Protein–RNA interactions for Protein: Q5FWC9

Gm3558, Predicted gene 3558, mousemouse

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Length 205 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm3558Q5FWC9 Il1rn-201ENSMUST00000114482 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Gm3558Q5FWC9 Gm16712-201ENSMUST00000181962 1960 ntTSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Gm3558Q5FWC9 Syt3-202ENSMUST00000118962 2494 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Gm3558Q5FWC9 Nr2e1-201ENSMUST00000019938 3285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Gm3558Q5FWC9 K230015D01Rik-201ENSMUST00000211969 1516 ntBASIC16.37■□□□□ 0.21
Gm3558Q5FWC9 Atox1-201ENSMUST00000108857 541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Gm3558Q5FWC9 Gm22325-201ENSMUST00000158904 308 ntBASIC16.37■□□□□ 0.21
Gm3558Q5FWC9 Gm19426-201ENSMUST00000181711 726 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
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Gm3558Q5FWC9 AC135963.1-201ENSMUST00000211640 717 ntBASIC16.37■□□□□ 0.21
Gm3558Q5FWC9 Cmc1-202ENSMUST00000215799 531 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Gm3558Q5FWC9 Isg20l2-201ENSMUST00000055984 2893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Gm3558Q5FWC9 Large1-204ENSMUST00000212459 4746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Gm3558Q5FWC9 Fubp1-205ENSMUST00000196695 2374 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Gm3558Q5FWC9 4930448E22Rik-202ENSMUST00000215242 2102 ntTSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Gm3558Q5FWC9 Osbpl1a-208ENSMUST00000121888 2674 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Gm3558Q5FWC9 CT010444.2-201ENSMUST00000217877 1629 ntBASIC16.37■□□□□ 0.21
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Gm3558Q5FWC9 Ttc13-202ENSMUST00000117624 3096 ntTSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Gm3558Q5FWC9 Clcn2-202ENSMUST00000120099 2812 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Gm3558Q5FWC9 Sybu-202ENSMUST00000110267 3127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Gm3558Q5FWC9 Igdcc3-201ENSMUST00000034961 3146 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Gm3558Q5FWC9 March2-201ENSMUST00000066121 3400 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Gm3558Q5FWC9 Yipf3-201ENSMUST00000095263 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Gm3558Q5FWC9 Aqp1-201ENSMUST00000004774 2627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Gm3558Q5FWC9 Fev-201ENSMUST00000068631 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Gm3558Q5FWC9 Btbd1-201ENSMUST00000026093 3001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Gm3558Q5FWC9 Mrpl15-205ENSMUST00000146665 1569 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Gm3558Q5FWC9 Mrps10-204ENSMUST00000120737 1017 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Gm3558Q5FWC9 Gm14321-201ENSMUST00000127441 632 ntTSL 3 BASIC16.36■□□□□ 0.21
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Gm3558Q5FWC9 Nr2c2ap-202ENSMUST00000211898 1078 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Gm3558Q5FWC9 Usf3-201ENSMUST00000088356 757 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Gm3558Q5FWC9 Krt9-201ENSMUST00000059707 2580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Gm3558Q5FWC9 Knl1-201ENSMUST00000028799 5527 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
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Gm3558Q5FWC9 Rab11fip3-202ENSMUST00000120691 5103 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Gm3558Q5FWC9 Galnt18-201ENSMUST00000049430 2575 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
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Gm3558Q5FWC9 Ddn-201ENSMUST00000075444 3740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Gm3558Q5FWC9 Mfsd4b1-201ENSMUST00000163705 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Gm3558Q5FWC9 Mfsd10-202ENSMUST00000114329 1906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Gm3558Q5FWC9 Ehmt2-204ENSMUST00000114033 3882 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Gm3558Q5FWC9 Wnt10b-202ENSMUST00000166022 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Gm3558Q5FWC9 Kdelc2-201ENSMUST00000037853 3642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Gm3558Q5FWC9 Ngb-201ENSMUST00000021420 1616 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Gm3558Q5FWC9 Noxa1-201ENSMUST00000044018 1617 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Gm3558Q5FWC9 Trhde-201ENSMUST00000061632 5714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Gm3558Q5FWC9 Mapk8ip3-205ENSMUST00000119115 4173 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Gm3558Q5FWC9 4932443I19Rik-204ENSMUST00000214337 1212 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Gm3558Q5FWC9 Bricd5-201ENSMUST00000054946 997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
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Gm3558Q5FWC9 Fxn-201ENSMUST00000081333 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Gm3558Q5FWC9 Mtmr12-201ENSMUST00000038172 6840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Gm3558Q5FWC9 Phb-204ENSMUST00000125172 1799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Gm3558Q5FWC9 Lin7a-203ENSMUST00000218031 1769 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Gm3558Q5FWC9 Mfsd13a-202ENSMUST00000128041 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Gm3558Q5FWC9 Cadm1-204ENSMUST00000114548 4482 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Gm3558Q5FWC9 Shisa7-201ENSMUST00000066041 6006 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Gm3558Q5FWC9 Krt81-201ENSMUST00000061185 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Gm3558Q5FWC9 Shh-201ENSMUST00000002708 2847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
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Gm3558Q5FWC9 Eda-202ENSMUST00000113775 5088 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Gm3558Q5FWC9 Chsy3-201ENSMUST00000080721 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Gm3558Q5FWC9 Snrk-201ENSMUST00000118886 4811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Gm3558Q5FWC9 Ptpa-202ENSMUST00000113601 1838 ntTSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
Gm3558Q5FWC9 Rab1b-201ENSMUST00000025804 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Gm3558Q5FWC9 Gm16867-201ENSMUST00000179116 3084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Gm3558Q5FWC9 Atp5c1-203ENSMUST00000114897 1166 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Gm3558Q5FWC9 Gm16127-201ENSMUST00000131619 234 ntTSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
Gm3558Q5FWC9 Calu-208ENSMUST00000173694 611 ntTSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
Gm3558Q5FWC9 Gm16998-201ENSMUST00000181899 1230 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
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Gm3558Q5FWC9 Nsg1-204ENSMUST00000201363 820 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.34■□□□□ 0.21
Gm3558Q5FWC9 Zfp787-204ENSMUST00000207628 576 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Gm3558Q5FWC9 Zdhhc24-201ENSMUST00000006632 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Gm3558Q5FWC9 Tmed3-201ENSMUST00000058488 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Gm3558Q5FWC9 Mettl21a-201ENSMUST00000053469 2666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Gm3558Q5FWC9 Zfp367-202ENSMUST00000117241 2753 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Gm3558Q5FWC9 Ctnna2-204ENSMUST00000160894 4162 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Gm3558Q5FWC9 Tspan4-201ENSMUST00000026585 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Gm3558Q5FWC9 Efna4-201ENSMUST00000029674 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Gm3558Q5FWC9 Rara-204ENSMUST00000107475 2469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Gm3558Q5FWC9 Zdhhc1-201ENSMUST00000044286 1737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
Gm3558Q5FWC9 Mdfi-202ENSMUST00000066368 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
Gm3558Q5FWC9 Gabrb3-201ENSMUST00000039697 5579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
Gm3558Q5FWC9 Pde5a-204ENSMUST00000200389 7603 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.21
Gm3558Q5FWC9 Samd4-211ENSMUST00000228404 3039 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.33■□□□□ 0.21
Gm3558Q5FWC9 Ppp1r1b-201ENSMUST00000078694 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
Gm3558Q5FWC9 Fam57a-201ENSMUST00000094014 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
Gm3558Q5FWC9 Pdx1-201ENSMUST00000085591 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
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