Protein–RNA interactions for Protein: Q5DTT3

Fam208b, Protein FAM208B, mousemouse

Predictions only

Length 2,382 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Fam208bQ5DTT3 Tbc1d2b-202ENSMUST00000128874 3473 ntTSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Fam208bQ5DTT3 Gm26885-201ENSMUST00000181920 1688 ntTSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Fam208bQ5DTT3 Ctsg-201ENSMUST00000015583 1002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Fam208bQ5DTT3 Tex30-213ENSMUST00000156392 1122 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.54□□□□□ -0.08
Fam208bQ5DTT3 Gm2756-201ENSMUST00000195851 400 ntBASIC14.54□□□□□ -0.08
Fam208bQ5DTT3 Ank1-201ENSMUST00000033947 1030 ntTSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Fam208bQ5DTT3 Ptprcap-201ENSMUST00000061086 927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Fam208bQ5DTT3 Pla2g12b-201ENSMUST00000009790 1091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Fam208bQ5DTT3 Anapc5-205ENSMUST00000197074 2413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Fam208bQ5DTT3 Anapc5-212ENSMUST00000199406 2413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Fam208bQ5DTT3 Snrnp48-201ENSMUST00000091641 1785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Fam208bQ5DTT3 Noxa1-201ENSMUST00000044018 1617 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Fam208bQ5DTT3 Gm4675-202ENSMUST00000164755 2322 ntTSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Fam208bQ5DTT3 Tal1-204ENSMUST00000162489 2894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Fam208bQ5DTT3 Acot2-201ENSMUST00000021649 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Fam208bQ5DTT3 Igsf8-202ENSMUST00000085912 2182 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.54□□□□□ -0.08
Fam208bQ5DTT3 Smim3-201ENSMUST00000042710 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Fam208bQ5DTT3 Fbxo30-201ENSMUST00000070300 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Fam208bQ5DTT3 Gdf15-201ENSMUST00000003808 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Fam208bQ5DTT3 Olfr1564-201ENSMUST00000112162 1091 ntAPPRIS P2 BASIC14.54□□□□□ -0.08
Fam208bQ5DTT3 Tsen15-205ENSMUST00000162371 431 ntTSL 5 BASIC14.54□□□□□ -0.08
Fam208bQ5DTT3 Ciao1-204ENSMUST00000174030 1109 ntTSL 5 BASIC14.54□□□□□ -0.08
Fam208bQ5DTT3 Gm10060-201ENSMUST00000212002 111 ntBASIC14.54□□□□□ -0.08
Fam208bQ5DTT3 Magohb-201ENSMUST00000032307 767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Fam208bQ5DTT3 Tamm41-201ENSMUST00000032461 1168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Fam208bQ5DTT3 Phf7-203ENSMUST00000226565 1971 ntBASIC14.54□□□□□ -0.08
Fam208bQ5DTT3 Zic1-202ENSMUST00000065360 2811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Fam208bQ5DTT3 Rb1-201ENSMUST00000022701 4656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Fam208bQ5DTT3 Rbm43-201ENSMUST00000102767 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Fam208bQ5DTT3 Tmem242-201ENSMUST00000005053 948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Fam208bQ5DTT3 Ythdf2-201ENSMUST00000085181 955 ntTSL 2 BASIC14.53□□□□□ -0.08
Fam208bQ5DTT3 Ffar3-201ENSMUST00000094583 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Fam208bQ5DTT3 Negr1-203ENSMUST00000106065 1953 ntTSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Fam208bQ5DTT3 Acbd4-203ENSMUST00000107040 1959 ntTSL 2 BASIC14.53□□□□□ -0.08
Fam208bQ5DTT3 Hr-203ENSMUST00000161069 5607 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Fam208bQ5DTT3 Zfp523-202ENSMUST00000073534 2654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.53□□□□□ -0.08
Fam208bQ5DTT3 Zfp644-204ENSMUST00000112696 5785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.53□□□□□ -0.08
Fam208bQ5DTT3 Gm6190-201ENSMUST00000220683 1374 ntBASIC14.53□□□□□ -0.08
Fam208bQ5DTT3 Amn1-201ENSMUST00000095319 1369 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Fam208bQ5DTT3 Tpm1-215ENSMUST00000113705 1759 ntTSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Fam208bQ5DTT3 Ebf3-204ENSMUST00000169486 4994 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.53□□□□□ -0.08
Fam208bQ5DTT3 3110002H16Rik-201ENSMUST00000025276 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Fam208bQ5DTT3 Card10-202ENSMUST00000164826 4726 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Fam208bQ5DTT3 Mindy2-201ENSMUST00000049031 8081 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Fam208bQ5DTT3 Helt-201ENSMUST00000058636 1541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Fam208bQ5DTT3 Dpy19l1-203ENSMUST00000142064 3489 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.53□□□□□ -0.08
Fam208bQ5DTT3 Nipsnap3b-201ENSMUST00000015391 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Fam208bQ5DTT3 Kmt5b-204ENSMUST00000113970 2975 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Fam208bQ5DTT3 Mir5131-201ENSMUST00000175426 93 ntBASIC14.53□□□□□ -0.08
