Protein–RNA interactions for Protein: Q60754

Marco, Macrophage receptor MARCO, mousemouse

Predictions only

Length 518 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MarcoQ60754 Adgrb2-204ENSMUST00000106015 4982 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
MarcoQ60754 Ptges2-201ENSMUST00000028162 4978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
MarcoQ60754 Mta3-203ENSMUST00000112350 1723 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
MarcoQ60754 Med9-201ENSMUST00000081980 1920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
MarcoQ60754 Ptprs-201ENSMUST00000067538 6855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
MarcoQ60754 Apbb1-209ENSMUST00000188368 1970 ntTSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
MarcoQ60754 Gm5414-201ENSMUST00000062879 1659 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
MarcoQ60754 Ccnd3-ps-201ENSMUST00000117963 881 ntBASIC16.7■□□□□ 0.26
MarcoQ60754 Gm44924-201ENSMUST00000138087 421 ntTSL 3 BASIC16.7■□□□□ 0.26
MarcoQ60754 Gm18958-201ENSMUST00000174258 762 ntBASIC16.7■□□□□ 0.26
MarcoQ60754 H2afz-207ENSMUST00000174561 810 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
MarcoQ60754 4732471J01Rik-202ENSMUST00000205787 991 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
MarcoQ60754 Mrps33-201ENSMUST00000031978 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
MarcoQ60754 Olfr279-201ENSMUST00000050451 933 ntAPPRIS P1 BASIC16.7■□□□□ 0.26
MarcoQ60754 3110070M22Rik-201ENSMUST00000099148 1123 ntAPPRIS P1 BASIC16.7■□□□□ 0.26
MarcoQ60754 Nrl-201ENSMUST00000062232 2504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
MarcoQ60754 Bmp8a-201ENSMUST00000040496 2405 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
MarcoQ60754 Raver2-201ENSMUST00000038463 4045 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
MarcoQ60754 Wnt10b-207ENSMUST00000228594 1510 ntAPPRIS P1 BASIC16.7■□□□□ 0.26
MarcoQ60754 Rcc1-201ENSMUST00000030726 2278 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
MarcoQ60754 Fam110a-204ENSMUST00000109865 1853 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.69■□□□□ 0.26
MarcoQ60754 Usp6nl-202ENSMUST00000114937 7484 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
MarcoQ60754 Sim1-202ENSMUST00000219436 1687 ntTSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
MarcoQ60754 Fam57b-201ENSMUST00000079423 2328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
MarcoQ60754 Sh2b2-203ENSMUST00000196397 2797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
MarcoQ60754 Tm9sf2-203ENSMUST00000171318 1494 ntTSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
MarcoQ60754 Acadvl-201ENSMUST00000018718 2020 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
MarcoQ60754 Mmp17-201ENSMUST00000031390 6422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
MarcoQ60754 Cadm1-204ENSMUST00000114548 4482 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
MarcoQ60754 Ccni-201ENSMUST00000058550 2804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
MarcoQ60754 Serf1-205ENSMUST00000152286 465 ntTSL 3 BASIC16.69■□□□□ 0.26
MarcoQ60754 Muc2-203ENSMUST00000179227 399 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
MarcoQ60754 Lsm1-203ENSMUST00000211168 343 ntTSL 3 BASIC16.69■□□□□ 0.26
MarcoQ60754 Gm7370-201ENSMUST00000219471 767 ntBASIC16.69■□□□□ 0.26
MarcoQ60754 Vpreb1-201ENSMUST00000075017 766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
MarcoQ60754 Myoz1-201ENSMUST00000090469 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
MarcoQ60754 Col4a3bp-201ENSMUST00000077672 2746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
MarcoQ60754 Lhfpl4-201ENSMUST00000162280 4762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
MarcoQ60754 Alcam-201ENSMUST00000023312 6036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
MarcoQ60754 Mycbp-202ENSMUST00000106202 1536 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
MarcoQ60754 Ccnd3-202ENSMUST00000171031 2113 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
MarcoQ60754 Abhd10-201ENSMUST00000066983 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
MarcoQ60754 Zfp512b-201ENSMUST00000108789 5714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
MarcoQ60754 Foxp4-204ENSMUST00000113265 3999 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
MarcoQ60754 Ntrk1-201ENSMUST00000029712 2588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
MarcoQ60754 Thegl-202ENSMUST00000117880 1641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
MarcoQ60754 Arhgef25-212ENSMUST00000222006 1896 ntTSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
MarcoQ60754 Eepd1-201ENSMUST00000040677 2723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
MarcoQ60754 Cyp4f41-ps-201ENSMUST00000126790 1077 ntBASIC16.68■□□□□ 0.26
MarcoQ60754 AC134329.2-201ENSMUST00000217897 428 ntBASIC16.68■□□□□ 0.26
