Protein–RNA interactions for Protein: Q61290

Cacna1e, Voltage-dependent R-type calcium channel subunit alpha-1E, mousemouse

Predictions only

Length 2,272 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cacna1eQ61290 Kcns1-201ENSMUST00000045196 2712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Cacna1eQ61290 Ift74-202ENSMUST00000107104 1713 ntTSL 2 BASIC16.63■□□□□ 0.25
Cacna1eQ61290 Mfsd13a-201ENSMUST00000086969 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Cacna1eQ61290 Sars2-201ENSMUST00000094632 1868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Cacna1eQ61290 Npcd-202ENSMUST00000089299 1453 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Cacna1eQ61290 Ocel1-201ENSMUST00000002469 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Cacna1eQ61290 Tmem198-202ENSMUST00000113575 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Cacna1eQ61290 Arpc5-201ENSMUST00000077755 1914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Cacna1eQ61290 Actrt3-201ENSMUST00000047630 1961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Cacna1eQ61290 0610009B22Rik-202ENSMUST00000109098 892 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.63■□□□□ 0.25
Cacna1eQ61290 Tpt1-201ENSMUST00000110894 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Cacna1eQ61290 Ppil3-202ENSMUST00000114345 1175 ntTSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Cacna1eQ61290 Apopt1-204ENSMUST00000163220 671 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.63■□□□□ 0.25
Cacna1eQ61290 Srrd-201ENSMUST00000031289 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Cacna1eQ61290 Gm42939-201ENSMUST00000197514 2205 ntBASIC16.63■□□□□ 0.25
Cacna1eQ61290 Lrrc14-204ENSMUST00000137649 2832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Cacna1eQ61290 Acvr2b-205ENSMUST00000215746 3175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Cacna1eQ61290 Pacsin1-202ENSMUST00000097360 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Cacna1eQ61290 2210408F21Rik-212ENSMUST00000152157 490 ntTSL 2 BASIC16.62■□□□□ 0.25
Cacna1eQ61290 Faap20-210ENSMUST00000178473 1076 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Cacna1eQ61290 9530052E02Rik-201ENSMUST00000180750 949 ntTSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Cacna1eQ61290 Pgpep1-208ENSMUST00000211715 676 ntTSL 3 BASIC16.62■□□□□ 0.25
Cacna1eQ61290 Thrsp-201ENSMUST00000043077 1277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Cacna1eQ61290 Dmtn-207ENSMUST00000228001 2437 ntBASIC16.62■□□□□ 0.25
Cacna1eQ61290 Ncoa5-203ENSMUST00000122070 3117 ntTSL 5 BASIC16.62■□□□□ 0.25
Cacna1eQ61290 Foxp1-230ENSMUST00000177437 2468 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Cacna1eQ61290 Stambpl1-201ENSMUST00000054956 2024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Cacna1eQ61290 Fam3a-206ENSMUST00000114143 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Cacna1eQ61290 Agbl5-215ENSMUST00000202060 3121 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Cacna1eQ61290 Ythdc1-203ENSMUST00000120498 3269 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.62■□□□□ 0.25
Cacna1eQ61290 Gm43514-201ENSMUST00000198852 424 ntBASIC16.62■□□□□ 0.25
Cacna1eQ61290 3110040N11Rik-201ENSMUST00000026092 887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Cacna1eQ61290 4931422A03Rik-201ENSMUST00000056170 1037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Cacna1eQ61290 Ubp1-201ENSMUST00000009885 3742 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.62■□□□□ 0.25
Cacna1eQ61290 Gal3st1-201ENSMUST00000063004 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Cacna1eQ61290 Fbxo45-201ENSMUST00000042732 4179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Cacna1eQ61290 Fiz1-203ENSMUST00000167804 2637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Cacna1eQ61290 Eif4a2-201ENSMUST00000023599 2208 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Cacna1eQ61290 Dcaf8-206ENSMUST00000192704 2859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Cacna1eQ61290 AC148328.1-201ENSMUST00000216448 920 ntTSL 5 BASIC16.61■□□□□ 0.25
Cacna1eQ61290 Hist1h1a-201ENSMUST00000055770 741 ntAPPRIS P1 BASIC16.61■□□□□ 0.25
Cacna1eQ61290 Agfg2-201ENSMUST00000031736 2893 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Cacna1eQ61290 Trim33-202ENSMUST00000106860 5025 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Cacna1eQ61290 5330438I03Rik-201ENSMUST00000168347 2845 ntBASIC16.61■□□□□ 0.25
Cacna1eQ61290 A730056A06Rik-201ENSMUST00000181299 2689 ntTSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Cacna1eQ61290 Best2-203ENSMUST00000209421 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Cacna1eQ61290 Gm26825-201ENSMUST00000181751 2026 ntTSL 5 BASIC16.61■□□□□ 0.25
