Protein–RNA interactions for Protein: Q5SX40

Myh1, Myosin-1, mousemouse

Predictions only

Length 1,942 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Myh1Q5SX40 Paip2-201ENSMUST00000041314 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Myh1Q5SX40 Ddx39b-203ENSMUST00000173731 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Myh1Q5SX40 Gm31727-201ENSMUST00000210102 360 ntTSL 3 BASIC20.47■□□□□ 0.87
Myh1Q5SX40 Il17b-201ENSMUST00000025471 692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Myh1Q5SX40 Efemp2-204ENSMUST00000165485 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Myh1Q5SX40 Gm16638-201ENSMUST00000148687 1865 ntTSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Myh1Q5SX40 Pea15a-201ENSMUST00000013842 2501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Myh1Q5SX40 Smap2-201ENSMUST00000043200 2905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Myh1Q5SX40 Rgmb-201ENSMUST00000170578 2633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Myh1Q5SX40 Pptc7-201ENSMUST00000053426 4644 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Myh1Q5SX40 Tfap2a-208ENSMUST00000224999 2058 ntAPPRIS ALT1 BASIC20.46■□□□□ 0.87
Myh1Q5SX40 Itgb5-201ENSMUST00000069345 3056 ntTSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Myh1Q5SX40 Prkcg-202ENSMUST00000172109 2119 ntTSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Myh1Q5SX40 Rsph6a-202ENSMUST00000076887 1580 ntTSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Myh1Q5SX40 Ubp1-201ENSMUST00000009885 3742 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.46■□□□□ 0.87
Myh1Q5SX40 Ccdc102a-201ENSMUST00000077955 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Myh1Q5SX40 Gm44430-201ENSMUST00000203376 995 ntBASIC20.46■□□□□ 0.87
Myh1Q5SX40 AC153556.1-201ENSMUST00000215135 794 ntTSL 5 BASIC20.46■□□□□ 0.87
Myh1Q5SX40 Psmg3-201ENSMUST00000031531 883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Myh1Q5SX40 Agfg2-202ENSMUST00000100544 2858 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Myh1Q5SX40 Otub1-202ENSMUST00000123594 1728 ntTSL 5 BASIC20.46■□□□□ 0.87
Myh1Q5SX40 Kcnj4-201ENSMUST00000057801 2148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Myh1Q5SX40 Nagpa-203ENSMUST00000147567 2230 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Myh1Q5SX40 Kcng4-202ENSMUST00000164382 1875 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.46■□□□□ 0.87
Myh1Q5SX40 Epha10-201ENSMUST00000059343 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.87
Myh1Q5SX40 Stxbp5l-202ENSMUST00000114775 1691 ntTSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Myh1Q5SX40 Rnf121-202ENSMUST00000096639 2249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Myh1Q5SX40 Arpc4-201ENSMUST00000156898 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Myh1Q5SX40 Gm27867-201ENSMUST00000184778 125 ntBASIC20.45■□□□□ 0.86
Myh1Q5SX40 A330070K13Rik-201ENSMUST00000063656 633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Myh1Q5SX40 Asnsd1-201ENSMUST00000027264 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Myh1Q5SX40 4833418N02Rik-202ENSMUST00000146560 1495 ntTSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Myh1Q5SX40 Apbb1-205ENSMUST00000187057 1630 ntTSL 5 BASIC20.45■□□□□ 0.86
Myh1Q5SX40 Anapc5-218ENSMUST00000200645 2404 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Myh1Q5SX40 Atp6v1g2-203ENSMUST00000130992 524 ntTSL 2 BASIC20.45■□□□□ 0.86
Myh1Q5SX40 Slbp-205ENSMUST00000139518 1191 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.45■□□□□ 0.86
Myh1Q5SX40 2210408F21Rik-212ENSMUST00000152157 490 ntTSL 2 BASIC20.45■□□□□ 0.86
Myh1Q5SX40 Fxyd5-208ENSMUST00000161805 1166 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Myh1Q5SX40 9530052E02Rik-201ENSMUST00000180750 949 ntTSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Myh1Q5SX40 Gm44357-201ENSMUST00000195897 142 ntBASIC20.45■□□□□ 0.86
Myh1Q5SX40 Gm19658-201ENSMUST00000196231 138 ntBASIC20.45■□□□□ 0.86
Myh1Q5SX40 Gm44367-201ENSMUST00000196836 138 ntBASIC20.45■□□□□ 0.86
Myh1Q5SX40 Gm44350-201ENSMUST00000197197 138 ntBASIC20.45■□□□□ 0.86
Myh1Q5SX40 Gm44390-201ENSMUST00000197533 144 ntBASIC20.45■□□□□ 0.86
Myh1Q5SX40 Gm44313-201ENSMUST00000198018 138 ntBASIC20.45■□□□□ 0.86
Myh1Q5SX40 Gm44486-201ENSMUST00000198508 138 ntBASIC20.45■□□□□ 0.86
Myh1Q5SX40 Gm44454-201ENSMUST00000198541 138 ntBASIC20.45■□□□□ 0.86
Myh1Q5SX40 Gm44314-201ENSMUST00000199263 138 ntBASIC20.45■□□□□ 0.86
Myh1Q5SX40 Gm44394-201ENSMUST00000199558 138 ntBASIC20.45■□□□□ 0.86
Myh1Q5SX40 Gm44484-201ENSMUST00000199873 138 ntBASIC20.45■□□□□ 0.86
