Protein–RNA interactions for Protein: Q60596

Xrcc1, DNA repair protein XRCC1, mousemouse

Predictions only

Length 631 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Xrcc1Q60596 Ing1-207ENSMUST00000211007 2241 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Xrcc1Q60596 Pik3r2-201ENSMUST00000034296 3165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Xrcc1Q60596 Uri1-201ENSMUST00000085513 3441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Xrcc1Q60596 Mink1-202ENSMUST00000072873 4610 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Xrcc1Q60596 Ache-201ENSMUST00000024099 2186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Xrcc1Q60596 Ets1-201ENSMUST00000034534 5080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Xrcc1Q60596 Ak5-201ENSMUST00000045262 3323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Xrcc1Q60596 Dbn1-202ENSMUST00000109921 2378 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Xrcc1Q60596 Cux1-206ENSMUST00000176172 4882 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Xrcc1Q60596 Vps53-203ENSMUST00000108419 2209 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Xrcc1Q60596 Rundc3a-202ENSMUST00000107102 1837 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Xrcc1Q60596 Srrm2-209ENSMUST00000190686 8864 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Xrcc1Q60596 Gm13474-201ENSMUST00000122466 815 ntBASIC16.22■□□□□ 0.19
Xrcc1Q60596 4930405A21Rik-202ENSMUST00000139042 994 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Xrcc1Q60596 H2afz-207ENSMUST00000174561 810 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Xrcc1Q60596 Cldn22-201ENSMUST00000038693 995 ntAPPRIS P1 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Xrcc1Q60596 Pih1d1-201ENSMUST00000085375 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Xrcc1Q60596 Esyt2-205ENSMUST00000220816 4287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Xrcc1Q60596 Hspa5-202ENSMUST00000100171 2613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Xrcc1Q60596 Ankrd63-201ENSMUST00000104937 4861 ntAPPRIS P1 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Xrcc1Q60596 Vmn1r17-201ENSMUST00000227186 2234 ntAPPRIS P2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Xrcc1Q60596 Chpt1-201ENSMUST00000020253 3898 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Xrcc1Q60596 Kcnab3-201ENSMUST00000018614 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Xrcc1Q60596 Sfrp4-201ENSMUST00000002883 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Xrcc1Q60596 Gm20517-202ENSMUST00000132397 4807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Xrcc1Q60596 Hmga1-206ENSMUST00000119486 1003 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.21■□□□□ 0.19
Xrcc1Q60596 Pabpc1l2b-ps-201ENSMUST00000124538 690 ntBASIC16.21■□□□□ 0.19
Xrcc1Q60596 1810012K08Rik-201ENSMUST00000155199 574 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Xrcc1Q60596 Arpc4-204ENSMUST00000204802 794 ntTSL 3 BASIC16.21■□□□□ 0.19
Xrcc1Q60596 Eps8-203ENSMUST00000111878 3560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Xrcc1Q60596 5031425F14Rik-201ENSMUST00000127920 2098 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Xrcc1Q60596 Usp47-201ENSMUST00000106653 5540 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
Xrcc1Q60596 Rtn4-204ENSMUST00000102842 2257 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Xrcc1Q60596 Arfip2-202ENSMUST00000084782 2254 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
Xrcc1Q60596 Wnt4-201ENSMUST00000045747 4194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Xrcc1Q60596 4930448E22Rik-201ENSMUST00000181712 1581 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.18
Xrcc1Q60596 Dock3-201ENSMUST00000044532 9063 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.21■□□□□ 0.18
Xrcc1Q60596 Il17re-208ENSMUST00000204774 2146 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.18
Xrcc1Q60596 Tigd3-201ENSMUST00000055911 2114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.18
Xrcc1Q60596 Spsb2-203ENSMUST00000112473 1322 ntBASIC16.2■□□□□ 0.18
Xrcc1Q60596 Praf2-201ENSMUST00000033489 1339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Xrcc1Q60596 Rbpms-213ENSMUST00000191473 2547 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Xrcc1Q60596 Gm7854-202ENSMUST00000187409 1433 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Xrcc1Q60596 Prdm6-201ENSMUST00000091900 2601 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Xrcc1Q60596 Nudt16-201ENSMUST00000035179 1631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Xrcc1Q60596 Stam2-202ENSMUST00000127316 1928 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Xrcc1Q60596 Htr5b-201ENSMUST00000055884 1935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Xrcc1Q60596 Fgf8-201ENSMUST00000026240 1117 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Xrcc1Q60596 Mrps33-201ENSMUST00000031978 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Xrcc1Q60596 