Protein–RNA interactions for Protein: Q640N4

Zfp248, Zinc finger protein 248, mousemouse

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Length 576 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Zfp248Q640N4 Adnp2-201ENSMUST00000066743 5012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
Zfp248Q640N4 Atp8a1-204ENSMUST00000113652 854 ntTSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
Zfp248Q640N4 Spata3-208ENSMUST00000149469 1110 ntTSL 5 BASIC12.93□□□□□ -0.34
Zfp248Q640N4 Arpc4-202ENSMUST00000171058 695 ntTSL 5 BASIC12.93□□□□□ -0.34
Zfp248Q640N4 H2-K2-201ENSMUST00000174250 1049 ntBASIC12.93□□□□□ -0.34
Zfp248Q640N4 Park7-201ENSMUST00000030805 908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
Zfp248Q640N4 Gm11273-201ENSMUST00000044043 390 ntAPPRIS P1 BASIC12.93□□□□□ -0.34
Zfp248Q640N4 Ly6g6d-201ENSMUST00000007259 546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
Zfp248Q640N4 Coq8b-202ENSMUST00000108378 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
Zfp248Q640N4 Nrbp1-207ENSMUST00000202576 2221 ntTSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
Zfp248Q640N4 Nrbp1-201ENSMUST00000031034 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
Zfp248Q640N4 Lrig3-201ENSMUST00000074807 4016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
Zfp248Q640N4 Zmynd19-201ENSMUST00000028350 3903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
Zfp248Q640N4 Irgc1-204ENSMUST00000205776 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
Zfp248Q640N4 Tbxas1-201ENSMUST00000003017 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
Zfp248Q640N4 Rnf168-203ENSMUST00000171474 4460 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
Zfp248Q640N4 Tlk2-204ENSMUST00000106941 3699 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
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Zfp248Q640N4 BC029722-201ENSMUST00000124586 1615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
Zfp248Q640N4 Rbmxl1-202ENSMUST00000211719 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
Zfp248Q640N4 Pprc1-203ENSMUST00000111899 5246 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
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Zfp248Q640N4 Tpgs1-201ENSMUST00000020552 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
Zfp248Q640N4 Fiz1-208ENSMUST00000208944 2306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
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Zfp248Q640N4 Spi1-201ENSMUST00000002180 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
Zfp248Q640N4 Thap3-201ENSMUST00000036680 1124 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
Zfp248Q640N4 Agps-201ENSMUST00000047232 7359 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
Zfp248Q640N4 Tmtc4-209ENSMUST00000148661 2719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
Zfp248Q640N4 Slc2a8-201ENSMUST00000028129 2108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
Zfp248Q640N4 Sept10-203ENSMUST00000220156 1821 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
Zfp248Q640N4 Mmd-202ENSMUST00000107887 1654 ntTSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
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Zfp248Q640N4 Zfp281-201ENSMUST00000047734 4933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
Zfp248Q640N4 Mms22l-202ENSMUST00000108222 4478 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.92□□□□□ -0.34
Zfp248Q640N4 Tbx21-201ENSMUST00000001484 2488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
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Zfp248Q640N4 Parg-201ENSMUST00000022470 4413 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
Zfp248Q640N4 4930461C15Rik-201ENSMUST00000133622 1302 ntTSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
Zfp248Q640N4 Slmap-212ENSMUST00000139075 4508 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
Zfp248Q640N4 Smim3-201ENSMUST00000042710 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
Zfp248Q640N4 Rb1cc1-201ENSMUST00000027040 7607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
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Zfp248Q640N4 Tbc1d9-201ENSMUST00000034145 4631 ntTSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
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Zfp248Q640N4 Zufsp-202ENSMUST00000218055 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
Zfp248Q640N4 Cct6b-201ENSMUST00000021040 1787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
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Zfp248Q640N4 Ctla2a-201ENSMUST00000021880 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
Zfp248Q640N4 Hps5-202ENSMUST00000107653 4702 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
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Zfp248Q640N4 Rb1-201ENSMUST00000022701 4656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
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Zfp248Q640N4 Vps37d-202ENSMUST00000076203 1286 ntTSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
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Zfp248Q640N4 Atp8b2-210ENSMUST00000168276 4265 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.9□□□□□ -0.34
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Zfp248Q640N4 Ilk-212ENSMUST00000163389 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
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Zfp248Q640N4 Sipa1l1-202ENSMUST00000166429 8215 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
Zfp248Q640N4 A930017K11Rik-201ENSMUST00000162431 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
Zfp248Q640N4 Nrxn2-202ENSMUST00000113458 3503 ntTSL 5 BASIC12.89□□□□□ -0.35
Zfp248Q640N4 Zfand5-201ENSMUST00000025659 2834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
Zfp248Q640N4 Adrb3-202ENSMUST00000117565 1336 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
Zfp248Q640N4 Nsun5-201ENSMUST00000000940 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
Zfp248Q640N4 Sars2-201ENSMUST00000094632 1868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
Zfp248Q640N4 Fam109a-203ENSMUST00000198271 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
Zfp248Q640N4 Tbc1d12-201ENSMUST00000037302 4209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
Zfp248Q640N4 Ado-201ENSMUST00000075686 4445 ntAPPRIS P1 BASIC12.89□□□□□ -0.35
Zfp248Q640N4 Luc7l2-208ENSMUST00000161538 4253 ntTSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
Zfp248Q640N4 Tmc6-202ENSMUST00000103025 1279 ntTSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
Zfp248Q640N4 Gm9694-201ENSMUST00000193347 1189 ntBASIC12.89□□□□□ -0.35
Zfp248Q640N4 Gm43183-201ENSMUST00000200632 547 ntBASIC12.89□□□□□ -0.35
Zfp248Q640N4 AC135637.1-201ENSMUST00000227750 365 ntBASIC12.89□□□□□ -0.35
Zfp248Q640N4 H2-Eb1-201ENSMUST00000074557 1184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
Zfp248Q640N4 Ick-201ENSMUST00000009972 873 ntTSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
Zfp248Q640N4 C030014I23Rik-201ENSMUST00000080911 1810 ntBASIC12.89□□□□□ -0.35
Zfp248Q640N4 Slc35e3-201ENSMUST00000079041 3489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
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