Protein–RNA interactions for Protein: Q64310

Surf4, Surfeit locus protein 4, mousemouse

Predictions only

Length 269 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Surf4Q64310 Cdk17-201ENSMUST00000069965 3615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Surf4Q64310 Ccdc106-204ENSMUST00000207974 2492 ntTSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Surf4Q64310 Cox18-201ENSMUST00000048363 1333 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Surf4Q64310 Zic1-202ENSMUST00000065360 2811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Surf4Q64310 Pigz-201ENSMUST00000052174 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Surf4Q64310 Sh2b3-201ENSMUST00000040308 2530 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Surf4Q64310 Trp73-203ENSMUST00000105643 1916 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Surf4Q64310 Nr1h2-213ENSMUST00000167197 1944 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Surf4Q64310 Ctu1-201ENSMUST00000038332 2475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Surf4Q64310 Timm44-201ENSMUST00000003029 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Surf4Q64310 Nsmf-207ENSMUST00000116574 2863 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Surf4Q64310 Lmtk2-201ENSMUST00000041804 8114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Surf4Q64310 Mrps10-203ENSMUST00000119945 1018 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Surf4Q64310 Gm15723-201ENSMUST00000139331 600 ntTSL 3 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Surf4Q64310 4930554G22Rik-201ENSMUST00000196102 686 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
Surf4Q64310 Gm45894-201ENSMUST00000211940 651 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Surf4Q64310 Tmem14c-201ENSMUST00000021790 914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Surf4Q64310 AC166341.7-201ENSMUST00000221698 126 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
Surf4Q64310 Tmem54-201ENSMUST00000030575 1064 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Surf4Q64310 Atg5-201ENSMUST00000039286 2352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Surf4Q64310 Bicdl1-201ENSMUST00000055408 3026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Surf4Q64310 Arid3c-202ENSMUST00000150809 1327 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Surf4Q64310 Ebf1-203ENSMUST00000109268 2864 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Surf4Q64310 Mtcp1-201ENSMUST00000033542 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Surf4Q64310 Ran-201ENSMUST00000031383 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Surf4Q64310 Inppl1-201ENSMUST00000035836 4995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Surf4Q64310 Adamtsl1-201ENSMUST00000048885 1842 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Surf4Q64310 Tnks-201ENSMUST00000033929 9163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Surf4Q64310 Nox4-202ENSMUST00000068829 1861 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Surf4Q64310 Lrrc36-206ENSMUST00000216765 2301 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Surf4Q64310 Rbm39-202ENSMUST00000109584 667 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Surf4Q64310 Vkorc1-202ENSMUST00000119922 387 ntTSL 3 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Surf4Q64310 Gm6270-201ENSMUST00000132731 559 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Surf4Q64310 Tspan2-203ENSMUST00000196611 682 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Surf4Q64310 Gm5297-201ENSMUST00000198555 1171 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
Surf4Q64310 Grp-201ENSMUST00000025395 862 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Surf4Q64310 Fosl1-201ENSMUST00000025850 1707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Surf4Q64310 Lhfpl4-201ENSMUST00000162280 4762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Surf4Q64310 Ppp2r1b-204ENSMUST00000174628 2195 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Surf4Q64310 Shc1-202ENSMUST00000094378 2617 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Surf4Q64310 Txndc11-201ENSMUST00000038424 3095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Surf4Q64310 Gm21596-201ENSMUST00000178049 1316 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
