Protein–RNA interactions for Protein: Q62468

Vil1, Villin-1, mousemouse

Predictions only

Length 827 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Vil1Q62468 Cdkl3-207ENSMUST00000109080 2749 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
Vil1Q62468 Tob1-201ENSMUST00000041589 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
Vil1Q62468 Higd1b-202ENSMUST00000107072 497 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.03■□□□□ 0.8
Vil1Q62468 Higd1b-203ENSMUST00000107073 530 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.03■□□□□ 0.8
Vil1Q62468 Gm11729-201ENSMUST00000124901 713 ntTSL 3 BASIC20.03■□□□□ 0.8
Vil1Q62468 Higd1b-201ENSMUST00000021302 735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
Vil1Q62468 Hist1h2ak-201ENSMUST00000074752 393 ntAPPRIS P1 BASIC20.03■□□□□ 0.8
Vil1Q62468 Gm10190-201ENSMUST00000086549 324 ntAPPRIS P1 BASIC20.03■□□□□ 0.8
Vil1Q62468 Nbn-201ENSMUST00000029879 2533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
Vil1Q62468 Six3-203ENSMUST00000176081 3680 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
Vil1Q62468 Ogfod3-201ENSMUST00000026169 1308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
Vil1Q62468 Ovol2-202ENSMUST00000103171 1547 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
Vil1Q62468 Nsmf-206ENSMUST00000114388 2781 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
Vil1Q62468 Rilpl1-201ENSMUST00000062153 2249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
Vil1Q62468 Gm9725-202ENSMUST00000166229 2326 ntTSL 5 BASIC20.02■□□□□ 0.8
Vil1Q62468 Anapc5-205ENSMUST00000197074 2413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
Vil1Q62468 Anapc5-212ENSMUST00000199406 2413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
Vil1Q62468 Golga5-202ENSMUST00000179218 2827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
Vil1Q62468 Selenoh-201ENSMUST00000102646 783 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
Vil1Q62468 Cabp2-205ENSMUST00000162908 911 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
Vil1Q62468 Selenoh-206ENSMUST00000189988 390 ntTSL 3 BASIC20.02■□□□□ 0.8
Vil1Q62468 Gm2756-201ENSMUST00000195851 400 ntBASIC20.02■□□□□ 0.8
Vil1Q62468 Cyba-202ENSMUST00000212600 638 ntTSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
Vil1Q62468 Kcng4-202ENSMUST00000164382 1875 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.02■□□□□ 0.8
Vil1Q62468 Cdca4-202ENSMUST00000220899 1994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
Vil1Q62468 Evc-202ENSMUST00000114148 2119 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.79
Vil1Q62468 Zdhhc16-201ENSMUST00000026154 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.79
Vil1Q62468 Gss-203ENSMUST00000130881 1724 ntTSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.79
Vil1Q62468 Hdhd2-202ENSMUST00000097521 1716 ntTSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.79
Vil1Q62468 Zcchc24-201ENSMUST00000069180 4556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.79
Vil1Q62468 Igfbpl1-201ENSMUST00000044297 2864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
Vil1Q62468 Lrriq4-203ENSMUST00000172350 1797 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.01■□□□□ 0.79
Vil1Q62468 Ubb-201ENSMUST00000019649 1499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
Vil1Q62468 2410004I01Rik-201ENSMUST00000138424 1187 ntTSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
Vil1Q62468 Tpt1-205ENSMUST00000142061 996 ntTSL 5 BASIC20.01■□□□□ 0.79
Vil1Q62468 Gm11750-201ENSMUST00000146016 583 ntTSL 5 BASIC20.01■□□□□ 0.79
Vil1Q62468 Csrp3-202ENSMUST00000167786 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
Vil1Q62468 Anapc15-202ENSMUST00000035395 836 ntTSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
Vil1Q62468 Mapre3-201ENSMUST00000031058 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
Vil1Q62468 Secisbp2-202ENSMUST00000110044 1915 ntTSL 2 BASIC20.01■□□□□ 0.79
Vil1Q62468 Casp8-204ENSMUST00000191201 1849 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.01■□□□□ 0.79
Vil1Q62468 Ythdc1-202ENSMUST00000119339 3222 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.01■□□□□ 0.79
Vil1Q62468 Znrf1-205ENSMUST00000172856 4600 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.01■□□□□ 0.79
Vil1Q62468 Matn4-204ENSMUST00000109359 2179 ntTSL 5 BASIC20.01■□□□□ 0.79
Vil1Q62468 Madcam1-201ENSMUST00000020554 1436 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
Vil1Q62468 Tmem121b-201ENSMUST00000178687 4869 ntAPPRIS P1 BASIC20.01■□□□□ 0.79
Vil1Q62468 Cops6-201ENSMUST00000019638 1787 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
Vil1Q62468 Cnot11-201ENSMUST00000003219 3162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
Vil1Q62468 Nexmif-201ENSMUST00000056502 5211 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
