Protein–RNA interactions for Protein: Q62424

Hoxa13, Homeobox protein Hox-A13, mousemouse

Predictions only

Length 386 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hoxa13Q62424 Zfp644-205ENSMUST00000112698 5689 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.14■□□□□ 0.65
Hoxa13Q62424 Taf6l-211ENSMUST00000177056 2006 ntTSL 5 BASIC19.13■□□□□ 0.65
Hoxa13Q62424 Slc22a12-201ENSMUST00000113451 2213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Hoxa13Q62424 Mycn-202ENSMUST00000130990 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Hoxa13Q62424 Ak6-201ENSMUST00000022135 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Hoxa13Q62424 Mrpl14-201ENSMUST00000024734 645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Hoxa13Q62424 Cbx2-201ENSMUST00000026662 3807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Hoxa13Q62424 Nkx2-6-201ENSMUST00000062437 1134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Hoxa13Q62424 Trim14-202ENSMUST00000102924 1582 ntTSL 2 BASIC19.13■□□□□ 0.65
Hoxa13Q62424 Zfp119b-201ENSMUST00000056147 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Hoxa13Q62424 Slc23a4-205ENSMUST00000201355 2003 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.13■□□□□ 0.65
Hoxa13Q62424 Car9-201ENSMUST00000030183 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Hoxa13Q62424 Zbtb8a-201ENSMUST00000030610 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Hoxa13Q62424 Kmt5b-203ENSMUST00000113968 3216 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Hoxa13Q62424 Slc30a5-205ENSMUST00000225922 2722 ntAPPRIS ALT2 BASIC19.12■□□□□ 0.65
Hoxa13Q62424 Men1-205ENSMUST00000113501 2508 ntTSL 5 BASIC19.12■□□□□ 0.65
Hoxa13Q62424 Nrros-203ENSMUST00000115165 2389 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Hoxa13Q62424 Fam131a-202ENSMUST00000118919 2262 ntTSL 5 BASIC19.12■□□□□ 0.65
Hoxa13Q62424 Ddx41-201ENSMUST00000021956 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Hoxa13Q62424 Cspg5-205ENSMUST00000199736 2107 ntTSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Hoxa13Q62424 Cdipt-201ENSMUST00000032920 1974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Hoxa13Q62424 Isyna1-204ENSMUST00000210005 1914 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.12■□□□□ 0.65
Hoxa13Q62424 Cldn4-201ENSMUST00000051401 1816 ntAPPRIS P1 BASIC19.12■□□□□ 0.65
Hoxa13Q62424 Tyk2-205ENSMUST00000214864 1662 ntTSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Hoxa13Q62424 4833445I07Rik-201ENSMUST00000193193 1642 ntBASIC19.12■□□□□ 0.65
Hoxa13Q62424 Rdx-202ENSMUST00000061352 1502 ntTSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Hoxa13Q62424 Nit1-202ENSMUST00000111295 1335 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Hoxa13Q62424 Gm7284-201ENSMUST00000131667 944 ntBASIC19.12■□□□□ 0.65
Hoxa13Q62424 Calu-207ENSMUST00000173216 673 ntTSL 5 BASIC19.12■□□□□ 0.65
Hoxa13Q62424 4930505N22Rik-201ENSMUST00000181820 945 ntTSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Hoxa13Q62424 Gm17808-201ENSMUST00000200859 894 ntBASIC19.12■□□□□ 0.65
Hoxa13Q62424 Flt3l-206ENSMUST00000210197 834 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.12■□□□□ 0.65
Hoxa13Q62424 C1qbp-201ENSMUST00000078528 1175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Hoxa13Q62424 Uchl5-201ENSMUST00000018333 1845 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Hoxa13Q62424 Phf20l1-201ENSMUST00000048188 6670 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.11■□□□□ 0.65
Hoxa13Q62424 Sh2b2-203ENSMUST00000196397 2797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Hoxa13Q62424 Hsf4-202ENSMUST00000163734 1630 ntTSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Hoxa13Q62424 Ascl2-201ENSMUST00000009392 1605 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Hoxa13Q62424 Slbp-203ENSMUST00000101354 1578 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Hoxa13Q62424 Stard6-201ENSMUST00000114959 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Hoxa13Q62424 Htr6-202ENSMUST00000105802 2341 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.11■□□□□ 0.65
Hoxa13Q62424 A130014A01Rik-201ENSMUST00000183021 2323 ntBASIC19.11■□□□□ 0.65
Hoxa13Q62424 Ddx59-201ENSMUST00000027655 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Hoxa13Q62424 Gm11860-201ENSMUST00000122346 1010 ntBASIC19.11■□□□□ 0.65
Hoxa13Q62424 Acaa1a-203ENSMUST00000175743 1219 ntTSL 5 BASIC19.11■□□□□ 0.65
Hoxa13Q62424 Acaa1a-207ENSMUST00000176397 996 ntTSL 5 BASIC19.11■□□□□ 0.65
Hoxa13Q62424 Gm44973-201ENSMUST00000207050 1003 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.11■□□□□ 0.65
Hoxa13Q62424 AC156832.2-201ENSMUST00000216217 1295 ntTSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Hoxa13Q62424 Znhit1-202ENSMUST00000085941 740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Hoxa13Q62424 Aatk-203ENSMUST00000103020 5687 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Hoxa13Q62424 L3hypdh-201ENSMUST00000019862 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Hoxa13Q62424 Tfap2a-209ENSMUST00000225180 1828 ntBASIC19.11■□□□□ 0.65
