Protein–RNA interactions for Protein: Q4QQM4

Trp53i11, Tumor protein p53-inducible protein 11, mousemouse

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Length 189 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Trp53i11Q4QQM4 Sim1-202ENSMUST00000219436 1687 ntTSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Trp53i11Q4QQM4 Sars2-201ENSMUST00000094632 1868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Trp53i11Q4QQM4 Gpat3-203ENSMUST00000112887 3059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Trp53i11Q4QQM4 Amfr-201ENSMUST00000053766 3880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Trp53i11Q4QQM4 Cul4a-201ENSMUST00000016680 3728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Trp53i11Q4QQM4 Gm3488-202ENSMUST00000181562 1945 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Trp53i11Q4QQM4 Atp5c1-202ENSMUST00000114896 1735 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Trp53i11Q4QQM4 4930519A11Rik-201ENSMUST00000181381 1523 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Trp53i11Q4QQM4 Ing1-202ENSMUST00000209565 1971 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Trp53i11Q4QQM4 Camk2n1-201ENSMUST00000050918 4444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Trp53i11Q4QQM4 Gm42417-201ENSMUST00000191849 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Trp53i11Q4QQM4 Ffar3-201ENSMUST00000094583 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Trp53i11Q4QQM4 Trim25-202ENSMUST00000100627 1433 ntTSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Trp53i11Q4QQM4 Xiap-203ENSMUST00000115094 6542 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Trp53i11Q4QQM4 Tpd52-205ENSMUST00000120143 6317 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Trp53i11Q4QQM4 Ntrk1-201ENSMUST00000029712 2588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Trp53i11Q4QQM4 Dbn1-202ENSMUST00000109921 2378 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Trp53i11Q4QQM4 Abhd11-206ENSMUST00000154469 1473 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Trp53i11Q4QQM4 Ptprd-206ENSMUST00000107289 9899 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Trp53i11Q4QQM4 Foxp4-204ENSMUST00000113265 3999 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Trp53i11Q4QQM4 Baiap2-204ENSMUST00000106231 4005 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Trp53i11Q4QQM4 Mta3-203ENSMUST00000112350 1723 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Trp53i11Q4QQM4 Gm26938-201ENSMUST00000182839 744 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Trp53i11Q4QQM4 Gm43799-201ENSMUST00000201845 579 ntBASIC16.12■□□□□ 0.17
Trp53i11Q4QQM4 Psmd4-201ENSMUST00000071664 1276 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Trp53i11Q4QQM4 Aifm1-201ENSMUST00000037349 2237 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Trp53i11Q4QQM4 Ppp2r5e-201ENSMUST00000021447 4810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Trp53i11Q4QQM4 March3-202ENSMUST00000102912 1754 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Trp53i11Q4QQM4 Farsa-202ENSMUST00000109754 1795 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Trp53i11Q4QQM4 Atp2b2-201ENSMUST00000089003 7067 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Trp53i11Q4QQM4 Nrl-201ENSMUST00000062232 2504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Trp53i11Q4QQM4 Sik3-204ENSMUST00000126865 6287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Trp53i11Q4QQM4 Arrb2-203ENSMUST00000102563 1352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Trp53i11Q4QQM4 Tnfsf14-201ENSMUST00000005976 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Trp53i11Q4QQM4 Urgcp-201ENSMUST00000053427 5527 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Trp53i11Q4QQM4 Med18-201ENSMUST00000102567 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Trp53i11Q4QQM4 Synpo-201ENSMUST00000097566 5060 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Trp53i11Q4QQM4 Rrbp1-201ENSMUST00000016072 5177 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Trp53i11Q4QQM4 Kcnab3-201ENSMUST00000018614 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Trp53i11Q4QQM4 Arfip2-202ENSMUST00000084782 2254 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Trp53i11Q4QQM4 Tm9sf2-203ENSMUST00000171318 1494 ntTSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Trp53i11Q4QQM4 Lrrc43-202ENSMUST00000121444 2016 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Trp53i11Q4QQM4 Sap18-201ENSMUST00000111267 660 ntTSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Trp53i11Q4QQM4 Gm13559-201ENSMUST00000120476 863 ntBASIC16.11■□□□□ 0.17