Fam208bQ5DTT3 Eif4a1-213ENSMUST00000163666 1774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Fam208bQ5DTT3 Trim45-202ENSMUST00000094048 1815 ntTSL 5 BASIC14.53□□□□□ -0.08
Fam208bQ5DTT3 Cspg5-202ENSMUST00000196060 3790 ntTSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Fam208bQ5DTT3 Rhd-201ENSMUST00000030627 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
Fam208bQ5DTT3 Ap2a2-201ENSMUST00000003038 4646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
Fam208bQ5DTT3 Eif4g3-201ENSMUST00000058133 2663 ntTSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
Fam208bQ5DTT3 Col15a1-202ENSMUST00000102917 5172 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
Fam208bQ5DTT3 Prmt6-201ENSMUST00000106567 2450 ntAPPRIS P1 BASIC14.52□□□□□ -0.08
Fam208bQ5DTT3 Higd1b-202ENSMUST00000107072 497 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.52□□□□□ -0.08
Fam208bQ5DTT3 Higd1b-203ENSMUST00000107073 530 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.52□□□□□ -0.08
Fam208bQ5DTT3 Gm13830-205ENSMUST00000201195 1155 ntBASIC14.52□□□□□ -0.08
Fam208bQ5DTT3 Higd1b-201ENSMUST00000021302 735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
Fam208bQ5DTT3 4930451I11Rik-201ENSMUST00000061695 481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
Fam208bQ5DTT3 A330070K13Rik-201ENSMUST00000063656 633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
Fam208bQ5DTT3 Plekhh1-201ENSMUST00000039928 6439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
Fam208bQ5DTT3 Naif1-201ENSMUST00000048431 4650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
Fam208bQ5DTT3 Coq5-201ENSMUST00000040421 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
Fam208bQ5DTT3 Kcng3-201ENSMUST00000051482 3356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
Fam208bQ5DTT3 Pisd-201ENSMUST00000061895 2183 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
Fam208bQ5DTT3 Cnr1-201ENSMUST00000057188 5807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
Fam208bQ5DTT3 Rpap3-201ENSMUST00000023104 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
Fam208bQ5DTT3 Cyb561-201ENSMUST00000019734 2741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
Fam208bQ5DTT3 Lrrc43-203ENSMUST00000196809 2031 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
Fam208bQ5DTT3 Plekhg3-207ENSMUST00000219063 4535 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.52□□□□□ -0.09
Fam208bQ5DTT3 Rnf157-202ENSMUST00000106398 4553 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.52□□□□□ -0.09
Fam208bQ5DTT3 Slc30a9-204ENSMUST00000162372 5711 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
Fam208bQ5DTT3 Otud7a-201ENSMUST00000058476 3483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
Fam208bQ5DTT3 Brpf1-202ENSMUST00000113119 4826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
Fam208bQ5DTT3 Vegfc-201ENSMUST00000033919 2449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
Fam208bQ5DTT3 Gm11729-201ENSMUST00000124901 713 ntTSL 3 BASIC14.52□□□□□ -0.09
Fam208bQ5DTT3 Gm1818-201ENSMUST00000169406 1184 ntBASIC14.52□□□□□ -0.09
Fam208bQ5DTT3 Zfyve21-204ENSMUST00000221375 1265 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
Fam208bQ5DTT3 Hist1h2bg-201ENSMUST00000079251 618 ntAPPRIS P1 BASIC14.52□□□□□ -0.09
Fam208bQ5DTT3 Hist1h2bn-201ENSMUST00000091709 381 ntAPPRIS P1 BASIC14.52□□□□□ -0.09
Fam208bQ5DTT3 Rhog-201ENSMUST00000098230 1269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
Fam208bQ5DTT3 B3gat2-203ENSMUST00000144602 1488 ntTSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
Fam208bQ5DTT3 Alkbh5-201ENSMUST00000044250 5730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Fam208bQ5DTT3 Nt5dc3-201ENSMUST00000099396 5952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Fam208bQ5DTT3 2810408A11Rik-203ENSMUST00000102580 1640 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Fam208bQ5DTT3 Spry1-202ENSMUST00000108107 2773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Fam208bQ5DTT3 Dbi-207ENSMUST00000151708 491 ntTSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Fam208bQ5DTT3 Mchr1-201ENSMUST00000166855 2188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Fam208bQ5DTT3 Ppp2r1b-205ENSMUST00000175640 1523 ntTSL 5 BASIC14.51□□□□□ -0.09
Fam208bQ5DTT3 Dynlt1b-201ENSMUST00000179569 768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Fam208bQ5DTT3 Gm28411-202ENSMUST00000191318 464 ntTSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Fam208bQ5DTT3 Il3ra-205ENSMUST00000224877 1128 ntAPPRIS ALT2 BASIC14.51□□□□□ -0.09
Fam208bQ5DTT3 Rbpms-202ENSMUST00000033995 1039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Fam208bQ5DTT3 Ube2f-201ENSMUST00000059743 1154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Fam208bQ5DTT3 Mis18a-201ENSMUST00000099554 1333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Fam208bQ5DTT3 Bmp2k-202ENSMUST00000112974 3244 ntTSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Fam208bQ5DTT3 Timm17b-201ENSMUST00000033498 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 20.7 ms