Protein–RNA interactions for Protein: Q52KR3

Prune2, Protein prune homolog 2, mousemouse

Predictions only

Length 3,084 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Prune2Q52KR3 Tbkbp1-203ENSMUST00000107614 2391 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Prune2Q52KR3 Mef2b-201ENSMUST00000110140 1223 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
Prune2Q52KR3 Mef2b-202ENSMUST00000110141 1253 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
Prune2Q52KR3 Egfl8-201ENSMUST00000015611 1150 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
Prune2Q52KR3 Egfl8-202ENSMUST00000097345 1064 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
Prune2Q52KR3 Sh2b1-203ENSMUST00000205440 3089 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
Prune2Q52KR3 Alyref-201ENSMUST00000026125 3527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
Prune2Q52KR3 Mtmr14-201ENSMUST00000113146 2676 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
Prune2Q52KR3 Ankrd13d-204ENSMUST00000167215 639 ntTSL 3 BASIC15.83■□□□□ 0.12
Prune2Q52KR3 Mir3113-201ENSMUST00000175478 76 ntBASIC15.83■□□□□ 0.12
Prune2Q52KR3 Cfd-202ENSMUST00000217837 871 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Prune2Q52KR3 Sfrp4-201ENSMUST00000002883 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Prune2Q52KR3 Fam57b-201ENSMUST00000079423 2328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Prune2Q52KR3 Zfp668-202ENSMUST00000106261 2410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Prune2Q52KR3 B9d2-201ENSMUST00000108403 1021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Prune2Q52KR3 Gm45091-201ENSMUST00000205799 504 ntTSL 3 BASIC15.83■□□□□ 0.12
Prune2Q52KR3 Lrr1-203ENSMUST00000222520 767 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Prune2Q52KR3 AC090659.1-201ENSMUST00000224334 768 ntBASIC15.83■□□□□ 0.12
Prune2Q52KR3 Ccdc126-201ENSMUST00000055559 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Prune2Q52KR3 Tada2b-201ENSMUST00000031097 3791 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.83■□□□□ 0.12
Prune2Q52KR3 Chrna2-202ENSMUST00000206455 1933 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
Prune2Q52KR3 Lhx6-208ENSMUST00000148852 1481 ntTSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
Prune2Q52KR3 Rbm3-206ENSMUST00000115621 1338 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Prune2Q52KR3 Fkbp5-201ENSMUST00000079413 3542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Prune2Q52KR3 Irak2-203ENSMUST00000089023 1734 ntTSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Prune2Q52KR3 Atoh1-201ENSMUST00000101351 2121 ntAPPRIS P1 BASIC15.82■□□□□ 0.12
Prune2Q52KR3 Gm14701-201ENSMUST00000117156 348 ntBASIC15.82■□□□□ 0.12
Prune2Q52KR3 Ccnd3-202ENSMUST00000171031 2113 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
Prune2Q52KR3 Mrgpra9-201ENSMUST00000098436 1049 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
Prune2Q52KR3 Gm36447-201ENSMUST00000201101 1978 ntTSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Prune2Q52KR3 Cldn11-201ENSMUST00000046174 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Prune2Q52KR3 Foxj1-201ENSMUST00000036215 2623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Prune2Q52KR3 Nup188-205ENSMUST00000138666 534 ntTSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Prune2Q52KR3 Apopt1-204ENSMUST00000163220 671 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.82■□□□□ 0.12
Prune2Q52KR3 4931406C07Rik-209ENSMUST00000217042 691 ntTSL 3 BASIC15.82■□□□□ 0.12
Prune2Q52KR3 Cidea-201ENSMUST00000025404 1164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Prune2Q52KR3 Aga-201ENSMUST00000033920 1181 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Prune2Q52KR3 Olfr632-201ENSMUST00000098189 954 ntAPPRIS P1 BASIC15.82■□□□□ 0.12
Prune2Q52KR3 Bean1-201ENSMUST00000093245 3199 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Prune2Q52KR3 Cxcl14-201ENSMUST00000021970 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Prune2Q52KR3 Dap-201ENSMUST00000044524 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Prune2Q52KR3 Klf13-202ENSMUST00000183817 599 ntTSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Prune2Q52KR3 Wnt6-201ENSMUST00000006716 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Prune2Q52KR3 Dtnb-222ENSMUST00000174479 3689 ntTSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Prune2Q52KR3 Smap2-201ENSMUST00000043200 2905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Prune2Q52KR3 Nfil3-201ENSMUST00000071065 2026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Prune2Q52KR3 Pmpcb-201ENSMUST00000030882 1615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Prune2Q52KR3 Sec14l1-203ENSMUST00000103026 2589 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.81■□□□□ 0.12
