Protein–RNA interactions for Protein: Q60803

Traf3, TNF receptor-associated factor 3, mousemouse

Predictions only

Length 567 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Traf3Q60803 Gtf3a-204ENSMUST00000146511 1298 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Traf3Q60803 Gm21057-201ENSMUST00000206022 670 ntTSL 3 BASIC17.75■□□□□ 0.43
Traf3Q60803 Bean1-201ENSMUST00000093245 3199 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Traf3Q60803 Smpdl3b-201ENSMUST00000030709 2006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Traf3Q60803 Apbb1-214ENSMUST00000189378 2878 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Traf3Q60803 Gm7008-201ENSMUST00000038121 1366 ntTSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Traf3Q60803 Col15a1-202ENSMUST00000102917 5172 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Traf3Q60803 Pigw-202ENSMUST00000108080 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Traf3Q60803 Irak2-203ENSMUST00000089023 1734 ntTSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Traf3Q60803 Fam46c-201ENSMUST00000061455 5640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Traf3Q60803 Slbp-203ENSMUST00000101354 1578 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Traf3Q60803 C130026I21Rik-201ENSMUST00000064341 1561 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Traf3Q60803 Il4i1-202ENSMUST00000118125 2275 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.74■□□□□ 0.43
Traf3Q60803 Itsn1-205ENSMUST00000113996 5147 ntTSL 5 BASIC17.74■□□□□ 0.43
Traf3Q60803 Gjb3-201ENSMUST00000046532 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Traf3Q60803 Enah-210ENSMUST00000193074 1971 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.74■□□□□ 0.43
Traf3Q60803 Klhdc8b-214ENSMUST00000195435 1612 ntTSL 5 BASIC17.74■□□□□ 0.43
Traf3Q60803 Gm7213-201ENSMUST00000215977 950 ntBASIC17.74■□□□□ 0.43
Traf3Q60803 Atp23-201ENSMUST00000026504 903 ntTSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Traf3Q60803 Kcnk4-201ENSMUST00000025908 1715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Traf3Q60803 Grk6-201ENSMUST00000001115 2994 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Traf3Q60803 Baiap2-202ENSMUST00000075180 3518 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Traf3Q60803 Bcap29-201ENSMUST00000020979 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Traf3Q60803 Hoxc9-201ENSMUST00000001706 2374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Traf3Q60803 Mmd-201ENSMUST00000004050 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Traf3Q60803 Stk33-201ENSMUST00000090414 2221 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.74■□□□□ 0.43
Traf3Q60803 Khsrp-201ENSMUST00000007814 3990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Traf3Q60803 Men1-205ENSMUST00000113501 2508 ntTSL 5 BASIC17.73■□□□□ 0.43
Traf3Q60803 Scrib-201ENSMUST00000002603 5599 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Traf3Q60803 3110002H16Rik-201ENSMUST00000025276 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Traf3Q60803 Scrib-202ENSMUST00000063747 5440 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Traf3Q60803 Puf60-201ENSMUST00000002599 1821 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Traf3Q60803 Tmco4-202ENSMUST00000050949 3318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Traf3Q60803 Axin1-203ENSMUST00000163421 2890 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.73■□□□□ 0.43
Traf3Q60803 Smad5-203ENSMUST00000109876 4570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Traf3Q60803 4930405A21Rik-202ENSMUST00000139042 994 ntTSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Traf3Q60803 Arpc4-204ENSMUST00000204802 794 ntTSL 3 BASIC17.73■□□□□ 0.43
Traf3Q60803 Xpa-201ENSMUST00000030013 955 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Traf3Q60803 Hist3h2ba-201ENSMUST00000078267 614 ntAPPRIS P1 BASIC17.73■□□□□ 0.43
Traf3Q60803 Tox2-205ENSMUST00000165937 1675 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.73■□□□□ 0.43
Traf3Q60803 Rmnd1-201ENSMUST00000042251 3139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Traf3Q60803 Hyls1-201ENSMUST00000115110 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Traf3Q60803 Tmem127-201ENSMUST00000035871 4811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Traf3Q60803 Rasgrp1-201ENSMUST00000102534 5229 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.72■□□□□ 0.43
Traf3Q60803 Tmf1-201ENSMUST00000095664 5732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Traf3Q60803 Gm10461-201ENSMUST00000202073 4786 ntBASIC17.72■□□□□ 0.43
Traf3Q60803 Gm3272-201ENSMUST00000181181 1229 ntBASIC17.72■□□□□ 0.43
Traf3Q60803 Tmem270-201ENSMUST00000047305 932 ntTSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Traf3Q60803 Gm10566-201ENSMUST00000086739 996 ntBASIC17.72■□□□□ 0.43
