Protein–RNA interactions for Protein: Q61999

Odf1, Outer dense fiber protein 1, mousemouse

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Length 247 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Odf1Q61999 Tubgcp4-203ENSMUST00000110658 4250 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
Odf1Q61999 Praf2-201ENSMUST00000033489 1339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
Odf1Q61999 Atp5g1-203ENSMUST00000107686 691 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC12.74□□□□□ -0.37
Odf1Q61999 Mrpl13-205ENSMUST00000172387 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
Odf1Q61999 Gm20544-201ENSMUST00000174338 690 ntTSL 3 BASIC12.74□□□□□ -0.37
Odf1Q61999 Mrpl10-202ENSMUST00000054252 744 ntTSL 5 BASIC12.74□□□□□ -0.37
Odf1Q61999 Rtl8a-201ENSMUST00000088779 1195 ntAPPRIS P1 BASIC12.74□□□□□ -0.37
Odf1Q61999 Ube2d3-202ENSMUST00000166033 2504 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
Odf1Q61999 Ccnd3-202ENSMUST00000171031 2113 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.74□□□□□ -0.37
Odf1Q61999 Esrrb-201ENSMUST00000021680 2136 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.74□□□□□ -0.37
Odf1Q61999 Foxp4-204ENSMUST00000113265 3999 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
Odf1Q61999 Slc29a1-202ENSMUST00000064889 1988 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
Odf1Q61999 Hand1-201ENSMUST00000036917 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
Odf1Q61999 Gpr161-202ENSMUST00000178700 1827 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
Odf1Q61999 Sar1a-201ENSMUST00000020285 2613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
Odf1Q61999 Tox2-205ENSMUST00000165937 1675 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.73□□□□□ -0.37
Odf1Q61999 Rap2a-201ENSMUST00000062117 4191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
Odf1Q61999 Cacna1h-205ENSMUST00000159610 8230 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
Odf1Q61999 Cacna1h-201ENSMUST00000078496 8220 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
Odf1Q61999 1810013L24Rik-201ENSMUST00000023150 4066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
Odf1Q61999 Ran-201ENSMUST00000031383 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
Odf1Q61999 Ccdc126-201ENSMUST00000055559 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
Odf1Q61999 Sik3-204ENSMUST00000126865 6287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
Odf1Q61999 Naf1-201ENSMUST00000118009 2990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
Odf1Q61999 Dnlz-201ENSMUST00000028295 2916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
Odf1Q61999 F830208F22Rik-202ENSMUST00000143732 2891 ntTSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
Odf1Q61999 Lrrc47-205ENSMUST00000169622 3468 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
Odf1Q61999 Cap1-202ENSMUST00000106255 2737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
Odf1Q61999 Adrb3-202ENSMUST00000117565 1336 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
Odf1Q61999 Spata18-202ENSMUST00000071077 1978 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.73□□□□□ -0.37
Odf1Q61999 Braf-201ENSMUST00000002487 9728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
Odf1Q61999 Unc50-203ENSMUST00000118059 1179 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.73□□□□□ -0.37
Odf1Q61999 Gm17661-201ENSMUST00000170317 270 ntBASIC12.73□□□□□ -0.37
Odf1Q61999 Uqcr11-201ENSMUST00000020372 445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
Odf1Q61999 Atg4c-201ENSMUST00000030279 3178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
Odf1Q61999 Trim45-202ENSMUST00000094048 1815 ntTSL 5 BASIC12.73□□□□□ -0.37
Odf1Q61999 Farsa-202ENSMUST00000109754 1795 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
Odf1Q61999 Abcd4-201ENSMUST00000021666 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
Odf1Q61999 Lhx6-203ENSMUST00000112963 3481 ntTSL 2 BASIC12.73□□□□□ -0.37
Odf1Q61999 Gbe1-201ENSMUST00000023393 2846 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.73□□□□□ -0.37
Odf1Q61999 Lzts2-201ENSMUST00000039016 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
Odf1Q61999 Taok3-203ENSMUST00000111978 4467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
Odf1Q61999 Syngap1-204ENSMUST00000194598 6011 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.73□□□□□ -0.37
Odf1Q61999 Pigu-201ENSMUST00000077626 1636 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
Odf1Q61999 2610301B20Rik-201ENSMUST00000080517 2116 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
Odf1Q61999 Cpox-201ENSMUST00000060077 3186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
Odf1Q61999 Mid1ip1-201ENSMUST00000008179 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
Odf1Q61999 Tm9sf1-205ENSMUST00000122358 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
Odf1Q61999 Tnfrsf13c-201ENSMUST00000089161 1906 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
