Protein–RNA interactions for Protein: Q60750

Epha1, Ephrin type-A receptor 1, mousemouse

Predictions only

Length 977 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Epha1Q60750 Gm26795-201ENSMUST00000180993 1952 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Epha1Q60750 A530084C06Rik-201ENSMUST00000170573 3200 ntAPPRIS P1 BASIC15.77■□□□□ 0.12
Epha1Q60750 Lrrc14-202ENSMUST00000127208 4849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Epha1Q60750 Gm7638-201ENSMUST00000121348 967 ntBASIC15.77■□□□□ 0.12
Epha1Q60750 1810012K08Rik-201ENSMUST00000155199 574 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Epha1Q60750 Rfesd-202ENSMUST00000167271 595 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.12
Epha1Q60750 Gm45058-201ENSMUST00000205810 766 ntBASIC15.77■□□□□ 0.12
Epha1Q60750 0610009B22Rik-201ENSMUST00000007921 813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Epha1Q60750 9030624G23Rik-201ENSMUST00000101538 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Epha1Q60750 Camk2b-202ENSMUST00000019133 2223 ntTSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
Epha1Q60750 Wnt6-201ENSMUST00000006716 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Epha1Q60750 Ryr2-203ENSMUST00000220597 4924 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Epha1Q60750 Fez2-202ENSMUST00000112487 2020 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Epha1Q60750 Kcnn2-208ENSMUST00000211323 2046 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Epha1Q60750 Mpped2-202ENSMUST00000111063 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Epha1Q60750 Abhd10-201ENSMUST00000066983 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Epha1Q60750 Cep104-201ENSMUST00000047497 5151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Epha1Q60750 Nos1ap-207ENSMUST00000161966 1607 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Epha1Q60750 Tigd3-201ENSMUST00000055911 2114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Epha1Q60750 Dbndd2-201ENSMUST00000017878 1338 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Epha1Q60750 Prdm6-201ENSMUST00000091900 2601 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Epha1Q60750 Cdv3-207ENSMUST00000190226 3107 ntTSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Epha1Q60750 Adgrl1-205ENSMUST00000132500 5719 ntTSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Epha1Q60750 Lzts2-201ENSMUST00000039016 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Epha1Q60750 Mir5130-201ENSMUST00000175160 84 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
Epha1Q60750 Arpc4-201ENSMUST00000156898 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Epha1Q60750 Dnaja3-202ENSMUST00000115854 2505 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Epha1Q60750 Klc3-202ENSMUST00000108457 1632 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Epha1Q60750 Eif1a-202ENSMUST00000168382 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Epha1Q60750 Ell2-201ENSMUST00000001583 4382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Epha1Q60750 Ctnnal1-202ENSMUST00000107612 850 ntTSL 3 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Epha1Q60750 Gas5-203ENSMUST00000159119 665 ntTSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Epha1Q60750 Vkorc1-203ENSMUST00000206053 606 ntTSL 3 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Epha1Q60750 Metrn-201ENSMUST00000002344 987 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Epha1Q60750 Mrpl28-201ENSMUST00000025014 1048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Epha1Q60750 Gm45623-201ENSMUST00000210744 1457 ntAPPRIS P1 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Epha1Q60750 Gpr180-201ENSMUST00000022728 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Epha1Q60750 Gm5898-201ENSMUST00000121016 2071 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
Epha1Q60750 Ddx28-201ENSMUST00000058579 2262 ntAPPRIS P1 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Epha1Q60750 Gbx1-201ENSMUST00000088311 3475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Epha1Q60750 Appl2-201ENSMUST00000020500 3020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Epha1Q60750 Kmt5c-201ENSMUST00000098853 2189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Epha1Q60750 March11-203ENSMUST00000152841 1365 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Epha1Q60750 Kat14-208ENSMUST00000147747 3299 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Epha1Q60750 Tmem81-201ENSMUST00000058167 1742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Epha1Q60750 Iqsec1-202ENSMUST00000101153 8036 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Epha1Q60750 Mycbp-202ENSMUST00000106202 1536 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Epha1Q60750 Rtn4-204ENSMUST00000102842 2257 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Epha1Q60750 Gm42417-201ENSMUST00000191849 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Epha1Q60750 