Protein–RNA interactions for Protein: Q4VA36

Ccdc84, Coiled-coil domain-containing protein 84, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 332 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc84Q4VA36 Tubb6-201ENSMUST00000001513 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
Ccdc84Q4VA36 Zbtb25-201ENSMUST00000167011 1681 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.37■□□□□ 0.69
Ccdc84Q4VA36 2810474O19Rik-201ENSMUST00000046689 6066 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
Ccdc84Q4VA36 Rpl3l-202ENSMUST00000170239 1375 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.37■□□□□ 0.69
Ccdc84Q4VA36 Slc39a10-201ENSMUST00000027131 5498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
Ccdc84Q4VA36 Btn1a1-202ENSMUST00000110434 1077 ntTSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
Ccdc84Q4VA36 Gm13524-201ENSMUST00000125869 662 ntTSL 3 BASIC19.37■□□□□ 0.69
Ccdc84Q4VA36 Gm12963-201ENSMUST00000131846 783 ntTSL 5 BASIC19.37■□□□□ 0.69
Ccdc84Q4VA36 Fbxo6-208ENSMUST00000168503 1240 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.37■□□□□ 0.69
Ccdc84Q4VA36 Gm26871-202ENSMUST00000180774 695 ntTSL 2 BASIC19.37■□□□□ 0.69
Ccdc84Q4VA36 Rpl13a-204ENSMUST00000209711 495 ntTSL 3 BASIC19.37■□□□□ 0.69
Ccdc84Q4VA36 Ppib-201ENSMUST00000034947 892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
Ccdc84Q4VA36 Prima1-201ENSMUST00000074416 909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
Ccdc84Q4VA36 Dok5-201ENSMUST00000029075 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
Ccdc84Q4VA36 Slit3-201ENSMUST00000069837 5228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
Ccdc84Q4VA36 Gnb1-203ENSMUST00000165335 3143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
Ccdc84Q4VA36 Ager-201ENSMUST00000015596 1370 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
Ccdc84Q4VA36 Ubl7-201ENSMUST00000163329 1364 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.36■□□□□ 0.69
Ccdc84Q4VA36 Hsd17b1-201ENSMUST00000019445 1339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
Ccdc84Q4VA36 Nrxn2-203ENSMUST00000113459 3285 ntTSL 2 BASIC19.36■□□□□ 0.69
Ccdc84Q4VA36 Adal-203ENSMUST00000110662 1231 ntTSL 5 BASIC19.36■□□□□ 0.69
Ccdc84Q4VA36 Gm26661-201ENSMUST00000181025 471 ntAPPRIS P1 BASIC19.36■□□□□ 0.69
Ccdc84Q4VA36 Gm26887-201ENSMUST00000181282 547 ntTSL 5 BASIC19.36■□□□□ 0.69
Ccdc84Q4VA36 Gm27459-201ENSMUST00000184860 107 ntBASIC19.36■□□□□ 0.69
Ccdc84Q4VA36 Ifi27l2a-201ENSMUST00000055071 463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
Ccdc84Q4VA36 Dnajb9-201ENSMUST00000015049 2461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
Ccdc84Q4VA36 Tmem136-202ENSMUST00000213544 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
Ccdc84Q4VA36 L3hypdh-201ENSMUST00000019862 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
Ccdc84Q4VA36 Sept10-203ENSMUST00000220156 1821 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
Ccdc84Q4VA36 Stk3-201ENSMUST00000018476 2914 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
Ccdc84Q4VA36 Smim15-205ENSMUST00000225972 2097 ntAPPRIS P1 BASIC19.36■□□□□ 0.69
Ccdc84Q4VA36 Gnb2-203ENSMUST00000111023 1471 ntTSL 5 BASIC19.35■□□□□ 0.69
Ccdc84Q4VA36 Ubtf-204ENSMUST00000107117 3258 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.35■□□□□ 0.69
Ccdc84Q4VA36 Icmt-201ENSMUST00000048892 4919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
Ccdc84Q4VA36 2810468N07Rik-201ENSMUST00000163493 1349 ntTSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
Ccdc84Q4VA36 Irak2-203ENSMUST00000089023 1734 ntTSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
Ccdc84Q4VA36 Mbd6-202ENSMUST00000119078 4287 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
Ccdc84Q4VA36 Cgrrf1-204ENSMUST00000140114 419 ntTSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
Ccdc84Q4VA36 Rpp40-202ENSMUST00000174230 1053 ntTSL 5 BASIC19.35■□□□□ 0.69
Ccdc84Q4VA36 Lysmd4-209ENSMUST00000208998 2110 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
Ccdc84Q4VA36 Ano10-206ENSMUST00000216670 2108 ntTSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
Ccdc84Q4VA36 AC164629.2-201ENSMUST00000217916 270 ntBASIC19.35■□□□□ 0.69
Ccdc84Q4VA36 Diras1-201ENSMUST00000055125 2953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
Ccdc84Q4VA36 Gm9991-201ENSMUST00000070048 1207 ntTSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
Ccdc84Q4VA36 Rusc2-202ENSMUST00000098106 5325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
Ccdc84Q4VA36 Dscam-201ENSMUST00000056102 7498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
Ccdc84Q4VA36 Tbc1d2b-202ENSMUST00000128874 3473 ntTSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
Ccdc84Q4VA36 Gm26627-201ENSMUST00000181540 1487 ntTSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
Ccdc84Q4VA36 Gm42900-201ENSMUST00000197184 2167 ntBASIC19.34■□□□□ 0.69
Ccdc84Q4VA36 Ptpra-201ENSMUST00000028769 3227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
