Protein–RNA interactions for Protein: Q60972

Rbbp4, Histone-binding protein RBBP4, mousemouse

Predictions only

Length 425 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rbbp4Q60972 Fev-202ENSMUST00000159232 928 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Rbbp4Q60972 Gm44210-201ENSMUST00000205253 713 ntTSL 3 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Rbbp4Q60972 Gm36736-201ENSMUST00000206060 646 ntTSL 3 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Rbbp4Q60972 Gpaa1-201ENSMUST00000023221 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Rbbp4Q60972 Gm11273-201ENSMUST00000044043 390 ntAPPRIS P1 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Rbbp4Q60972 Tmprss5-201ENSMUST00000070390 2047 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Rbbp4Q60972 Acvr2a-201ENSMUST00000063886 5686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Rbbp4Q60972 Myo9b-206ENSMUST00000212935 6316 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Rbbp4Q60972 Gm37166-201ENSMUST00000195473 2474 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
Rbbp4Q60972 Klhl33-201ENSMUST00000164415 1602 ntTSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Rbbp4Q60972 Dclk2-208ENSMUST00000194452 2066 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Rbbp4Q60972 Atp6v1c1-201ENSMUST00000022904 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Rbbp4Q60972 Sox14-201ENSMUST00000054819 2065 ntAPPRIS P1 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Rbbp4Q60972 Adnp2-201ENSMUST00000066743 5012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Rbbp4Q60972 Tlcd1-204ENSMUST00000127587 1412 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Rbbp4Q60972 Lrch3-203ENSMUST00000135193 2794 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Rbbp4Q60972 Adam23-201ENSMUST00000087374 6426 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Rbbp4Q60972 Gm45623-201ENSMUST00000210744 1457 ntAPPRIS P1 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Rbbp4Q60972 Tspan4-201ENSMUST00000026585 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Rbbp4Q60972 Nanp-201ENSMUST00000066640 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Rbbp4Q60972 Agpat3-203ENSMUST00000105388 3681 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Rbbp4Q60972 Mrps10-203ENSMUST00000119945 1018 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Rbbp4Q60972 Gm12382-201ENSMUST00000122005 922 ntBASIC15.92■□□□□ 0.14
Rbbp4Q60972 Prss16-204ENSMUST00000150547 1159 ntTSL 3 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Rbbp4Q60972 Alcam-206ENSMUST00000168071 878 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Rbbp4Q60972 2610035F20Rik-202ENSMUST00000177306 1149 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Rbbp4Q60972 Gm37292-201ENSMUST00000192062 758 ntBASIC15.92■□□□□ 0.14
Rbbp4Q60972 Thap3-201ENSMUST00000036680 1124 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Rbbp4Q60972 K230015D01Rik-201ENSMUST00000211969 1516 ntBASIC15.92■□□□□ 0.14
Rbbp4Q60972 Foxq1-201ENSMUST00000042118 4843 ntAPPRIS P1 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Rbbp4Q60972 Brpf1-203ENSMUST00000113121 4603 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Rbbp4Q60972 Tmem132c-201ENSMUST00000119026 5134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Rbbp4Q60972 Fmnl3-202ENSMUST00000088233 4423 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Rbbp4Q60972 Mettl4-ps1-202ENSMUST00000130218 1323 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Rbbp4Q60972 Mgll-205ENSMUST00000150180 1312 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Rbbp4Q60972 Prdm11-201ENSMUST00000111272 3012 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Rbbp4Q60972 Zfx-204ENSMUST00000113927 6933 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Rbbp4Q60972 Cnppd1-208ENSMUST00000190679 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Rbbp4Q60972 Nfkbib-201ENSMUST00000032815 2061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Rbbp4Q60972 Atf6b-202ENSMUST00000173984 2315 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Rbbp4Q60972 Bambi-201ENSMUST00000025075 5040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Rbbp4Q60972 Rab35-201ENSMUST00000031492 2820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Rbbp4Q60972 Ilk-212ENSMUST00000163389 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Rbbp4Q60972 Ran-201ENSMUST00000031383 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Rbbp4Q60972 Relt-201ENSMUST00000008462 2851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Rbbp4Q60972 Zfp746-201ENSMUST00000073124 3651 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Rbbp4Q60972 Mef2d-203ENSMUST00000107559 1791 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Rbbp4Q60972 Tpm1-204ENSMUST00000113684 887 ntTSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Rbbp4Q60972 AC107711.5-202ENSMUST00000226429 702 ntBASIC15.91■□□□□ 0.14
