Protein–RNA interactions for Protein: Q61069

Usf1, Upstream stimulatory factor 1, mousemouse

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Length 310 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Usf1Q61069 Rgp1-201ENSMUST00000030190 1292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Usf1Q61069 Srrd-201ENSMUST00000031289 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Usf1Q61069 Mamstr-201ENSMUST00000148532 1606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Usf1Q61069 Gm26892-201ENSMUST00000181695 1636 ntTSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Usf1Q61069 Acads-201ENSMUST00000031524 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Usf1Q61069 Shd-201ENSMUST00000044216 1546 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Usf1Q61069 Fhl3-201ENSMUST00000038684 1664 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Usf1Q61069 Tenm3-204ENSMUST00000110346 2267 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Usf1Q61069 Smarca4-201ENSMUST00000034707 6354 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Usf1Q61069 Sharpin-201ENSMUST00000023211 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Usf1Q61069 Hnrnph3-201ENSMUST00000020263 2213 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Usf1Q61069 Irx3-202ENSMUST00000175795 2748 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Usf1Q61069 Ccnd3-202ENSMUST00000171031 2113 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Usf1Q61069 Epdr1-201ENSMUST00000002885 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Usf1Q61069 Ffar3-201ENSMUST00000094583 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Usf1Q61069 Gapvd1-203ENSMUST00000113099 5758 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Usf1Q61069 Mbd6-202ENSMUST00000119078 4287 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
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Usf1Q61069 Tbc1d9-202ENSMUST00000093393 5334 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Usf1Q61069 Sdhb-201ENSMUST00000010007 1142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Usf1Q61069 Rplp2-203ENSMUST00000106004 421 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
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Usf1Q61069 Pced1a-202ENSMUST00000110277 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Usf1Q61069 Rasal2-201ENSMUST00000078308 10047 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Usf1Q61069 Fbxo30-201ENSMUST00000070300 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
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Usf1Q61069 Platr31-201ENSMUST00000180653 1466 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
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Usf1Q61069 Gm5464-201ENSMUST00000100453 2156 ntAPPRIS P1 BASIC15.39■□□□□ 0.05
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Usf1Q61069 Rab11fip3-202ENSMUST00000120691 5103 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Usf1Q61069 Kcng3-201ENSMUST00000051482 3356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Usf1Q61069 Klc1-204ENSMUST00000122300 2268 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Usf1Q61069 Ascl2-201ENSMUST00000009392 1605 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Usf1Q61069 Prdm5-201ENSMUST00000031973 1488 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Usf1Q61069 Gm4675-202ENSMUST00000164755 2322 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Usf1Q61069 Kat14-201ENSMUST00000028911 3801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Usf1Q61069 Rab40c-207ENSMUST00000167626 2506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Usf1Q61069 A530016L24Rik-202ENSMUST00000223266 1547 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Usf1Q61069 Pus1-204ENSMUST00000112426 1389 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Usf1Q61069 Rbm43-201ENSMUST00000102767 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Usf1Q61069 Usf2-201ENSMUST00000058860 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Usf1Q61069 Dll3-201ENSMUST00000108315 2618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Usf1Q61069 Lman2l-202ENSMUST00000115011 2290 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Usf1Q61069 Psme3-201ENSMUST00000019470 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Usf1Q61069 Dnajc24-201ENSMUST00000102555 1197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Usf1Q61069 Chchd7-205ENSMUST00000120732 711 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Usf1Q61069 Tnpo2-207ENSMUST00000211601 2941 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Usf1Q61069 Ppan-201ENSMUST00000004203 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Usf1Q61069 Foxf1-201ENSMUST00000181504 2415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Usf1Q61069 Clint1-202ENSMUST00000109261 3365 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Usf1Q61069 Ppp2r1b-209ENSMUST00000176349 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
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Usf1Q61069 Crhbp-201ENSMUST00000045583 1701 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
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