Myh1Q5SX40 Gm44466-201ENSMUST00000200264 138 ntBASIC20.45■□□□□ 0.86
Myh1Q5SX40 Gm44359-201ENSMUST00000200671 138 ntBASIC20.45■□□□□ 0.86
Myh1Q5SX40 Jdp2-202ENSMUST00000171754 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Myh1Q5SX40 Dhx15-201ENSMUST00000031061 3010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Myh1Q5SX40 Fam104a-201ENSMUST00000120194 2619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Myh1Q5SX40 Pih1d1-202ENSMUST00000107811 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Myh1Q5SX40 Gm13054-201ENSMUST00000154192 820 ntTSL 3 BASIC20.44■□□□□ 0.86
Myh1Q5SX40 AV026068-207ENSMUST00000187718 400 ntTSL 5 BASIC20.44■□□□□ 0.86
Myh1Q5SX40 Ssr2-205ENSMUST00000193934 569 ntTSL 3 BASIC20.44■□□□□ 0.86
Myh1Q5SX40 Ift74-202ENSMUST00000107104 1713 ntTSL 2 BASIC20.44■□□□□ 0.86
Myh1Q5SX40 Mettl27-205ENSMUST00000111221 1796 ntTSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Myh1Q5SX40 Ache-201ENSMUST00000024099 2186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Myh1Q5SX40 Slc39a1-201ENSMUST00000015467 2364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Myh1Q5SX40 Schip1-201ENSMUST00000029346 2201 ntTSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Myh1Q5SX40 Zpbp2-203ENSMUST00000107509 1577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Myh1Q5SX40 Scpep1os-201ENSMUST00000139592 811 ntTSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Myh1Q5SX40 Edf1-201ENSMUST00000015236 722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Myh1Q5SX40 Bag2-203ENSMUST00000187602 378 ntTSL 2 BASIC20.43■□□□□ 0.86
Myh1Q5SX40 Hmgb1-rs17-201ENSMUST00000210634 972 ntBASIC20.43■□□□□ 0.86
Myh1Q5SX40 Tmem270-201ENSMUST00000047305 932 ntTSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Myh1Q5SX40 5031425F14Rik-201ENSMUST00000127920 2098 ntTSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Myh1Q5SX40 Mier2-212ENSMUST00000172158 1400 ntTSL 5 BASIC20.43■□□□□ 0.86
Myh1Q5SX40 Selenoh-201ENSMUST00000102646 783 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Myh1Q5SX40 Drap1-202ENSMUST00000113673 744 ntTSL 2 BASIC20.43■□□□□ 0.86
Myh1Q5SX40 Gm13884-201ENSMUST00000118103 829 ntBASIC20.43■□□□□ 0.86
Myh1Q5SX40 Selenoh-206ENSMUST00000189988 390 ntTSL 3 BASIC20.43■□□□□ 0.86
Myh1Q5SX40 4931422A03Rik-201ENSMUST00000056170 1037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Myh1Q5SX40 Chtf8-206ENSMUST00000177068 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Myh1Q5SX40 Gnb1-203ENSMUST00000165335 3143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
Myh1Q5SX40 Arhgef9-208ENSMUST00000128565 2285 ntTSL 5 BASIC20.42■□□□□ 0.86
Myh1Q5SX40 Csnk1e-203ENSMUST00000122044 3174 ntTSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
Myh1Q5SX40 Jam2-201ENSMUST00000098407 1998 ntTSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
Myh1Q5SX40 Rasgef1b-205ENSMUST00000161148 2430 ntTSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
Myh1Q5SX40 Smpd5-202ENSMUST00000163991 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
Myh1Q5SX40 Dvl3-204ENSMUST00000171774 2319 ntTSL 5 BASIC20.42■□□□□ 0.86
Myh1Q5SX40 Prr3-202ENSMUST00000165613 767 ntTSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
Myh1Q5SX40 H2-T-ps-201ENSMUST00000172538 1067 ntBASIC20.42■□□□□ 0.86
Myh1Q5SX40 Lmo1-203ENSMUST00000208136 772 ntTSL 2 BASIC20.42■□□□□ 0.86
Myh1Q5SX40 Nudt16l1-201ENSMUST00000050881 1269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
Myh1Q5SX40 Klf16-201ENSMUST00000038558 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
Myh1Q5SX40 Hmbs-201ENSMUST00000077353 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
Myh1Q5SX40 Usb1-201ENSMUST00000034245 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
Myh1Q5SX40 Magi2-201ENSMUST00000088516 4843 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.41■□□□□ 0.86
Myh1Q5SX40 Ogfod3-201ENSMUST00000026169 1308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Myh1Q5SX40 Acadvl-201ENSMUST00000018718 2020 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.41■□□□□ 0.86
Myh1Q5SX40 Hrh3-204ENSMUST00000165248 1224 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.41■□□□□ 0.86
Myh1Q5SX40 Vamp8-201ENSMUST00000059983 820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Myh1Q5SX40 Clasp2-204ENSMUST00000213663 2727 ntTSL 5 BASIC20.41■□□□□ 0.86
Myh1Q5SX40 Nrn1-201ENSMUST00000037623 1619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Myh1Q5SX40 Ing1-202ENSMUST00000209565 1971 ntTSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 66.1 ms