MarcoQ60754 Uchl3-201ENSMUST00000002289 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
MarcoQ60754 Pldi-201ENSMUST00000036304 853 ntTSL 2 BASIC16.68■□□□□ 0.26
MarcoQ60754 Hist3h2ba-201ENSMUST00000078267 614 ntAPPRIS P1 BASIC16.68■□□□□ 0.26
MarcoQ60754 Dbn1-202ENSMUST00000109921 2378 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
MarcoQ60754 Pdap1-201ENSMUST00000031627 2353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
MarcoQ60754 Kcnab3-201ENSMUST00000018614 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
MarcoQ60754 Nr1h2-213ENSMUST00000167197 1944 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
MarcoQ60754 Synm-205ENSMUST00000208815 2697 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
MarcoQ60754 Dzip3-202ENSMUST00000121869 5820 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
MarcoQ60754 Spsb2-203ENSMUST00000112473 1322 ntBASIC16.68■□□□□ 0.26
MarcoQ60754 Pigw-202ENSMUST00000108080 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
MarcoQ60754 Irf3-213ENSMUST00000209066 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
MarcoQ60754 Lrp5-201ENSMUST00000025856 5161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
MarcoQ60754 Fiz1-203ENSMUST00000167804 2637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
MarcoQ60754 Mrpl39-201ENSMUST00000116584 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
MarcoQ60754 Fignl2-201ENSMUST00000178140 4206 ntAPPRIS P1 BASIC16.67■□□□□ 0.26
MarcoQ60754 Nxnl1-201ENSMUST00000048243 2285 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.67■□□□□ 0.26
MarcoQ60754 Iqgap2-201ENSMUST00000068603 5771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
MarcoQ60754 AC121598.2-201ENSMUST00000228376 2325 ntBASIC16.67■□□□□ 0.26
MarcoQ60754 Ppm1b-202ENSMUST00000112304 3262 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
MarcoQ60754 Prmt2-202ENSMUST00000099571 2052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
MarcoQ60754 4930544I03Rik-201ENSMUST00000181184 1276 ntTSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
MarcoQ60754 Gm9745-201ENSMUST00000021573 684 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
MarcoQ60754 Snx12-201ENSMUST00000077876 1002 ntTSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
MarcoQ60754 0610009B22Rik-201ENSMUST00000007921 813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
MarcoQ60754 Mcl1-201ENSMUST00000037947 3418 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
MarcoQ60754 Cacna1c-216ENSMUST00000188522 7338 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
MarcoQ60754 Ptpdc1-204ENSMUST00000222028 3164 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
MarcoQ60754 Gnao1-201ENSMUST00000034198 2948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
MarcoQ60754 4930448E22Rik-201ENSMUST00000181712 1581 ntTSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
MarcoQ60754 Tcf7l2-203ENSMUST00000111646 2839 ntTSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
MarcoQ60754 Mta1-201ENSMUST00000009099 2826 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
MarcoQ60754 Vgf-201ENSMUST00000041543 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
MarcoQ60754 Ercc6l2-203ENSMUST00000067821 2743 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
MarcoQ60754 Ffar3-201ENSMUST00000094583 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
MarcoQ60754 Ap2a2-201ENSMUST00000003038 4646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
MarcoQ60754 Pitpnm1-201ENSMUST00000049658 4206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
MarcoQ60754 Esrrb-201ENSMUST00000021680 2136 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.66■□□□□ 0.26
MarcoQ60754 Mag-201ENSMUST00000040548 2419 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
MarcoQ60754 Mtg2-202ENSMUST00000108901 1444 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.66■□□□□ 0.26
MarcoQ60754 Kmt5b-203ENSMUST00000113968 3216 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
MarcoQ60754 Hist1h2br-203ENSMUST00000180288 1256 ntTSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
MarcoQ60754 Tdh-201ENSMUST00000022522 1881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
MarcoQ60754 Snapc3-201ENSMUST00000030206 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
MarcoQ60754 Ccdc17-201ENSMUST00000051869 2003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
MarcoQ60754 Hoxa6-201ENSMUST00000062829 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
MarcoQ60754 Pih1d1-201ENSMUST00000085375 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
MarcoQ60754 Hist1h2bq-202ENSMUST00000091749 1254 ntTSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
MarcoQ60754 Atf7-209ENSMUST00000184485 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
MarcoQ60754 Vmn1r17-201ENSMUST00000227186 2234 ntAPPRIS P2 BASIC16.66■□□□□ 0.26
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 33.8 ms