Cacna1eQ61290 Acaa1a-201ENSMUST00000039784 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Cacna1eQ61290 Map3k9-201ENSMUST00000035987 4564 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Cacna1eQ61290 4930458A03Rik-201ENSMUST00000198197 961 ntTSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Cacna1eQ61290 1810010D01Rik-204ENSMUST00000208788 889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Cacna1eQ61290 Rock2-201ENSMUST00000020904 7644 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.61■□□□□ 0.25
Cacna1eQ61290 Cyb5d2-201ENSMUST00000079681 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Cacna1eQ61290 Tm7sf2-201ENSMUST00000025713 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Cacna1eQ61290 Irx5-201ENSMUST00000034184 2450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Cacna1eQ61290 Kcng4-202ENSMUST00000164382 1875 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
Cacna1eQ61290 Cdk9-202ENSMUST00000120105 1565 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Cacna1eQ61290 Cd164l2-201ENSMUST00000105910 986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Cacna1eQ61290 Pih1d1-202ENSMUST00000107811 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Cacna1eQ61290 Gm20675-201ENSMUST00000175861 338 ntTSL 3 BASIC16.6■□□□□ 0.25
Cacna1eQ61290 Camkk2-211ENSMUST00000200109 2751 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Cacna1eQ61290 St8sia5-201ENSMUST00000075290 1841 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Cacna1eQ61290 Paip2-201ENSMUST00000041314 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Cacna1eQ61290 St3gal3-203ENSMUST00000106410 2225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Cacna1eQ61290 Gas1-201ENSMUST00000065086 2961 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.6■□□□□ 0.25
Cacna1eQ61290 Ttc19-201ENSMUST00000050646 3410 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Cacna1eQ61290 Med9-201ENSMUST00000081980 1920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Cacna1eQ61290 Gm11452-201ENSMUST00000122376 690 ntBASIC16.59■□□□□ 0.25
Cacna1eQ61290 2410004I01Rik-201ENSMUST00000138424 1187 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Cacna1eQ61290 Ino80dos-204ENSMUST00000188602 678 ntTSL 2 BASIC16.59■□□□□ 0.25
Cacna1eQ61290 Hs3st2-202ENSMUST00000206880 1149 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Cacna1eQ61290 1700019N19Rik-201ENSMUST00000028299 970 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Cacna1eQ61290 Hist1h2ak-201ENSMUST00000074752 393 ntAPPRIS P1 BASIC16.59■□□□□ 0.25
Cacna1eQ61290 Mfsd10-203ENSMUST00000114331 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Cacna1eQ61290 Tnfsf14-201ENSMUST00000005976 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Cacna1eQ61290 Gm14261-201ENSMUST00000145105 1429 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Cacna1eQ61290 Usp21-201ENSMUST00000065941 2219 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Cacna1eQ61290 Ldlrad4-201ENSMUST00000063775 2493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Cacna1eQ61290 Adgrb1-201ENSMUST00000042035 6228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Cacna1eQ61290 Gm13884-201ENSMUST00000118103 829 ntBASIC16.59■□□□□ 0.25
Cacna1eQ61290 Atp6v1g2-203ENSMUST00000130992 524 ntTSL 2 BASIC16.59■□□□□ 0.25
Cacna1eQ61290 Hint3-203ENSMUST00000161074 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Cacna1eQ61290 Gm9449-201ENSMUST00000207265 1011 ntBASIC16.59■□□□□ 0.25
Cacna1eQ61290 Lmo1-203ENSMUST00000208136 772 ntTSL 2 BASIC16.59■□□□□ 0.25
Cacna1eQ61290 Ndufb9-201ENSMUST00000022980 704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Cacna1eQ61290 Magohb-201ENSMUST00000032307 767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Cacna1eQ61290 Chrna2-202ENSMUST00000206455 1933 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
Cacna1eQ61290 9930012K11Rik-205ENSMUST00000153871 1983 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Cacna1eQ61290 9930012K11Rik-201ENSMUST00000058240 1986 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Cacna1eQ61290 Jdp2-202ENSMUST00000171754 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Cacna1eQ61290 Casp8-204ENSMUST00000191201 1849 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
Cacna1eQ61290 Eral1-201ENSMUST00000021183 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
Cacna1eQ61290 Atp6v1c1-201ENSMUST00000022904 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
Cacna1eQ61290 Auh-202ENSMUST00000110031 3235 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
Cacna1eQ61290 Tgfb1-201ENSMUST00000002678 2175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
Cacna1eQ61290 Usp21-202ENSMUST00000111305 2278 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.25
Cacna1eQ61290 Sdhb-201ENSMUST00000010007 1142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
Cacna1eQ61290 Cyp26b1-203ENSMUST00000204109 1340 ntTSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.25
Cacna1eQ61290 Pias2-202ENSMUST00000114777 4968 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
Cacna1eQ61290 Fbrsl1-206ENSMUST00000198834 2571 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 31 ms