Protein–RNA interactions for Protein: Q4KL18

Tmem171, Transmembrane protein 171, mousemouse

Predictions only

Length 322 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tmem171Q4KL18 Pgpep1-208ENSMUST00000211715 676 ntTSL 3 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Tmem171Q4KL18 Prss27-201ENSMUST00000059482 1253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Tmem171Q4KL18 Lrrfip2-202ENSMUST00000098340 3191 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Tmem171Q4KL18 Atp9a-211ENSMUST00000178504 3668 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Tmem171Q4KL18 Hs6st1-201ENSMUST00000088174 3719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Tmem171Q4KL18 2610301B20Rik-201ENSMUST00000080517 2116 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Tmem171Q4KL18 Cep83-201ENSMUST00000020212 3639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Tmem171Q4KL18 Lrrc43-202ENSMUST00000121444 2016 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Tmem171Q4KL18 Ddhd2-206ENSMUST00000211688 2265 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Tmem171Q4KL18 Gm15635-204ENSMUST00000208024 2539 ntBASIC15.15■□□□□ 0.02
Tmem171Q4KL18 Abr-202ENSMUST00000072740 5394 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Tmem171Q4KL18 Utp23-204ENSMUST00000161651 582 ntTSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Tmem171Q4KL18 Rfesd-202ENSMUST00000167271 595 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Tmem171Q4KL18 Psma6-201ENSMUST00000021412 1042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Tmem171Q4KL18 Tmem270-201ENSMUST00000047305 932 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Tmem171Q4KL18 Cltb-201ENSMUST00000049575 1004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Tmem171Q4KL18 Rad51d-203ENSMUST00000092844 1228 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Tmem171Q4KL18 Il9r-204ENSMUST00000142396 1542 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Tmem171Q4KL18 Psmd8-203ENSMUST00000186182 1512 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Tmem171Q4KL18 Rdx-202ENSMUST00000061352 1502 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Tmem171Q4KL18 Car9-201ENSMUST00000030183 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Tmem171Q4KL18 Sort1-203ENSMUST00000135636 6836 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Tmem171Q4KL18 Galnt1-206ENSMUST00000170243 4108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Tmem171Q4KL18 Ttc13-201ENSMUST00000041614 3038 ntTSL 2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Tmem171Q4KL18 Kmt2b-201ENSMUST00000006470 8469 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Tmem171Q4KL18 Hoxa10-201ENSMUST00000121043 1436 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Tmem171Q4KL18 Ispd-201ENSMUST00000062041 2690 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Tmem171Q4KL18 Gnao1-201ENSMUST00000034198 2948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Tmem171Q4KL18 Caskin1-201ENSMUST00000024958 6172 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Tmem171Q4KL18 Cog6-204ENSMUST00000193432 2078 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Tmem171Q4KL18 Rnf208-202ENSMUST00000114355 1333 ntAPPRIS P1 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Tmem171Q4KL18 Spg21-202ENSMUST00000213957 1302 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Tmem171Q4KL18 Lrp5-202ENSMUST00000176867 2759 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Tmem171Q4KL18 Gm12359-201ENSMUST00000139017 1399 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Tmem171Q4KL18 Dvl3-204ENSMUST00000171774 2319 ntTSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Tmem171Q4KL18 Nova2-202ENSMUST00000220302 8372 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Tmem171Q4KL18 Nova2-201ENSMUST00000032571 8372 ntTSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Tmem171Q4KL18 Lce1j-201ENSMUST00000107304 420 ntAPPRIS P1 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Tmem171Q4KL18 Gm37722-201ENSMUST00000193757 208 ntBASIC15.14■□□□□ 0.01
Tmem171Q4KL18 Rpl13a-204ENSMUST00000209711 495 ntTSL 3 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Tmem171Q4KL18 Mrpl14-201ENSMUST00000024734 645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Tmem171Q4KL18 Nkx2-9-201ENSMUST00000072631 1264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Tmem171Q4KL18 Birc5-201ENSMUST00000081387 947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Tmem171Q4KL18 Gm8258-201ENSMUST00000055593 1449 ntBASIC15.14■□□□□ 0.01
Tmem171Q4KL18 Acss2-201ENSMUST00000029135 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Tmem171Q4KL18 Cdca3-201ENSMUST00000024270 1976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Tmem171Q4KL18 Nrxn2-204ENSMUST00000113461 5505 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Tmem171Q4KL18 Kcnab3-201ENSMUST00000018614 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Tmem171Q4KL18 Meis2-202ENSMUST00000074285 2844 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Tmem171Q4KL18 Zdhhc6-209ENSMUST00000225495 1711 ntBASIC15.14■□□□□ 0.01
