Protein–RNA interactions for Protein: Q62383

Supt6h, Transcription elongation factor SPT6, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 1,726 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Supt6hQ62383 Fam26f-201ENSMUST00000062784 1094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
Supt6hQ62383 Ccdc106-201ENSMUST00000045543 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
Supt6hQ62383 Atad3a-201ENSMUST00000030903 2413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
Supt6hQ62383 B3gnt2-202ENSMUST00000062844 3057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
Supt6hQ62383 Dhx32-203ENSMUST00000106139 2233 ntTSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
Supt6hQ62383 1700018L02Rik-201ENSMUST00000187897 2485 ntBASIC24.62■■□□□ 1.53
Supt6hQ62383 Gm14494-201ENSMUST00000118786 435 ntBASIC24.61■■□□□ 1.53
Supt6hQ62383 Rasd2-201ENSMUST00000132133 1299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
Supt6hQ62383 Gm19345-201ENSMUST00000172815 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
Supt6hQ62383 Ighv1-15-201ENSMUST00000192077 351 ntAPPRIS P1 BASIC24.61■■□□□ 1.53
Supt6hQ62383 Pfn3-201ENSMUST00000054146 545 ntAPPRIS P1 BASIC24.61■■□□□ 1.53
Supt6hQ62383 Pdss2-201ENSMUST00000095725 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
Supt6hQ62383 Ssx2ip-201ENSMUST00000039021 3410 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
Supt6hQ62383 Nkapl-201ENSMUST00000068235 1463 ntAPPRIS P1 BASIC24.61■■□□□ 1.53
Supt6hQ62383 Mipol1-201ENSMUST00000123498 2117 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.61■■□□□ 1.53
Supt6hQ62383 Dleu2-208ENSMUST00000182768 1442 ntTSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
Supt6hQ62383 Itgb1bp1-201ENSMUST00000076260 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
Supt6hQ62383 Nudt16l1-201ENSMUST00000050881 1269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
Supt6hQ62383 Pcolce-202ENSMUST00000054564 1585 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.6■■□□□ 1.53
Supt6hQ62383 Foxo3-204ENSMUST00000175881 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
Supt6hQ62383 Gm17018-201ENSMUST00000047057 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
Supt6hQ62383 Zscan12-201ENSMUST00000053293 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
Supt6hQ62383 Apba3-201ENSMUST00000057798 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
Supt6hQ62383 Lca5l-201ENSMUST00000054855 2508 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
Supt6hQ62383 Taf3-202ENSMUST00000114906 583 ntTSL 2 BASIC24.6■■□□□ 1.53
Supt6hQ62383 Sumo3-204ENSMUST00000129492 487 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.6■■□□□ 1.53
Supt6hQ62383 Gm45890-204ENSMUST00000212356 545 ntTSL 2 BASIC24.6■■□□□ 1.53
Supt6hQ62383 Fcnb-201ENSMUST00000028179 1170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
Supt6hQ62383 Lrfn4-202ENSMUST00000113822 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
Supt6hQ62383 Tab2-204ENSMUST00000146444 4380 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.59■■□□□ 1.53
Supt6hQ62383 Phf7-203ENSMUST00000226565 1971 ntBASIC24.59■■□□□ 1.53
Supt6hQ62383 Cxcl10-202ENSMUST00000118006 1353 ntTSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
Supt6hQ62383 Snx14-205ENSMUST00000173011 2238 ntTSL 5 BASIC24.59■■□□□ 1.53
Supt6hQ62383 Gm11750-201ENSMUST00000146016 583 ntTSL 5 BASIC24.59■■□□□ 1.53
Supt6hQ62383 Gm5617-201ENSMUST00000048824 531 ntAPPRIS P1 BASIC24.59■■□□□ 1.53
Supt6hQ62383 Fam159a-201ENSMUST00000053157 593 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.59■■□□□ 1.53
Supt6hQ62383 Camkk2-211ENSMUST00000200109 2751 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
Supt6hQ62383 Ppp4r2-201ENSMUST00000063854 4874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
Supt6hQ62383 Kbtbd13-201ENSMUST00000068307 2969 ntAPPRIS P1 BASIC24.59■■□□□ 1.53
Supt6hQ62383 Zbtb24-202ENSMUST00000213797 2734 ntTSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
Supt6hQ62383 Khdrbs2-201ENSMUST00000027226 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
Supt6hQ62383 Tob1-201ENSMUST00000041589 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
Supt6hQ62383 Wnt10b-204ENSMUST00000226655 1807 ntBASIC24.58■■□□□ 1.53
Supt6hQ62383 Gm13186-201ENSMUST00000118031 316 ntBASIC24.58■■□□□ 1.53
Supt6hQ62383 Arid2-202ENSMUST00000134985 809 ntTSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
Supt6hQ62383 Gm44123-201ENSMUST00000204662 577 ntTSL 5 BASIC24.58■■□□□ 1.53
Supt6hQ62383 AC225888.1-201ENSMUST00000227184 728 ntBASIC24.58■■□□□ 1.53
Supt6hQ62383 Apoa1-201ENSMUST00000034588 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
Supt6hQ62383 Ascl2-201ENSMUST00000009392 1605 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
