Protein–RNA interactions for Protein: Q68EF0

Rab3ip, Rab-3A-interacting protein, mousemouse

Predictions only

Length 428 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rab3ipQ68EF0 Ppp1r35-201ENSMUST00000031739 956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Rab3ipQ68EF0 Srpr-201ENSMUST00000034541 2993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Rab3ipQ68EF0 Igfbp7-201ENSMUST00000046746 1116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Rab3ipQ68EF0 Ptrh1-201ENSMUST00000066352 952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Rab3ipQ68EF0 Spaca1-202ENSMUST00000084734 1149 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Rab3ipQ68EF0 Pias4-201ENSMUST00000005064 2571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Rab3ipQ68EF0 Lhx8-205ENSMUST00000205251 1729 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Rab3ipQ68EF0 Nosip-201ENSMUST00000003513 1814 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
Rab3ipQ68EF0 Adamtsl1-201ENSMUST00000048885 1842 ntTSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.14
Rab3ipQ68EF0 Taf6l-212ENSMUST00000177216 2167 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.14
Rab3ipQ68EF0 Wipf3-204ENSMUST00000132855 4516 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.14
Rab3ipQ68EF0 Tmtc4-204ENSMUST00000126867 2952 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.14
Rab3ipQ68EF0 Arpc5-201ENSMUST00000077755 1914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
Rab3ipQ68EF0 Gm36858-201ENSMUST00000194501 2391 ntBASIC15.95■□□□□ 0.14
Rab3ipQ68EF0 Dlg5-202ENSMUST00000073687 7784 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Rab3ipQ68EF0 Tlnrd1-201ENSMUST00000094216 4433 ntAPPRIS P1 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Rab3ipQ68EF0 Shroom3-203ENSMUST00000113055 6765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Rab3ipQ68EF0 Ccdc84-202ENSMUST00000213813 2675 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Rab3ipQ68EF0 Atp6v1g2-201ENSMUST00000068261 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Rab3ipQ68EF0 Nr1h2-203ENSMUST00000107911 1988 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Rab3ipQ68EF0 Gramd3-201ENSMUST00000070166 2605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Rab3ipQ68EF0 Nkx6-2-202ENSMUST00000106095 1299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Rab3ipQ68EF0 C1qtnf4-201ENSMUST00000111466 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Rab3ipQ68EF0 Ramp1-202ENSMUST00000165855 852 ntTSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Rab3ipQ68EF0 Hikeshi-201ENSMUST00000075010 715 ntTSL 3 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Rab3ipQ68EF0 Cbl-204ENSMUST00000205968 2809 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Rab3ipQ68EF0 Gm26526-201ENSMUST00000181075 2927 ntTSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Rab3ipQ68EF0 Npffr1-201ENSMUST00000020287 3479 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Rab3ipQ68EF0 Slc43a1-202ENSMUST00000111624 2556 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Rab3ipQ68EF0 Rab22a-201ENSMUST00000029024 7155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Rab3ipQ68EF0 Stambpl1-201ENSMUST00000054956 2024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Rab3ipQ68EF0 Pla2g12a-201ENSMUST00000029629 1561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Rab3ipQ68EF0 Ctnna2-205ENSMUST00000161846 4018 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Rab3ipQ68EF0 Bri3bp-201ENSMUST00000049040 6473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Rab3ipQ68EF0 Tmem150b-202ENSMUST00000086364 2822 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Rab3ipQ68EF0 Qprt-201ENSMUST00000032912 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Rab3ipQ68EF0 Pank3-201ENSMUST00000018990 7376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Rab3ipQ68EF0 Klhl25-203ENSMUST00000205612 1343 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Rab3ipQ68EF0 Hmx2-202ENSMUST00000183219 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Rab3ipQ68EF0 Cdh11-201ENSMUST00000075190 5647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Rab3ipQ68EF0 Cog8-202ENSMUST00000095517 4476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Rab3ipQ68EF0 Irs2-201ENSMUST00000040514 6323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Rab3ipQ68EF0 Mbtps2-201ENSMUST00000058098 4797 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Rab3ipQ68EF0 Bex1-202ENSMUST00000113118 754 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Rab3ipQ68EF0 Zcrb1-208ENSMUST00000162160 850 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Rab3ipQ68EF0 0610010K14Rik-202ENSMUST00000021181 779 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Rab3ipQ68EF0 Gm9959-201ENSMUST00000068277 390 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
Rab3ipQ68EF0 Fscn1-207ENSMUST00000198017 2157 ntTSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Rab3ipQ68EF0 Ralb-201ENSMUST00000004565 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Rab3ipQ68EF0 Zfp326-201ENSMUST00000031227 2667 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Rab3ipQ68EF0 Tdg-ps-201ENSMUST00000051363 2968 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