Tmem171Q4KL18 Larp1-203ENSMUST00000178636 6617 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Tmem171Q4KL18 Gm26627-201ENSMUST00000181540 1487 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Tmem171Q4KL18 Cxcl14-202ENSMUST00000224801 1467 ntBASIC15.14■□□□□ 0.01
Tmem171Q4KL18 Lpgat1-202ENSMUST00000110856 2792 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Tmem171Q4KL18 Fnbp1-205ENSMUST00000113552 1910 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Tmem171Q4KL18 Dbn1-202ENSMUST00000109921 2378 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Tmem171Q4KL18 Gm8909-201ENSMUST00000040467 1357 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Tmem171Q4KL18 Slc30a9-204ENSMUST00000162372 5711 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Tmem171Q4KL18 Fem1c-201ENSMUST00000036226 5726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Tmem171Q4KL18 Irf5-205ENSMUST00000167252 1693 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Tmem171Q4KL18 Evc-202ENSMUST00000114148 2119 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Tmem171Q4KL18 Il4i1-202ENSMUST00000118125 2275 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Tmem171Q4KL18 Erich2-201ENSMUST00000100041 1749 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Tmem171Q4KL18 Urah-202ENSMUST00000106050 719 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Tmem171Q4KL18 Tm6sf2-202ENSMUST00000110160 1446 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Tmem171Q4KL18 Lmo4-203ENSMUST00000121796 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Tmem171Q4KL18 Ramp2-202ENSMUST00000122006 899 ntTSL 2 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Tmem171Q4KL18 Krt12-201ENSMUST00000017741 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Tmem171Q4KL18 Gm6345-202ENSMUST00000180900 204 ntBASIC15.13■□□□□ 0.01
Tmem171Q4KL18 Ttyh3-202ENSMUST00000197452 4576 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Tmem171Q4KL18 Nudt21-204ENSMUST00000212981 1184 ntTSL 3 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Tmem171Q4KL18 AC156832.2-201ENSMUST00000216217 1295 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Tmem171Q4KL18 2210016L21Rik-201ENSMUST00000031538 2607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Tmem171Q4KL18 Pcolce-202ENSMUST00000054564 1585 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Tmem171Q4KL18 Gm10461-201ENSMUST00000202073 4786 ntBASIC15.13■□□□□ 0.01
Tmem171Q4KL18 Arhgef19-201ENSMUST00000006618 3414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Tmem171Q4KL18 Mfsd13a-202ENSMUST00000128041 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Tmem171Q4KL18 Rmdn3-201ENSMUST00000094695 2249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Tmem171Q4KL18 Fdxr-201ENSMUST00000021078 1948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Tmem171Q4KL18 Atp6v0a2-201ENSMUST00000037865 5345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Tmem171Q4KL18 Ascl2-201ENSMUST00000009392 1605 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Tmem171Q4KL18 Appl2-201ENSMUST00000020500 3020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Tmem171Q4KL18 5830415G21Rik-201ENSMUST00000192543 1332 ntBASIC15.13■□□□□ 0.01
Tmem171Q4KL18 Zfp865-203ENSMUST00000085427 2751 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Tmem171Q4KL18 Coil-201ENSMUST00000036649 2607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Tmem171Q4KL18 Csnk1a1-206ENSMUST00000165721 2323 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Tmem171Q4KL18 March11-203ENSMUST00000152841 1365 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Tmem171Q4KL18 Nagpa-203ENSMUST00000147567 2230 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Tmem171Q4KL18 Rrbp1-202ENSMUST00000037875 2701 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Tmem171Q4KL18 Ercc6l2-203ENSMUST00000067821 2743 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Tmem171Q4KL18 Zdhhc24-201ENSMUST00000006632 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Tmem171Q4KL18 Itsn2-215ENSMUST00000220311 6080 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Tmem171Q4KL18 Crocc-202ENSMUST00000097816 6273 ntTSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Tmem171Q4KL18 AL590614.2-201ENSMUST00000225374 1937 ntBASIC15.12■□□□□ 0.01
Tmem171Q4KL18 Aldh7a1-201ENSMUST00000066208 1914 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Tmem171Q4KL18 Rab11fip3-202ENSMUST00000120691 5103 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Tmem171Q4KL18 Sgsm1-204ENSMUST00000112325 2274 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Tmem171Q4KL18 Arid1a-202ENSMUST00000105897 8175 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Tmem171Q4KL18 Nisch-221ENSMUST00000171735 1763 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Tmem171Q4KL18 Fam57b-207ENSMUST00000207020 1777 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 31.7 ms