Protein–RNA interactions for Protein: Q5U4D9

Thoc6, THO complex subunit 6 homolog, mousemouse

Predictions only

Length 341 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Thoc6Q5U4D9 Dctn3-201ENSMUST00000030158 973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Thoc6Q5U4D9 Ripply2-201ENSMUST00000058846 503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Thoc6Q5U4D9 Wt1-205ENSMUST00000143043 3090 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Thoc6Q5U4D9 Cdh2-201ENSMUST00000025166 4843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Thoc6Q5U4D9 Cxcl14-201ENSMUST00000021970 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Thoc6Q5U4D9 Atp8b1-201ENSMUST00000025482 6440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Thoc6Q5U4D9 Armc10-202ENSMUST00000095495 2700 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Thoc6Q5U4D9 Arpc1a-201ENSMUST00000031625 1632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Thoc6Q5U4D9 Impdh1-210ENSMUST00000162739 2471 ntTSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Thoc6Q5U4D9 Ppp1r1b-204ENSMUST00000137634 1343 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Thoc6Q5U4D9 Mpdu1-201ENSMUST00000018905 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Thoc6Q5U4D9 Rps5-202ENSMUST00000108539 794 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Thoc6Q5U4D9 Gm13836-201ENSMUST00000121159 501 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
Thoc6Q5U4D9 4833413E03Rik-201ENSMUST00000013706 1091 ntTSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Thoc6Q5U4D9 AC159205.6-201ENSMUST00000224935 887 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
Thoc6Q5U4D9 Mrpl21-202ENSMUST00000025745 1138 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Thoc6Q5U4D9 Gng11-201ENSMUST00000031670 919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Thoc6Q5U4D9 Myoz1-201ENSMUST00000090469 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Thoc6Q5U4D9 Glmn-201ENSMUST00000078021 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Thoc6Q5U4D9 Ets1-201ENSMUST00000034534 5080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Thoc6Q5U4D9 Cep135-202ENSMUST00000121979 5537 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Thoc6Q5U4D9 Cadps2-212ENSMUST00000163871 4969 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Thoc6Q5U4D9 Sox4-201ENSMUST00000067230 4795 ntAPPRIS P1 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Thoc6Q5U4D9 Scly-201ENSMUST00000027532 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Thoc6Q5U4D9 6330411D24Rik-201ENSMUST00000211105 1568 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Thoc6Q5U4D9 Zdhhc6-207ENSMUST00000224897 2168 ntAPPRIS P1 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Thoc6Q5U4D9 Rasgrp1-201ENSMUST00000102534 5229 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Thoc6Q5U4D9 Gm21974-201ENSMUST00000126662 2037 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Thoc6Q5U4D9 Eif2b5-201ENSMUST00000003320 3186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Thoc6Q5U4D9 Dcps-202ENSMUST00000119847 1445 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Thoc6Q5U4D9 Tspan9-201ENSMUST00000032503 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Thoc6Q5U4D9 Dusp12-201ENSMUST00000027970 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Thoc6Q5U4D9 Fam166b-201ENSMUST00000052829 1349 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Thoc6Q5U4D9 Hoxc9-201ENSMUST00000001706 2374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Thoc6Q5U4D9 Tmc6-202ENSMUST00000103025 1279 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Thoc6Q5U4D9 Syt8-202ENSMUST00000105976 1289 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Thoc6Q5U4D9 Syt8-205ENSMUST00000122393 1291 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Thoc6Q5U4D9 Gm14114-201ENSMUST00000139345 287 ntTSL 3 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Thoc6Q5U4D9 Gm26709-202ENSMUST00000223049 819 ntTSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Thoc6Q5U4D9 Esyt2-205ENSMUST00000220816 4287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Thoc6Q5U4D9 Pkn1-201ENSMUST00000005616 6662 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Thoc6Q5U4D9 Bcar1-201ENSMUST00000166232 3142 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Thoc6Q5U4D9 Prkar2a-201ENSMUST00000035220 4965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Thoc6Q5U4D9 Ntrk1-201ENSMUST00000029712 2588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Thoc6Q5U4D9 5031425F14Rik-201ENSMUST00000127920 2098 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Thoc6Q5U4D9 Nfe2l1-202ENSMUST00000107657 3869 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Thoc6Q5U4D9 Plac9a-201ENSMUST00000052286 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Thoc6Q5U4D9 Ern1-204ENSMUST00000106801 1957 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Thoc6Q5U4D9 Donson-201ENSMUST00000023682 2360 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Thoc6Q5U4D9 Gm45623-201ENSMUST00000210744 1457 