Protein–RNA interactions for Protein: Q61271

Acvr1b, Activin receptor type-1B, mousemouse

Predictions only

Length 505 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Acvr1bQ61271 9530080O11Rik-201ENSMUST00000137239 1475 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Acvr1bQ61271 Ssu72-201ENSMUST00000030905 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Acvr1bQ61271 Nfs1-201ENSMUST00000029147 2051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Acvr1bQ61271 Tnks-201ENSMUST00000033929 9163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Acvr1bQ61271 Ern1-203ENSMUST00000106800 654 ntTSL 3 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Acvr1bQ61271 Pld2-203ENSMUST00000108557 3655 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Acvr1bQ61271 Gtf2a2-204ENSMUST00000119905 622 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Acvr1bQ61271 Mrps10-204ENSMUST00000120737 1017 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Acvr1bQ61271 1700101I19Rik-202ENSMUST00000186712 510 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
Acvr1bQ61271 Gm37856-201ENSMUST00000191634 999 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
Acvr1bQ61271 Gabarapl1-202ENSMUST00000204487 902 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Acvr1bQ61271 Krt81-201ENSMUST00000061185 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Acvr1bQ61271 Ube2s-201ENSMUST00000079496 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Acvr1bQ61271 Tmem260-201ENSMUST00000111735 5485 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Acvr1bQ61271 Mycn-201ENSMUST00000043396 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Acvr1bQ61271 Pex5-202ENSMUST00000080557 3073 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Acvr1bQ61271 Fhl1-203ENSMUST00000114769 2770 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Acvr1bQ61271 A130014A01Rik-201ENSMUST00000183021 2323 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
Acvr1bQ61271 Hnrnpll-205ENSMUST00000184635 3009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Acvr1bQ61271 Gramd4-204ENSMUST00000138134 4292 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Acvr1bQ61271 Nat8l-201ENSMUST00000056355 6529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Acvr1bQ61271 Chka-202ENSMUST00000072055 2549 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Acvr1bQ61271 Cdipt-201ENSMUST00000032920 1974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Acvr1bQ61271 Hrh3-202ENSMUST00000163215 1401 ntTSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Acvr1bQ61271 Rbpms-201ENSMUST00000033994 2375 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Acvr1bQ61271 Ssu72-202ENSMUST00000105595 874 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Acvr1bQ61271 Spata3-208ENSMUST00000149469 1110 ntTSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Acvr1bQ61271 Gm17098-201ENSMUST00000166507 628 ntTSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Acvr1bQ61271 Gm36736-201ENSMUST00000206060 646 ntTSL 3 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Acvr1bQ61271 Cmc1-201ENSMUST00000044220 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Acvr1bQ61271 Haglr-201ENSMUST00000100000 2085 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
Acvr1bQ61271 Disp3-201ENSMUST00000047720 5282 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Acvr1bQ61271 Mmp28-204ENSMUST00000119346 1517 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Acvr1bQ61271 Rsph3a-201ENSMUST00000097423 2189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Acvr1bQ61271 Sapcd2-202ENSMUST00000100323 1761 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Acvr1bQ61271 Tmem125-201ENSMUST00000060214 1864 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.06
Acvr1bQ61271 Rhot1-201ENSMUST00000017831 3029 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
Acvr1bQ61271 2810408A11Rik-201ENSMUST00000018714 1485 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
Acvr1bQ61271 Fam126a-201ENSMUST00000030849 5659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
Acvr1bQ61271 Slc27a1-207ENSMUST00000212889 2730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Acvr1bQ61271 Plbd2-201ENSMUST00000031597 4208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Acvr1bQ61271 Gm10649-203ENSMUST00000148066 1812 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Acvr1bQ61271 Gm16401-202ENSMUST00000197463 2074 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
Acvr1bQ61271 Slc35f2-201ENSMUST00000048670 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Acvr1bQ61271 Ngly1-201ENSMUST00000022310 2935 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Acvr1bQ61271 Prss56-201ENSMUST00000044533 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Acvr1bQ61271 Trim7-201ENSMUST00000046903 2161 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Acvr1bQ61271 Nrn1-203ENSMUST00000223611 1443 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
