Protein–RNA interactions for Protein: Q61735

Cd47, Leukocyte surface antigen CD47, mousemouse

Predictions only

Length 303 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cd47Q61735 Mmp28-204ENSMUST00000119346 1517 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Cd47Q61735 Mid2-202ENSMUST00000112990 6271 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Cd47Q61735 Lrrc73-201ENSMUST00000095262 1384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Cd47Q61735 Glmn-201ENSMUST00000078021 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Cd47Q61735 Bean1-201ENSMUST00000093245 3199 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
Cd47Q61735 Slc25a31-201ENSMUST00000091184 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
Cd47Q61735 Add1-204ENSMUST00000114338 4007 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
Cd47Q61735 Gprc5c-203ENSMUST00000122967 1709 ntTSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.06
Cd47Q61735 Negr1-203ENSMUST00000106065 1953 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Cd47Q61735 A430078I02Rik-202ENSMUST00000154066 2233 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Cd47Q61735 Eif1-201ENSMUST00000049385 1322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Cd47Q61735 Gprin1-202ENSMUST00000135343 4248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Cd47Q61735 Aig1-205ENSMUST00000162610 1554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Cd47Q61735 Aldh2-202ENSMUST00000129753 1799 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Cd47Q61735 Snrnp48-201ENSMUST00000091641 1785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Cd47Q61735 Grb7-201ENSMUST00000019456 2397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Cd47Q61735 Ttc6-203ENSMUST00000172939 5782 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Cd47Q61735 Sarnp-201ENSMUST00000105230 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Cd47Q61735 Plxdc1-202ENSMUST00000107564 619 ntTSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Cd47Q61735 Ctnnal1-202ENSMUST00000107612 850 ntTSL 3 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Cd47Q61735 Bex3-202ENSMUST00000113112 826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Cd47Q61735 Gm18666-201ENSMUST00000190039 958 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
Cd47Q61735 Gm37292-201ENSMUST00000192062 758 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
Cd47Q61735 Kcnn4-203ENSMUST00000205626 461 ntTSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Cd47Q61735 H2-Eb1-201ENSMUST00000074557 1184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Cd47Q61735 1700028I16Rik-201ENSMUST00000076984 1048 ntTSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Cd47Q61735 Sh3glb1-202ENSMUST00000198254 5945 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Cd47Q61735 Stk35-202ENSMUST00000166282 5445 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Cd47Q61735 Anapc5-201ENSMUST00000086216 2760 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Cd47Q61735 Lrrc47-205ENSMUST00000169622 3468 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Cd47Q61735 Slc35e3-201ENSMUST00000079041 3489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Cd47Q61735 Cdk12-203ENSMUST00000107539 5912 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Cd47Q61735 Bicc1-203ENSMUST00000143791 5431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Cd47Q61735 Gm20517-202ENSMUST00000132397 4807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Cd47Q61735 Acss3-201ENSMUST00000044668 2494 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Cd47Q61735 Fmnl3-202ENSMUST00000088233 4423 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Cd47Q61735 Tia1-203ENSMUST00000095754 1789 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Cd47Q61735 2810425M01Rik-201ENSMUST00000180790 1850 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Cd47Q61735 Ncoa1-201ENSMUST00000085814 7329 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Cd47Q61735 Slc25a39-202ENSMUST00000107098 1606 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Cd47Q61735 Ccdc58-202ENSMUST00000163352 970 ntTSL 3 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Cd47Q61735 Ccdc58-203ENSMUST00000164916 1096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Cd47Q61735 1600023N17Rik-201ENSMUST00000196242 1007 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
Cd47Q61735 Trmt13-210ENSMUST00000198454 880 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
