Protein–RNA interactions for Protein: Q61473

Sox17, Transcription factor SOX-17, mousemouse

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Length 419 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sox17Q61473 Htr5b-201ENSMUST00000055884 1935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
Sox17Q61473 Plekha7-210ENSMUST00000182834 5257 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
Sox17Q61473 Nkx2-1-201ENSMUST00000001536 2809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Sox17Q61473 Espn-206ENSMUST00000103196 1323 ntTSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Sox17Q61473 Aldh2-202ENSMUST00000129753 1799 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Sox17Q61473 Atp8b1-201ENSMUST00000025482 6440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Sox17Q61473 Ankrd29-201ENSMUST00000118525 3242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Sox17Q61473 Mis18bp1-208ENSMUST00000222244 2053 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Sox17Q61473 Sh3yl1-202ENSMUST00000110880 1601 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Sox17Q61473 App-203ENSMUST00000226801 3299 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Sox17Q61473 Klf13-202ENSMUST00000183817 599 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Sox17Q61473 Gm29458-201ENSMUST00000187093 354 ntTSL 3 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Sox17Q61473 Erh-205ENSMUST00000218740 981 ntTSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Sox17Q61473 Dtnbp1-208ENSMUST00000222805 1231 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Sox17Q61473 Arl10-201ENSMUST00000026988 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Sox17Q61473 Zmynd11-207ENSMUST00000110638 4003 ntTSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Sox17Q61473 Lrrc7-201ENSMUST00000106044 5918 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Sox17Q61473 Mrpl9-202ENSMUST00000196143 1657 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Sox17Q61473 Gata5os-201ENSMUST00000069943 1678 ntTSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Sox17Q61473 Snrnp48-201ENSMUST00000091641 1785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Sox17Q61473 Krt90-201ENSMUST00000023714 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Sox17Q61473 Rgl3-201ENSMUST00000045726 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Sox17Q61473 Kdm5b-203ENSMUST00000112198 5413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Sox17Q61473 Zkscan14-201ENSMUST00000031632 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Sox17Q61473 Dclk2-208ENSMUST00000194452 2066 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Sox17Q61473 Xiap-203ENSMUST00000115094 6542 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Sox17Q61473 Tmem131l-201ENSMUST00000052342 4815 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Sox17Q61473 Kcnq2-204ENSMUST00000103047 2899 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Sox17Q61473 Ttc13-203ENSMUST00000118134 3277 ntTSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Sox17Q61473 Ppfibp1-201ENSMUST00000016631 4851 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Sox17Q61473 Dpyd-204ENSMUST00000149101 531 ntTSL 3 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Sox17Q61473 Fhl2-201ENSMUST00000008280 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Sox17Q61473 Timm44-201ENSMUST00000003029 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Sox17Q61473 Tia1-203ENSMUST00000095754 1789 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Sox17Q61473 Rab7-203ENSMUST00000113597 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Sox17Q61473 Zfp648-201ENSMUST00000086195 1892 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Sox17Q61473 A230103J11Rik-202ENSMUST00000156084 2086 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Sox17Q61473 Igdcc3-203ENSMUST00000217371 3183 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Sox17Q61473 Gclc-201ENSMUST00000034905 3423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Sox17Q61473 Kctd15-203ENSMUST00000108070 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Sox17Q61473 Pgap3-202ENSMUST00000090827 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Sox17Q61473 Mief1-203ENSMUST00000228788 5352 ntAPPRIS P1 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Sox17Q61473 Ell2-201ENSMUST00000001583 4382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Sox17Q61473 Alcam-201ENSMUST00000023312 6036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Sox17Q61473 Med15-202ENSMUST00000080936 3263 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Sox17Q61473 Foxo3-201ENSMUST00000056974 2889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Sox17Q61473 Disc1-201ENSMUST00000074562 2597 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Sox17Q61473 Disc1-203ENSMUST00000098311 2597 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Sox17Q61473 Mtcl1-202ENSMUST00000097291 7274 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Sox17Q61473 Slc46a1-201ENSMUST00000001126 1978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Sox17Q61473 Ptpdc1-201ENSMUST00000035824 4402 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Sox17Q61473 Immp2l-203ENSMUST00000134965 977 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Sox17Q61473 Tspan2os-201ENSMUST00000146624 590 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Sox17Q61473 Mcl1-202ENSMUST00000178686 858 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Sox17Q61473 Mtag2-201ENSMUST00000058665 714 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