Rbbp4Q60972 Fbxo6-202ENSMUST00000056965 1163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Rbbp4Q60972 Crb3-202ENSMUST00000097299 1206 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Rbbp4Q60972 Tmem175-204ENSMUST00000146207 1686 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Rbbp4Q60972 Shank1-203ENSMUST00000107938 9826 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Rbbp4Q60972 Dvl2-201ENSMUST00000019362 2968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Rbbp4Q60972 Dusp4-201ENSMUST00000033930 2740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Rbbp4Q60972 Ggnbp2-201ENSMUST00000018547 2478 ntTSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Rbbp4Q60972 Cacna1i-202ENSMUST00000160424 9781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Rbbp4Q60972 Atg4c-201ENSMUST00000030279 3178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Rbbp4Q60972 Ltbp1-201ENSMUST00000001927 6671 ntTSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Rbbp4Q60972 Pacsin3-202ENSMUST00000059566 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Rbbp4Q60972 Klhl5-204ENSMUST00000204097 3149 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Rbbp4Q60972 Farsa-202ENSMUST00000109754 1795 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Rbbp4Q60972 Grid2-201ENSMUST00000095852 5860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Rbbp4Q60972 Bcor-203ENSMUST00000115512 6887 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Rbbp4Q60972 A930001A20Rik-201ENSMUST00000182586 1366 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Rbbp4Q60972 Podnl1-201ENSMUST00000093380 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Rbbp4Q60972 Lzts2-203ENSMUST00000179108 2781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Rbbp4Q60972 Mboat4-201ENSMUST00000095345 1836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Rbbp4Q60972 Gm12216-203ENSMUST00000121435 655 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Rbbp4Q60972 Gm24841-201ENSMUST00000158676 357 ntBASIC15.9■□□□□ 0.14
Rbbp4Q60972 Gm20635-201ENSMUST00000176473 1287 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Rbbp4Q60972 Gm44899-201ENSMUST00000207451 391 ntTSL 3 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Rbbp4Q60972 Clybl-201ENSMUST00000026625 1231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Rbbp4Q60972 Cox8a-201ENSMUST00000039758 545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Rbbp4Q60972 Fam57a-201ENSMUST00000094014 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Rbbp4Q60972 Mef2d-201ENSMUST00000001455 5401 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Rbbp4Q60972 Tle2-213ENSMUST00000146358 2749 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Rbbp4Q60972 F830208F22Rik-202ENSMUST00000143732 2891 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Rbbp4Q60972 Lrrc7-204ENSMUST00000199890 6326 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Rbbp4Q60972 Gpr180-201ENSMUST00000022728 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Rbbp4Q60972 Plekhh3-201ENSMUST00000043397 3056 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Rbbp4Q60972 Camk2d-226ENSMUST00000199300 5524 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Rbbp4Q60972 Gm26774-201ENSMUST00000181534 2401 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Rbbp4Q60972 Ino80e-203ENSMUST00000106343 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Rbbp4Q60972 Tmem260-201ENSMUST00000111735 5485 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Rbbp4Q60972 Wnt10b-207ENSMUST00000228594 1510 ntAPPRIS P1 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Rbbp4Q60972 Mybl2-201ENSMUST00000018005 3651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Rbbp4Q60972 Trim7-201ENSMUST00000046903 2161 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Rbbp4Q60972 Ints8-201ENSMUST00000044616 3433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Rbbp4Q60972 Smurf2-201ENSMUST00000092517 3125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Rbbp4Q60972 Fosl1-201ENSMUST00000025850 1707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Rbbp4Q60972 Acbd3-201ENSMUST00000027780 3471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Rbbp4Q60972 Pou3f2-201ENSMUST00000178174 5587 ntAPPRIS P1 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Rbbp4Q60972 Gm12473-201ENSMUST00000137535 579 ntTSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Rbbp4Q60972 E030044B06Rik-201ENSMUST00000181195 1266 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Rbbp4Q60972 Gm18666-201ENSMUST00000190039 958 ntBASIC15.89■□□□□ 0.13
Rbbp4Q60972 Gm10517-202ENSMUST00000192970 758 ntBASIC15.89■□□□□ 0.13
Rbbp4Q60972 Kcnn4-203ENSMUST00000205626 461 ntTSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Rbbp4Q60972 5033430I15Rik-201ENSMUST00000038032 729 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Rbbp4Q60972 Zfp446-202ENSMUST00000108535 2594 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 38.1 ms