Protein–RNA interactions for Protein: Q60688

Foxd4, Forkhead box protein D4, mousemouse

Predictions only

Length 444 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Foxd4Q60688 Icam2-201ENSMUST00000001055 1282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Foxd4Q60688 Gm11249-201ENSMUST00000117071 859 ntBASIC17.46■□□□□ 0.39
Foxd4Q60688 Spata3-208ENSMUST00000149469 1110 ntTSL 5 BASIC17.46■□□□□ 0.39
Foxd4Q60688 Gm8369-204ENSMUST00000188633 1227 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.46■□□□□ 0.39
Foxd4Q60688 Trip10-205ENSMUST00000224885 2136 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.46■□□□□ 0.39
Foxd4Q60688 Smim15-206ENSMUST00000226042 1092 ntAPPRIS P1 BASIC17.46■□□□□ 0.39
Foxd4Q60688 Grp-201ENSMUST00000025395 862 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Foxd4Q60688 Lrp6-201ENSMUST00000032322 9368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Foxd4Q60688 Sgsm2-201ENSMUST00000057631 4743 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Foxd4Q60688 Pprc1-203ENSMUST00000111899 5246 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Foxd4Q60688 Cul1-201ENSMUST00000031697 3161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Foxd4Q60688 Aqp2-201ENSMUST00000023752 1416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Foxd4Q60688 Il17re-201ENSMUST00000053569 1898 ntTSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.38
Foxd4Q60688 Cox18-201ENSMUST00000048363 1333 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.38
Foxd4Q60688 Senp3-202ENSMUST00000066760 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Foxd4Q60688 Atp1b1-201ENSMUST00000027863 2580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Foxd4Q60688 Slc23a4-205ENSMUST00000201355 2003 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.45■□□□□ 0.38
Foxd4Q60688 Kcmf1-201ENSMUST00000068697 3251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Foxd4Q60688 Nrip1-201ENSMUST00000054178 4529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Foxd4Q60688 Chrm3-202ENSMUST00000187510 4336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Foxd4Q60688 Anks6-201ENSMUST00000084616 3552 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.45■□□□□ 0.38
Foxd4Q60688 Zfp142-201ENSMUST00000027315 6480 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Foxd4Q60688 Stard7-202ENSMUST00000110375 3116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Foxd4Q60688 Mir2861-201ENSMUST00000175539 82 ntBASIC17.45■□□□□ 0.38
Foxd4Q60688 AC153845.2-202ENSMUST00000213372 807 ntTSL 3 BASIC17.45■□□□□ 0.38
Foxd4Q60688 Stam-202ENSMUST00000102960 5000 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Foxd4Q60688 Hmga1-204ENSMUST00000118570 1898 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Foxd4Q60688 Atp6v1g2-201ENSMUST00000068261 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Foxd4Q60688 Rabep1-201ENSMUST00000076270 5408 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Foxd4Q60688 Zbtb32-202ENSMUST00000108151 1775 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.45■□□□□ 0.38
Foxd4Q60688 Hrh3-202ENSMUST00000163215 1401 ntTSL 5 BASIC17.45■□□□□ 0.38
Foxd4Q60688 Hivep3-201ENSMUST00000084306 2973 ntBASIC17.45■□□□□ 0.38
Foxd4Q60688 9330151L19Rik-201ENSMUST00000181850 2545 ntTSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Foxd4Q60688 Med9-201ENSMUST00000081980 1920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Foxd4Q60688 Hmces-202ENSMUST00000113606 1572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Foxd4Q60688 Sntg2-201ENSMUST00000021004 2411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Foxd4Q60688 Aida-206ENSMUST00000193625 1810 ntTSL 3 BASIC17.44■□□□□ 0.38
Foxd4Q60688 Lrig2-207ENSMUST00000199070 5991 ntTSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Foxd4Q60688 Adra2c-201ENSMUST00000049545 3445 ntAPPRIS P1 BASIC17.44■□□□□ 0.38
Foxd4Q60688 Krt86-201ENSMUST00000088049 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Foxd4Q60688 Col18a1-202ENSMUST00000081654 5063 ntTSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Foxd4Q60688 Fbxl3-206ENSMUST00000145693 3352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Foxd4Q60688 Itgb1bp1-201ENSMUST00000076260 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Foxd4Q60688 Fubp3-202ENSMUST00000113482 3268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Foxd4Q60688 Il6st-206ENSMUST00000183886 3004 ntTSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Foxd4Q60688 Gm29241-201ENSMUST00000189260 1096 ntBASIC17.44■□□□□ 0.38
Foxd4Q60688 Stard10-211ENSMUST00000210192 1258 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.44■□□□□ 0.38
Foxd4Q60688 Cck-201ENSMUST00000035120 691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Foxd4Q60688 Nnat-201ENSMUST00000088484 458 ntTSL 2 BASIC17.44■□□□□ 0.38
