Protein–RNA interactions for Protein: Q3ZT31

Snx25, Sorting nexin-25, mousemouse

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Length 840 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Snx25Q3ZT31 Gm8587-201ENSMUST00000076538 843 ntBASIC18.41■□□□□ 0.54
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Snx25Q3ZT31 Mrpl43-201ENSMUST00000097715 1213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Snx25Q3ZT31 Ctbp2-201ENSMUST00000033269 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Snx25Q3ZT31 Ttl-201ENSMUST00000035812 4567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Snx25Q3ZT31 Tmem185a-201ENSMUST00000101506 2429 ntTSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Snx25Q3ZT31 Sfrp1-201ENSMUST00000033952 4372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Snx25Q3ZT31 March11-203ENSMUST00000152841 1365 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Snx25Q3ZT31 Nsfl1c-201ENSMUST00000028949 1364 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Snx25Q3ZT31 Btbd2-201ENSMUST00000003434 3026 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
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Snx25Q3ZT31 Adam22-205ENSMUST00000115385 2318 ntTSL 2 BASIC18.4■□□□□ 0.54
Snx25Q3ZT31 Urgcp-206ENSMUST00000170116 5528 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.4■□□□□ 0.54
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Snx25Q3ZT31 Tbx18-201ENSMUST00000034991 4679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
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Snx25Q3ZT31 Fbxo9-203ENSMUST00000159099 1201 ntTSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
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Snx25Q3ZT31 Prss27-201ENSMUST00000059482 1253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
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Snx25Q3ZT31 2810408A11Rik-203ENSMUST00000102580 1640 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Snx25Q3ZT31 Zscan12-201ENSMUST00000053293 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Snx25Q3ZT31 Mfsd13a-201ENSMUST00000086969 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
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Snx25Q3ZT31 Tppp3-201ENSMUST00000014990 1127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
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Snx25Q3ZT31 Eif1b-201ENSMUST00000007139 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Snx25Q3ZT31 Nkx2-9-201ENSMUST00000072631 1264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Snx25Q3ZT31 Irf3-213ENSMUST00000209066 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
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Snx25Q3ZT31 Stam2-202ENSMUST00000127316 1928 ntTSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
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Snx25Q3ZT31 Gm15138-201ENSMUST00000151778 379 ntTSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
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Snx25Q3ZT31 Evx2-201ENSMUST00000001867 4191 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Snx25Q3ZT31 Ndufv3-201ENSMUST00000046288 1537 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Snx25Q3ZT31 Gm20460-201ENSMUST00000168709 1572 ntTSL 5 BASIC18.37■□□□□ 0.53
Snx25Q3ZT31 Dtnbp1-203ENSMUST00000220555 1589 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.37■□□□□ 0.53
Snx25Q3ZT31 Plcl1-201ENSMUST00000042986 6580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Snx25Q3ZT31 Zfp142-201ENSMUST00000027315 6480 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Snx25Q3ZT31 Ocel1-202ENSMUST00000110051 2179 ntTSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Snx25Q3ZT31 Synpo-205ENSMUST00000130044 4970 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.37■□□□□ 0.53
Snx25Q3ZT31 Epn1-202ENSMUST00000098845 2565 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Snx25Q3ZT31 Spsb4-201ENSMUST00000055433 2720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Snx25Q3ZT31 Mcu-202ENSMUST00000020312 2872 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.36■□□□□ 0.53
Snx25Q3ZT31 Itgb5-201ENSMUST00000069345 3056 ntTSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Snx25Q3ZT31 Rfx7-202ENSMUST00000163401 7880 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.36■□□□□ 0.53
Snx25Q3ZT31 Krtap1-5-201ENSMUST00000054532 1041 ntAPPRIS P1 BASIC18.36■□□□□ 0.53
Snx25Q3ZT31 Glmn-201ENSMUST00000078021 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Snx25Q3ZT31 Mn1-201ENSMUST00000094463 6860 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.36■□□□□ 0.53
Snx25Q3ZT31 Ldlrad1-201ENSMUST00000094916 1093 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.36■□□□□ 0.53
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Snx25Q3ZT31 Ccdc149-201ENSMUST00000059428 3295 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.36■□□□□ 0.53
Snx25Q3ZT31 Camkk2-211ENSMUST00000200109 2751 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 33 ms