Protein–RNA interactions for Protein: Q69ZF8

Msl2, E3 ubiquitin-protein ligase MSL2, mousemouse

Predictions only

Length 577 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Msl2Q69ZF8 Cyp4f14-202ENSMUST00000179434 2207 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.71□□□□□ -0.05
Msl2Q69ZF8 Cyp4f14-201ENSMUST00000054174 2207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Msl2Q69ZF8 Agbl4-205ENSMUST00000106591 1406 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Msl2Q69ZF8 Atf7-209ENSMUST00000184485 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Msl2Q69ZF8 Zmynd19-201ENSMUST00000028350 3903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Msl2Q69ZF8 Fez2-202ENSMUST00000112487 2020 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
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Msl2Q69ZF8 Mag-201ENSMUST00000040548 2419 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.06
Msl2Q69ZF8 Hoxb4-201ENSMUST00000049241 2566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.06
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Msl2Q69ZF8 2810408A11Rik-203ENSMUST00000102580 1640 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Msl2Q69ZF8 Gnb1-202ENSMUST00000105616 3088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
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Msl2Q69ZF8 Arhgef16-201ENSMUST00000030898 2860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Msl2Q69ZF8 Thsd7a-202ENSMUST00000119581 5678 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.7□□□□□ -0.06
Msl2Q69ZF8 Myb-201ENSMUST00000020158 3074 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
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Msl2Q69ZF8 Ubac2-201ENSMUST00000039803 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Msl2Q69ZF8 Mpst-203ENSMUST00000169133 1309 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.69□□□□□ -0.06
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Msl2Q69ZF8 Syt8-205ENSMUST00000122393 1291 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
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Msl2Q69ZF8 Ripply2-201ENSMUST00000058846 503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
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Msl2Q69ZF8 Plppr5-202ENSMUST00000106473 4294 ntTSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Msl2Q69ZF8 Rgmb-201ENSMUST00000170578 2633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Msl2Q69ZF8 Kdelr2-201ENSMUST00000110731 1829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
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Msl2Q69ZF8 Ccdc17-201ENSMUST00000051869 2003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Msl2Q69ZF8 Sorcs3-201ENSMUST00000078880 5634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Msl2Q69ZF8 Sfrp1-201ENSMUST00000033952 4372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Msl2Q69ZF8 Ankrd22-201ENSMUST00000025686 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Msl2Q69ZF8 Mpdu1-201ENSMUST00000018905 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Msl2Q69ZF8 Epha10-201ENSMUST00000059343 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Msl2Q69ZF8 Gbe1-206ENSMUST00000170464 2736 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.67□□□□□ -0.06
Msl2Q69ZF8 Gm16499-203ENSMUST00000204633 2177 ntBASIC14.67□□□□□ -0.06
Msl2Q69ZF8 Pacsin1-203ENSMUST00000114872 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Msl2Q69ZF8 Pld2-203ENSMUST00000108557 3655 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Msl2Q69ZF8 Prdm11-201ENSMUST00000111272 3012 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.67□□□□□ -0.06
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Msl2Q69ZF8 Mbp-201ENSMUST00000047865 2492 ntTSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 19.3 ms