud6aQ6IE21 Gata5-201ENSMUST00000015771 3277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Otud6aQ6IE21 Rgs19-202ENSMUST00000108769 1460 ntTSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Otud6aQ6IE21 Axin1-201ENSMUST00000074370 3777 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Otud6aQ6IE21 Six3os1-212ENSMUST00000177220 5601 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Otud6aQ6IE21 Gm8495-201ENSMUST00000188740 694 ntBASIC16.12■□□□□ 0.17
Otud6aQ6IE21 Emc9-201ENSMUST00000022828 855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Otud6aQ6IE21 Adnp2-201ENSMUST00000066743 5012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Otud6aQ6IE21 Nipal2-201ENSMUST00000040791 4331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Otud6aQ6IE21 Bicd2-203ENSMUST00000110085 4588 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Otud6aQ6IE21 Acss3-201ENSMUST00000044668 2494 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Otud6aQ6IE21 Flt1-203ENSMUST00000110529 6292 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Otud6aQ6IE21 Zdhhc8-201ENSMUST00000076957 4867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Otud6aQ6IE21 Zfp281-201ENSMUST00000047734 4933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Otud6aQ6IE21 Olfr94-201ENSMUST00000055324 1304 ntAPPRIS P2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Otud6aQ6IE21 Sept8-203ENSMUST00000120878 1806 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Otud6aQ6IE21 Pex12-205ENSMUST00000175741 2337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Otud6aQ6IE21 Ptp4a3-201ENSMUST00000053232 3608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Otud6aQ6IE21 1700052K11Rik-201ENSMUST00000190120 3708 ntBASIC16.11■□□□□ 0.17
Otud6aQ6IE21 Lgmn-201ENSMUST00000021607 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Otud6aQ6IE21 Nrros-201ENSMUST00000099991 2548 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Otud6aQ6IE21 Rb1-201ENSMUST00000022701 4656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Otud6aQ6IE21 Zmynd11-204ENSMUST00000110635 3881 ntTSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Otud6aQ6IE21 Tm2d3-202ENSMUST00000065574 1478 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Otud6aQ6IE21 Kif21a-204ENSMUST00000109287 6124 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Otud6aQ6IE21 Kif21a-205ENSMUST00000109288 6142 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Otud6aQ6IE21 Mef2d-203ENSMUST00000107559 1791 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Otud6aQ6IE21 Senp7-211ENSMUST00000202000 3218 ntTSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Otud6aQ6IE21 Rflnb-201ENSMUST00000021207 3512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Otud6aQ6IE21 Gm13234-201ENSMUST00000120010 747 ntBASIC16.11■□□□□ 0.17
Otud6aQ6IE21 Sfr1-201ENSMUST00000099353 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Otud6aQ6IE21 Serinc2-201ENSMUST00000105996 1878 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Otud6aQ6IE21 Sphk1-206ENSMUST00000106388 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Otud6aQ6IE21 Mdfic-202ENSMUST00000120512 1871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Otud6aQ6IE21 Snx15-201ENSMUST00000025702 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Otud6aQ6IE21 Spdef-205ENSMUST00000167489 1708 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Otud6aQ6IE21 Zdhhc16-201ENSMUST00000026154 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Otud6aQ6IE21 Cspg5-201ENSMUST00000035058 3870 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Otud6aQ6IE21 Adnp-201ENSMUST00000057793 4917 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Otud6aQ6IE21 Slc43a1-202ENSMUST00000111624 2556 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Otud6aQ6IE21 Rnpep-202ENSMUST00000077340 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Otud6aQ6IE21 Slc35e4-202ENSMUST00000109995 3063 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Otud6aQ6IE21 Slc35e4-201ENSMUST00000051207 3059 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Otud6aQ6IE21 Cdh4-203ENSMUST00000108911 1208 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Otud6aQ6IE21 Gm27032-201ENSMUST00000183124 1116 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
Otud6aQ6IE21 Lhx1-204ENSMUST00000184646 1201 ntTSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Otud6aQ6IE21 Gm38205-201ENSMUST00000192243 258 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
Otud6aQ6IE21 Cox7c-202ENSMUST00000078764 433 ntTSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Otud6aQ6IE21 Hist1h2ag-201ENSMUST00000091741 485 ntAPPRIS P1 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Otud6aQ6IE21 Sec31a-201ENSMUST00000094578 4228 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Otud6aQ6IE21 Cfap36-201ENSMUST00000020754 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Otud6aQ6IE21 Ogfr-201ENSMUST00000029087 2449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Otud6aQ6IE21 Klhl25-203ENSMUST00000205612 1343 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Otud6aQ6IE21 Syt6-202ENSMUST00000117221 4394 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Otud6aQ6IE21 Dmpk-202ENSMUST00000108473 2588 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Otud6aQ6IE21 Ankrd44-201ENSMUST00000044359 6192 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Otud6aQ6IE21 Dab2ip-202ENSMUST00000091010 6455 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Otud6aQ6IE21 Cog8-201ENSMUST00000034391 2954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Otud6aQ6IE21 Spsb3-203ENSMUST00000117890 1641 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Otud6aQ6IE21 Gramd3-201ENSMUST00000070166 2605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Otud6aQ6IE21 Gm16499-203ENSMUST00000204633 2177 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
Otud6aQ6IE21 Efr3a-201ENSMUST00000015146 5215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 24.9 ms