Trp53i11Q4QQM4 Prr23a1-201ENSMUST00000170349 883 ntAPPRIS P1 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Trp53i11Q4QQM4 Gm28876-201ENSMUST00000188137 703 ntTSL 3 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Trp53i11Q4QQM4 Zfpl1-201ENSMUST00000025707 1287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Trp53i11Q4QQM4 Nudt8-202ENSMUST00000025802 787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Trp53i11Q4QQM4 Matn4-202ENSMUST00000103104 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Trp53i11Q4QQM4 Nagpa-203ENSMUST00000147567 2230 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Trp53i11Q4QQM4 Gm5414-201ENSMUST00000062879 1659 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Trp53i11Q4QQM4 Rhobtb1-202ENSMUST00000067908 4422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Trp53i11Q4QQM4 Lrp3-201ENSMUST00000118444 3877 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Trp53i11Q4QQM4 Zar1-201ENSMUST00000073528 1429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Trp53i11Q4QQM4 Prmt2-202ENSMUST00000099571 2052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Trp53i11Q4QQM4 Cct6b-201ENSMUST00000021040 1787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Trp53i11Q4QQM4 Spout1-201ENSMUST00000100220 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Trp53i11Q4QQM4 Rmdn3-201ENSMUST00000094695 2249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Trp53i11Q4QQM4 Stam-202ENSMUST00000102960 5000 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Trp53i11Q4QQM4 Simc1-202ENSMUST00000121401 4819 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Trp53i11Q4QQM4 Gm19426-201ENSMUST00000181711 726 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
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Trp53i11Q4QQM4 Usf3-201ENSMUST00000088356 757 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Trp53i11Q4QQM4 Ncoa1-201ENSMUST00000085814 7329 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Trp53i11Q4QQM4 Nptn-212ENSMUST00000177292 1390 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Trp53i11Q4QQM4 Acaa1a-201ENSMUST00000039784 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Trp53i11Q4QQM4 Ing4-205ENSMUST00000140131 1446 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Trp53i11Q4QQM4 Nxnl1-201ENSMUST00000048243 2285 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Trp53i11Q4QQM4 2610035D17Rik-201ENSMUST00000127263 1861 ntTSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Trp53i11Q4QQM4 Rnf112-202ENSMUST00000060255 3161 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Trp53i11Q4QQM4 Tcf7l2-203ENSMUST00000111646 2839 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Trp53i11Q4QQM4 Eme2-202ENSMUST00000121542 1521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Trp53i11Q4QQM4 Rab11fip4-201ENSMUST00000017783 7156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Trp53i11Q4QQM4 Nudt16-201ENSMUST00000035179 1631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Trp53i11Q4QQM4 Ubac2-201ENSMUST00000039803 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Trp53i11Q4QQM4 Uso1-204ENSMUST00000202155 3707 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Trp53i11Q4QQM4 Pdxk-ps-203ENSMUST00000183934 680 ntTSL 3 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Trp53i11Q4QQM4 Krtap5-1-202ENSMUST00000188274 742 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
Trp53i11Q4QQM4 Camk2d-226ENSMUST00000199300 5524 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Trp53i11Q4QQM4 Blmh-201ENSMUST00000021197 2497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Trp53i11Q4QQM4 Map3k10-201ENSMUST00000036453 3682 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Trp53i11Q4QQM4 Zfyve19-201ENSMUST00000090174 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Trp53i11Q4QQM4 Npas3-203ENSMUST00000223057 2724 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Trp53i11Q4QQM4 Skap1-203ENSMUST00000100521 1539 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Trp53i11Q4QQM4 Skap1-204ENSMUST00000103154 1507 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Trp53i11Q4QQM4 Sh2b2-203ENSMUST00000196397 2797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Trp53i11Q4QQM4 Mroh5-201ENSMUST00000071419 2766 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Trp53i11Q4QQM4 Aspscr1-205ENSMUST00000106160 1550 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Trp53i11Q4QQM4 Celf1-201ENSMUST00000005643 4830 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.17
Trp53i11Q4QQM4 2310002F09Rik-201ENSMUST00000181454 1607 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
Trp53i11Q4QQM4 Gm16861-201ENSMUST00000181498 1647 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
Trp53i11Q4QQM4 Ankra2-203ENSMUST00000123924 2328 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
Trp53i11Q4QQM4 Bmp8a-201ENSMUST00000040496 2405 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
Trp53i11Q4QQM4 Spi1-201ENSMUST00000002180 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Trp53i11Q4QQM4 Ppp4r3a-201ENSMUST00000048305 4516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Trp53i11Q4QQM4 Gm44924-201ENSMUST00000138087 421 ntTSL 3 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Trp53i11Q4QQM4 Gm3764-209ENSMUST00000181550 1093 ntTSL 3 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Trp53i11Q4QQM4 Mrps28-201ENSMUST00000042148 783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Trp53i11Q4QQM4 Snapc3-202ENSMUST00000071544 942 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
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