Protein–RNA interactions for Protein: Q69ZU6

Thsd7a, Thrombospondin type-1 domain-containing protein 7A, mousemouse

Predictions only

Length 1,645 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Thsd7aQ69ZU6 H2af-ps-201ENSMUST00000119066 295 ntBASIC22.84■■□□□ 1.25
Thsd7aQ69ZU6 Gm36584-201ENSMUST00000209046 708 ntTSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Thsd7aQ69ZU6 Higd1a-206ENSMUST00000215300 605 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.84■■□□□ 1.25
Thsd7aQ69ZU6 AC158982.1-201ENSMUST00000228377 901 ntBASIC22.84■■□□□ 1.25
Thsd7aQ69ZU6 March3-201ENSMUST00000035278 860 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.84■■□□□ 1.25
Thsd7aQ69ZU6 Nrn1-201ENSMUST00000037623 1619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Thsd7aQ69ZU6 Gm28111-201ENSMUST00000187786 1393 ntTSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Thsd7aQ69ZU6 Otub1-202ENSMUST00000123594 1728 ntTSL 5 BASIC22.84■■□□□ 1.25
Thsd7aQ69ZU6 Zfp623-201ENSMUST00000037260 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Thsd7aQ69ZU6 C920006O11Rik-201ENSMUST00000180974 1444 ntTSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Thsd7aQ69ZU6 Gm10505-201ENSMUST00000151398 1587 ntTSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
Thsd7aQ69ZU6 Gde1-201ENSMUST00000038791 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
Thsd7aQ69ZU6 Usf2-201ENSMUST00000058860 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
Thsd7aQ69ZU6 Scamp5-203ENSMUST00000214256 1025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
Thsd7aQ69ZU6 Dnajb8-201ENSMUST00000061866 990 ntAPPRIS P1 BASIC22.83■■□□□ 1.25
Thsd7aQ69ZU6 Haghl-201ENSMUST00000077938 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
Thsd7aQ69ZU6 Igsf23-201ENSMUST00000043440 1908 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
Thsd7aQ69ZU6 Ssbp3-201ENSMUST00000030367 3195 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.24
Thsd7aQ69ZU6 Usp12-201ENSMUST00000085614 4327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.24
Thsd7aQ69ZU6 Tal1-204ENSMUST00000162489 2894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.24
Thsd7aQ69ZU6 Paxx-201ENSMUST00000114261 981 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Thsd7aQ69ZU6 Mir3113-201ENSMUST00000175478 76 ntBASIC22.82■■□□□ 1.24
Thsd7aQ69ZU6 2310001H17Rik-206ENSMUST00000205051 676 ntTSL 3 BASIC22.82■■□□□ 1.24
Thsd7aQ69ZU6 Erp27-201ENSMUST00000032343 1029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Thsd7aQ69ZU6 Mrpl46-201ENSMUST00000032841 1134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Thsd7aQ69ZU6 Nap1l1-206ENSMUST00000219143 1365 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Thsd7aQ69ZU6 Gm19554-201ENSMUST00000220934 2076 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Thsd7aQ69ZU6 Kcnip2-202ENSMUST00000079431 2302 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Thsd7aQ69ZU6 Slc25a11-201ENSMUST00000014750 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Thsd7aQ69ZU6 Lca5l-201ENSMUST00000054855 2508 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Thsd7aQ69ZU6 Vps25-203ENSMUST00000100414 1220 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Thsd7aQ69ZU6 Gm12480-201ENSMUST00000129576 774 ntTSL 3 BASIC22.82■■□□□ 1.24
Thsd7aQ69ZU6 Dynlt1b-201ENSMUST00000179569 768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Thsd7aQ69ZU6 5830454E08Rik-202ENSMUST00000213974 744 ntBASIC22.82■■□□□ 1.24
Thsd7aQ69ZU6 Ndufaf2-202ENSMUST00000223734 556 ntBASIC22.82■■□□□ 1.24
Thsd7aQ69ZU6 Luc7l2-201ENSMUST00000057692 2702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Thsd7aQ69ZU6 Syne4-201ENSMUST00000054594 1355 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Thsd7aQ69ZU6 Ccdc166-202ENSMUST00000183130 1563 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.82■■□□□ 1.24
Thsd7aQ69ZU6 Prlhr-201ENSMUST00000051277 1572 ntAPPRIS P1 BASIC22.82■■□□□ 1.24
Thsd7aQ69ZU6 Gm16712-201ENSMUST00000181962 1960 ntTSL 2 BASIC22.81■■□□□ 1.24
Thsd7aQ69ZU6 Slc1a6-201ENSMUST00000005490 2029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Thsd7aQ69ZU6 Zpbp2-203ENSMUST00000107509 1577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Thsd7aQ69ZU6 1700029H14Rik-203ENSMUST00000134023 1319 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Thsd7aQ69ZU6 Tmem44-204ENSMUST00000140402 2405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Thsd7aQ69ZU6 Flg-204ENSMUST00000178752 756 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.81■■□□□ 1.24
Thsd7aQ69ZU6 4930445N18Rik-202ENSMUST00000181345 1033 ntTSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Thsd7aQ69ZU6 Larp1b-205ENSMUST00000191805 1581 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.81■■□□□ 1.24
Thsd7aQ69ZU6 Fuz-213ENSMUST00000209039 1453 ntTSL 5 BASIC22.81■■□□□ 1.24
Thsd7aQ69ZU6 Elof1-203ENSMUST00000213233 810 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.81■■□□□ 1.24