Prune2Q52KR3 Neil2-201ENSMUST00000038229 1932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Prune2Q52KR3 Galk2-202ENSMUST00000094604 1928 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Prune2Q52KR3 Gm13418-201ENSMUST00000119097 944 ntBASIC15.81■□□□□ 0.12
Prune2Q52KR3 AV026068-207ENSMUST00000187718 400 ntTSL 5 BASIC15.81■□□□□ 0.12
Prune2Q52KR3 Frmd5-213ENSMUST00000212518 922 ntTSL 5 BASIC15.81■□□□□ 0.12
Prune2Q52KR3 4933406B15Rik-201ENSMUST00000220065 1182 ntTSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Prune2Q52KR3 Wdyhv1-206ENSMUST00000227142 786 ntBASIC15.81■□□□□ 0.12
Prune2Q52KR3 Ankrd39-201ENSMUST00000001172 2109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Prune2Q52KR3 Relb-202ENSMUST00000094762 2209 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Prune2Q52KR3 Relb-203ENSMUST00000098754 2203 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.81■□□□□ 0.12
Prune2Q52KR3 Hsdl1-201ENSMUST00000036049 3141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Prune2Q52KR3 Krcc1-203ENSMUST00000204436 1687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Prune2Q52KR3 Cabp2-205ENSMUST00000162908 911 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Prune2Q52KR3 Gm27628-201ENSMUST00000184911 107 ntBASIC15.81■□□□□ 0.12
Prune2Q52KR3 Rad51d-203ENSMUST00000092844 1228 ntTSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Prune2Q52KR3 Rbm18-201ENSMUST00000028251 2617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Prune2Q52KR3 Hoxd3-201ENSMUST00000047830 2292 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
Prune2Q52KR3 Nr1h2-213ENSMUST00000167197 1944 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
Prune2Q52KR3 Nfatc2-205ENSMUST00000137451 2369 ntTSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Prune2Q52KR3 Casp8-204ENSMUST00000191201 1849 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
Prune2Q52KR3 1700012D14Rik-201ENSMUST00000209597 605 ntTSL 3 BASIC15.8■□□□□ 0.12
Prune2Q52KR3 Elof1-203ENSMUST00000213233 810 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.8■□□□□ 0.12
Prune2Q52KR3 Npcd-201ENSMUST00000023060 1162 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Prune2Q52KR3 Rpl28-201ENSMUST00000032597 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Prune2Q52KR3 Gpank1-201ENSMUST00000052167 1295 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Prune2Q52KR3 Mef2b-203ENSMUST00000110143 1312 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Prune2Q52KR3 Mef2b-204ENSMUST00000110146 1342 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Prune2Q52KR3 Fam69a-201ENSMUST00000031198 2721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Prune2Q52KR3 Gm13036-201ENSMUST00000117799 748 ntBASIC15.8■□□□□ 0.12
Prune2Q52KR3 Gm13186-201ENSMUST00000118031 316 ntBASIC15.8■□□□□ 0.12
Prune2Q52KR3 Gm6089-201ENSMUST00000197666 938 ntBASIC15.8■□□□□ 0.12
Prune2Q52KR3 2610301B20Rik-201ENSMUST00000080517 2116 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Prune2Q52KR3 Tmem51os1-202ENSMUST00000141769 2131 ntTSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Prune2Q52KR3 Gm26885-201ENSMUST00000181920 1688 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Prune2Q52KR3 Krtap9-3-201ENSMUST00000062683 759 ntAPPRIS P1 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Prune2Q52KR3 H2-K1-205ENSMUST00000172912 1570 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Prune2Q52KR3 Pdss2-201ENSMUST00000095725 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Prune2Q52KR3 Foxf1-201ENSMUST00000181504 2415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Prune2Q52KR3 Six3-203ENSMUST00000176081 3680 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Prune2Q52KR3 Yipf3-201ENSMUST00000095263 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Prune2Q52KR3 Triqk-201ENSMUST00000143186 888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Prune2Q52KR3 AC171004.1-201ENSMUST00000221723 664 ntTSL 3 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Prune2Q52KR3 Krt19-201ENSMUST00000007317 1576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Prune2Q52KR3 Cd40-202ENSMUST00000073707 1596 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Prune2Q52KR3 4933402J07Rik-201ENSMUST00000093342 1304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Prune2Q52KR3 Arid3b-202ENSMUST00000098686 1969 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Prune2Q52KR3 Negr1-201ENSMUST00000041425 2095 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Prune2Q52KR3 Cdkn1a-203ENSMUST00000122348 857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Prune2Q52KR3 Arhgap27os1-201ENSMUST00000130556 923 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Prune2Q52KR3 Rpl31-205ENSMUST00000194746 703 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Prune2Q52KR3 Acp7-201ENSMUST00000040112 1978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Prune2Q52KR3 Alg3-201ENSMUST00000045918 1451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 22.4 ms