Protein–RNA interactions for Protein: Q5U3K5

Rabl6, Rab-like protein 6, mousemouse

Predictions only

Length 725 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rabl6Q5U3K5 Ppm1d-201ENSMUST00000020835 2899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Rabl6Q5U3K5 Zfc3h1-201ENSMUST00000036044 6957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Rabl6Q5U3K5 Doc2g-201ENSMUST00000025806 1446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Rabl6Q5U3K5 Rusc1-203ENSMUST00000166687 1922 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Rabl6Q5U3K5 Mfsd4b1-201ENSMUST00000163705 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Rabl6Q5U3K5 Sh2b1-203ENSMUST00000205440 3089 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Rabl6Q5U3K5 Rab27b-202ENSMUST00000117692 2842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Rabl6Q5U3K5 Matn4-201ENSMUST00000103103 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Rabl6Q5U3K5 Spata18-202ENSMUST00000071077 1978 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
Rabl6Q5U3K5 Slc6a17-208ENSMUST00000169449 6322 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Rabl6Q5U3K5 Slc6a17-201ENSMUST00000029499 6308 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Rabl6Q5U3K5 1600012H06Rik-203ENSMUST00000174004 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Rabl6Q5U3K5 Pld2-201ENSMUST00000018429 3659 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Rabl6Q5U3K5 Foxp4-203ENSMUST00000113263 3156 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
Rabl6Q5U3K5 Stxbp3-205ENSMUST00000138552 1789 ntTSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Rabl6Q5U3K5 Hnrnpu-201ENSMUST00000037748 7640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Rabl6Q5U3K5 Fbxl12os-202ENSMUST00000136376 2349 ntTSL 2 BASIC16.67■□□□□ 0.26
Rabl6Q5U3K5 1810013L24Rik-201ENSMUST00000023150 4066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Rabl6Q5U3K5 Arpc4-202ENSMUST00000171058 695 ntTSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
Rabl6Q5U3K5 Gm43183-201ENSMUST00000200632 547 ntBASIC16.67■□□□□ 0.26
Rabl6Q5U3K5 Fcho1-209ENSMUST00000146100 3188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Rabl6Q5U3K5 Adamtsl1-201ENSMUST00000048885 1842 ntTSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
Rabl6Q5U3K5 Trim45-202ENSMUST00000094048 1815 ntTSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
Rabl6Q5U3K5 Ddn-201ENSMUST00000075444 3740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Rabl6Q5U3K5 Nrn1-203ENSMUST00000223611 1443 ntBASIC16.67■□□□□ 0.26
Rabl6Q5U3K5 Ngly1-201ENSMUST00000022310 2935 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Rabl6Q5U3K5 Psen2-205ENSMUST00000111108 1997 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Rabl6Q5U3K5 Slc46a1-201ENSMUST00000001126 1978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Rabl6Q5U3K5 Wdtc1-201ENSMUST00000043305 4191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Rabl6Q5U3K5 4930448E22Rik-202ENSMUST00000215242 2102 ntTSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
Rabl6Q5U3K5 Trim31-201ENSMUST00000078438 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Rabl6Q5U3K5 Irf3-213ENSMUST00000209066 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Rabl6Q5U3K5 Stk39-201ENSMUST00000102715 3536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Rabl6Q5U3K5 Cxcl12-202ENSMUST00000112866 1878 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Rabl6Q5U3K5 Ptpn5-201ENSMUST00000033142 3145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Rabl6Q5U3K5 Igdcc3-201ENSMUST00000034961 3146 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Rabl6Q5U3K5 Mdm1-204ENSMUST00000169817 2022 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Rabl6Q5U3K5 Katnbl1-201ENSMUST00000028552 2886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Rabl6Q5U3K5 Irak1-201ENSMUST00000033769 2890 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Rabl6Q5U3K5 Cul4a-201ENSMUST00000016680 3728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Rabl6Q5U3K5 Gata6-201ENSMUST00000047762 3194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Rabl6Q5U3K5 Tnfrsf25-202ENSMUST00000035275 1603 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Rabl6Q5U3K5 Ffar3-201ENSMUST00000094583 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Rabl6Q5U3K5 Ccdc106-204ENSMUST00000207974 2492 ntTSL 2 BASIC16.67■□□□□ 0.26
Rabl6Q5U3K5 Dag1-201ENSMUST00000080435 4364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Rabl6Q5U3K5 Mst1-204ENSMUST00000162886 2209 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.66■□□□□ 0.26
Rabl6Q5U3K5 Pex11a-201ENSMUST00000032761 2241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Rabl6Q5U3K5 Met-203ENSMUST00000115443 6809 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.66■□□□□ 0.26
Rabl6Q5U3K5 Hivep3-201ENSMUST00000084306 2973 ntBASIC16.66■□□□□ 0.26
