Protein–RNA interactions for Protein: Q62388

Atm, Serine-protein kinase ATM, mousemouse

Predictions only

Length 3,066 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
AtmQ62388 Gm43006-201ENSMUST00000197702 1602 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
AtmQ62388 Epo-202ENSMUST00000111038 855 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
AtmQ62388 Gm13524-201ENSMUST00000125869 662 ntTSL 3 BASIC16.03■□□□□ 0.16
AtmQ62388 Gm29791-202ENSMUST00000207888 369 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
AtmQ62388 Wdyhv1-206ENSMUST00000227142 786 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
AtmQ62388 Pisd-201ENSMUST00000061895 2183 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
AtmQ62388 Hoxd3-201ENSMUST00000047830 2292 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
AtmQ62388 Chrna2-202ENSMUST00000206455 1933 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
AtmQ62388 Pip5k1c-202ENSMUST00000105327 2551 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
AtmQ62388 Cnpy1-202ENSMUST00000118882 1984 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
AtmQ62388 Nadk2-202ENSMUST00000100789 3578 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
AtmQ62388 Shkbp1-201ENSMUST00000003857 2358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
AtmQ62388 Gm14140-201ENSMUST00000119999 995 ntBASIC16.02■□□□□ 0.16
AtmQ62388 Gm27397-201ENSMUST00000184997 107 ntBASIC16.02■□□□□ 0.16
AtmQ62388 Gm45091-201ENSMUST00000205799 504 ntTSL 3 BASIC16.02■□□□□ 0.16
AtmQ62388 Gm45144-201ENSMUST00000207473 354 ntTSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
AtmQ62388 2010003K11Rik-201ENSMUST00000048482 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
AtmQ62388 Ehmt2-203ENSMUST00000097342 3934 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
AtmQ62388 Bmi1-201ENSMUST00000028071 3594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
AtmQ62388 4930471E19Rik-201ENSMUST00000219022 1514 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
AtmQ62388 Il17re-205ENSMUST00000203661 2118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
AtmQ62388 Tmem185a-201ENSMUST00000101506 2429 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
AtmQ62388 Gm5953-201ENSMUST00000220644 2616 ntBASIC16.02■□□□□ 0.15
AtmQ62388 Dpy19l1-203ENSMUST00000142064 3489 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.15
AtmQ62388 4930426D05Rik-202ENSMUST00000139804 1650 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
AtmQ62388 Gnb2-212ENSMUST00000150063 1569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
AtmQ62388 Mrps18c-203ENSMUST00000112901 820 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
AtmQ62388 Gm19935-201ENSMUST00000209208 979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
AtmQ62388 AC159114.1-201ENSMUST00000220349 266 ntBASIC16.02■□□□□ 0.15
AtmQ62388 Klk15-201ENSMUST00000068625 845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
AtmQ62388 Acbd4-201ENSMUST00000024492 2075 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.15
AtmQ62388 Slc17a7-202ENSMUST00000209634 1860 ntTSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
AtmQ62388 Nectin3-201ENSMUST00000023334 3062 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
AtmQ62388 Trnt1-203ENSMUST00000113248 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
AtmQ62388 Msantd3-202ENSMUST00000064807 1378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
AtmQ62388 Zmym3-204ENSMUST00000118092 1502 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
AtmQ62388 Jdp2-202ENSMUST00000171754 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
AtmQ62388 Lhx6-208ENSMUST00000148852 1481 ntTSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
AtmQ62388 Myef2-209ENSMUST00000152367 2071 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
AtmQ62388 Ccdc102a-201ENSMUST00000077955 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
AtmQ62388 Snupn-201ENSMUST00000068856 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
AtmQ62388 Mtmr9-201ENSMUST00000058679 2570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
AtmQ62388 Armc10-202ENSMUST00000095495 2700 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
AtmQ62388 Nup188-205ENSMUST00000138666 534 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
AtmQ62388 Sfxn5-202ENSMUST00000059034 1081 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
AtmQ62388 D1Ertd622e-204ENSMUST00000153115 3495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
AtmQ62388 Gm43213-201ENSMUST00000151866 1790 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
AtmQ62388 Pknox1-203ENSMUST00000175806 2272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
AtmQ62388 Ddx19a-201ENSMUST00000040416 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
AtmQ62388 Ralgps2-205ENSMUST00000185198 2229 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
