Protein–RNA interactions for Protein: Q61146

Ocln, Occludin, mousemouse

Predictions only

Length 521 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
OclnQ61146 Sphk1-206ENSMUST00000106388 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
OclnQ61146 Zfp648-201ENSMUST00000086195 1892 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.88■□□□□ 0.13
OclnQ61146 Fam71e1-202ENSMUST00000205359 1307 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
OclnQ61146 Hps6-201ENSMUST00000099393 2696 ntAPPRIS P1 BASIC15.88■□□□□ 0.13
OclnQ61146 Usp6nl-202ENSMUST00000114937 7484 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
OclnQ61146 Wdr41-205ENSMUST00000160801 3062 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
OclnQ61146 Wdr41-201ENSMUST00000056512 3063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
OclnQ61146 Was-201ENSMUST00000033505 2114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
OclnQ61146 2610301B20Rik-201ENSMUST00000080517 2116 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
OclnQ61146 Lrrc36-206ENSMUST00000216765 2301 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
OclnQ61146 Uso1-201ENSMUST00000031355 3898 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
OclnQ61146 Gm17509-201ENSMUST00000165680 2375 ntAPPRIS P1 BASIC15.87■□□□□ 0.13
OclnQ61146 Cdk17-201ENSMUST00000069965 3615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
OclnQ61146 Mid1ip1-202ENSMUST00000115524 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
OclnQ61146 2810408A11Rik-203ENSMUST00000102580 1640 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
OclnQ61146 A830073O21Rik-202ENSMUST00000205693 3096 ntBASIC15.87■□□□□ 0.13
OclnQ61146 Rgs3-203ENSMUST00000098031 2072 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
OclnQ61146 Carmil2-201ENSMUST00000062574 2526 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
OclnQ61146 Gm12896-201ENSMUST00000118430 226 ntBASIC15.87■□□□□ 0.13
OclnQ61146 Snhg6-203ENSMUST00000182580 473 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
OclnQ61146 Gng5-201ENSMUST00000090031 593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
OclnQ61146 Htr5b-201ENSMUST00000055884 1935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
OclnQ61146 Krt84-201ENSMUST00000023720 2570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
OclnQ61146 Rara-202ENSMUST00000107473 3238 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
OclnQ61146 Pld2-203ENSMUST00000108557 3655 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
OclnQ61146 Pld2-201ENSMUST00000018429 3659 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
OclnQ61146 Gabra5-202ENSMUST00000206382 2607 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
OclnQ61146 C130073E24Rik-201ENSMUST00000210222 6144 ntTSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
OclnQ61146 Hmga1-202ENSMUST00000117254 1328 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
OclnQ61146 Mief1-203ENSMUST00000228788 5352 ntAPPRIS P1 BASIC15.87■□□□□ 0.13
OclnQ61146 Gabpa-201ENSMUST00000009120 4987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
OclnQ61146 Cdh2-201ENSMUST00000025166 4843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
OclnQ61146 Gm16754-201ENSMUST00000181222 2077 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
OclnQ61146 Irak1-205ENSMUST00000114353 1896 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
OclnQ61146 Xpo4-209ENSMUST00000174545 8680 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
OclnQ61146 Usp49-201ENSMUST00000024779 8252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
OclnQ61146 Gm45623-201ENSMUST00000210744 1457 ntAPPRIS P1 BASIC15.86■□□□□ 0.13
OclnQ61146 Krt83-201ENSMUST00000023718 1756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
OclnQ61146 Ppp1r36-201ENSMUST00000063977 1515 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
OclnQ61146 1110004F10Rik-202ENSMUST00000106607 1153 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
OclnQ61146 Gabarapl1-202ENSMUST00000204487 902 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
OclnQ61146 1110004E09Rik-201ENSMUST00000023694 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
OclnQ61146 Zfp326-201ENSMUST00000031227 2667 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
OclnQ61146 Rab7-203ENSMUST00000113597 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
OclnQ61146 Gpr180-201ENSMUST00000022728 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
OclnQ61146 Abhd16a-201ENSMUST00000007251 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
OclnQ61146 Mfsd12-201ENSMUST00000044844 3971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
OclnQ61146 Fam181a-201ENSMUST00000179363 1406 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
OclnQ61146 Ilk-212ENSMUST00000163389 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
OclnQ61146 Irak1-201ENSMUST00000033769 2890 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