Thsd7aQ69ZU6 Chchd2-201ENSMUST00000094280 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Thsd7aQ69ZU6 Ccdc126-201ENSMUST00000055559 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Thsd7aQ69ZU6 Snx14-205ENSMUST00000173011 2238 ntTSL 5 BASIC22.8■■□□□ 1.24
Thsd7aQ69ZU6 Gpr162-204ENSMUST00000204667 2855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Thsd7aQ69ZU6 Gm26718-201ENSMUST00000181048 1378 ntTSL 5 BASIC22.8■■□□□ 1.24
Thsd7aQ69ZU6 H2-Bl-211ENSMUST00000195838 1105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Thsd7aQ69ZU6 AC159114.1-201ENSMUST00000220349 266 ntBASIC22.8■■□□□ 1.24
Thsd7aQ69ZU6 Tcp11-202ENSMUST00000043925 1746 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.8■■□□□ 1.24
Thsd7aQ69ZU6 Slc16a7-205ENSMUST00000210780 2562 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.8■■□□□ 1.24
Thsd7aQ69ZU6 Gm45277-201ENSMUST00000210549 1695 ntTSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Thsd7aQ69ZU6 Clk3-201ENSMUST00000065330 2496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Thsd7aQ69ZU6 Slc38a10-202ENSMUST00000053692 1947 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Thsd7aQ69ZU6 Nudt6-208ENSMUST00000146324 1264 ntTSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Thsd7aQ69ZU6 Gm15598-201ENSMUST00000156965 763 ntTSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
Thsd7aQ69ZU6 Tomm20l-201ENSMUST00000021482 578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Thsd7aQ69ZU6 Tpbgl-201ENSMUST00000178124 3022 ntAPPRIS P1 BASIC22.79■■□□□ 1.24
Thsd7aQ69ZU6 AI661453-201ENSMUST00000037701 1410 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Thsd7aQ69ZU6 Zxdb-201ENSMUST00000101388 5619 ntAPPRIS P1 BASIC22.79■■□□□ 1.24
Thsd7aQ69ZU6 Isl2-201ENSMUST00000034869 1854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Thsd7aQ69ZU6 Ppp3cb-206ENSMUST00000161989 2322 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Thsd7aQ69ZU6 Smad6-201ENSMUST00000041029 2971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Thsd7aQ69ZU6 Ptpmt1-203ENSMUST00000125001 3183 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Thsd7aQ69ZU6 Fkbp5-201ENSMUST00000079413 3542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Thsd7aQ69ZU6 Gm3248-201ENSMUST00000163885 2055 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
Thsd7aQ69ZU6 Gm7222-201ENSMUST00000117512 906 ntBASIC22.78■■□□□ 1.24
Thsd7aQ69ZU6 4930593A02Rik-202ENSMUST00000203879 938 ntTSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
Thsd7aQ69ZU6 D530014G21Rik-201ENSMUST00000208416 587 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Thsd7aQ69ZU6 Msantd1-204ENSMUST00000212362 798 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
Thsd7aQ69ZU6 Hpn-202ENSMUST00000108102 1830 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Thsd7aQ69ZU6 Sept8-203ENSMUST00000120878 1806 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
Thsd7aQ69ZU6 Gm9725-202ENSMUST00000166229 2326 ntTSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
Thsd7aQ69ZU6 Tmed4-201ENSMUST00000004508 2003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Thsd7aQ69ZU6 Camsap3-212ENSMUST00000208240 2572 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Thsd7aQ69ZU6 Gm37500-201ENSMUST00000192059 1443 ntBASIC22.77■■□□□ 1.24
Thsd7aQ69ZU6 Coro6-201ENSMUST00000021190 1418 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Thsd7aQ69ZU6 AL590614.2-201ENSMUST00000225374 1937 ntBASIC22.77■■□□□ 1.24
Thsd7aQ69ZU6 2610301B20Rik-201ENSMUST00000080517 2116 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Thsd7aQ69ZU6 Lrfn4-201ENSMUST00000053597 3194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Thsd7aQ69ZU6 Gm14057-201ENSMUST00000120631 482 ntBASIC22.77■■□□□ 1.24
Thsd7aQ69ZU6 Cbfb-202ENSMUST00000109392 2891 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Thsd7aQ69ZU6 Gm11373-201ENSMUST00000129791 2819 ntTSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
Thsd7aQ69ZU6 Fpgs-201ENSMUST00000028148 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Thsd7aQ69ZU6 Slc35f5-201ENSMUST00000027580 2733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Thsd7aQ69ZU6 Rabepk-202ENSMUST00000113086 1106 ntTSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
Thsd7aQ69ZU6 Gm15920-201ENSMUST00000118998 402 ntBASIC22.76■■□□□ 1.23
Thsd7aQ69ZU6 Wdr61-203ENSMUST00000121204 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Thsd7aQ69ZU6 Hmgb1-208ENSMUST00000139443 923 ntTSL 2 BASIC22.76■■□□□ 1.23
Thsd7aQ69ZU6 Rhox2a-202ENSMUST00000173650 735 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Thsd7aQ69ZU6 Rhox2c-204ENSMUST00000184688 720 ntTSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
Thsd7aQ69ZU6 1810008I18Rik-202ENSMUST00000187848 819 ntTSL 3 BASIC22.76■■□□□ 1.23
Thsd7aQ69ZU6 Gm45231-201ENSMUST00000208629 1064 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 34.2 ms