AtmQ62388 Arfrp1-209ENSMUST00000170190 2483 ntTSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
AtmQ62388 Umad1-206ENSMUST00000160705 624 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
AtmQ62388 Sbsn-202ENSMUST00000182227 432 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
AtmQ62388 Sbsn-203ENSMUST00000182229 732 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
AtmQ62388 Snrnp25-201ENSMUST00000039601 821 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
AtmQ62388 Krt19-201ENSMUST00000007317 1576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
AtmQ62388 Zfp655-206ENSMUST00000200039 1765 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
AtmQ62388 Tmem51os1-202ENSMUST00000141769 2131 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
AtmQ62388 Smim22-208ENSMUST00000185147 399 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
AtmQ62388 Cbr2-201ENSMUST00000026148 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
AtmQ62388 Atp6v1b2-201ENSMUST00000006435 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
AtmQ62388 A730056A06Rik-201ENSMUST00000181299 2689 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
AtmQ62388 Amdhd1-201ENSMUST00000016034 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
AtmQ62388 Gm16897-201ENSMUST00000180780 2492 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
AtmQ62388 Serinc2-201ENSMUST00000105996 1878 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
AtmQ62388 Irak1-205ENSMUST00000114353 1896 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
AtmQ62388 Glra1-202ENSMUST00000102716 2390 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
AtmQ62388 Zfp768-201ENSMUST00000060783 2356 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
AtmQ62388 H2-K1-205ENSMUST00000172912 1570 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
AtmQ62388 Hspbp1-201ENSMUST00000079970 1593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
AtmQ62388 Polr2i-202ENSMUST00000108192 508 ntTSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
AtmQ62388 Gm26892-201ENSMUST00000181695 1636 ntTSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
AtmQ62388 Agfg2-201ENSMUST00000031736 2893 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
AtmQ62388 Ncam2-202ENSMUST00000067602 3563 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
AtmQ62388 Pomgnt2-201ENSMUST00000084743 2365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
AtmQ62388 Smox-204ENSMUST00000110181 2299 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
AtmQ62388 Slc16a3-201ENSMUST00000070653 2272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
AtmQ62388 Adpgk-205ENSMUST00000217570 2484 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
AtmQ62388 Rab3a-201ENSMUST00000034301 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
AtmQ62388 4930452B06Rik-201ENSMUST00000102996 2681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
AtmQ62388 Evc-202ENSMUST00000114148 2119 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
AtmQ62388 Kcnn1-207ENSMUST00000212509 1608 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
AtmQ62388 Sytl3-204ENSMUST00000159880 1296 ntTSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
AtmQ62388 Pdcd6-201ENSMUST00000022060 1131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
AtmQ62388 Nmur1-203ENSMUST00000212541 1534 ntTSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
AtmQ62388 Tubb4b-ps1-201ENSMUST00000179460 1336 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
AtmQ62388 Dnase2a-202ENSMUST00000109744 1958 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
AtmQ62388 Rgp1-203ENSMUST00000117140 1635 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
AtmQ62388 Zbtb24-202ENSMUST00000213797 2734 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
AtmQ62388 Chrm4-201ENSMUST00000045537 1440 ntAPPRIS P1 BASIC15.99■□□□□ 0.15
AtmQ62388 AC125311.2-201ENSMUST00000227477 1940 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
AtmQ62388 Sec61b-201ENSMUST00000065678 564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
AtmQ62388 Mdk-202ENSMUST00000069423 773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
AtmQ62388 Rasl10b-202ENSMUST00000108140 3156 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
AtmQ62388 Yipf2-201ENSMUST00000034700 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
AtmQ62388 Nrxn2-203ENSMUST00000113459 3285 ntTSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
AtmQ62388 Ftl2-ps-201ENSMUST00000118517 552 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
AtmQ62388 Gm11729-201ENSMUST00000124901 713 ntTSL 3 BASIC15.98■□□□□ 0.15
AtmQ62388 Tmem270-202ENSMUST00000201316 847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
AtmQ62388 1700012D14Rik-201ENSMUST00000209597 605 ntTSL 3 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 24.5 ms