Protein–RNA interactions for Protein: Q61474

Msi1, RNA-binding protein Musashi homolog 1, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 362 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Msi1Q61474 Tnfsf14-201ENSMUST00000005976 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Msi1Q61474 Usp36-201ENSMUST00000092382 5609 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.48■□□□□ 0.39
Msi1Q61474 Tmem8-201ENSMUST00000025010 3464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Msi1Q61474 Klf3-201ENSMUST00000165536 5221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Msi1Q61474 Impdh1-210ENSMUST00000162739 2471 ntTSL 5 BASIC17.47■□□□□ 0.39
Msi1Q61474 Ndufv3-201ENSMUST00000046288 1537 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Msi1Q61474 Lrrc47-201ENSMUST00000030894 3395 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Msi1Q61474 Smad5-203ENSMUST00000109876 4570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Msi1Q61474 Rasl10b-204ENSMUST00000175848 3249 ntTSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Msi1Q61474 Map3k7-202ENSMUST00000080933 5669 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Msi1Q61474 Gpha2-202ENSMUST00000113526 762 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.47■□□□□ 0.39
Msi1Q61474 Rfesd-202ENSMUST00000167271 595 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.47■□□□□ 0.39
Msi1Q61474 Gm23634-201ENSMUST00000175071 91 ntBASIC17.47■□□□□ 0.39
Msi1Q61474 Gm26827-201ENSMUST00000181911 148 ntTSL 5 BASIC17.47■□□□□ 0.39
Msi1Q61474 Bcl7c-205ENSMUST00000205977 891 ntTSL 2 BASIC17.47■□□□□ 0.39
Msi1Q61474 Gpha2-201ENSMUST00000025698 609 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Msi1Q61474 Krtap1-5-201ENSMUST00000054532 1041 ntAPPRIS P1 BASIC17.47■□□□□ 0.39
Msi1Q61474 Nsfl1c-201ENSMUST00000028949 1364 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Msi1Q61474 Kcnd3-202ENSMUST00000098761 7169 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Msi1Q61474 Platr31-201ENSMUST00000180653 1466 ntTSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Msi1Q61474 Gpr6-201ENSMUST00000061796 1786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Msi1Q61474 Acads-201ENSMUST00000031524 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Msi1Q61474 A430057M04Rik-202ENSMUST00000170150 2176 ntTSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Msi1Q61474 Usp36-202ENSMUST00000106296 5655 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.47■□□□□ 0.39
Msi1Q61474 Ckap4-202ENSMUST00000167671 2606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Msi1Q61474 Mtif3-201ENSMUST00000016654 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Msi1Q61474 2310002F09Rik-201ENSMUST00000181454 1607 ntTSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Msi1Q61474 Actl10-201ENSMUST00000104928 1501 ntAPPRIS P1 BASIC17.47■□□□□ 0.39
Msi1Q61474 Actl10-202ENSMUST00000226583 1501 ntBASIC17.47■□□□□ 0.39
Msi1Q61474 Hsf5-201ENSMUST00000093956 4158 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.47■□□□□ 0.39
Msi1Q61474 Deaf1-209ENSMUST00000211537 2882 ntTSL 2 BASIC17.46■□□□□ 0.39
Msi1Q61474 Zdhhc24-201ENSMUST00000006632 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Msi1Q61474 3110002H16Rik-201ENSMUST00000025276 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Msi1Q61474 Cyb561d2-201ENSMUST00000041459 1786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Msi1Q61474 Ube2z-201ENSMUST00000100528 3997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Msi1Q61474 Dpep3-201ENSMUST00000034371 1698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Msi1Q61474 Trim14-202ENSMUST00000102924 1582 ntTSL 2 BASIC17.46■□□□□ 0.39
Msi1Q61474 Ankra2-203ENSMUST00000123924 2328 ntTSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Msi1Q61474 Myb-201ENSMUST00000020158 3074 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Msi1Q61474 Hoxa6-201ENSMUST00000062829 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Msi1Q61474 Tbpl1-201ENSMUST00000095794 1195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Msi1Q61474 Lrrc43-202ENSMUST00000121444 2016 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Msi1Q61474 Ppfia1-201ENSMUST00000168134 5181 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Msi1Q61474 Ptgis-202ENSMUST00000088041 1711 ntTSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Msi1Q61474 Irak2-203ENSMUST00000089023 1734 ntTSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Msi1Q61474 Ran-201ENSMUST00000031383 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Msi1Q61474 Mink1-205ENSMUST00000102559 4865 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Msi1Q61474 Gclm-201ENSMUST00000029769 5589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Msi1Q61474 Zfp689-202ENSMUST00000106299 1417 ntTSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Msi1Q61474 Men1-205ENSMUST00000113501 2508 ntTSL 5 BASIC17.46■□□□□ 0.38