Ccdc84Q4VA36 Ciz1-201ENSMUST00000048964 2771 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
Ccdc84Q4VA36 Tmem79-201ENSMUST00000001456 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
Ccdc84Q4VA36 Adgra2-201ENSMUST00000033876 5760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
Ccdc84Q4VA36 BC034090-204ENSMUST00000186156 4873 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC19.34■□□□□ 0.69
Ccdc84Q4VA36 Prob1-203ENSMUST00000190196 4888 ntAPPRIS P1 BASIC19.34■□□□□ 0.69
Ccdc84Q4VA36 Gm13884-201ENSMUST00000118103 829 ntBASIC19.34■□□□□ 0.69
Ccdc84Q4VA36 Gm12895-201ENSMUST00000122214 226 ntBASIC19.34■□□□□ 0.69
Ccdc84Q4VA36 Prr3-202ENSMUST00000165613 767 ntTSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
Ccdc84Q4VA36 Ighv6-1-201ENSMUST00000193612 343 ntBASIC19.34■□□□□ 0.69
Ccdc84Q4VA36 Gm40457-201ENSMUST00000205319 1174 ntTSL 5 BASIC19.34■□□□□ 0.69
Ccdc84Q4VA36 Arhgap33-206ENSMUST00000208522 781 ntTSL 3 BASIC19.34■□□□□ 0.69
Ccdc84Q4VA36 AW822252-206ENSMUST00000208904 237 ntBASIC19.34■□□□□ 0.69
Ccdc84Q4VA36 Angptl8-201ENSMUST00000058777 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
Ccdc84Q4VA36 Acads-201ENSMUST00000031524 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
Ccdc84Q4VA36 Hspa1l-201ENSMUST00000007248 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
Ccdc84Q4VA36 Nxn-201ENSMUST00000021204 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
Ccdc84Q4VA36 Chst3-202ENSMUST00000135158 6108 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.34■□□□□ 0.69
Ccdc84Q4VA36 Dtnb-222ENSMUST00000174479 3689 ntTSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
Ccdc84Q4VA36 Wnk2-205ENSMUST00000110097 6882 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.34■□□□□ 0.69
Ccdc84Q4VA36 Wnk2-203ENSMUST00000091623 6897 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC19.34■□□□□ 0.69
Ccdc84Q4VA36 Nisch-221ENSMUST00000171735 1763 ntTSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
Ccdc84Q4VA36 Galnt1-206ENSMUST00000170243 4108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
Ccdc84Q4VA36 Tmed4-201ENSMUST00000004508 2003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
Ccdc84Q4VA36 Ccdc105-201ENSMUST00000105383 1714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
Ccdc84Q4VA36 Zkscan14-201ENSMUST00000031632 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.69
Ccdc84Q4VA36 Prkci-201ENSMUST00000108249 4708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.69
Ccdc84Q4VA36 Ssc4d-204ENSMUST00000111153 2745 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.33■□□□□ 0.69
Ccdc84Q4VA36 Fam69a-201ENSMUST00000031198 2721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.69
Ccdc84Q4VA36 Itsn2-215ENSMUST00000220311 6080 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.69
Ccdc84Q4VA36 Paqr7-201ENSMUST00000081525 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.69
Ccdc84Q4VA36 Agfg2-201ENSMUST00000031736 2893 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.69
Ccdc84Q4VA36 Ncam2-202ENSMUST00000067602 3563 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
Ccdc84Q4VA36 Scml4-203ENSMUST00000105495 1033 ntTSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
Ccdc84Q4VA36 Gm13186-201ENSMUST00000118031 316 ntBASIC19.33■□□□□ 0.68
Ccdc84Q4VA36 Mis18bp1-202ENSMUST00000124201 717 ntTSL 3 BASIC19.33■□□□□ 0.68
Ccdc84Q4VA36 Gm12359-202ENSMUST00000141696 713 ntTSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
Ccdc84Q4VA36 Gm12359-203ENSMUST00000153181 680 ntTSL 3 BASIC19.33■□□□□ 0.68
Ccdc84Q4VA36 A830052D11Rik-201ENSMUST00000181729 1130 ntTSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
Ccdc84Q4VA36 Cldn6-201ENSMUST00000024699 1506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
Ccdc84Q4VA36 Rfx7-201ENSMUST00000093820 7988 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.33■□□□□ 0.68
Ccdc84Q4VA36 Nr4a1-201ENSMUST00000023779 2474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
Ccdc84Q4VA36 Platr31-201ENSMUST00000180653 1466 ntTSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
Ccdc84Q4VA36 Slc30a9-201ENSMUST00000113676 5648 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
Ccdc84Q4VA36 Fam109a-201ENSMUST00000056654 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
Ccdc84Q4VA36 Gab1-202ENSMUST00000210676 4985 ntTSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
Ccdc84Q4VA36 Itgb5-201ENSMUST00000069345 3056 ntTSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
Ccdc84Q4VA36 Fam46a-202ENSMUST00000187711 5648 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
Ccdc84Q4VA36 Ascl2-201ENSMUST00000009392 1605 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
Ccdc84Q4VA36 Ern1-204ENSMUST00000106801 1957 ntTSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
Ccdc84Q4VA36 Ppp2r1b-204ENSMUST00000174628 2195 ntTSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 20.4 ms