Sox17Q61473 Sds-201ENSMUST00000066540 1207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Sox17Q61473 Abhd16a-201ENSMUST00000007251 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Sox17Q61473 Etnk1-201ENSMUST00000032413 6433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Sox17Q61473 Senp7-211ENSMUST00000202000 3218 ntTSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Sox17Q61473 2310002F09Rik-201ENSMUST00000181454 1607 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Sox17Q61473 Arfip2-202ENSMUST00000084782 2254 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
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Sox17Q61473 Phf7-201ENSMUST00000022459 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Sox17Q61473 Unc13b-203ENSMUST00000107953 5034 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Sox17Q61473 Amigo1-202ENSMUST00000106656 5482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Sox17Q61473 Rasgef1b-205ENSMUST00000161148 2430 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Sox17Q61473 Pacsin3-201ENSMUST00000028694 1862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Sox17Q61473 Taz-201ENSMUST00000069722 1851 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Sox17Q61473 Rcc2-202ENSMUST00000071169 3999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Sox17Q61473 Mettl27-204ENSMUST00000111219 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Sox17Q61473 Sybu-202ENSMUST00000110267 3127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Sox17Q61473 Gnb1-203ENSMUST00000165335 3143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Sox17Q61473 Taf5l-201ENSMUST00000093039 2912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Sox17Q61473 Gm5421-201ENSMUST00000181698 2354 ntBASIC15.92■□□□□ 0.14
Sox17Q61473 Tm7sf2-202ENSMUST00000113543 1498 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Sox17Q61473 Casc3-201ENSMUST00000017384 3963 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Sox17Q61473 Itga6-201ENSMUST00000028522 4310 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Sox17Q61473 Myo9b-206ENSMUST00000212935 6316 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Sox17Q61473 Lonp2-201ENSMUST00000034141 2860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Sox17Q61473 Mff-212ENSMUST00000162003 2087 ntTSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Sox17Q61473 Rtp2-201ENSMUST00000061030 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Sox17Q61473 Luc7l2-208ENSMUST00000161538 4253 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Sox17Q61473 Etv2-201ENSMUST00000108147 1048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Sox17Q61473 Kcnd3os-201ENSMUST00000130683 1091 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Sox17Q61473 Nfe2l3-203ENSMUST00000160133 1125 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Sox17Q61473 Gm26881-201ENSMUST00000180426 593 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Sox17Q61473 Gm3331-201ENSMUST00000183423 1017 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Sox17Q61473 D830036C21Rik-201ENSMUST00000207444 453 ntTSL 3 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Sox17Q61473 Psmb5-201ENSMUST00000022803 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Sox17Q61473 Gm7075-201ENSMUST00000054760 425 ntAPPRIS P1 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Sox17Q61473 Tcap-201ENSMUST00000008021 948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Sox17Q61473 Ltbp4-202ENSMUST00000108369 5377 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Sox17Q61473 Rundc3b-201ENSMUST00000047485 3677 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Sox17Q61473 Pola2-202ENSMUST00000165143 2397 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Sox17Q61473 Gm16386-201ENSMUST00000181397 1423 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Sox17Q61473 Cadps2-202ENSMUST00000069074 3935 ntTSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Sox17Q61473 Agfg1-208ENSMUST00000190052 2991 ntTSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Sox17Q61473 Npffr1-201ENSMUST00000020287 3479 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Sox17Q61473 Cirbp-202ENSMUST00000105365 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
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