Traf3Q60803 Sbf1-201ENSMUST00000123791 6190 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Traf3Q60803 Otud5-201ENSMUST00000033494 4259 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Traf3Q60803 Arhgef9-216ENSMUST00000197206 2227 ntTSL 5 BASIC17.72■□□□□ 0.43
Traf3Q60803 Fam20c-201ENSMUST00000026972 3582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Traf3Q60803 Msmo1-201ENSMUST00000034015 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Traf3Q60803 Wnt10b-204ENSMUST00000226655 1807 ntBASIC17.72■□□□□ 0.43
Traf3Q60803 Trmo-201ENSMUST00000030015 1527 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Traf3Q60803 Lman2l-202ENSMUST00000115011 2290 ntTSL 5 BASIC17.72■□□□□ 0.43
Traf3Q60803 Zfp92-202ENSMUST00000086470 2050 ntTSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Traf3Q60803 Rbpms2-201ENSMUST00000055844 1987 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Traf3Q60803 Efnb2-201ENSMUST00000001319 4793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Traf3Q60803 Scly-201ENSMUST00000027532 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Traf3Q60803 Gm15582-201ENSMUST00000132849 1581 ntTSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Traf3Q60803 Cldn4-201ENSMUST00000051401 1816 ntAPPRIS P1 BASIC17.71■□□□□ 0.43
Traf3Q60803 Pacsin1-202ENSMUST00000097360 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Traf3Q60803 Fam229a-201ENSMUST00000106043 558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Traf3Q60803 Echdc2-203ENSMUST00000116307 893 ntTSL 5 BASIC17.71■□□□□ 0.43
Traf3Q60803 Gm13836-201ENSMUST00000121159 501 ntBASIC17.71■□□□□ 0.43
Traf3Q60803 Psmd13-209ENSMUST00000164681 726 ntTSL 5 BASIC17.71■□□□□ 0.43
Traf3Q60803 Cdc34-202ENSMUST00000166603 1078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Traf3Q60803 Gm18032-201ENSMUST00000222541 538 ntBASIC17.71■□□□□ 0.43
Traf3Q60803 Olfr279-201ENSMUST00000050451 933 ntAPPRIS P1 BASIC17.71■□□□□ 0.43
Traf3Q60803 Fam92a-201ENSMUST00000087052 1292 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Traf3Q60803 Acot7-206ENSMUST00000167926 1505 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Traf3Q60803 Rasl10b-204ENSMUST00000175848 3249 ntTSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Traf3Q60803 Synm-205ENSMUST00000208815 2697 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.71■□□□□ 0.43
Traf3Q60803 Sart1-201ENSMUST00000044207 5091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Traf3Q60803 Zic1-202ENSMUST00000065360 2811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.42
Traf3Q60803 Sprtn-201ENSMUST00000034467 4464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Traf3Q60803 Trpc4ap-201ENSMUST00000041059 3204 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Traf3Q60803 Hsf4-202ENSMUST00000163734 1630 ntTSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Traf3Q60803 Tmem233-201ENSMUST00000111997 2477 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.7■□□□□ 0.42
Traf3Q60803 Gm1673-202ENSMUST00000114382 451 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.7■□□□□ 0.42
Traf3Q60803 Ccl27a-219ENSMUST00000173865 657 ntTSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Traf3Q60803 Gm9745-201ENSMUST00000021573 684 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.7■□□□□ 0.42
Traf3Q60803 AC134329.2-201ENSMUST00000217897 428 ntBASIC17.7■□□□□ 0.42
Traf3Q60803 Prdx5-201ENSMUST00000025904 1262 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Traf3Q60803 Fgf8-201ENSMUST00000026240 1117 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Traf3Q60803 0610009B22Rik-201ENSMUST00000007921 813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Traf3Q60803 Ldlrad1-201ENSMUST00000094916 1093 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.7■□□□□ 0.42
Traf3Q60803 Actl10-201ENSMUST00000104928 1501 ntAPPRIS P1 BASIC17.7■□□□□ 0.42
Traf3Q60803 Actl10-202ENSMUST00000226583 1501 ntBASIC17.7■□□□□ 0.42
Traf3Q60803 Dlx3-201ENSMUST00000092768 2607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Traf3Q60803 Paqr4-201ENSMUST00000024702 2507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Traf3Q60803 Zbtb25-201ENSMUST00000167011 1681 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.7■□□□□ 0.42
Traf3Q60803 Ppp2r2d-207ENSMUST00000155672 1938 ntTSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Traf3Q60803 Zufsp-202ENSMUST00000218055 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Traf3Q60803 Kank3-201ENSMUST00000048560 2641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Traf3Q60803 Sh3bp1-201ENSMUST00000001226 2510 ntTSL 5 BASIC17.69■□□□□ 0.42
Traf3Q60803 Atxn7l2-204ENSMUST00000119650 2274 ntTSL 5 BASIC17.69■□□□□ 0.42
Traf3Q60803 Yars2-204ENSMUST00000159962 2805 ntTSL 2 BASIC17.69■□□□□ 0.42
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 26.3 ms