Hoxa13Q62424 Tubb6-201ENSMUST00000001513 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Hoxa13Q62424 Wac-207ENSMUST00000167020 5208 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Hoxa13Q62424 Mag-201ENSMUST00000040548 2419 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Hoxa13Q62424 Gm42417-201ENSMUST00000191849 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Hoxa13Q62424 Tdrd12-201ENSMUST00000032701 1620 ntTSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Hoxa13Q62424 Prss56-201ENSMUST00000044533 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Hoxa13Q62424 Psmd8-203ENSMUST00000186182 1512 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Hoxa13Q62424 Bmp8a-201ENSMUST00000040496 2405 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Hoxa13Q62424 Ptcra-201ENSMUST00000041012 1283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Hoxa13Q62424 Rln3-201ENSMUST00000061923 634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Hoxa13Q62424 Cct6b-201ENSMUST00000021040 1787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Hoxa13Q62424 Rtn4-204ENSMUST00000102842 2257 ntTSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Hoxa13Q62424 Igsf8-201ENSMUST00000039506 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Hoxa13Q62424 Dpep3-201ENSMUST00000034371 1698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Hoxa13Q62424 2310002F09Rik-201ENSMUST00000181454 1607 ntTSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Hoxa13Q62424 Tnfrsf25-202ENSMUST00000035275 1603 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Hoxa13Q62424 S1pr5-201ENSMUST00000122088 2500 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.1■□□□□ 0.65
Hoxa13Q62424 Magi3-203ENSMUST00000122303 3827 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Hoxa13Q62424 Acadvl-201ENSMUST00000018718 2020 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.1■□□□□ 0.65
Hoxa13Q62424 Eomes-202ENSMUST00000111763 2869 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Hoxa13Q62424 Phf7-203ENSMUST00000226565 1971 ntBASIC19.1■□□□□ 0.65
Hoxa13Q62424 Gdf15-201ENSMUST00000003808 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Hoxa13Q62424 Abhd10-201ENSMUST00000066983 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Hoxa13Q62424 Ran-201ENSMUST00000031383 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Hoxa13Q62424 Tdh-201ENSMUST00000022522 1881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Hoxa13Q62424 Acads-201ENSMUST00000031524 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Hoxa13Q62424 Hoxa10-201ENSMUST00000121043 1436 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.09■□□□□ 0.65
Hoxa13Q62424 Rgmb-201ENSMUST00000170578 2633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Hoxa13Q62424 Tmem131-201ENSMUST00000027290 6546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Hoxa13Q62424 5031425F14Rik-201ENSMUST00000127920 2098 ntTSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Hoxa13Q62424 Med18-201ENSMUST00000102567 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Hoxa13Q62424 Mir770-201ENSMUST00000103252 94 ntBASIC19.09■□□□□ 0.65
Hoxa13Q62424 Gm14859-201ENSMUST00000117752 357 ntBASIC19.09■□□□□ 0.65
Hoxa13Q62424 Gfod2-203ENSMUST00000155038 951 ntTSL 2 BASIC19.09■□□□□ 0.65
Hoxa13Q62424 1700022H01Rik-201ENSMUST00000219142 387 ntTSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Hoxa13Q62424 Snrnp35-201ENSMUST00000031349 1115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Hoxa13Q62424 Thrsp-201ENSMUST00000043077 1277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Hoxa13Q62424 Gm44832-201ENSMUST00000208849 2303 ntBASIC19.09■□□□□ 0.65
Hoxa13Q62424 Pcdhac2-201ENSMUST00000047479 5888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Hoxa13Q62424 Runx1t1-201ENSMUST00000006761 5783 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Hoxa13Q62424 Rilpl1-201ENSMUST00000062153 2249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Hoxa13Q62424 Atf7-209ENSMUST00000184485 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Hoxa13Q62424 Tcf7l2-203ENSMUST00000111646 2839 ntTSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Hoxa13Q62424 Slc9a5-201ENSMUST00000073149 3499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Hoxa13Q62424 Mark3-202ENSMUST00000084953 3365 ntTSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Hoxa13Q62424 Prdm11-201ENSMUST00000111272 3012 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.09■□□□□ 0.65
Hoxa13Q62424 Pdap1-201ENSMUST00000031627 2353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
Hoxa13Q62424 Gprin1-202ENSMUST00000135343 4248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 45.3 ms