Vil1Q62468 Klhl36-201ENSMUST00000034287 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
Vil1Q62468 Polr3h-201ENSMUST00000023113 2514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
Vil1Q62468 Nr1h3-202ENSMUST00000111354 1738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
Vil1Q62468 Elac2-201ENSMUST00000071891 2771 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
Vil1Q62468 Rpl39l-202ENSMUST00000121292 550 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20■□□□□ 0.79
Vil1Q62468 Gm42670-201ENSMUST00000201816 1292 ntBASIC20■□□□□ 0.79
Vil1Q62468 Ap2s1-204ENSMUST00000205607 372 ntTSL 3 BASIC20■□□□□ 0.79
Vil1Q62468 AC159641.1-201ENSMUST00000221117 177 ntTSL 3 BASIC20■□□□□ 0.79
Vil1Q62468 Rbfox2-207ENSMUST00000227533 1041 ntBASIC20■□□□□ 0.79
Vil1Q62468 Gpank1-201ENSMUST00000052167 1295 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
Vil1Q62468 Lce1l-201ENSMUST00000054426 670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
Vil1Q62468 Aurkaip1-201ENSMUST00000084097 1159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
Vil1Q62468 Psma5-201ENSMUST00000090569 1239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
Vil1Q62468 Pik3ip1-202ENSMUST00000093399 1098 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
Vil1Q62468 Zkscan14-201ENSMUST00000031632 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
Vil1Q62468 Mycl-202ENSMUST00000106252 3293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
Vil1Q62468 Matk-201ENSMUST00000105328 2228 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
Vil1Q62468 Gm35558-201ENSMUST00000222675 2219 ntBASIC20■□□□□ 0.79
Vil1Q62468 Eif4a2-201ENSMUST00000023599 2208 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
Vil1Q62468 Spg7-209ENSMUST00000149248 2896 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
Vil1Q62468 Aebp2-202ENSMUST00000087614 3727 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
Vil1Q62468 Maml1-201ENSMUST00000059458 5528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
Vil1Q62468 Gm4779-203ENSMUST00000147742 1991 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.99■□□□□ 0.79
Vil1Q62468 Rnf26-201ENSMUST00000056328 2724 ntAPPRIS P2 BASIC19.99■□□□□ 0.79
Vil1Q62468 Ccdc24-201ENSMUST00000106422 1365 ntTSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
Vil1Q62468 Kcnn1-207ENSMUST00000212509 1608 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.99■□□□□ 0.79
Vil1Q62468 Arl4a-201ENSMUST00000101472 1200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
Vil1Q62468 Gm23935-201ENSMUST00000102303 57 ntBASIC19.99■□□□□ 0.79
Vil1Q62468 Gm24270-201ENSMUST00000102326 57 ntBASIC19.99■□□□□ 0.79
Vil1Q62468 Get4-202ENSMUST00000110878 1180 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
Vil1Q62468 Izumo1r-203ENSMUST00000117620 1095 ntTSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
Vil1Q62468 Gm24245-201ENSMUST00000157318 57 ntBASIC19.99■□□□□ 0.79
Vil1Q62468 Sox2ot-202ENSMUST00000196058 753 ntTSL 3 BASIC19.99■□□□□ 0.79
Vil1Q62468 Methig1-201ENSMUST00000075675 1029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
Vil1Q62468 Gm14261-201ENSMUST00000145105 1429 ntTSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
Vil1Q62468 Azi2-207ENSMUST00000134433 2499 ntTSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
Vil1Q62468 Hirip3-201ENSMUST00000037248 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
Vil1Q62468 Mrpl15-203ENSMUST00000130201 1894 ntTSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
Vil1Q62468 Stx2-201ENSMUST00000031378 2939 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
Vil1Q62468 Mast4-202ENSMUST00000164111 2350 ntTSL 2 BASIC19.98■□□□□ 0.79
Vil1Q62468 B9d2-201ENSMUST00000108403 1021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
Vil1Q62468 Cnbp-202ENSMUST00000113617 952 ntTSL 5 BASIC19.98■□□□□ 0.79
Vil1Q62468 Sec22b-202ENSMUST00000122288 1177 ntTSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
Vil1Q62468 Ubl5-204ENSMUST00000160682 489 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.98■□□□□ 0.79
Vil1Q62468 1810010D01Rik-204ENSMUST00000208788 889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
Vil1Q62468 Gm40513-201ENSMUST00000217258 411 ntTSL 3 BASIC19.98■□□□□ 0.79
Vil1Q62468 Pecr-202ENSMUST00000097698 932 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
Vil1Q62468 Gm8909-203ENSMUST00000173353 1428 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.98■□□□□ 0.79
Vil1Q62468 Anapc5-203ENSMUST00000196640 2422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
Vil1Q62468 Usf2-201ENSMUST00000058860 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
Vil1Q62468 Zdhhc6-207ENSMUST00000224897 2168 ntAPPRIS P1 BASIC19.98■□□□□ 0.79
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 23.2 ms