Msi1Q61474 Atp8b2-202ENSMUST00000107396 5705 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.46■□□□□ 0.38
Msi1Q61474 Ngrn-201ENSMUST00000117989 1317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.38
Msi1Q61474 8030462N17Rik-201ENSMUST00000074653 3418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.38
Msi1Q61474 Ankrd22-201ENSMUST00000025686 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Msi1Q61474 Mfsd13a-202ENSMUST00000128041 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Msi1Q61474 Mlxip-202ENSMUST00000111596 2653 ntTSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Msi1Q61474 Spi1-201ENSMUST00000002180 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Msi1Q61474 Rbm12b1-202ENSMUST00000069128 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Msi1Q61474 Gm10649-203ENSMUST00000148066 1812 ntTSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Msi1Q61474 Ndufaf8-201ENSMUST00000106223 781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Msi1Q61474 Gm27389-201ENSMUST00000183622 195 ntBASIC17.45■□□□□ 0.38
Msi1Q61474 Tcta-202ENSMUST00000192886 1094 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.45■□□□□ 0.38
Msi1Q61474 Pdrg1-201ENSMUST00000028972 1273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Msi1Q61474 Coq7-201ENSMUST00000032887 914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Msi1Q61474 Ecel1-201ENSMUST00000027463 2695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Msi1Q61474 Rmdn3-201ENSMUST00000094695 2249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Msi1Q61474 Dnm1-216ENSMUST00000201494 2732 ntTSL 5 BASIC17.45■□□□□ 0.38
Msi1Q61474 Atp8b2-201ENSMUST00000069805 5559 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.45■□□□□ 0.38
Msi1Q61474 Amigo1-202ENSMUST00000106656 5482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Msi1Q61474 Rpf1-201ENSMUST00000029838 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Msi1Q61474 Lrp3-201ENSMUST00000118444 3877 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.45■□□□□ 0.38
Msi1Q61474 Krt27-201ENSMUST00000017732 1550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Msi1Q61474 Wnt10b-204ENSMUST00000226655 1807 ntBASIC17.44■□□□□ 0.38
Msi1Q61474 Zic1-202ENSMUST00000065360 2811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Msi1Q61474 Pitpnm2-210ENSMUST00000162812 6952 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Msi1Q61474 Large1-202ENSMUST00000119826 4647 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.44■□□□□ 0.38
Msi1Q61474 Tnfrsf25-202ENSMUST00000035275 1603 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Msi1Q61474 Mroh5-201ENSMUST00000071419 2766 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Msi1Q61474 Ppdpf-201ENSMUST00000016488 1160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Msi1Q61474 Irak1bp1-201ENSMUST00000034783 1159 ntTSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Msi1Q61474 Nkx2-9-201ENSMUST00000072631 1264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Msi1Q61474 Bcap29-201ENSMUST00000020979 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Msi1Q61474 Lats2-201ENSMUST00000022531 5191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Msi1Q61474 Tm6sf2-202ENSMUST00000110160 1446 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Msi1Q61474 Ube2d1-201ENSMUST00000020085 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Msi1Q61474 Nptxr-203ENSMUST00000175858 4948 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Msi1Q61474 Col4a3bp-201ENSMUST00000077672 2746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Msi1Q61474 Coil-201ENSMUST00000036649 2607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Msi1Q61474 Slc26a10-205ENSMUST00000222911 3067 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.44■□□□□ 0.38
Msi1Q61474 Dusp8-201ENSMUST00000039926 4804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Msi1Q61474 Mrpl37-201ENSMUST00000030365 1498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Msi1Q61474 Nsun5-201ENSMUST00000000940 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Msi1Q61474 Evx2-201ENSMUST00000001867 4191 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Msi1Q61474 Echdc2-203ENSMUST00000116307 893 ntTSL 5 BASIC17.43■□□□□ 0.38
Msi1Q61474 Asnsd1-202ENSMUST00000123519 983 ntTSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Msi1Q61474 Gm26039-201ENSMUST00000158152 144 ntBASIC17.43■□□□□ 0.38
Msi1Q61474 Aga-203ENSMUST00000211424 1147 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Msi1Q61474 AC130671.1-201ENSMUST00000227384 1237 ntBASIC17.43■□□□□ 0.38
Msi1Q61474 Sox6os-201ENSMUST00000032900 420 ntTSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Msi1Q61474 Rpl21-202ENSMUST00000075453 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 22.3 ms