Protein–RNA interactions for Protein: Q69ZL1

Fgd6, FYVE, RhoGEF and PH domain-containing protein 6, mousemouse

Predictions only

Length 1,399 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Fgd6Q69ZL1 Ptpmt1-203ENSMUST00000125001 3183 ntTSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
Fgd6Q69ZL1 Chn2-201ENSMUST00000046856 2418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
Fgd6Q69ZL1 Coro6-201ENSMUST00000021190 1418 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
Fgd6Q69ZL1 Pcp2-205ENSMUST00000142431 524 ntTSL 2 BASIC26.15■■□□□ 1.78
Fgd6Q69ZL1 Gm27321-201ENSMUST00000185021 205 ntBASIC26.15■■□□□ 1.78
Fgd6Q69ZL1 D530014G21Rik-201ENSMUST00000208416 587 ntTSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
Fgd6Q69ZL1 Racgap1-213ENSMUST00000171702 3052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
Fgd6Q69ZL1 8030462N17Rik-201ENSMUST00000074653 3418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
Fgd6Q69ZL1 Syne4-201ENSMUST00000054594 1355 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
Fgd6Q69ZL1 Cic-202ENSMUST00000163320 6096 ntTSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
Fgd6Q69ZL1 Cic-201ENSMUST00000005578 6099 ntTSL 5 BASIC26.15■■□□□ 1.78
Fgd6Q69ZL1 Fdxr-201ENSMUST00000021078 1948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
Fgd6Q69ZL1 Prlhr-201ENSMUST00000051277 1572 ntAPPRIS P1 BASIC26.15■■□□□ 1.78
Fgd6Q69ZL1 Gabra4-205ENSMUST00000199357 2407 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.78
Fgd6Q69ZL1 Map4k3-201ENSMUST00000025089 4225 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC26.14■■□□□ 1.78
Fgd6Q69ZL1 Serpinh1-202ENSMUST00000169437 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.78
Fgd6Q69ZL1 Il11ra2-201ENSMUST00000108006 1299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.78
Fgd6Q69ZL1 Siva1-202ENSMUST00000109755 333 ntTSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.78
Fgd6Q69ZL1 Rabepk-202ENSMUST00000113086 1106 ntTSL 5 BASIC26.14■■□□□ 1.78
Fgd6Q69ZL1 Meig1-204ENSMUST00000115083 567 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.14■■□□□ 1.78
Fgd6Q69ZL1 Gm4459-201ENSMUST00000118750 468 ntBASIC26.14■■□□□ 1.78
Fgd6Q69ZL1 Rab10os-206ENSMUST00000179908 746 ntTSL 5 BASIC26.14■■□□□ 1.78
Fgd6Q69ZL1 Inpp5a-203ENSMUST00000106098 2826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.78
Fgd6Q69ZL1 Cobll1-204ENSMUST00000112430 4917 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.78
Fgd6Q69ZL1 Hoxc13-201ENSMUST00000001700 2461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.77
Fgd6Q69ZL1 Gm12689-201ENSMUST00000094955 1359 ntAPPRIS P1 BASIC26.14■■□□□ 1.77
Fgd6Q69ZL1 Dlg3-201ENSMUST00000000901 4885 ntTSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.77
Fgd6Q69ZL1 Gm3928-201ENSMUST00000121141 1307 ntBASIC26.13■■□□□ 1.77
Fgd6Q69ZL1 Zdhhc16-201ENSMUST00000026154 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
Fgd6Q69ZL1 Suz12-206ENSMUST00000163272 4303 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.13■■□□□ 1.77
Fgd6Q69ZL1 Mgat2-201ENSMUST00000060579 2614 ntAPPRIS P1 BASIC26.13■■□□□ 1.77
Fgd6Q69ZL1 Styxl1-204ENSMUST00000111163 1276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
Fgd6Q69ZL1 Edn3-203ENSMUST00000140908 731 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.13■■□□□ 1.77
Fgd6Q69ZL1 2210408F21Rik-210ENSMUST00000151076 539 ntTSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
Fgd6Q69ZL1 Nap1l1-206ENSMUST00000219143 1365 ntTSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
Fgd6Q69ZL1 Slc25a11-201ENSMUST00000014750 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
Fgd6Q69ZL1 Psmc4-201ENSMUST00000032824 1440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
Fgd6Q69ZL1 Rassf1-204ENSMUST00000122225 1783 ntTSL 5 BASIC26.12■■□□□ 1.77
Fgd6Q69ZL1 Gm14701-201ENSMUST00000117156 348 ntBASIC26.12■■□□□ 1.77
Fgd6Q69ZL1 Rhox2a-202ENSMUST00000173650 735 ntTSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
Fgd6Q69ZL1 Rhox2c-204ENSMUST00000184688 720 ntTSL 5 BASIC26.12■■□□□ 1.77
Fgd6Q69ZL1 Gm8396-201ENSMUST00000057361 823 ntBASIC26.12■■□□□ 1.77
Fgd6Q69ZL1 Dnajb8-201ENSMUST00000061866 990 ntAPPRIS P1 BASIC26.12■■□□□ 1.77
Fgd6Q69ZL1 Slc1a6-201ENSMUST00000005490 2029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
Fgd6Q69ZL1 Mff-208ENSMUST00000160786 1645 ntTSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
Fgd6Q69ZL1 Rap1a-201ENSMUST00000090678 2407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
Fgd6Q69ZL1 Rassf1-202ENSMUST00000093786 1787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
Fgd6Q69ZL1 C630004M23Rik-201ENSMUST00000194765 1682 ntBASIC26.12■■□□□ 1.77
Fgd6Q69ZL1 Lgi2-201ENSMUST00000039750 6456 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
