Protein–RNA interactions for Protein: Q505D7

Opa3, Optic atrophy 3 protein homolog, mousemouse

Predictions only

Length 179 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Opa3Q505D7 Taz-201ENSMUST00000069722 1851 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Opa3Q505D7 Arid3c-202ENSMUST00000150809 1327 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Opa3Q505D7 1810010K12Rik-201ENSMUST00000070378 1324 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
Opa3Q505D7 Spef1-201ENSMUST00000028801 2328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Opa3Q505D7 Adam22-201ENSMUST00000046838 2773 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Opa3Q505D7 Add1-204ENSMUST00000114338 4007 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Opa3Q505D7 Gm21974-201ENSMUST00000126662 2037 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Opa3Q505D7 Rprm-201ENSMUST00000100089 1460 ntAPPRIS P1 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Opa3Q505D7 Hoxb8-201ENSMUST00000052650 2635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Opa3Q505D7 Rilpl2-201ENSMUST00000031347 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Opa3Q505D7 Tmem81-201ENSMUST00000058167 1742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Opa3Q505D7 Tomm6-201ENSMUST00000113301 594 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Opa3Q505D7 Rell2-204ENSMUST00000163591 1057 ntTSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Opa3Q505D7 Gnb5-201ENSMUST00000076889 1188 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Opa3Q505D7 Negr1-203ENSMUST00000106065 1953 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Opa3Q505D7 Pnpt1-201ENSMUST00000020756 2707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Opa3Q505D7 Dio3-201ENSMUST00000097228 1449 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
Opa3Q505D7 Magi1-201ENSMUST00000055224 7007 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Opa3Q505D7 Bcar1-201ENSMUST00000166232 3142 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Opa3Q505D7 Pard6g-201ENSMUST00000070219 3143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Opa3Q505D7 Galk2-202ENSMUST00000094604 1928 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Opa3Q505D7 Klf5-201ENSMUST00000005279 3352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Opa3Q505D7 Espn-208ENSMUST00000105654 1566 ntTSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Opa3Q505D7 Aspscr1-205ENSMUST00000106160 1550 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Opa3Q505D7 Gm16863-201ENSMUST00000181476 2431 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Opa3Q505D7 Nkpd1-202ENSMUST00000207576 2916 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Opa3Q505D7 A830073O21Rik-202ENSMUST00000205693 3096 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
Opa3Q505D7 Krt86-201ENSMUST00000088049 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Opa3Q505D7 Nespas-203ENSMUST00000151472 2248 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Opa3Q505D7 Clvs2-201ENSMUST00000019920 2717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Opa3Q505D7 Erlin1-201ENSMUST00000071698 3228 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Opa3Q505D7 Gm10435-202ENSMUST00000162526 2878 ntTSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Opa3Q505D7 Cnot9-201ENSMUST00000087215 3268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Opa3Q505D7 Anapc7-201ENSMUST00000031422 2751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Opa3Q505D7 Kcnn1-208ENSMUST00000212611 2528 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Opa3Q505D7 Polr3d-201ENSMUST00000000793 2016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Opa3Q505D7 Ubr2-202ENSMUST00000113337 7633 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Opa3Q505D7 Mrpl52-201ENSMUST00000010550 418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Opa3Q505D7 Gm6270-201ENSMUST00000132731 559 ntTSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Opa3Q505D7 1110065P20Rik-203ENSMUST00000137769 659 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Opa3Q505D7 Gm44210-201ENSMUST00000205253 713 ntTSL 3 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Opa3Q505D7 Cmtm7-204ENSMUST00000216760 665 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Opa3Q505D7 E030030I06Rik-201ENSMUST00000069372 876 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Opa3Q505D7 Gm10065-201ENSMUST00000076238 345 ntAPPRIS P1 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Opa3Q505D7 Eda-205ENSMUST00000113778 4942 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Opa3Q505D7 Eda-207ENSMUST00000113780 4915 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Opa3Q505D7 Eda-208ENSMUST00000113781 4915 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Opa3Q505D7 Eda-209ENSMUST00000113783 4930 ntTSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Opa3Q505D7 Efcab11-201ENSMUST00000046485 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Opa3Q505D7 Gm21596-201ENSMUST00000178049 1316 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