Cd47Q61735 Atp5c1-201ENSMUST00000026887 1060 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Cd47Q61735 Ube2s-201ENSMUST00000079496 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Cd47Q61735 Ick-201ENSMUST00000009972 873 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Cd47Q61735 Dlgap4-212ENSMUST00000169464 4851 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Cd47Q61735 Usp47-201ENSMUST00000106653 5540 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Cd47Q61735 Lrrc7-201ENSMUST00000106044 5918 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Cd47Q61735 Arhgef16-201ENSMUST00000030898 2860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Cd47Q61735 Tapt1-201ENSMUST00000055128 3513 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Cd47Q61735 Wnt4-201ENSMUST00000045747 4194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Cd47Q61735 Med18-201ENSMUST00000102567 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Cd47Q61735 Epha10-201ENSMUST00000059343 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Cd47Q61735 Prkar2b-202ENSMUST00000036497 3378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Cd47Q61735 Cdc42ep3-201ENSMUST00000068958 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Cd47Q61735 Gm16401-202ENSMUST00000197463 2074 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
Cd47Q61735 Shisa2-201ENSMUST00000053949 3119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Cd47Q61735 Tlcd1-204ENSMUST00000127587 1412 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Cd47Q61735 Kdelc2-201ENSMUST00000037853 3642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Cd47Q61735 Prps1l3-201ENSMUST00000139049 1720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Cd47Q61735 Gm4425-201ENSMUST00000172838 2857 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Cd47Q61735 Kctd1-202ENSMUST00000168989 3456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Cd47Q61735 Cbl-204ENSMUST00000205968 2809 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Cd47Q61735 Ypel3-204ENSMUST00000106359 469 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Cd47Q61735 Gm12382-201ENSMUST00000122005 922 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
Cd47Q61735 Spata3-208ENSMUST00000149469 1110 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Cd47Q61735 H2-K2-201ENSMUST00000174250 1049 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
Cd47Q61735 Gm34933-201ENSMUST00000203245 1067 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Cd47Q61735 Rpl18a-206ENSMUST00000212709 700 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Cd47Q61735 2900052L18Rik-201ENSMUST00000139014 1588 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Cd47Q61735 1190002N15Rik-201ENSMUST00000113028 3950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Cd47Q61735 Ankrd13a-201ENSMUST00000102578 3717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Cd47Q61735 Fam57b-201ENSMUST00000079423 2328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Cd47Q61735 Hif3a-201ENSMUST00000037762 2206 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Cd47Q61735 Rbmxl1-202ENSMUST00000211719 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Cd47Q61735 Nrn1-203ENSMUST00000223611 1443 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
Cd47Q61735 Sprn-201ENSMUST00000059241 3374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Cd47Q61735 Gm16499-203ENSMUST00000204633 2177 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
Cd47Q61735 Zdhhc6-207ENSMUST00000224897 2168 ntAPPRIS P1 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Cd47Q61735 Luc7l2-213ENSMUST00000163047 3141 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Cd47Q61735 Fmr1-205ENSMUST00000114656 4257 ntTSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Cd47Q61735 Tra2a-204ENSMUST00000204189 1777 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Cd47Q61735 Agap1-204ENSMUST00000190096 4078 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Cd47Q61735 Atp6v0a1-203ENSMUST00000103110 2716 ntTSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Cd47Q61735 Foxc2-201ENSMUST00000054691 2725 ntAPPRIS P1 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Cd47Q61735 Crct1-202ENSMUST00000107301 460 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Cd47Q61735 Josd2-204ENSMUST00000118628 864 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Cd47Q61735 Arpc4-202ENSMUST00000171058 695 ntTSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Cd47Q61735 4833428L15Rik-202ENSMUST00000215652 641 ntTSL 3 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Cd47Q61735 Josd2-201ENSMUST00000035844 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Cd47Q61735 Lrch3-211ENSMUST00000170899 2752 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Cd47Q61735 Tmx1-201ENSMUST00000021471 2795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Cd47Q61735 Kri1-201ENSMUST00000038671 2598 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Cd47Q61735 Ilk-212ENSMUST00000163389 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Cd47Q61735 Ptprd-206ENSMUST00000107289 9899 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Cd47Q61735 Cdh24-201ENSMUST00000067784 3489 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Cd47Q61735 Aim2-204ENSMUST00000166137 2079 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Cd47Q61735 Akap8l-201ENSMUST00000050214 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 21.1 ms