Tcf7l2-203ENSMUST00000111646 2839 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Epha1Q60750 Fam126a-202ENSMUST00000101513 1679 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Epha1Q60750 Xpr1-202ENSMUST00000111774 2753 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Epha1Q60750 Slc25a35-202ENSMUST00000102606 1828 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Epha1Q60750 Cutc-202ENSMUST00000112047 1233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Epha1Q60750 Bola2-203ENSMUST00000130498 1266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Epha1Q60750 Arpc4-204ENSMUST00000204802 794 ntTSL 3 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Epha1Q60750 Aga-203ENSMUST00000211424 1147 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Epha1Q60750 Gm7791-201ENSMUST00000219066 539 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
Epha1Q60750 Lsm10-201ENSMUST00000055575 943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Epha1Q60750 Pih1d1-201ENSMUST00000085375 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Epha1Q60750 Bicd2-201ENSMUST00000048544 6309 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Epha1Q60750 Gm6093-201ENSMUST00000221792 1623 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Epha1Q60750 Amigo2-201ENSMUST00000053106 2871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Epha1Q60750 Trim54-201ENSMUST00000013771 1434 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Epha1Q60750 Hpn-209ENSMUST00000168884 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Epha1Q60750 Cyfip2-205ENSMUST00000165599 6659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Epha1Q60750 Rnf38-203ENSMUST00000102934 5240 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Epha1Q60750 Pten-201ENSMUST00000013807 8292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Epha1Q60750 Hikeshi-206ENSMUST00000153470 2224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Epha1Q60750 Nfil3-201ENSMUST00000071065 2026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Epha1Q60750 Tmem57-201ENSMUST00000030628 3826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Epha1Q60750 Lhfpl4-201ENSMUST00000162280 4762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Epha1Q60750 Mef2d-201ENSMUST00000001455 5401 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Epha1Q60750 Xpo6-213ENSMUST00000168189 4552 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Epha1Q60750 Mmp11-201ENSMUST00000000924 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Epha1Q60750 Hoxd4-201ENSMUST00000047904 2560 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Epha1Q60750 Klf13-202ENSMUST00000183817 599 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Epha1Q60750 Tcta-202ENSMUST00000192886 1094 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Epha1Q60750 Gm9745-201ENSMUST00000021573 684 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Epha1Q60750 Rgcc-201ENSMUST00000022595 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Epha1Q60750 Pdlim5-211ENSMUST00000198381 1555 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Epha1Q60750 Zfp119b-201ENSMUST00000056147 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Epha1Q60750 Sept4-205ENSMUST00000107962 1678 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Epha1Q60750 Nectin2-202ENSMUST00000108450 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Epha1Q60750 Tmem51os1-202ENSMUST00000141769 2131 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Epha1Q60750 Vps37a-201ENSMUST00000098817 6379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Epha1Q60750 Gabpa-201ENSMUST00000009120 4987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Epha1Q60750 Nfs1-201ENSMUST00000029147 2051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Epha1Q60750 Map3k7-201ENSMUST00000037607 5773 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Epha1Q60750 Galk2-202ENSMUST00000094604 1928 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Epha1Q60750 Sapcd2-202ENSMUST00000100323 1761 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Epha1Q60750 Sarm1-202ENSMUST00000108287 4868 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Epha1Q60750 Synpo-205ENSMUST00000130044 4970 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Epha1Q60750 Col11a2-202ENSMUST00000114252 5620 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Epha1Q60750 Csf3-201ENSMUST00000038886 1413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Epha1Q60750 Il4i1-202ENSMUST00000118125 2275 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Epha1Q60750 Gm10013-201ENSMUST00000106074 672 ntBASIC15.72■□□□□ 0.11
Epha1Q60750 Pdcd5-202ENSMUST00000120714 767 ntTSL 3 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Epha1Q60750 Gm6659-201ENSMUST00000174752 547 ntBASIC15.72■□□□□ 0.11
Epha1Q60750 Gm4217-201ENSMUST00000182243 1002 ntBASIC15.72■□□□□ 0.11
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 24.5 ms