ntAPPRIS P1 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Thoc6Q5U4D9 Cacfd1-205ENSMUST00000114007 2689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Thoc6Q5U4D9 Vmn1r17-201ENSMUST00000227186 2234 ntAPPRIS P2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Thoc6Q5U4D9 Fiz1-203ENSMUST00000167804 2637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Thoc6Q5U4D9 Sharpin-201ENSMUST00000023211 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Thoc6Q5U4D9 Ccni-201ENSMUST00000058550 2804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Thoc6Q5U4D9 Trabd-201ENSMUST00000081702 2439 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Thoc6Q5U4D9 Izumo1r-204ENSMUST00000121116 726 ntTSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Thoc6Q5U4D9 2210408F21Rik-208ENSMUST00000144612 450 ntTSL 3 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Thoc6Q5U4D9 Gm37025-201ENSMUST00000195159 829 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
Thoc6Q5U4D9 Gm29994-201ENSMUST00000195495 1193 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
Thoc6Q5U4D9 Lsm10-201ENSMUST00000055575 943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Thoc6Q5U4D9 Hist3h2ba-201ENSMUST00000078267 614 ntAPPRIS P1 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Thoc6Q5U4D9 F12-201ENSMUST00000021948 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Thoc6Q5U4D9 Synm-205ENSMUST00000208815 2697 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Thoc6Q5U4D9 Mrpl39-201ENSMUST00000116584 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Thoc6Q5U4D9 Nxnl1-201ENSMUST00000048243 2285 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Thoc6Q5U4D9 Iqsec2-203ENSMUST00000112605 6017 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Thoc6Q5U4D9 6430573F11Rik-202ENSMUST00000135373 2573 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Thoc6Q5U4D9 P2ry1-203ENSMUST00000193943 2203 ntAPPRIS P1 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Thoc6Q5U4D9 Dcaf12l2-201ENSMUST00000115057 2885 ntAPPRIS P1 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Thoc6Q5U4D9 Mpped2-202ENSMUST00000111063 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Thoc6Q5U4D9 Fam171a2-201ENSMUST00000049057 3118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Thoc6Q5U4D9 Adat2-201ENSMUST00000019944 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Thoc6Q5U4D9 Atad3a-201ENSMUST00000030903 2413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Thoc6Q5U4D9 Zfp746-201ENSMUST00000073124 3651 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Thoc6Q5U4D9 Krt73-201ENSMUST00000063292 2165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Thoc6Q5U4D9 Pdcd5-202ENSMUST00000120714 767 ntTSL 3 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Thoc6Q5U4D9 Ptf1aos-201ENSMUST00000122978 916 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Thoc6Q5U4D9 Gm16731-201ENSMUST00000132432 922 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Thoc6Q5U4D9 Steap1-201ENSMUST00000015796 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Thoc6Q5U4D9 Muc2-203ENSMUST00000179227 399 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Thoc6Q5U4D9 4930579K19Rik-202ENSMUST00000190541 632 ntTSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Thoc6Q5U4D9 4732471J01Rik-202ENSMUST00000205787 991 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Thoc6Q5U4D9 Olfr464-201ENSMUST00000074874 1084 ntAPPRIS P1 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Thoc6Q5U4D9 Dlx3-201ENSMUST00000092768 2607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Thoc6Q5U4D9 Myo5a-214ENSMUST00000155282 6372 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.15
Thoc6Q5U4D9 Paqr4-201ENSMUST00000024702 2507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Thoc6Q5U4D9 Syt9-201ENSMUST00000073459 3817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Thoc6Q5U4D9 Appl2-201ENSMUST00000020500 3020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Thoc6Q5U4D9 Mfsd13a-202ENSMUST00000128041 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Thoc6Q5U4D9 Dbn1-202ENSMUST00000109921 2378 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Thoc6Q5U4D9 Gm16861-201ENSMUST00000181498 1647 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Thoc6Q5U4D9 Kdelr2-201ENSMUST00000110731 1829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Thoc6Q5U4D9 Pdlim5-211ENSMUST00000198381 1555 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Thoc6Q5U4D9 Cyr61-201ENSMUST00000029846 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Thoc6Q5U4D9 Mycbp-202ENSMUST00000106202 1536 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Thoc6Q5U4D9 Ing1-202ENSMUST00000209565 1971 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Thoc6Q5U4D9 Otud5-202ENSMUST00000115665 3821 ntTSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Thoc6Q5U4D9 Gm9731-201ENSMUST00000209480 747 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
Thoc6Q5U4D9 Fitm1-201ENSMUST00000022826 971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 32.3 ms