Protein–RNA interactions for Protein: Q69ZZ6

Tmcc1, Transmembrane and coiled-coil domains protein 1, mousemouse

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Length 649 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tmcc1Q69ZZ6 Slain1-201ENSMUST00000069443 2863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Tmcc1Q69ZZ6 Pigz-201ENSMUST00000052174 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Tmcc1Q69ZZ6 Fdx1l-201ENSMUST00000010348 812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Tmcc1Q69ZZ6 Klf13-202ENSMUST00000183817 599 ntTSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Tmcc1Q69ZZ6 Gm44899-202ENSMUST00000209433 511 ntTSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
Tmcc1Q69ZZ6 Smn1-201ENSMUST00000022147 1222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Tmcc1Q69ZZ6 Ttc32-201ENSMUST00000085741 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Tmcc1Q69ZZ6 Chsy3-201ENSMUST00000080721 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Tmcc1Q69ZZ6 Flg-201ENSMUST00000050758 1488 ntBASIC16.97■□□□□ 0.31
Tmcc1Q69ZZ6 Elk4-202ENSMUST00000086556 4433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Tmcc1Q69ZZ6 Mtmr12-201ENSMUST00000038172 6840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Tmcc1Q69ZZ6 Matn4-201ENSMUST00000103103 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Tmcc1Q69ZZ6 Saysd1-201ENSMUST00000059666 2315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Tmcc1Q69ZZ6 Met-203ENSMUST00000115443 6809 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
Tmcc1Q69ZZ6 Espn-206ENSMUST00000103196 1323 ntTSL 5 BASIC16.96■□□□□ 0.31
Tmcc1Q69ZZ6 Ttc32-202ENSMUST00000219470 1645 ntTSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Tmcc1Q69ZZ6 Gprc5c-203ENSMUST00000122967 1709 ntTSL 5 BASIC16.96■□□□□ 0.31
Tmcc1Q69ZZ6 Kcnk4-201ENSMUST00000025908 1715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Tmcc1Q69ZZ6 Zpbp-201ENSMUST00000020413 4248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Tmcc1Q69ZZ6 Spef1-201ENSMUST00000028801 2328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Tmcc1Q69ZZ6 G3bp2-204ENSMUST00000169094 2716 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Tmcc1Q69ZZ6 Hmga1-205ENSMUST00000118599 529 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC16.96■□□□□ 0.31
Tmcc1Q69ZZ6 Stmn4-203ENSMUST00000120229 1281 ntTSL 2 BASIC16.96■□□□□ 0.31
Tmcc1Q69ZZ6 Josd2-205ENSMUST00000120852 727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.96■□□□□ 0.31
Tmcc1Q69ZZ6 Prmt1-205ENSMUST00000207659 945 ntTSL 5 BASIC16.96■□□□□ 0.31
Tmcc1Q69ZZ6 Gm40460-201ENSMUST00000211591 735 ntAPPRIS P1 BASIC16.96■□□□□ 0.31
Tmcc1Q69ZZ6 Fabp3-201ENSMUST00000070532 823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Tmcc1Q69ZZ6 Pitpnm1-201ENSMUST00000049658 4206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Tmcc1Q69ZZ6 4430402I18Rik-205ENSMUST00000162110 1559 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.96■□□□□ 0.31
Tmcc1Q69ZZ6 Acads-201ENSMUST00000031524 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Tmcc1Q69ZZ6 Pacsin3-202ENSMUST00000059566 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Tmcc1Q69ZZ6 Negr1-203ENSMUST00000106065 1953 ntTSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Tmcc1Q69ZZ6 Klhl40-201ENSMUST00000098272 2370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Tmcc1Q69ZZ6 A330074K22Rik-201ENSMUST00000183235 2489 ntTSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Tmcc1Q69ZZ6 Pde8b-202ENSMUST00000067082 2598 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.96■□□□□ 0.31
Tmcc1Q69ZZ6 Snx27-202ENSMUST00000107283 3531 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Tmcc1Q69ZZ6 Il6st-206ENSMUST00000183886 3004 ntTSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.3
Tmcc1Q69ZZ6 Was-201ENSMUST00000033505 2114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.3
Tmcc1Q69ZZ6 Nrxn1-206ENSMUST00000160800 5683 ntTSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.3
Tmcc1Q69ZZ6 Gm16386-201ENSMUST00000181397 1423 ntTSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.3
Tmcc1Q69ZZ6 Hoxb6-201ENSMUST00000000704 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.3
Tmcc1Q69ZZ6 Mid1-206ENSMUST00000112107 3194 ntTSL 5 BASIC16.95■□□□□ 0.3
Tmcc1Q69ZZ6 Bard1-201ENSMUST00000027393 5659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Tmcc1Q69ZZ6 Ankrd13a-201ENSMUST00000102578 3717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Tmcc1Q69ZZ6 Wipi2-201ENSMUST00000036872 5171 ntTSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Tmcc1Q69ZZ6 Atp6v1c1-201ENSMUST00000022904 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Tmcc1Q69ZZ6 Nfs1-201ENSMUST00000029147 2051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Tmcc1Q69ZZ6 Slc13a3-202ENSMUST00000109279 3131 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Tmcc1Q69ZZ6 Rgl1-202ENSMUST00000111857 3037 ntTSL 5 BASIC16.95■□□□□ 0.3