Foxd4Q60688 Dnm2-204ENSMUST00000165766 3063 ntTSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Foxd4Q60688 Bcs1l-202ENSMUST00000113732 1679 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.44■□□□□ 0.38
Foxd4Q60688 Pcdh1-203ENSMUST00000160721 5416 ntTSL 5 BASIC17.44■□□□□ 0.38
Foxd4Q60688 Dio3-201ENSMUST00000097228 1449 ntBASIC17.44■□□□□ 0.38
Foxd4Q60688 Slc9a6-202ENSMUST00000114784 4449 ntTSL 5 BASIC17.44■□□□□ 0.38
Foxd4Q60688 Nagpa-203ENSMUST00000147567 2230 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Foxd4Q60688 Tfdp2-206ENSMUST00000185644 2646 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Foxd4Q60688 P2rx5-201ENSMUST00000006104 2395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Foxd4Q60688 Gm26657-201ENSMUST00000181745 1308 ntAPPRIS P1 BASIC17.44■□□□□ 0.38
Foxd4Q60688 Heyl-201ENSMUST00000040821 4537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Foxd4Q60688 A930024E05Rik-201ENSMUST00000148466 1896 ntTSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Foxd4Q60688 Gbe1-201ENSMUST00000023393 2846 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.43■□□□□ 0.38
Foxd4Q60688 Cmip-202ENSMUST00000166750 2408 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.43■□□□□ 0.38
Foxd4Q60688 Ric3-202ENSMUST00000120876 1633 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Foxd4Q60688 Gm10654-201ENSMUST00000098653 1633 ntBASIC17.43■□□□□ 0.38
Foxd4Q60688 Dach1-201ENSMUST00000069334 5063 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Foxd4Q60688 Micall1-201ENSMUST00000040320 6701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Foxd4Q60688 Rap1gap-202ENSMUST00000097837 3168 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Foxd4Q60688 Celf6-204ENSMUST00000121266 2610 ntTSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Foxd4Q60688 Nrxn1-206ENSMUST00000160800 5683 ntTSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Foxd4Q60688 Dhcr24-201ENSMUST00000047973 4028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Foxd4Q60688 AW011738-201ENSMUST00000105140 1848 ntAPPRIS P1 BASIC17.43■□□□□ 0.38
Foxd4Q60688 Zfp1-201ENSMUST00000077791 1811 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Foxd4Q60688 Lhx5-201ENSMUST00000031591 2689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Foxd4Q60688 Zfp428-203ENSMUST00000177205 1159 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Foxd4Q60688 Map7-205ENSMUST00000214231 675 ntTSL 3 BASIC17.43■□□□□ 0.38
Foxd4Q60688 Snhg10-202ENSMUST00000222812 527 ntTSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Foxd4Q60688 Cfap20-201ENSMUST00000034249 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Foxd4Q60688 Cox8a-201ENSMUST00000039758 545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Foxd4Q60688 Tmem91-201ENSMUST00000079439 877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Foxd4Q60688 Gm10638-201ENSMUST00000098532 905 ntAPPRIS P1 BASIC17.43■□□□□ 0.38
Foxd4Q60688 Zfp691-202ENSMUST00000106355 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Foxd4Q60688 Gm26858-201ENSMUST00000180608 2040 ntTSL 5 BASIC17.43■□□□□ 0.38
Foxd4Q60688 Rhod-202ENSMUST00000117462 1495 ntTSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Foxd4Q60688 Eif1a-202ENSMUST00000168382 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Foxd4Q60688 Hpn-209ENSMUST00000168884 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Foxd4Q60688 Fcgrt-201ENSMUST00000003512 1770 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Foxd4Q60688 Fam120c-201ENSMUST00000073364 5463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Foxd4Q60688 Slc44a1-201ENSMUST00000102911 3102 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Foxd4Q60688 Ccdc88a-201ENSMUST00000040182 9376 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.43■□□□□ 0.38
Foxd4Q60688 Sept8-203ENSMUST00000120878 1806 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.42■□□□□ 0.38
Foxd4Q60688 Galnt13-202ENSMUST00000112634 7639 ntTSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Foxd4Q60688 Shc3-201ENSMUST00000021898 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Foxd4Q60688 Lrg1-201ENSMUST00000041357 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Foxd4Q60688 Smpdl3b-201ENSMUST00000030709 2006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Foxd4Q60688 Galnt13-203ENSMUST00000112635 7531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Foxd4Q60688 Dlgap1-206ENSMUST00000133717 2355 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.42■□□□□ 0.38
Foxd4Q60688 Ptpro-203ENSMUST00000167679 5096 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Foxd4Q60688 Il4-203ENSMUST00000140684 530 ntTSL 2 BASIC17.42■□□□□ 0.38
Foxd4Q60688 Il4-204ENSMUST00000150568 605 ntTSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Foxd4Q60688 Alkbh1-212ENSMUST00000185301 408 ntBASIC17.42■□□□□ 0.38
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 30 ms