Protein–RNA interactions for Protein: Q62443

Nptx1, Neuronal pentraxin-1, mousemouse

Predictions only

Length 432 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nptx1Q62443 Sh3yl1-202ENSMUST00000110880 1601 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Nptx1Q62443 Serbp1-203ENSMUST00000203077 1617 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Nptx1Q62443 Zfp326-201ENSMUST00000031227 2667 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Nptx1Q62443 Urgcp-206ENSMUST00000170116 5528 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Nptx1Q62443 Cct6b-201ENSMUST00000021040 1787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Nptx1Q62443 Bcat2-201ENSMUST00000033098 1772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Nptx1Q62443 Snrnp48-201ENSMUST00000091641 1785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Nptx1Q62443 Tia1-203ENSMUST00000095754 1789 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Nptx1Q62443 Eml2-201ENSMUST00000048502 2275 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Nptx1Q62443 Sgsm2-202ENSMUST00000081799 4873 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Nptx1Q62443 Heyl-201ENSMUST00000040821 4537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Nptx1Q62443 Mettl21a-201ENSMUST00000053469 2666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Nptx1Q62443 Gpr161-202ENSMUST00000178700 1827 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Nptx1Q62443 Ptprj-204ENSMUST00000168621 7634 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Nptx1Q62443 Gabra5-202ENSMUST00000206382 2607 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Nptx1Q62443 Ngb-201ENSMUST00000021420 1616 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Nptx1Q62443 Txndc11-201ENSMUST00000038424 3095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Nptx1Q62443 Plekha4-202ENSMUST00000209517 2577 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Nptx1Q62443 Nsmf-207ENSMUST00000116574 2863 ntTSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Nptx1Q62443 Adamtsl5-202ENSMUST00000105352 989 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Nptx1Q62443 Gm15847-201ENSMUST00000121417 1065 ntBASIC15.22■□□□□ 0.03
Nptx1Q62443 Stx6-209ENSMUST00000195302 955 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Nptx1Q62443 Gm19391-201ENSMUST00000196653 999 ntTSL 3 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Nptx1Q62443 Jkamp-201ENSMUST00000057257 1292 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Nptx1Q62443 Fam72a-201ENSMUST00000068613 2191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Nptx1Q62443 Men1-203ENSMUST00000079327 2639 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Nptx1Q62443 Anapc5-201ENSMUST00000086216 2760 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Nptx1Q62443 Kcna6-204ENSMUST00000185333 5836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Nptx1Q62443 Dph1-201ENSMUST00000044949 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Nptx1Q62443 Tead3-201ENSMUST00000114799 2448 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Nptx1Q62443 Csk-201ENSMUST00000034863 2749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Nptx1Q62443 Ell2-201ENSMUST00000001583 4382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Nptx1Q62443 Ankrd13a-201ENSMUST00000102578 3717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Nptx1Q62443 Ssu72-201ENSMUST00000030905 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Nptx1Q62443 Foxq1-201ENSMUST00000042118 4843 ntAPPRIS P1 BASIC15.21■□□□□ 0.03
Nptx1Q62443 Hace1-201ENSMUST00000037044 3785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Nptx1Q62443 A930024E05Rik-201ENSMUST00000148466 1896 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Nptx1Q62443 Artn-202ENSMUST00000097913 1568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Nptx1Q62443 Plppr5-202ENSMUST00000106473 4294 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Nptx1Q62443 Gm11643-201ENSMUST00000119578 864 ntBASIC15.21■□□□□ 0.03
Nptx1Q62443 Gm34933-201ENSMUST00000203245 1067 ntTSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
Nptx1Q62443 Cetn3-201ENSMUST00000022009 1226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Nptx1Q62443 Ptpro-203ENSMUST00000167679 5096 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Nptx1Q62443 Hps6-201ENSMUST00000099393 2696 ntAPPRIS P1 BASIC15.21■□□□□ 0.03
Nptx1Q62443 Mmd-202ENSMUST00000107887 1654 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Nptx1Q62443 Rpf1-201ENSMUST00000029838 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Nptx1Q62443 Ggnbp2-201ENSMUST00000018547 2478 ntTSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.02
Nptx1Q62443 Aldh2-202ENSMUST00000129753 1799 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
Nptx1Q62443 Vps37a-201ENSMUST00000098817 6379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
Nptx1Q62443 Gm8839-201ENSMUST00000121279 1645 ntBASIC15.21■□□□□ 0.02