Tmcc1Q69ZZ6 1190002N15Rik-201ENSMUST00000113028 3950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Tmcc1Q69ZZ6 Mmd-202ENSMUST00000107887 1654 ntTSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Tmcc1Q69ZZ6 Hace1-201ENSMUST00000037044 3785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Tmcc1Q69ZZ6 Crtac1-201ENSMUST00000048630 2616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Tmcc1Q69ZZ6 Tmem203-201ENSMUST00000104998 854 ntAPPRIS P1 BASIC16.95■□□□□ 0.3
Tmcc1Q69ZZ6 Clta-201ENSMUST00000107845 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.95■□□□□ 0.3
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Tmcc1Q69ZZ6 Mir5133-201ENSMUST00000174955 77 ntBASIC16.95■□□□□ 0.3
Tmcc1Q69ZZ6 Gm29241-201ENSMUST00000189260 1096 ntBASIC16.95■□□□□ 0.3
Tmcc1Q69ZZ6 Gm34933-201ENSMUST00000203245 1067 ntTSL 5 BASIC16.95■□□□□ 0.3
Tmcc1Q69ZZ6 Gpaa1-201ENSMUST00000023221 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Tmcc1Q69ZZ6 Naxe-201ENSMUST00000029708 908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Tmcc1Q69ZZ6 Zfp580-201ENSMUST00000069324 1096 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Tmcc1Q69ZZ6 Acvr2a-201ENSMUST00000063886 5686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Tmcc1Q69ZZ6 Celf1-201ENSMUST00000005643 4830 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.95■□□□□ 0.3
Tmcc1Q69ZZ6 Prkcb-201ENSMUST00000064921 2557 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Tmcc1Q69ZZ6 Ubr2-202ENSMUST00000113337 7633 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Tmcc1Q69ZZ6 Susd1-202ENSMUST00000107544 3220 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.95■□□□□ 0.3
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Tmcc1Q69ZZ6 Sh3yl1-202ENSMUST00000110880 1601 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Tmcc1Q69ZZ6 Dhfr-201ENSMUST00000022218 5347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Tmcc1Q69ZZ6 Chrd-202ENSMUST00000115423 2417 ntTSL 2 BASIC16.95■□□□□ 0.3
Tmcc1Q69ZZ6 Prpf40b-212ENSMUST00000145482 3308 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Tmcc1Q69ZZ6 Snrnp48-201ENSMUST00000091641 1785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Tmcc1Q69ZZ6 Tia1-203ENSMUST00000095754 1789 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.94■□□□□ 0.3
Tmcc1Q69ZZ6 Slc5a10-203ENSMUST00000148584 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Tmcc1Q69ZZ6 Mdm1-204ENSMUST00000169817 2022 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Tmcc1Q69ZZ6 Rbck1-202ENSMUST00000109847 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Tmcc1Q69ZZ6 Atg5-201ENSMUST00000039286 2352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Tmcc1Q69ZZ6 Prelid3a-201ENSMUST00000025411 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Tmcc1Q69ZZ6 Agtr1a-201ENSMUST00000066412 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Tmcc1Q69ZZ6 Uts2r-201ENSMUST00000039044 1703 ntAPPRIS P1 BASIC16.94■□□□□ 0.3
Tmcc1Q69ZZ6 Tmem234-215ENSMUST00000173758 453 ntTSL 2 BASIC16.94■□□□□ 0.3
Tmcc1Q69ZZ6 Cystm1-201ENSMUST00000050584 831 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Tmcc1Q69ZZ6 Mtag2-201ENSMUST00000058665 714 ntBASIC16.94■□□□□ 0.3
Tmcc1Q69ZZ6 Sprn-201ENSMUST00000059241 3374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Tmcc1Q69ZZ6 Grwd1-201ENSMUST00000107723 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Tmcc1Q69ZZ6 Nox4-202ENSMUST00000068829 1861 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Tmcc1Q69ZZ6 Ccdc106-204ENSMUST00000207974 2492 ntTSL 2 BASIC16.94■□□□□ 0.3
Tmcc1Q69ZZ6 Atp1a1-201ENSMUST00000036493 3679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Tmcc1Q69ZZ6 Nfkbid-201ENSMUST00000046177 2039 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Tmcc1Q69ZZ6 Fam213a-202ENSMUST00000118466 1567 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Tmcc1Q69ZZ6 Plcl1-201ENSMUST00000042986 6580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Tmcc1Q69ZZ6 Ppm1h-206ENSMUST00000161487 2931 ntTSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Tmcc1Q69ZZ6 Arntl-201ENSMUST00000047321 2908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Tmcc1Q69ZZ6 Lrrc36-206ENSMUST00000216765 2301 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.93■□□□□ 0.3
Tmcc1Q69ZZ6 Map2k5-201ENSMUST00000034920 2310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Tmcc1Q69ZZ6 9530018F02Rik-201ENSMUST00000219513 2599 ntBASIC16.93■□□□□ 0.3
Tmcc1Q69ZZ6 Disp3-201ENSMUST00000047720 5282 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.93■□□□□ 0.3
Tmcc1Q69ZZ6 Fbxl21-203ENSMUST00000121871 1963 ntTSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Tmcc1Q69ZZ6 Zkscan2-203ENSMUST00000128217 2218 ntTSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 23.9 ms