Fgd6Q69ZL1 Cdkn1a-203ENSMUST00000122348 857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
Fgd6Q69ZL1 Gm11025-201ENSMUST00000140773 466 ntBASIC26.11■■□□□ 1.77
Fgd6Q69ZL1 AC174742.1-201ENSMUST00000218272 304 ntBASIC26.11■■□□□ 1.77
Fgd6Q69ZL1 Chka-201ENSMUST00000025760 2319 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.11■■□□□ 1.77
Fgd6Q69ZL1 Matk-201ENSMUST00000105328 2228 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
Fgd6Q69ZL1 Slc39a1-201ENSMUST00000015467 2364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
Fgd6Q69ZL1 1700029J07Rik-202ENSMUST00000098786 1340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
Fgd6Q69ZL1 Rd3-201ENSMUST00000175680 1969 ntTSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
Fgd6Q69ZL1 9530068E07Rik-202ENSMUST00000109057 2472 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
Fgd6Q69ZL1 Dhh-201ENSMUST00000023737 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
Fgd6Q69ZL1 Pdss2-201ENSMUST00000095725 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
Fgd6Q69ZL1 Acaa2-201ENSMUST00000041053 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
Fgd6Q69ZL1 Gm7507-201ENSMUST00000183053 1008 ntBASIC26.1■■□□□ 1.77
Fgd6Q69ZL1 Klk14-201ENSMUST00000056329 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
Fgd6Q69ZL1 Npb-201ENSMUST00000061309 418 ntTSL 3 BASIC26.1■■□□□ 1.77
Fgd6Q69ZL1 Sept10-203ENSMUST00000220156 1821 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
Fgd6Q69ZL1 Mef2b-203ENSMUST00000110143 1312 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
Fgd6Q69ZL1 Mef2b-204ENSMUST00000110146 1342 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
Fgd6Q69ZL1 Psme3-201ENSMUST00000019470 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
Fgd6Q69ZL1 0610040J01Rik-201ENSMUST00000081747 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
Fgd6Q69ZL1 Pan3-201ENSMUST00000031651 5048 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC26.1■■□□□ 1.77
Fgd6Q69ZL1 Gm15442-201ENSMUST00000117905 1527 ntBASIC26.1■■□□□ 1.77
Fgd6Q69ZL1 P2ry2-204ENSMUST00000207916 2372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
Fgd6Q69ZL1 Cpt2-203ENSMUST00000106720 1015 ntTSL 2 BASIC26.09■■□□□ 1.77
Fgd6Q69ZL1 Hsf4-203ENSMUST00000172525 1276 ntTSL 5 BASIC26.09■■□□□ 1.77
Fgd6Q69ZL1 Fau-202ENSMUST00000178310 571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
Fgd6Q69ZL1 1110035H17Rik-202ENSMUST00000205672 1231 ntBASIC26.09■■□□□ 1.77
Fgd6Q69ZL1 1700012D14Rik-201ENSMUST00000209597 605 ntTSL 3 BASIC26.09■■□□□ 1.77
Fgd6Q69ZL1 Scamp5-203ENSMUST00000214256 1025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
Fgd6Q69ZL1 Sfxn5-202ENSMUST00000059034 1081 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
Fgd6Q69ZL1 Rnf7-202ENSMUST00000071301 334 ntTSL 2 BASIC26.09■■□□□ 1.77
Fgd6Q69ZL1 Ak2-202ENSMUST00000102604 1781 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
Fgd6Q69ZL1 Dvl3-203ENSMUST00000171572 2493 ntTSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
Fgd6Q69ZL1 1810062O18Rik-203ENSMUST00000129237 647 ntTSL 5 BASIC26.08■■□□□ 1.77
Fgd6Q69ZL1 Tsc22d1-208ENSMUST00000142683 797 ntTSL 3 BASIC26.08■■□□□ 1.77
Fgd6Q69ZL1 Rpl28-201ENSMUST00000032597 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
Fgd6Q69ZL1 Acyp2-201ENSMUST00000074613 863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
Fgd6Q69ZL1 Smpd5-202ENSMUST00000163991 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
Fgd6Q69ZL1 Cyb561d2-201ENSMUST00000041459 1786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.76
Fgd6Q69ZL1 Slc7a10-201ENSMUST00000001854 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.76
Fgd6Q69ZL1 Kifc3-201ENSMUST00000034240 3277 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.76
Fgd6Q69ZL1 Gm8349-201ENSMUST00000182720 1003 ntBASIC26.07■■□□□ 1.76
Fgd6Q69ZL1 1810008I18Rik-202ENSMUST00000187848 819 ntTSL 3 BASIC26.07■■□□□ 1.76
Fgd6Q69ZL1 Nckipsd-206ENSMUST00000195323 467 ntTSL 3 BASIC26.07■■□□□ 1.76
Fgd6Q69ZL1 AC114585.2-202ENSMUST00000228094 426 ntBASIC26.07■■□□□ 1.76
Fgd6Q69ZL1 1700086L19Rik-201ENSMUST00000095617 706 ntBASIC26.07■■□□□ 1.76
Fgd6Q69ZL1 Bfsp2-201ENSMUST00000124310 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
Fgd6Q69ZL1 Lrrfip1-201ENSMUST00000068116 2050 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.07■■□□□ 1.76
Fgd6Q69ZL1 Phb2-201ENSMUST00000004375 1318 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.07■■□□□ 1.76
Fgd6Q69ZL1 Htr5b-201ENSMUST00000055884 1935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
Fgd6Q69ZL1 Ism1-201ENSMUST00000099307 2944 ntTSL 5 BASIC26.07■■□□□ 1.76
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 41.1 ms