Opa3Q505D7 Pdk3-201ENSMUST00000045748 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Opa3Q505D7 Kctd1-202ENSMUST00000168989 3456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Opa3Q505D7 Snap91-204ENSMUST00000098495 4150 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Opa3Q505D7 Cyb5r3-201ENSMUST00000018186 2422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Opa3Q505D7 Dnajc3-201ENSMUST00000022734 5141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Opa3Q505D7 Sprn-201ENSMUST00000059241 3374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Opa3Q505D7 9930021J03Rik-204ENSMUST00000177155 6632 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Opa3Q505D7 Camsap3-212ENSMUST00000208240 2572 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Opa3Q505D7 Hdac2-202ENSMUST00000105510 3250 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Opa3Q505D7 Nrip1-201ENSMUST00000054178 4529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Opa3Q505D7 Tmem233-201ENSMUST00000111997 2477 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Opa3Q505D7 Elac2-203ENSMUST00000108697 2612 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Opa3Q505D7 Fem1b-201ENSMUST00000034775 6785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Opa3Q505D7 Slc39a7-201ENSMUST00000025186 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Opa3Q505D7 Rhof-201ENSMUST00000031401 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Opa3Q505D7 Cep44-201ENSMUST00000040330 1690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Opa3Q505D7 Plekha8-202ENSMUST00000119706 6739 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Opa3Q505D7 1110004F10Rik-202ENSMUST00000106607 1153 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Opa3Q505D7 Speg-204ENSMUST00000113589 833 ntTSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Opa3Q505D7 Gm11643-201ENSMUST00000119578 864 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
Opa3Q505D7 Gm12216-203ENSMUST00000121435 655 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Opa3Q505D7 Gm15908-201ENSMUST00000154345 1091 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Opa3Q505D7 Gm29241-201ENSMUST00000189260 1096 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
Opa3Q505D7 Ssfa2-201ENSMUST00000111784 4999 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Opa3Q505D7 Foxo1-201ENSMUST00000053764 8665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Opa3Q505D7 Dlx1-201ENSMUST00000037119 4111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Opa3Q505D7 Mapk8ip3-208ENSMUST00000121787 5431 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Opa3Q505D7 Agap1-202ENSMUST00000074945 10069 ntTSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Opa3Q505D7 Ctnna2-204ENSMUST00000160894 4162 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Opa3Q505D7 Wasf2-201ENSMUST00000084241 5642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Opa3Q505D7 Prkar2b-202ENSMUST00000036497 3378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Opa3Q505D7 Ngb-201ENSMUST00000021420 1616 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Opa3Q505D7 Fosl2-201ENSMUST00000031017 6537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Opa3Q505D7 Six1-201ENSMUST00000050029 3316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Opa3Q505D7 Adora2a-201ENSMUST00000105420 2596 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Opa3Q505D7 Meg3-201ENSMUST00000124106 1988 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Opa3Q505D7 Slc7a10-201ENSMUST00000001854 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Opa3Q505D7 Rock1-201ENSMUST00000067947 6187 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Opa3Q505D7 Impdh1-210ENSMUST00000162739 2471 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Opa3Q505D7 Neu1-201ENSMUST00000007253 2474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Opa3Q505D7 Cep152-201ENSMUST00000089776 5768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Opa3Q505D7 Shisa2-201ENSMUST00000053949 3119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Opa3Q505D7 Mir8112-201ENSMUST00000184382 131 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
Opa3Q505D7 Grp-201ENSMUST00000025395 862 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Opa3Q505D7 Exosc3-201ENSMUST00000030003 1077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Opa3Q505D7 5033430I15Rik-201ENSMUST00000038032 729 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Opa3Q505D7 1700018M17Rik-201ENSMUST00000052502 456 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
Opa3Q505D7 Tpsb2-201ENSMUST00000069616 1081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Opa3Q505D7 Cdk5-201ENSMUST00000030814 2059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Opa3Q505D7 Gm26762-201ENSMUST00000180864 5284 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 22.7 ms