Protein–RNA interactions for Protein: Q61657

Hes3, Transcription factor HES-3, mousemouse

Predictions only

Length 175 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hes3Q61657 Zfyve19-201ENSMUST00000090174 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Hes3Q61657 Mycn-201ENSMUST00000043396 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Hes3Q61657 Slc9a6-202ENSMUST00000114784 4449 ntTSL 5 BASIC14.67□□□□□ -0.06
Hes3Q61657 Hmga1-202ENSMUST00000117254 1328 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC14.67□□□□□ -0.06
Hes3Q61657 Snap91-204ENSMUST00000098495 4150 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Hes3Q61657 Wdr41-205ENSMUST00000160801 3062 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.67□□□□□ -0.06
Hes3Q61657 Wdr41-201ENSMUST00000056512 3063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Hes3Q61657 Gabra5-202ENSMUST00000206382 2607 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.67□□□□□ -0.06
Hes3Q61657 Stam-202ENSMUST00000102960 5000 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Hes3Q61657 G3bp2-204ENSMUST00000169094 2716 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Hes3Q61657 Kctd1-202ENSMUST00000168989 3456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Hes3Q61657 Itga6-201ENSMUST00000028522 4310 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Hes3Q61657 Ppp2r5e-201ENSMUST00000021447 4810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Hes3Q61657 Mfsd4b1-201ENSMUST00000163705 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Hes3Q61657 Acap3-202ENSMUST00000105584 4365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Hes3Q61657 Espnl-201ENSMUST00000088904 5445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Hes3Q61657 Mrps10-204ENSMUST00000120737 1017 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Hes3Q61657 Arl4aos-201ENSMUST00000135883 748 ntTSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Hes3Q61657 Tmem14c-201ENSMUST00000021790 914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Hes3Q61657 AC166341.7-201ENSMUST00000221698 126 ntBASIC14.67□□□□□ -0.06
Hes3Q61657 Flywch2-201ENSMUST00000024704 694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Hes3Q61657 Fam50b-201ENSMUST00000039605 1229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Hes3Q61657 1700028I16Rik-201ENSMUST00000076984 1048 ntTSL 5 BASIC14.67□□□□□ -0.06
Hes3Q61657 Parg-201ENSMUST00000022470 4413 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Hes3Q61657 Luc7l2-208ENSMUST00000161538 4253 ntTSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Hes3Q61657 Gm20628-201ENSMUST00000177363 3215 ntBASIC14.67□□□□□ -0.06
Hes3Q61657 Kif5b-201ENSMUST00000025083 6032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Hes3Q61657 Tedc2-201ENSMUST00000024930 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Hes3Q61657 Plbd2-201ENSMUST00000031597 4208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Hes3Q61657 Dennd4b-202ENSMUST00000129564 5647 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.67□□□□□ -0.06
Hes3Q61657 Atp1a1-201ENSMUST00000036493 3679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Hes3Q61657 Tubb4b-ps1-201ENSMUST00000179460 1336 ntBASIC14.66□□□□□ -0.06
Hes3Q61657 Aspscr1-204ENSMUST00000106159 1615 ntTSL 5 BASIC14.66□□□□□ -0.06
Hes3Q61657 Mrpl9-201ENSMUST00000029786 1612 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Hes3Q61657 Zmynd15-203ENSMUST00000108563 2649 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Hes3Q61657 Dnm2-204ENSMUST00000165766 3063 ntTSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Hes3Q61657 Gart-202ENSMUST00000120450 1865 ntTSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Hes3Q61657 Guca1b-202ENSMUST00000145462 1556 ntTSL 2 BASIC14.66□□□□□ -0.06
Hes3Q61657 Agrn-206ENSMUST00000180572 6891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.66□□□□□ -0.06
Hes3Q61657 Ctnnal1-202ENSMUST00000107612 850 ntTSL 3 BASIC14.66□□□□□ -0.06
Hes3Q61657 1700101I19Rik-202ENSMUST00000186712 510 ntBASIC14.66□□□□□ -0.06
Hes3Q61657 Ick-201ENSMUST00000009972 873 ntTSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Hes3Q61657 Snx27-202ENSMUST00000107283 3531 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Hes3Q61657 Polr3e-203ENSMUST00000207481 2545 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Hes3Q61657 Kcna6-204ENSMUST00000185333 5836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Hes3Q61657 Htr5b-201ENSMUST00000055884 1935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Hes3Q61657 Ilk-212ENSMUST00000163389 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Hes3Q61657 Aaed1-202ENSMUST00000220895 2858 ntTSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Hes3Q61657 Bcor-203ENSMUST00000115512 6887 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Hes3Q61657 Lrrn2-201ENSMUST00000027706 3428 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Hes3Q61657 Pigl-201ENSMUST00000014389 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Hes3Q61657 Matr3-214ENSMUST00000190029 2845 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.65□□□□□ -0.06
