Protein–RNA interactions for Protein: Q60670

Sik1, Serine/threonine-protein kinase SIK1, mousemouse

Predictions only

Length 779 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sik1Q60670 Rsph6a-202ENSMUST00000076887 1580 ntTSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Sik1Q60670 Hrh3-201ENSMUST00000056480 2706 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Sik1Q60670 Ltbp3-201ENSMUST00000081496 5190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.53■■□□□ 1.04
Sik1Q60670 Higd1b-202ENSMUST00000107072 497 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.53■■□□□ 1.04
Sik1Q60670 Higd1b-203ENSMUST00000107073 530 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.53■■□□□ 1.04
Sik1Q60670 Gm45144-201ENSMUST00000207473 354 ntTSL 5 BASIC21.53■■□□□ 1.04
Sik1Q60670 Higd1b-201ENSMUST00000021302 735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Sik1Q60670 Gm40849-201ENSMUST00000222330 603 ntTSL 3 BASIC21.53■■□□□ 1.04
Sik1Q60670 Psmb5-202ENSMUST00000227257 622 ntBASIC21.53■■□□□ 1.04
Sik1Q60670 1700021F07Rik-201ENSMUST00000029023 646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Sik1Q60670 BC031181-201ENSMUST00000040284 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Sik1Q60670 Slbp-202ENSMUST00000075670 1027 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Sik1Q60670 Rgp1-203ENSMUST00000117140 1635 ntTSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Sik1Q60670 Dnajb9-201ENSMUST00000015049 2461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Sik1Q60670 Nup153-201ENSMUST00000021803 6109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Sik1Q60670 Ubxn2a-201ENSMUST00000020962 2696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
Sik1Q60670 Rac1-202ENSMUST00000100489 2325 ntTSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
Sik1Q60670 Orai3-201ENSMUST00000061587 1996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
Sik1Q60670 Ccdc24-201ENSMUST00000106422 1365 ntTSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
Sik1Q60670 Fcgrt-203ENSMUST00000210642 1602 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
Sik1Q60670 Tnfrsf25-202ENSMUST00000035275 1603 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
Sik1Q60670 Pknox2-201ENSMUST00000039674 3632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
Sik1Q60670 P2rx5-201ENSMUST00000006104 2395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
Sik1Q60670 Magi3-201ENSMUST00000064371 6640 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
Sik1Q60670 Msh3-205ENSMUST00000187424 666 ntTSL 2 BASIC21.52■■□□□ 1.04
Sik1Q60670 Gm43575-201ENSMUST00000196420 516 ntBASIC21.52■■□□□ 1.04
Sik1Q60670 Apoa1-201ENSMUST00000034588 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
Sik1Q60670 Hist1h2bg-201ENSMUST00000079251 618 ntAPPRIS P1 BASIC21.52■■□□□ 1.04
Sik1Q60670 Lce3f-201ENSMUST00000090863 611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
Sik1Q60670 Hist1h2bn-201ENSMUST00000091709 381 ntAPPRIS P1 BASIC21.52■■□□□ 1.04
Sik1Q60670 Stk11-201ENSMUST00000003152 2566 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
Sik1Q60670 Pde1b-201ENSMUST00000023132 3218 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
Sik1Q60670 Gm14261-201ENSMUST00000145105 1429 ntTSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
Sik1Q60670 Gm10518-201ENSMUST00000097454 1301 ntAPPRIS P1 BASIC21.52■■□□□ 1.03
Sik1Q60670 Bud23-201ENSMUST00000071677 1607 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Sik1Q60670 Fdxr-201ENSMUST00000021078 1948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Sik1Q60670 Igsf23-201ENSMUST00000043440 1908 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Sik1Q60670 Tbc1d25-201ENSMUST00000039892 2648 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Sik1Q60670 Gm19554-201ENSMUST00000220934 2076 ntTSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Sik1Q60670 Cyp2w1-201ENSMUST00000031521 1512 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.51■■□□□ 1.03
Sik1Q60670 Tram1-201ENSMUST00000027068 2938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Sik1Q60670 Mylip-201ENSMUST00000038275 3065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Sik1Q60670 Otud1-201ENSMUST00000052168 2832 ntAPPRIS P1 BASIC21.51■■□□□ 1.03
Sik1Q60670 B9d2-201ENSMUST00000108403 1021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Sik1Q60670 Get4-202ENSMUST00000110878 1180 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Sik1Q60670 Gm29246-201ENSMUST00000189221 349 ntTSL 3 BASIC21.51■■□□□ 1.03
Sik1Q60670 Gm40513-201ENSMUST00000217258 411 ntTSL 3 BASIC21.51■■□□□ 1.03