Odf1Q61999 Cisd2-202ENSMUST00000120988 1363 ntTSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
Odf1Q61999 Itgb7-201ENSMUST00000001327 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
Odf1Q61999 Lsm1-201ENSMUST00000038421 2663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
Odf1Q61999 Carmn-201ENSMUST00000181155 1778 ntTSL 2 BASIC12.72□□□□□ -0.37
Odf1Q61999 Psmd4-202ENSMUST00000107237 1332 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
Odf1Q61999 Lbp-202ENSMUST00000109491 1322 ntTSL 2 BASIC12.72□□□□□ -0.37
Odf1Q61999 Commd7-202ENSMUST00000109782 1343 ntTSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
Odf1Q61999 Fam126a-201ENSMUST00000030849 5659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
Odf1Q61999 Krt15-201ENSMUST00000107411 1700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
Odf1Q61999 Atp5c1-202ENSMUST00000114896 1735 ntTSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
Odf1Q61999 Irf3-213ENSMUST00000209066 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
Odf1Q61999 Homez-202ENSMUST00000142283 4713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
Odf1Q61999 Mrps18c-203ENSMUST00000112901 820 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
Odf1Q61999 2900072N19Rik-201ENSMUST00000123840 806 ntTSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
Odf1Q61999 Zfp560-202ENSMUST00000143992 608 ntTSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
Odf1Q61999 Serf1-204ENSMUST00000151821 570 ntTSL 2 BASIC12.72□□□□□ -0.37
Odf1Q61999 Cops9-201ENSMUST00000097642 438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
Odf1Q61999 Lrrtm1-202ENSMUST00000159616 2541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
Odf1Q61999 Cerkl-205ENSMUST00000143974 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
Odf1Q61999 Tmprss5-201ENSMUST00000070390 2047 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
Odf1Q61999 Gtpbp3-208ENSMUST00000168847 2803 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.72□□□□□ -0.37
Odf1Q61999 Zbtb9-201ENSMUST00000120016 2798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
Odf1Q61999 Enah-210ENSMUST00000193074 1971 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.72□□□□□ -0.37
Odf1Q61999 Prss54-205ENSMUST00000213096 1501 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC12.72□□□□□ -0.37
Odf1Q61999 Crebzf-201ENSMUST00000061767 3376 ntAPPRIS P1 BASIC12.72□□□□□ -0.37
Odf1Q61999 Nfib-205ENSMUST00000107247 3267 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.72□□□□□ -0.37
Odf1Q61999 Rbbp7-202ENSMUST00000112326 1430 ntTSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.37
Odf1Q61999 Dph1-201ENSMUST00000044949 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.37
Odf1Q61999 Smim10l1-201ENSMUST00000100864 2842 ntAPPRIS P1 BASIC12.71□□□□□ -0.37
Odf1Q61999 Zfp622-201ENSMUST00000061875 2802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.37
Odf1Q61999 Qprt-201ENSMUST00000032912 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.37
Odf1Q61999 Akap8l-201ENSMUST00000050214 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.37
Odf1Q61999 Cep104-201ENSMUST00000047497 5151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.37
Odf1Q61999 A330009N23Rik-201ENSMUST00000180639 1392 ntTSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.37
Odf1Q61999 Prrt4-201ENSMUST00000159200 3411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.37
Odf1Q61999 Cdc14b-203ENSMUST00000109770 3052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.37
Odf1Q61999 Fez2-202ENSMUST00000112487 2020 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.37
Odf1Q61999 Krt13-201ENSMUST00000007275 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.37
Odf1Q61999 Ric1-201ENSMUST00000043610 7190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.71□□□□□ -0.37
Odf1Q61999 Gm8839-201ENSMUST00000121279 1645 ntBASIC12.71□□□□□ -0.37
Odf1Q61999 Gm6093-201ENSMUST00000221792 1623 ntTSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.37
Odf1Q61999 Ffar3-201ENSMUST00000094583 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.37
Odf1Q61999 Josd2-206ENSMUST00000121922 684 ntTSL 5 BASIC12.71□□□□□ -0.37
Odf1Q61999 Klf13-204ENSMUST00000185175 487 ntTSL 2 BASIC12.71□□□□□ -0.37
Odf1Q61999 Gm37025-201ENSMUST00000195159 829 ntBASIC12.71□□□□□ -0.37
Odf1Q61999 Ube2a-208ENSMUST00000202812 719 ntTSL 2 BASIC12.71□□□□□ -0.37
Odf1Q61999 Rab7-206ENSMUST00000203674 424 ntTSL 5 BASIC12.71□□□□□ -0.37
Odf1Q61999 Nnat-201ENSMUST00000088484 458 ntTSL 2 BASIC12.71□□□□□ -0.37
Odf1Q61999 Ccnl1-201ENSMUST00000029416 2169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.37
Odf1Q61999 Gpr20-201ENSMUST00000064166 2144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.38
Odf1Q61999 Opn4-202ENSMUST00000168444 2075 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.38
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