Hes3Q61657 Gpr180-201ENSMUST00000022728 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Hes3Q61657 Tnfsf14-201ENSMUST00000005976 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Hes3Q61657 Yipf2-202ENSMUST00000078572 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Hes3Q61657 Mmd-202ENSMUST00000107887 1654 ntTSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Hes3Q61657 Mal-202ENSMUST00000028854 2778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Hes3Q61657 Ntng1-207ENSMUST00000131027 1485 ntTSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Hes3Q61657 9530080O11Rik-201ENSMUST00000137239 1475 ntTSL 2 BASIC14.65□□□□□ -0.06
Hes3Q61657 Ntng1-209ENSMUST00000138344 1452 ntTSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Hes3Q61657 1600012H06Rik-203ENSMUST00000174004 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Hes3Q61657 Spi1-201ENSMUST00000002180 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Hes3Q61657 Tmprss5-201ENSMUST00000070390 2047 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Hes3Q61657 Ngly1-201ENSMUST00000022310 2935 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Hes3Q61657 Ssu72-202ENSMUST00000105595 874 ntTSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Hes3Q61657 Bex3-202ENSMUST00000113112 826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Hes3Q61657 Tpm1-204ENSMUST00000113684 887 ntTSL 5 BASIC14.65□□□□□ -0.06
Hes3Q61657 Pigp-203ENSMUST00000113910 966 ntTSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Hes3Q61657 Arl6ip4-202ENSMUST00000122394 982 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.65□□□□□ -0.06
Hes3Q61657 Gm12473-201ENSMUST00000137535 579 ntTSL 5 BASIC14.65□□□□□ -0.06
Hes3Q61657 Gm20635-201ENSMUST00000176473 1287 ntTSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Hes3Q61657 Gm37856-201ENSMUST00000191634 999 ntBASIC14.65□□□□□ -0.06
Hes3Q61657 4930554G22Rik-201ENSMUST00000196102 686 ntBASIC14.65□□□□□ -0.06
Hes3Q61657 P2rx4-201ENSMUST00000031429 2702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Hes3Q61657 Gm16401-202ENSMUST00000197463 2074 ntBASIC14.65□□□□□ -0.06
Hes3Q61657 Ints8-201ENSMUST00000044616 3433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Hes3Q61657 Plcl1-201ENSMUST00000042986 6580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Hes3Q61657 Slit1-201ENSMUST00000025993 5045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Hes3Q61657 Krt81-201ENSMUST00000061185 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Hes3Q61657 Fxyd6-201ENSMUST00000085939 1788 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Hes3Q61657 Entpd7-201ENSMUST00000081079 5911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Hes3Q61657 Dbndd1-202ENSMUST00000176286 1344 ntTSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Hes3Q61657 H6pd-201ENSMUST00000030830 4745 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Hes3Q61657 Lrrtm1-202ENSMUST00000159616 2541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Hes3Q61657 Gprc5c-203ENSMUST00000122967 1709 ntTSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
Hes3Q61657 Dhrs7-201ENSMUST00000021512 1385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Hes3Q61657 Dtx2-201ENSMUST00000005072 2562 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Hes3Q61657 Asph-210ENSMUST00000108337 2836 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Hes3Q61657 Abi1-215ENSMUST00000178908 2239 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
Hes3Q61657 Gm12527-201ENSMUST00000117967 564 ntBASIC14.64□□□□□ -0.07
Hes3Q61657 Tnfaip8l2-201ENSMUST00000013851 1122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Hes3Q61657 Gm37292-201ENSMUST00000192062 758 ntBASIC14.64□□□□□ -0.07
Hes3Q61657 Trmt13-210ENSMUST00000198454 880 ntBASIC14.64□□□□□ -0.07
Hes3Q61657 Rpl18a-206ENSMUST00000212709 700 ntTSL 2 BASIC14.64□□□□□ -0.07
Hes3Q61657 Gm46218-201ENSMUST00000215448 801 ntTSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
Hes3Q61657 H2-Eb1-201ENSMUST00000074557 1184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Hes3Q61657 Tra2a-204ENSMUST00000204189 1777 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Hes3Q61657 Pacs2-202ENSMUST00000220541 3101 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Hes3Q61657 Ube2d3-202ENSMUST00000166033 2504 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Hes3Q61657 Gas6-201ENSMUST00000033828 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 26 ms