Protein–RNA interactions for Protein: Q61412

Vsx2, Visual system homeobox 2, mousemouse

Predictions only

Length 361 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Vsx2Q61412 Cib1-207ENSMUST00000206084 772 ntTSL 3 BASIC16.55■□□□□ 0.24
Vsx2Q61412 AC135963.1-201ENSMUST00000211640 717 ntBASIC16.55■□□□□ 0.24
Vsx2Q61412 Gm30025-201ENSMUST00000218555 728 ntBASIC16.55■□□□□ 0.24
Vsx2Q61412 Lce1m-201ENSMUST00000029520 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Vsx2Q61412 Grhpr-201ENSMUST00000045078 1280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Vsx2Q61412 Cib1-202ENSMUST00000071457 702 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Vsx2Q61412 Gzmd-201ENSMUST00000082093 964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Vsx2Q61412 Cask-201ENSMUST00000033321 4057 ntTSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
Vsx2Q61412 Bambi-201ENSMUST00000025075 5040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Vsx2Q61412 Nelfb-201ENSMUST00000059849 2637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Vsx2Q61412 Mrpl9-201ENSMUST00000029786 1612 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Vsx2Q61412 A730089K16Rik-201ENSMUST00000194526 2427 ntBASIC16.55■□□□□ 0.24
Vsx2Q61412 Il1rn-201ENSMUST00000114482 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Vsx2Q61412 Shc3-201ENSMUST00000021898 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Vsx2Q61412 Tle3-211ENSMUST00000161689 2836 ntTSL 2 BASIC16.55■□□□□ 0.24
Vsx2Q61412 Mapkapk3-201ENSMUST00000035194 2816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Vsx2Q61412 Bub3-201ENSMUST00000084502 2218 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Vsx2Q61412 C230012O17Rik-201ENSMUST00000130085 2999 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Vsx2Q61412 Atf7-209ENSMUST00000184485 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Vsx2Q61412 Impdh1-210ENSMUST00000162739 2471 ntTSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
Vsx2Q61412 Nfs1-201ENSMUST00000029147 2051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Vsx2Q61412 Nkpd1-201ENSMUST00000078908 2753 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Vsx2Q61412 Smpdl3b-201ENSMUST00000030709 2006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Vsx2Q61412 Ttc39a-201ENSMUST00000064129 2356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Vsx2Q61412 Sap18-201ENSMUST00000111267 660 ntTSL 2 BASIC16.54■□□□□ 0.24
Vsx2Q61412 Echdc2-204ENSMUST00000116309 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Vsx2Q61412 Ubtf-207ENSMUST00000128016 1062 ntTSL 2 BASIC16.54■□□□□ 0.24
Vsx2Q61412 D330023K18Rik-201ENSMUST00000133550 920 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Vsx2Q61412 2210408F21Rik-211ENSMUST00000151800 750 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Vsx2Q61412 Gm42884-202ENSMUST00000202523 423 ntTSL 3 BASIC16.54■□□□□ 0.24
Vsx2Q61412 Gm11273-201ENSMUST00000044043 390 ntAPPRIS P1 BASIC16.54■□□□□ 0.24
Vsx2Q61412 Vps37d-202ENSMUST00000076203 1286 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Vsx2Q61412 Klc3-202ENSMUST00000108457 1632 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
Vsx2Q61412 Kbtbd11-201ENSMUST00000069399 6973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Vsx2Q61412 Aig1-205ENSMUST00000162610 1554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Vsx2Q61412 Txnl1-201ENSMUST00000025476 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Vsx2Q61412 Atg4c-201ENSMUST00000030279 3178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Vsx2Q61412 AW011738-201ENSMUST00000105140 1848 ntAPPRIS P1 BASIC16.54■□□□□ 0.24
Vsx2Q61412 Ptpa-202ENSMUST00000113601 1838 ntTSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
Vsx2Q61412 Nrl-202ENSMUST00000111404 2422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Vsx2Q61412 Hmbox1-203ENSMUST00000175744 1771 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Vsx2Q61412 Iqsec1-202ENSMUST00000101153 8036 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Vsx2Q61412 Necab3-202ENSMUST00000109716 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Vsx2Q61412 Cpsf4-207ENSMUST00000162244 1387 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Vsx2Q61412 Prss33-201ENSMUST00000059906 1360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Vsx2Q61412 Adgrl1-201ENSMUST00000045393 5643 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Vsx2Q61412 Acss2-202ENSMUST00000065973 2876 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Vsx2Q61412 Taf6l-205ENSMUST00000176496 2224 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Vsx2Q61412 Senp3-202ENSMUST00000066760 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Vsx2Q61412 2210408F21Rik-213ENSMUST00000153057 652 ntTSL 3 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Vsx2Q61412 Gm20403-201ENSMUST00000173803 372 ntAPPRIS P1 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Vsx2Q61412 Gm19426-201ENSMUST00000181711 726 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Vsx2Q61412 Klf13-202ENSMUST00000183817 599 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Vsx2Q61412 Krtap5-1-202ENSMUST00000188274 742 ntBASIC16.53■□□□□ 0.24