Rab3ipQ68EF0 Ttll11-202ENSMUST00000112976 3077 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Rab3ipQ68EF0 Kdm7a-201ENSMUST00000002305 9566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Rab3ipQ68EF0 Tor1aip2-205ENSMUST00000111757 6118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Rab3ipQ68EF0 Il6st-206ENSMUST00000183886 3004 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Rab3ipQ68EF0 Rtcb-201ENSMUST00000001834 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Rab3ipQ68EF0 Slc35a1-201ENSMUST00000029970 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Rab3ipQ68EF0 Cdc123-201ENSMUST00000043864 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Rab3ipQ68EF0 Rae1-201ENSMUST00000029013 1742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Rab3ipQ68EF0 Cerkl-205ENSMUST00000143974 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Rab3ipQ68EF0 Art5-201ENSMUST00000094128 1518 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Rab3ipQ68EF0 App-203ENSMUST00000226801 3299 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Rab3ipQ68EF0 Rbck1-202ENSMUST00000109847 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Rab3ipQ68EF0 Cask-204ENSMUST00000115438 8366 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Rab3ipQ68EF0 Ankrd13a-201ENSMUST00000102578 3717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Rab3ipQ68EF0 Mff-212ENSMUST00000162003 2087 ntTSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Rab3ipQ68EF0 Tfap2a-206ENSMUST00000224665 1958 ntAPPRIS ALT1 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Rab3ipQ68EF0 Arhgef40-216ENSMUST00000182760 5130 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Rab3ipQ68EF0 Scrt1-202ENSMUST00000164703 3478 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Rab3ipQ68EF0 H2afx-201ENSMUST00000052686 1384 ntAPPRIS P1 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Rab3ipQ68EF0 Mapt-202ENSMUST00000106988 2202 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Rab3ipQ68EF0 Wac-215ENSMUST00000171042 2205 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Rab3ipQ68EF0 BC004004-202ENSMUST00000120346 1297 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Rab3ipQ68EF0 Gm11837-201ENSMUST00000136992 876 ntTSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Rab3ipQ68EF0 H2-Q5-202ENSMUST00000172979 998 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Rab3ipQ68EF0 CT010467.1-202ENSMUST00000205406 714 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
Rab3ipQ68EF0 AC161180.2-201ENSMUST00000222567 1015 ntAPPRIS P1 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Rab3ipQ68EF0 Sdf2l1-201ENSMUST00000023453 1108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Rab3ipQ68EF0 Gm10306-201ENSMUST00000094969 533 ntAPPRIS P1 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Rab3ipQ68EF0 Mid1ip1-202ENSMUST00000115524 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Rab3ipQ68EF0 Large2-215ENSMUST00000176810 2477 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Rab3ipQ68EF0 Kri1-205ENSMUST00000184326 2490 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Rab3ipQ68EF0 Klhl42-201ENSMUST00000036003 6267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Rab3ipQ68EF0 Tbl1x-201ENSMUST00000088217 5234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Rab3ipQ68EF0 Ttl-201ENSMUST00000035812 4567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Rab3ipQ68EF0 Chgb-201ENSMUST00000028826 2740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Rab3ipQ68EF0 Tmem26-201ENSMUST00000080995 5048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Rab3ipQ68EF0 Kcnq2-217ENSMUST00000149964 8209 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Rab3ipQ68EF0 Tubgcp4-202ENSMUST00000110657 1992 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Rab3ipQ68EF0 Ube2r2-201ENSMUST00000040008 3600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Rab3ipQ68EF0 Gdf1-201ENSMUST00000207684 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Rab3ipQ68EF0 Dtx2-201ENSMUST00000005072 2562 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Rab3ipQ68EF0 Fhl2-201ENSMUST00000008280 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Rab3ipQ68EF0 9530080O11Rik-201ENSMUST00000137239 1475 ntTSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Rab3ipQ68EF0 Pi4kb-202ENSMUST00000107251 2895 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Rab3ipQ68EF0 Gm14281-201ENSMUST00000121700 1294 ntBASIC15.92■□□□□ 0.14
Rab3ipQ68EF0 Vegfa-213ENSMUST00000217017 1179 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Rab3ipQ68EF0 Rasl10a-201ENSMUST00000037218 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Rab3ipQ68EF0 Spg21-201ENSMUST00000034955 2680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Rab3ipQ68EF0 Rab7-203ENSMUST00000113597 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 36.4 ms