Acvr1bQ61271 Sfrp2-201ENSMUST00000029625 2003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Acvr1bQ61271 Slc25a23-201ENSMUST00000040280 3362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Acvr1bQ61271 Ptpn5-201ENSMUST00000033142 3145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Acvr1bQ61271 Ina-201ENSMUST00000037636 3240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Acvr1bQ61271 Tpm1-204ENSMUST00000113684 887 ntTSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Acvr1bQ61271 Gm13168-201ENSMUST00000121771 632 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
Acvr1bQ61271 Gm20635-201ENSMUST00000176473 1287 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Acvr1bQ61271 Kcnn4-203ENSMUST00000205626 461 ntTSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Acvr1bQ61271 Atp5c1-201ENSMUST00000026887 1060 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Acvr1bQ61271 Cebpg-201ENSMUST00000070191 914 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Acvr1bQ61271 Pcmt1-202ENSMUST00000159917 2491 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Acvr1bQ61271 Sh3yl1-202ENSMUST00000110880 1601 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Acvr1bQ61271 Rhof-201ENSMUST00000031401 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Acvr1bQ61271 Gm28265-201ENSMUST00000188201 2319 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
Acvr1bQ61271 Kank3-202ENSMUST00000172649 2652 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Acvr1bQ61271 Nfe2l3-201ENSMUST00000005103 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Acvr1bQ61271 Relt-201ENSMUST00000008462 2851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Acvr1bQ61271 Msmo1-201ENSMUST00000034015 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Acvr1bQ61271 Acap3-201ENSMUST00000079031 4301 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Acvr1bQ61271 Plcl2-201ENSMUST00000043938 4050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Acvr1bQ61271 Cacnb1-204ENSMUST00000107561 1778 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Acvr1bQ61271 Gm19721-201ENSMUST00000195284 1764 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
Acvr1bQ61271 Atf6b-202ENSMUST00000173984 2315 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Acvr1bQ61271 Aipl1-201ENSMUST00000048207 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Acvr1bQ61271 Dnajc25-201ENSMUST00000095070 4023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Acvr1bQ61271 F12-201ENSMUST00000021948 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Acvr1bQ61271 Tm9sf1-205ENSMUST00000122358 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Acvr1bQ61271 Plxdc1-202ENSMUST00000107564 619 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Acvr1bQ61271 Bex3-202ENSMUST00000113112 826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Acvr1bQ61271 Gm12382-201ENSMUST00000122005 922 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
Acvr1bQ61271 H2-K2-201ENSMUST00000174250 1049 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
Acvr1bQ61271 1600023N17Rik-201ENSMUST00000196242 1007 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
Acvr1bQ61271 AC135637.1-201ENSMUST00000227750 365 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
Acvr1bQ61271 Flywch2-201ENSMUST00000024704 694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Acvr1bQ61271 Cdk2ap2-201ENSMUST00000025779 1080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Acvr1bQ61271 Ldb1-205ENSMUST00000137771 2014 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Acvr1bQ61271 Ube2j2-213ENSMUST00000166489 3339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Acvr1bQ61271 Aig1-205ENSMUST00000162610 1554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Acvr1bQ61271 Lrfn1-202ENSMUST00000108288 3060 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Acvr1bQ61271 Ctsf-201ENSMUST00000119694 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Acvr1bQ61271 Fgfr1-214ENSMUST00000178276 4741 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Acvr1bQ61271 Tubb4b-ps1-201ENSMUST00000179460 1336 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
Acvr1bQ61271 Wdr41-205ENSMUST00000160801 3062 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Acvr1bQ61271 Wdr41-201ENSMUST00000056512 3063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Acvr1bQ61271 Gm21974-201ENSMUST00000126662 2037 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Acvr1bQ61271 Ccdc58-202ENSMUST00000163352 970 ntTSL 3 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Acvr1bQ61271 Ccdc58-203ENSMUST00000164916 1096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Acvr1bQ61271 Tpgs1-201ENSMUST00000020552 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Acvr1bQ61271 Tmem14c-201ENSMUST00000021790 914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Acvr1bQ61271 Purg-201ENSMUST00000070340 1064 ntAPPRIS P1 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Acvr1bQ61271 Lrrc73-201ENSMUST00000095262 1384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Acvr1bQ61271 Parg-201ENSMUST00000022470 4413 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 126.6 ms