Supt6hQ62383 Myo1b-202ENSMUST00000046390 5052 ntTSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
Supt6hQ62383 Zkscan3-202ENSMUST00000116433 1421 ntTSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
Supt6hQ62383 Fhl3-201ENSMUST00000038684 1664 ntTSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
Supt6hQ62383 Nr1h2-202ENSMUST00000107910 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
Supt6hQ62383 Vps53-203ENSMUST00000108419 2209 ntTSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
Supt6hQ62383 Gm42939-201ENSMUST00000197514 2205 ntBASIC24.58■■□□□ 1.53
Supt6hQ62383 Best2-203ENSMUST00000209421 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
Supt6hQ62383 Ager-201ENSMUST00000015596 1370 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
Supt6hQ62383 Gm12216-201ENSMUST00000117316 1152 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.52
Supt6hQ62383 Bola3-202ENSMUST00000120040 583 ntTSL 3 BASIC24.58■■□□□ 1.52
Supt6hQ62383 Gm27397-201ENSMUST00000184997 107 ntBASIC24.58■■□□□ 1.52
Supt6hQ62383 Dmtn-207ENSMUST00000228001 2437 ntBASIC24.58■■□□□ 1.52
Supt6hQ62383 Acbd4-201ENSMUST00000024492 2075 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.57■■□□□ 1.52
Supt6hQ62383 Mzt1-201ENSMUST00000042662 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
Supt6hQ62383 Tubb6-201ENSMUST00000001513 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
Supt6hQ62383 Nisch-221ENSMUST00000171735 1763 ntTSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
Supt6hQ62383 Itgb5-202ENSMUST00000115028 3090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
Supt6hQ62383 Izumo1r-203ENSMUST00000117620 1095 ntTSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
Supt6hQ62383 Gm15165-201ENSMUST00000118140 502 ntBASIC24.57■■□□□ 1.52
Supt6hQ62383 Gm13830-202ENSMUST00000144202 381 ntTSL 3 BASIC24.57■■□□□ 1.52
Supt6hQ62383 Polr2m-202ENSMUST00000163972 2138 ntTSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
Supt6hQ62383 Gm7230-201ENSMUST00000173026 815 ntBASIC24.57■■□□□ 1.52
Supt6hQ62383 9130024F11Rik-204ENSMUST00000187927 517 ntTSL 5 BASIC24.57■■□□□ 1.52
Supt6hQ62383 Mrpl17-201ENSMUST00000033170 1028 ntTSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
Supt6hQ62383 Tsfm-201ENSMUST00000040560 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
Supt6hQ62383 Vamp8-201ENSMUST00000059983 820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
Supt6hQ62383 Slc16a3-201ENSMUST00000070653 2272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
Supt6hQ62383 Rhbdl1-202ENSMUST00000183929 1349 ntTSL 5 BASIC24.57■■□□□ 1.52
Supt6hQ62383 Spg7-209ENSMUST00000149248 2896 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
Supt6hQ62383 Arid3b-202ENSMUST00000098686 1969 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
Supt6hQ62383 Ahsa1-201ENSMUST00000021425 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
Supt6hQ62383 Hist1h4a-201ENSMUST00000102964 539 ntAPPRIS P1 BASIC24.56■■□□□ 1.52
Supt6hQ62383 Gm42456-201ENSMUST00000196840 387 ntTSL 3 BASIC24.56■■□□□ 1.52
Supt6hQ62383 Thrsp-201ENSMUST00000043077 1277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
Supt6hQ62383 Hist1h2ai-201ENSMUST00000070124 393 ntAPPRIS P1 BASIC24.56■■□□□ 1.52
Supt6hQ62383 Rogdi-202ENSMUST00000090453 652 ntTSL 5 BASIC24.56■■□□□ 1.52
Supt6hQ62383 Hist1h2an-201ENSMUST00000091751 393 ntAPPRIS P1 BASIC24.56■■□□□ 1.52
Supt6hQ62383 Ttc39a-201ENSMUST00000064129 2356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
Supt6hQ62383 Cyp4f16-201ENSMUST00000003416 2227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
Supt6hQ62383 Trim14-202ENSMUST00000102924 1582 ntTSL 2 BASIC24.56■■□□□ 1.52
Supt6hQ62383 Taz-202ENSMUST00000114180 1786 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.56■■□□□ 1.52
Supt6hQ62383 Fam105a-203ENSMUST00000226170 3043 ntBASIC24.56■■□□□ 1.52
Supt6hQ62383 Fosb-206ENSMUST00000208446 1090 ntTSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
Supt6hQ62383 Pla2g12b-201ENSMUST00000009790 1091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
Supt6hQ62383 Hist2h3b-201ENSMUST00000098843 488 ntAPPRIS P1 BASIC24.55■■□□□ 1.52
Supt6hQ62383 Vrk2-201ENSMUST00000078362 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
Supt6hQ62383 Prdm8-202ENSMUST00000210477 3316 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.55■■□□□ 1.52
Supt6hQ62383 Tpm1-215ENSMUST00000113705 1759 ntTSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
Supt6hQ62383 Dtx3-202ENSMUST00000116229 1994 ntTSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
Supt6hQ62383 Larp1b-202ENSMUST00000048490 2354 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
Supt6hQ62383 Sox30-201ENSMUST00000049038 2997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 40 ms