Surf4Q64310 Zkscan2-203ENSMUST00000128217 2218 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Surf4Q64310 Zmiz1-201ENSMUST00000007961 5397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Surf4Q64310 Dlgap4-205ENSMUST00000109567 4840 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Surf4Q64310 Arhgef10-201ENSMUST00000084207 5528 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Surf4Q64310 Mfsd12-201ENSMUST00000044844 3971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Surf4Q64310 Krt84-201ENSMUST00000023720 2570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Surf4Q64310 Rnf38-203ENSMUST00000102934 5240 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Surf4Q64310 Ccdc126-201ENSMUST00000055559 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Surf4Q64310 Impdh1-202ENSMUST00000159124 2600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Surf4Q64310 Nipsnap1-201ENSMUST00000038570 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Surf4Q64310 Uts2r-201ENSMUST00000039044 1703 ntAPPRIS P1 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Surf4Q64310 Mst1-204ENSMUST00000162886 2209 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Surf4Q64310 Pex11a-201ENSMUST00000032761 2241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Surf4Q64310 Pnpt1-201ENSMUST00000020756 2707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Surf4Q64310 Whrn-201ENSMUST00000063650 4016 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Surf4Q64310 Poglut1-201ENSMUST00000036210 2758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Surf4Q64310 Dtx2-203ENSMUST00000111144 2545 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Surf4Q64310 Nptx2-201ENSMUST00000071782 2536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Surf4Q64310 Ptprd-206ENSMUST00000107289 9899 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Surf4Q64310 Gm11249-201ENSMUST00000117071 859 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
Surf4Q64310 Lrfn1-202ENSMUST00000108288 3060 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Surf4Q64310 Usp47-201ENSMUST00000106653 5540 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Surf4Q64310 Bcor-202ENSMUST00000065143 6839 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Surf4Q64310 Htr5b-201ENSMUST00000055884 1935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Surf4Q64310 Zdhhc2-201ENSMUST00000049389 3381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Surf4Q64310 Gm18336-201ENSMUST00000180787 2298 ntAPPRIS P1 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Surf4Q64310 Ikbke-204ENSMUST00000161764 2867 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Surf4Q64310 Ppm1d-201ENSMUST00000020835 2899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Surf4Q64310 Pid1-201ENSMUST00000168574 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Surf4Q64310 Eva1c-202ENSMUST00000099543 1554 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Surf4Q64310 Carmil2-201ENSMUST00000062574 2526 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Surf4Q64310 Ankra2-204ENSMUST00000150352 2217 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Surf4Q64310 Bex3-202ENSMUST00000113112 826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Surf4Q64310 Gm12896-201ENSMUST00000118430 226 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
Surf4Q64310 D330023K18Rik-201ENSMUST00000133550 920 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Surf4Q64310 1110065P20Rik-203ENSMUST00000137769 659 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Surf4Q64310 Cdk2ap2-201ENSMUST00000025779 1080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Surf4Q64310 4930432B10Rik-202ENSMUST00000181330 1612 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Surf4Q64310 Slc46a1-201ENSMUST00000001126 1978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Surf4Q64310 Gm26917-202ENSMUST00000192833 3329 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
Surf4Q64310 Syngap1-204ENSMUST00000194598 6011 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Surf4Q64310 Cacna1b-204ENSMUST00000102939 9736 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Surf4Q64310 Rhot1-201ENSMUST00000017831 3029 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Surf4Q64310 Klhl40-201ENSMUST00000098272 2370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Surf4Q64310 B3gnt6-201ENSMUST00000098278 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Surf4Q64310 Pitx3-201ENSMUST00000026259 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Surf4Q64310 Mrps23-203ENSMUST00000118784 1404 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Surf4Q64310 Xiap-203ENSMUST00000115094 6542 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Surf4Q64310 Acbd3-201ENSMUST00000027780 3471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
Surf4Q64310 Fhl2-201ENSMUST00000008280 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
Surf4Q64310 Gm17509-201ENSMUST00000165680 2375 ntAPPRIS P1 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Surf4Q64310 Tsnax-201ENSMUST00000075896 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Surf4Q64310 Elk4-202ENSMUST00000086556 4433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Surf4Q64310 2810408A11Rik-203ENSMUST00000102580 1640 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Surf4Q64310 BC029722-201ENSMUST00000124586 1615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Surf4Q64310 Klhl33-201ENSMUST00000164415 1602 ntTSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Surf4Q64310 Tmc6-202ENSMUST00000103025 1279 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Surf4Q64310 Was-201ENSMUST00000033505 2114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 37.3 ms