Vsx2Q61412 Nudt17-204ENSMUST00000200387 2108 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Vsx2Q61412 Rps12-206ENSMUST00000218221 460 ntTSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Vsx2Q61412 Cebpg-201ENSMUST00000070191 914 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Vsx2Q61412 Usf3-201ENSMUST00000088356 757 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Vsx2Q61412 Nat8l-201ENSMUST00000056355 6529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Vsx2Q61412 Agfg1-205ENSMUST00000187899 2078 ntTSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Vsx2Q61412 Yars2-204ENSMUST00000159962 2805 ntTSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Vsx2Q61412 Matk-201ENSMUST00000105328 2228 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Vsx2Q61412 Meox1-201ENSMUST00000057054 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Vsx2Q61412 Erlin1-201ENSMUST00000071698 3228 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Vsx2Q61412 Rcbtb2-226ENSMUST00000171767 2692 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Vsx2Q61412 Gm2788-202ENSMUST00000147173 1390 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Vsx2Q61412 Lrp12-202ENSMUST00000110305 4244 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Vsx2Q61412 Gbx1-201ENSMUST00000088311 3475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Vsx2Q61412 Tra2a-204ENSMUST00000204189 1777 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Vsx2Q61412 Zfp668-203ENSMUST00000106262 3169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Vsx2Q61412 Nrn1-202ENSMUST00000122286 691 ntTSL 3 BASIC16.52■□□□□ 0.24
Vsx2Q61412 Gm16120-201ENSMUST00000127990 808 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Vsx2Q61412 Utf1-201ENSMUST00000168457 1227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Vsx2Q61412 Gm38027-201ENSMUST00000192315 235 ntBASIC16.52■□□□□ 0.24
Vsx2Q61412 Lysmd2-201ENSMUST00000034702 1189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Vsx2Q61412 Ddx41-204ENSMUST00000224765 2199 ntBASIC16.52■□□□□ 0.24
Vsx2Q61412 Rexo1-201ENSMUST00000057910 5250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
Vsx2Q61412 Foxq1-201ENSMUST00000042118 4843 ntAPPRIS P1 BASIC16.51■□□□□ 0.23
Vsx2Q61412 Apba3-201ENSMUST00000057798 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Vsx2Q61412 Fiz1-208ENSMUST00000208944 2306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Vsx2Q61412 Tmtc4-209ENSMUST00000148661 2719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Vsx2Q61412 Fam126a-201ENSMUST00000030849 5659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Vsx2Q61412 Iars2-201ENSMUST00000027921 5471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Vsx2Q61412 Atxn7l2-204ENSMUST00000119650 2274 ntTSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
Vsx2Q61412 Ctnnal1-202ENSMUST00000107612 850 ntTSL 3 BASIC16.51■□□□□ 0.23
Vsx2Q61412 Gm24841-201ENSMUST00000158676 357 ntBASIC16.51■□□□□ 0.23
Vsx2Q61412 Ndufa12-201ENSMUST00000020209 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Vsx2Q61412 Fxyd1-208ENSMUST00000205807 539 ntTSL 3 BASIC16.51■□□□□ 0.23
Vsx2Q61412 Casp3-203ENSMUST00000210534 583 ntTSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
Vsx2Q61412 Rps28-201ENSMUST00000087342 392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Vsx2Q61412 Gm26795-201ENSMUST00000180993 1952 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Vsx2Q61412 Rala-201ENSMUST00000009003 2688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Vsx2Q61412 Znfx1-201ENSMUST00000048988 7218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Vsx2Q61412 Gm44618-201ENSMUST00000208431 2262 ntTSL 3 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Vsx2Q61412 Adam33-201ENSMUST00000052104 2795 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Vsx2Q61412 Gpr180-201ENSMUST00000022728 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Vsx2Q61412 Btbd10-203ENSMUST00000119278 2394 ntTSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Vsx2Q61412 Snx25-203ENSMUST00000110378 3445 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Vsx2Q61412 Lgr6-201ENSMUST00000044828 6675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Vsx2Q61412 Neurl1a-202ENSMUST00000111808 4157 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 31.9 ms