OclnQ61146 Hsd3b2-201ENSMUST00000107021 1788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
OclnQ61146 Mettl27-204ENSMUST00000111219 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
OclnQ61146 Rassf1-202ENSMUST00000093786 1787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
OclnQ61146 A230103J11Rik-202ENSMUST00000156084 2086 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
OclnQ61146 Iqsec2-203ENSMUST00000112605 6017 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
OclnQ61146 Zfand3-202ENSMUST00000226208 923 ntAPPRIS P1 BASIC15.85■□□□□ 0.13
OclnQ61146 Gm11273-201ENSMUST00000044043 390 ntAPPRIS P1 BASIC15.85■□□□□ 0.13
OclnQ61146 Fabp3-201ENSMUST00000070532 823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
OclnQ61146 Ppp2r2d-207ENSMUST00000155672 1938 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
OclnQ61146 Slc5a10-203ENSMUST00000148584 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
OclnQ61146 Ccdc126-201ENSMUST00000055559 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
OclnQ61146 B3gnt6-201ENSMUST00000098278 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
OclnQ61146 Csk-201ENSMUST00000034863 2749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
OclnQ61146 A930001A20Rik-201ENSMUST00000182586 1366 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
OclnQ61146 Dhrs7-201ENSMUST00000021512 1385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
OclnQ61146 Map4k5-201ENSMUST00000049239 4452 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
OclnQ61146 Inpp5e-202ENSMUST00000114090 2790 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
OclnQ61146 Pde8b-214ENSMUST00000172104 2493 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
OclnQ61146 Doc2g-201ENSMUST00000025806 1446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
OclnQ61146 Trim67-202ENSMUST00000167588 8735 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
OclnQ61146 Spef1-201ENSMUST00000028801 2328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
OclnQ61146 Bhlhb9-201ENSMUST00000068755 2823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
OclnQ61146 Plekha4-206ENSMUST00000211155 2044 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
OclnQ61146 Cerkl-205ENSMUST00000143974 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
OclnQ61146 Ppm1d-201ENSMUST00000020835 2899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
OclnQ61146 Mcoln2-202ENSMUST00000098524 2492 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
OclnQ61146 Brpf1-203ENSMUST00000113121 4603 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
OclnQ61146 Snrnp35-202ENSMUST00000111453 1181 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
OclnQ61146 Hist2h3c2-201ENSMUST00000167403 1020 ntAPPRIS P1 BASIC15.84■□□□□ 0.13
OclnQ61146 Tspan2-203ENSMUST00000196611 682 ntTSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
OclnQ61146 Slc37a3-211ENSMUST00000202749 434 ntTSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
OclnQ61146 Gm42545-201ENSMUST00000202755 922 ntBASIC15.84■□□□□ 0.13
OclnQ61146 Chrac1-201ENSMUST00000089765 871 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
OclnQ61146 Mzf1-202ENSMUST00000182087 2197 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
OclnQ61146 Hbs1l-203ENSMUST00000092674 2625 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
OclnQ61146 Mettl4-ps1-202ENSMUST00000130218 1323 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
OclnQ61146 Slc44a1-201ENSMUST00000102911 3102 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
OclnQ61146 Cdc25a-201ENSMUST00000094324 3632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
OclnQ61146 Foxp4-203ENSMUST00000113263 3156 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
OclnQ61146 Trim45-202ENSMUST00000094048 1815 ntTSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
OclnQ61146 Aqp2-201ENSMUST00000023752 1416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
OclnQ61146 Tsnax-201ENSMUST00000075896 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
OclnQ61146 Rab11fip4-201ENSMUST00000017783 7156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
OclnQ61146 Wrb-201ENSMUST00000023913 2495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
OclnQ61146 Shc1-202ENSMUST00000094378 2617 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
OclnQ61146 Neo1-201ENSMUST00000068664 7379 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
OclnQ61146 Slc25a39-202ENSMUST00000107098 1606 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.13
OclnQ61146 Ffar3-201ENSMUST00000094583 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
OclnQ61146 Cops7b-201ENSMUST00000027446 2231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
OclnQ61146 Ebf1-203ENSMUST00000109268 2864 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.13
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 47.8 ms