Protein–RNA interactions for Protein: Q68FG2

Sptbn2, Spectrin beta chain, mousemouse

Predictions only

Length 2,388 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sptbn2Q68FG2 Mier2-212ENSMUST00000172158 1400 ntTSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Sptbn2Q68FG2 Gm13830-205ENSMUST00000201195 1155 ntBASIC15.15■□□□□ 0.02
Sptbn2Q68FG2 Supv3l1-201ENSMUST00000020273 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Sptbn2Q68FG2 Bptf-201ENSMUST00000057892 11488 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Sptbn2Q68FG2 Tmem125-201ENSMUST00000060214 1864 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Sptbn2Q68FG2 Fgf3-201ENSMUST00000105898 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Sptbn2Q68FG2 Cnih3-202ENSMUST00000161880 1995 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Sptbn2Q68FG2 Wnk2-202ENSMUST00000049265 6738 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Sptbn2Q68FG2 Gapvd1-201ENSMUST00000028224 5695 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Sptbn2Q68FG2 Leng1-201ENSMUST00000019878 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Sptbn2Q68FG2 Klk6-202ENSMUST00000107967 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Sptbn2Q68FG2 Tm4sf19-201ENSMUST00000115149 1257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Sptbn2Q68FG2 Gm15165-201ENSMUST00000118140 502 ntBASIC15.14■□□□□ 0.01
Sptbn2Q68FG2 Gm26854-201ENSMUST00000180418 705 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Sptbn2Q68FG2 Tm4sf5-201ENSMUST00000019063 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Sptbn2Q68FG2 Gm37280-201ENSMUST00000194583 375 ntTSL 3 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Sptbn2Q68FG2 Vsig2-201ENSMUST00000002008 1166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Sptbn2Q68FG2 Exoc5-206ENSMUST00000161504 2582 ntTSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Sptbn2Q68FG2 Aldh2-202ENSMUST00000129753 1799 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Sptbn2Q68FG2 Gm26608-201ENSMUST00000180740 1954 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Sptbn2Q68FG2 Ccnd3-218ENSMUST00000183177 2060 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Sptbn2Q68FG2 Ulk2-201ENSMUST00000004920 5743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Sptbn2Q68FG2 Ovol2-202ENSMUST00000103171 1547 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Sptbn2Q68FG2 Psmc4-206ENSMUST00000140053 1244 ntTSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Sptbn2Q68FG2 A830031A19Rik-201ENSMUST00000068360 757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Sptbn2Q68FG2 Nck2-201ENSMUST00000086421 2772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Sptbn2Q68FG2 Meis3-205ENSMUST00000176506 1839 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Sptbn2Q68FG2 Dlgap1-209ENSMUST00000140728 2173 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Sptbn2Q68FG2 Iqck-206ENSMUST00000208658 2891 ntBASIC15.13■□□□□ 0.01
Sptbn2Q68FG2 Sox18-201ENSMUST00000054491 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Sptbn2Q68FG2 Rpl28-201ENSMUST00000032597 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Sptbn2Q68FG2 Msantd3-202ENSMUST00000064807 1378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Sptbn2Q68FG2 Serac1-201ENSMUST00000024570 2033 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Sptbn2Q68FG2 4930560O18Rik-201ENSMUST00000207051 1595 ntBASIC15.13■□□□□ 0.01
Sptbn2Q68FG2 Krt13-201ENSMUST00000007275 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Sptbn2Q68FG2 Krt87-201ENSMUST00000081945 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Sptbn2Q68FG2 Zfp710-201ENSMUST00000049680 4721 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Sptbn2Q68FG2 Tk2-201ENSMUST00000050211 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Sptbn2Q68FG2 Tmc6-202ENSMUST00000103025 1279 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Sptbn2Q68FG2 Sec22b-202ENSMUST00000122288 1177 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Sptbn2Q68FG2 Gm26308-201ENSMUST00000157768 69 ntBASIC15.13■□□□□ 0.01
Sptbn2Q68FG2 Commd5-201ENSMUST00000068407 1037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Sptbn2Q68FG2 Dupd1-201ENSMUST00000073870 1138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Sptbn2Q68FG2 Snupn-201ENSMUST00000068856 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Sptbn2Q68FG2 Tspan31-201ENSMUST00000060991 1556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Sptbn2Q68FG2 AC122901.1-201ENSMUST00000214203 1790 ntBASIC15.13■□□□□ 0.01
Sptbn2Q68FG2 Usp35-202ENSMUST00000168435 3982 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Sptbn2Q68FG2 AC154855.1-201ENSMUST00000227353 1458 ntBASIC15.12■□□□□ 0.01
Sptbn2Q68FG2 Dnajc2-202ENSMUST00000115192 1132 ntTSL 2 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Sptbn2Q68FG2 H2af-ps-201ENSMUST00000119066 295 ntBASIC15.12■□□□□ 0.01