Sik1Q60670 Kdm3b-201ENSMUST00000043775 6363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Sik1Q60670 Tnp2-201ENSMUST00000051297 549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Sik1Q60670 Aurkaip1-201ENSMUST00000084097 1159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Sik1Q60670 Mprip-204ENSMUST00000116371 8766 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Sik1Q60670 Gxylt1-201ENSMUST00000049484 6611 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Sik1Q60670 Taz-202ENSMUST00000114180 1786 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.51■■□□□ 1.03
Sik1Q60670 Mfsd10-203ENSMUST00000114331 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Sik1Q60670 Tmem64-201ENSMUST00000062684 4670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Sik1Q60670 Pofut1-203ENSMUST00000099192 1385 ntTSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Sik1Q60670 Kat14-201ENSMUST00000028911 3801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Sik1Q60670 Galnt3-201ENSMUST00000028378 3885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Sik1Q60670 Grk3-203ENSMUST00000197776 1570 ntTSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Sik1Q60670 0610009B22Rik-202ENSMUST00000109098 892 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.5■■□□□ 1.03
Sik1Q60670 Gm11750-201ENSMUST00000146016 583 ntTSL 5 BASIC21.5■■□□□ 1.03
Sik1Q60670 Gm6736-201ENSMUST00000166583 948 ntBASIC21.5■■□□□ 1.03
Sik1Q60670 Csrp3-202ENSMUST00000167786 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Sik1Q60670 Gm42670-201ENSMUST00000201816 1292 ntBASIC21.5■■□□□ 1.03
Sik1Q60670 CT009713.7-201ENSMUST00000224689 571 ntBASIC21.5■■□□□ 1.03
Sik1Q60670 Rbfox2-207ENSMUST00000227533 1041 ntBASIC21.5■■□□□ 1.03
Sik1Q60670 Lce1l-201ENSMUST00000054426 670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Sik1Q60670 Psma5-201ENSMUST00000090569 1239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Sik1Q60670 Fam107a-202ENSMUST00000120411 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Sik1Q60670 Chrna2-202ENSMUST00000206455 1933 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.5■■□□□ 1.03
Sik1Q60670 Myo16-204ENSMUST00000208309 2462 ntTSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Sik1Q60670 Sfrp2-201ENSMUST00000029625 2003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Sik1Q60670 Phldb3-204ENSMUST00000206422 2564 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.49■■□□□ 1.03
Sik1Q60670 Cenpb-201ENSMUST00000089510 4886 ntAPPRIS P1 BASIC21.49■■□□□ 1.03
Sik1Q60670 Gm8909-203ENSMUST00000173353 1428 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.49■■□□□ 1.03
Sik1Q60670 Haghl-201ENSMUST00000077938 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Sik1Q60670 Gm16712-201ENSMUST00000181962 1960 ntTSL 2 BASIC21.49■■□□□ 1.03
Sik1Q60670 Rpl39l-202ENSMUST00000121292 550 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.49■■□□□ 1.03
Sik1Q60670 Ubl5-204ENSMUST00000160682 489 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.49■■□□□ 1.03
Sik1Q60670 Jpx-202ENSMUST00000182447 712 ntTSL 3 BASIC21.49■■□□□ 1.03
Sik1Q60670 Snrpf-201ENSMUST00000020203 861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Sik1Q60670 Cyba-202ENSMUST00000212600 638 ntTSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Sik1Q60670 CT943659.1-201ENSMUST00000215459 326 ntBASIC21.49■■□□□ 1.03
Sik1Q60670 Lce3b-201ENSMUST00000046234 562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Sik1Q60670 Vamp8-201ENSMUST00000059983 820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Sik1Q60670 Crlf3-201ENSMUST00000061283 2396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Sik1Q60670 Kmt5b-204ENSMUST00000113970 2975 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Sik1Q60670 Erich2-203ENSMUST00000134607 1659 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.49■■□□□ 1.03
Sik1Q60670 Zfp623-201ENSMUST00000037260 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Sik1Q60670 Krt23-201ENSMUST00000006969 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Sik1Q60670 Tbx20-202ENSMUST00000166018 1801 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Sik1Q60670 Arl4a-201ENSMUST00000101472 1200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Sik1Q60670 Gm25990-201ENSMUST00000102440 86 ntBASIC21.48■■□□□ 1.03
Sik1Q60670 Rhoc-202ENSMUST00000106787 959 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.48■■□□□ 1.03
Sik1Q60670 Fam107b-203ENSMUST00000115053 688 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.48■■□□□ 1.03
Sik1Q60670 Sec22b-202ENSMUST00000122288 1177 ntTSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Sik1Q60670 1700025J12Rik-201ENSMUST00000205586 630 ntTSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Sik1Q60670 AC154621.1-201ENSMUST00000226155 1119 ntBASIC21.48■■□□□ 1.03
Sik1Q60670 Ndufb9-201ENSMUST00000022980 704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Sik1Q60670 Anapc15-202ENSMUST00000035395 836 ntTSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 40.9 ms