Hist3h2ba-201ENSMUST00000078267 614 ntAPPRIS P1 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Xrcc1Q60596 Acvr1c-204ENSMUST00000112608 1497 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Xrcc1Q60596 Gm26781-201ENSMUST00000181385 1477 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Xrcc1Q60596 Fiz1-203ENSMUST00000167804 2637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Xrcc1Q60596 Tle3-211ENSMUST00000161689 2836 ntTSL 2 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Xrcc1Q60596 Abhd10-201ENSMUST00000066983 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Xrcc1Q60596 1810013L24Rik-201ENSMUST00000023150 4066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Xrcc1Q60596 Farsa-202ENSMUST00000109754 1795 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Xrcc1Q60596 Sgta-201ENSMUST00000005067 1969 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Xrcc1Q60596 Ntrk1-201ENSMUST00000029712 2588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Xrcc1Q60596 Prss12-201ENSMUST00000029603 2602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Xrcc1Q60596 Mark3-201ENSMUST00000075281 3321 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Xrcc1Q60596 Lhx6-205ENSMUST00000112967 3378 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Xrcc1Q60596 Pdxdc1-202ENSMUST00000115802 2466 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Xrcc1Q60596 Gm42417-201ENSMUST00000191849 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Xrcc1Q60596 Nxnl1-201ENSMUST00000048243 2285 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Xrcc1Q60596 Proser2-201ENSMUST00000054254 2061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Xrcc1Q60596 March3-202ENSMUST00000102912 1754 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Xrcc1Q60596 Fam229a-201ENSMUST00000106043 558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Xrcc1Q60596 Cyp4f41-ps-201ENSMUST00000126790 1077 ntBASIC16.19■□□□□ 0.18
Xrcc1Q60596 4930544I03Rik-201ENSMUST00000181184 1276 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Xrcc1Q60596 Banf1-201ENSMUST00000025762 735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Xrcc1Q60596 0610009B22Rik-201ENSMUST00000007921 813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Xrcc1Q60596 Clcn2-202ENSMUST00000120099 2812 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Xrcc1Q60596 Dnaaf5-203ENSMUST00000196441 2426 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Xrcc1Q60596 Bmi1-201ENSMUST00000028071 3594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Xrcc1Q60596 Tfap2a-209ENSMUST00000225180 1828 ntBASIC16.19■□□□□ 0.18
Xrcc1Q60596 Plekhf1-201ENSMUST00000098513 5263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Xrcc1Q60596 Hsf5-201ENSMUST00000093956 4158 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Xrcc1Q60596 Mrpl39-201ENSMUST00000116584 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Xrcc1Q60596 Ostm1-201ENSMUST00000040718 3006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Xrcc1Q60596 Cdipt-201ENSMUST00000032920 1974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Xrcc1Q60596 Arid3b-202ENSMUST00000098686 1969 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Xrcc1Q60596 Myo5a-214ENSMUST00000155282 6372 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Xrcc1Q60596 1600012H06Rik-201ENSMUST00000052691 2506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Xrcc1Q60596 Med18-201ENSMUST00000102567 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Xrcc1Q60596 Prickle4-201ENSMUST00000113299 990 ntTSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Xrcc1Q60596 Prickle4-202ENSMUST00000113300 1110 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Xrcc1Q60596 Pthlh-202ENSMUST00000204197 1281 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Xrcc1Q60596 Uchl3-201ENSMUST00000002289 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Xrcc1Q60596 Tmem205-201ENSMUST00000046831 785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Xrcc1Q60596 Cacna2d2-203ENSMUST00000164988 5542 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Xrcc1Q60596 Bmp8a-201ENSMUST00000040496 2405 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Xrcc1Q60596 9430097D07Rik-201ENSMUST00000100190 1501 ntAPPRIS P1 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Xrcc1Q60596 Snapc3-201ENSMUST00000030206 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Xrcc1Q60596 Rab1a-201ENSMUST00000020358 2827 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Xrcc1Q60596 Bicc1-203ENSMUST00000143791 5431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Xrcc1Q60596 Ppp2r1b-204ENSMUST00000174628 2195 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Xrcc1Q60596 Gm16499-203ENSMUST00000204633 2177 ntBASIC16.17■□□□□ 0.18
Xrcc1Q60596 Pigw-202ENSMUST00000108080 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Xrcc1Q60596 Ing1-202ENSMUST00000209565 1971 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 29.2 ms