Sptbn2Q68FG2 AC151286.1-201ENSMUST00000198489 145 ntBASIC15.12■□□□□ 0.01
Sptbn2Q68FG2 Gm44662-201ENSMUST00000206970 412 ntTSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Sptbn2Q68FG2 Psmg3-201ENSMUST00000031531 883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Sptbn2Q68FG2 Itsn2-201ENSMUST00000062580 5987 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Sptbn2Q68FG2 Irak1bp1-202ENSMUST00000113245 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Sptbn2Q68FG2 Gm14221-202ENSMUST00000209603 1437 ntTSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Sptbn2Q68FG2 Chrm4-201ENSMUST00000045537 1440 ntAPPRIS P1 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Sptbn2Q68FG2 St7l-201ENSMUST00000059271 5728 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Sptbn2Q68FG2 Tyro3-201ENSMUST00000028763 3989 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Sptbn2Q68FG2 Stk35-201ENSMUST00000165413 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Sptbn2Q68FG2 Gm9725-202ENSMUST00000166229 2326 ntTSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Sptbn2Q68FG2 Tm9sf2-203ENSMUST00000171318 1494 ntTSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Sptbn2Q68FG2 Fst-202ENSMUST00000223640 2612 ntBASIC15.12■□□□□ 0.01
Sptbn2Q68FG2 BC017158-201ENSMUST00000033044 2627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Sptbn2Q68FG2 Rnf157-202ENSMUST00000106398 4553 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Sptbn2Q68FG2 Otud7a-201ENSMUST00000058476 3483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Sptbn2Q68FG2 1810062O18Rik-203ENSMUST00000129237 647 ntTSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Sptbn2Q68FG2 Gm19553-201ENSMUST00000175723 494 ntTSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Sptbn2Q68FG2 AC154222.1-201ENSMUST00000223882 475 ntBASIC15.12■□□□□ 0.01
Sptbn2Q68FG2 Wdyhv1-204ENSMUST00000226955 1094 ntBASIC15.12■□□□□ 0.01
Sptbn2Q68FG2 Erp27-201ENSMUST00000032343 1029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Sptbn2Q68FG2 Gm5617-201ENSMUST00000048824 531 ntAPPRIS P1 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Sptbn2Q68FG2 Fmr1nb-201ENSMUST00000069731 799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Sptbn2Q68FG2 Cenpw-201ENSMUST00000099985 1532 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Sptbn2Q68FG2 Arl4c-203ENSMUST00000187810 2740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Sptbn2Q68FG2 Trp73-203ENSMUST00000105643 1916 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Sptbn2Q68FG2 Slc30a4-202ENSMUST00000099457 3170 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Sptbn2Q68FG2 Gm12359-201ENSMUST00000139017 1399 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Sptbn2Q68FG2 Cask-201ENSMUST00000033321 4057 ntTSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Sptbn2Q68FG2 Gm12216-201ENSMUST00000117316 1152 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Sptbn2Q68FG2 Gm16845-202ENSMUST00000216270 567 ntTSL 2 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Sptbn2Q68FG2 Hist1h1a-201ENSMUST00000055770 741 ntAPPRIS P1 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Sptbn2Q68FG2 Chrm3-202ENSMUST00000187510 4336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Sptbn2Q68FG2 2410002F23Rik-217ENSMUST00000188111 2131 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Sptbn2Q68FG2 Eif2b4-203ENSMUST00000166769 1878 ntTSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Sptbn2Q68FG2 Kbtbd13-201ENSMUST00000068307 2969 ntAPPRIS P1 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Sptbn2Q68FG2 Bola3-202ENSMUST00000120040 583 ntTSL 3 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Sptbn2Q68FG2 Smim22-208ENSMUST00000185147 399 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Sptbn2Q68FG2 Krtap9-3-201ENSMUST00000062683 759 ntAPPRIS P1 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Sptbn2Q68FG2 Ptges2-201ENSMUST00000028162 4978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Sptbn2Q68FG2 Nol4l-201ENSMUST00000035346 6399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Sptbn2Q68FG2 Cdk5r2-201ENSMUST00000160379 2799 ntAPPRIS P1 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Sptbn2Q68FG2 Gm14140-201ENSMUST00000119999 995 ntBASIC15.1■□□□□ 0.01
Sptbn2Q68FG2 Gm16838-201ENSMUST00000144594 816 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Sptbn2Q68FG2 Rprl3-201ENSMUST00000157400 290 ntBASIC15.1■□□□□ 0.01
Sptbn2Q68FG2 Gm27321-201ENSMUST00000185021 205 ntBASIC15.1■□□□□ 0.01
Sptbn2Q68FG2 Lin37-201ENSMUST00000043975 998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Sptbn2Q68FG2 Ptpra-201ENSMUST00000028769 3227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Sptbn2Q68FG2 Amfr-201ENSMUST00000053766 3880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Sptbn2Q68FG2 Abat-202ENSMUST00000115838 1348 ntTSL 2 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 30.5 ms