Rabl6Q5U3K5 Pard6g-201ENSMUST00000070219 3143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Rabl6Q5U3K5 Fbxo7-203ENSMUST00000120344 1655 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Rabl6Q5U3K5 Coro1a-201ENSMUST00000032949 1660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Rabl6Q5U3K5 Ptgis-201ENSMUST00000018113 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Rabl6Q5U3K5 Fam131b-201ENSMUST00000031891 4065 ntTSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Rabl6Q5U3K5 Synpo-205ENSMUST00000130044 4970 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.66■□□□□ 0.26
Rabl6Q5U3K5 Znfx1-201ENSMUST00000048988 7218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Rabl6Q5U3K5 Mrps18c-203ENSMUST00000112901 820 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Rabl6Q5U3K5 Jtb-202ENSMUST00000119304 878 ntTSL 3 BASIC16.66■□□□□ 0.26
Rabl6Q5U3K5 Mrps10-204ENSMUST00000120737 1017 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Rabl6Q5U3K5 Gm16764-202ENSMUST00000148931 433 ntTSL 5 BASIC16.66■□□□□ 0.26
Rabl6Q5U3K5 AA465934-203ENSMUST00000177150 383 ntTSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Rabl6Q5U3K5 Nudt22-203ENSMUST00000180765 1073 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.66■□□□□ 0.26
Rabl6Q5U3K5 Gm9694-201ENSMUST00000193347 1189 ntBASIC16.66■□□□□ 0.26
Rabl6Q5U3K5 Gm37025-201ENSMUST00000195159 829 ntBASIC16.66■□□□□ 0.26
Rabl6Q5U3K5 Coro2a-202ENSMUST00000107756 4154 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Rabl6Q5U3K5 Gabbr1-202ENSMUST00000172789 1460 ntTSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Rabl6Q5U3K5 Rab37-202ENSMUST00000067754 2577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Rabl6Q5U3K5 Mbip-201ENSMUST00000021416 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Rabl6Q5U3K5 Pkn1-201ENSMUST00000005616 6662 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Rabl6Q5U3K5 Atp5c1-202ENSMUST00000114896 1735 ntTSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Rabl6Q5U3K5 Gm42918-201ENSMUST00000199249 1580 ntBASIC16.65■□□□□ 0.26
Rabl6Q5U3K5 Dtnbp1-203ENSMUST00000220555 1589 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.65■□□□□ 0.26
Rabl6Q5U3K5 Fhl2-201ENSMUST00000008280 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Rabl6Q5U3K5 Bicc1-203ENSMUST00000143791 5431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Rabl6Q5U3K5 Ppp2r2d-207ENSMUST00000155672 1938 ntTSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Rabl6Q5U3K5 Dhx30-224ENSMUST00000200066 4623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Rabl6Q5U3K5 Rnf146-202ENSMUST00000160144 4323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Rabl6Q5U3K5 CT010444.2-201ENSMUST00000217877 1629 ntBASIC16.65■□□□□ 0.26
Rabl6Q5U3K5 Lmtk2-201ENSMUST00000041804 8114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Rabl6Q5U3K5 Matr3-214ENSMUST00000190029 2845 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.65■□□□□ 0.26
Rabl6Q5U3K5 Lrrc36-206ENSMUST00000216765 2301 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.65■□□□□ 0.26
Rabl6Q5U3K5 Plekha4-202ENSMUST00000209517 2577 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.65■□□□□ 0.26
Rabl6Q5U3K5 Shisa2-201ENSMUST00000053949 3119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Rabl6Q5U3K5 Fancg-201ENSMUST00000030165 2771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Rabl6Q5U3K5 Poglut1-201ENSMUST00000036210 2758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Rabl6Q5U3K5 4930519A11Rik-201ENSMUST00000181381 1523 ntTSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Rabl6Q5U3K5 Pitpnm1-201ENSMUST00000049658 4206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Rabl6Q5U3K5 AL590614.2-201ENSMUST00000225374 1937 ntBASIC16.64■□□□□ 0.26
Rabl6Q5U3K5 Ctu1-201ENSMUST00000038332 2475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.26
Rabl6Q5U3K5 Bmp2k-201ENSMUST00000035635 7387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Rabl6Q5U3K5 Arid3b-202ENSMUST00000098686 1969 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Rabl6Q5U3K5 Ntng1-204ENSMUST00000106571 1446 ntTSL 5 BASIC16.64■□□□□ 0.25
Rabl6Q5U3K5 Capg-202ENSMUST00000114071 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Rabl6Q5U3K5 Ntng1-210ENSMUST00000138953 1443 ntTSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Rabl6Q5U3K5 Esyt2-205ENSMUST00000220816 4287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Rabl6Q5U3K5 Plekha7-210ENSMUST00000182834 5257 ntTSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Rabl6Q5U3K5 E230025N22Rik-201ENSMUST00000115682 2016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Rabl6Q5U3K5 Spata3-208ENSMUST00000149469 1110 ntTSL 5 BASIC16.64■□□□□ 0.25
Rabl6Q5U3K5 Park7-201ENSMUST00000030805 908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Rabl6Q5U3K5 Hist1h2bh-201ENSMUST00000224359 1679 ntAPPRIS P1 BASIC16.64■□□□□ 0.25
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 19.6 ms