Nptx1Q62443 Gm26860-201ENSMUST00000181674 1489 ntTSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Nptx1Q62443 Sphk1-202ENSMUST00000063446 2527 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Nptx1Q62443 Tubb4b-ps1-201ENSMUST00000179460 1336 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
Nptx1Q62443 Galnt13-204ENSMUST00000112636 7530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Nptx1Q62443 Ebf1-203ENSMUST00000109268 2864 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Nptx1Q62443 Rhobtb1-202ENSMUST00000067908 4422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Nptx1Q62443 Arl4aos-201ENSMUST00000135883 748 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Nptx1Q62443 Gng2-202ENSMUST00000159028 458 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Nptx1Q62443 Cracr2b-207ENSMUST00000170879 1158 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Nptx1Q62443 Gm3764-202ENSMUST00000180582 440 ntTSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Nptx1Q62443 2310068J16Rik-201ENSMUST00000188271 1124 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
Nptx1Q62443 Tbc1d7-201ENSMUST00000021797 1239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Nptx1Q62443 Smn1-202ENSMUST00000091321 223 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Nptx1Q62443 Slc27a4-201ENSMUST00000080065 4054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Nptx1Q62443 Cnksr2-201ENSMUST00000026750 5738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Nptx1Q62443 Fzd5-201ENSMUST00000063982 6915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Nptx1Q62443 Brd3os-202ENSMUST00000209765 1898 ntAPPRIS P1 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Nptx1Q62443 AC069562.2-201ENSMUST00000224644 2146 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
Nptx1Q62443 Acads-201ENSMUST00000031524 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Nptx1Q62443 Atp2b2-201ENSMUST00000089003 7067 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Nptx1Q62443 Brpf1-202ENSMUST00000113119 4826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Nptx1Q62443 Iqsec1-202ENSMUST00000101153 8036 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Nptx1Q62443 Psen2-205ENSMUST00000111108 1997 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Nptx1Q62443 Macrod2-201ENSMUST00000043836 3552 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Nptx1Q62443 Synpo-206ENSMUST00000130360 5159 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Nptx1Q62443 Camk2n1-201ENSMUST00000050918 4444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Nptx1Q62443 Tlk1-201ENSMUST00000038584 4280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Nptx1Q62443 Susd1-201ENSMUST00000040166 3295 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Nptx1Q62443 Bicdl1-201ENSMUST00000055408 3026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Nptx1Q62443 Trim31-201ENSMUST00000078438 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Nptx1Q62443 E230025N22Rik-201ENSMUST00000115682 2016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Nptx1Q62443 Wnt1-201ENSMUST00000023734 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Nptx1Q62443 Sytl3-201ENSMUST00000097430 2100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Nptx1Q62443 Gm28372-201ENSMUST00000188900 1876 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Nptx1Q62443 Dtx2-201ENSMUST00000005072 2562 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Nptx1Q62443 Krt9-201ENSMUST00000059707 2580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Nptx1Q62443 Sh2b1-202ENSMUST00000205340 3366 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Nptx1Q62443 Tmem234-215ENSMUST00000173758 453 ntTSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Nptx1Q62443 Ube2i-213ENSMUST00000174031 824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Nptx1Q62443 Mir6349-201ENSMUST00000184059 97 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
Nptx1Q62443 Tmem42-202ENSMUST00000213514 631 ntTSL 3 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Nptx1Q62443 CT025689.6-201ENSMUST00000224991 1104 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
Nptx1Q62443 Tceanc2-201ENSMUST00000030362 935 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Nptx1Q62443 Tpsb2-201ENSMUST00000069616 1081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Nptx1Q62443 Izumo2-201ENSMUST00000085422 632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Nptx1Q62443 Selenom-201ENSMUST00000094469 707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Nptx1Q62443 Nrg3-201ENSMUST00000166968 4011 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Nptx1Q62443 Dtx2-203ENSMUST00000111144 2545 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Nptx1Q62443 Csrp2-201ENSMUST00000020403 1384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Nptx1Q62443 Clvs2-203ENSMUST00000160299 2610 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 21.2 ms