Protein–RNA interactions for Protein: Q3V1V3

Esf1, ESF1 homolog, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 845 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Esf1Q3V1V3 Fhdc1-205ENSMUST00000194027 1648 ntTSL 5 BASIC28.79■■■□□ 2.2
Esf1Q3V1V3 Zfp3-201ENSMUST00000060444 2061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.79■■■□□ 2.2
Esf1Q3V1V3 Klhl2-201ENSMUST00000034017 3412 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.79■■■□□ 2.2
Esf1Q3V1V3 Hdgfl3-201ENSMUST00000026094 2865 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.79■■■□□ 2.2
Esf1Q3V1V3 Dnaaf5-203ENSMUST00000196441 2426 ntTSL 1 (best) BASIC28.79■■■□□ 2.2
Esf1Q3V1V3 Gm8909-201ENSMUST00000040467 1357 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.78■■■□□ 2.2
Esf1Q3V1V3 Ppan-201ENSMUST00000004203 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.78■■■□□ 2.2
Esf1Q3V1V3 Tmem254c-202ENSMUST00000100819 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.78■■■□□ 2.2
Esf1Q3V1V3 Trmt112-ps2-201ENSMUST00000117987 378 ntBASIC28.78■■■□□ 2.2
Esf1Q3V1V3 AV026068-207ENSMUST00000187718 400 ntTSL 5 BASIC28.78■■■□□ 2.2
Esf1Q3V1V3 Vti1a-206ENSMUST00000225529 1244 ntBASIC28.78■■■□□ 2.2
Esf1Q3V1V3 Dupd1-201ENSMUST00000073870 1138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.78■■■□□ 2.2
Esf1Q3V1V3 Tnpo2-207ENSMUST00000211601 2941 ntTSL 1 (best) BASIC28.78■■■□□ 2.2
Esf1Q3V1V3 Abhd13-202ENSMUST00000139793 5191 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.78■■■□□ 2.2
Esf1Q3V1V3 Mtif3-201ENSMUST00000016654 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.78■■■□□ 2.2
Esf1Q3V1V3 Mfsd14a-201ENSMUST00000029570 2782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.78■■■□□ 2.2
Esf1Q3V1V3 Gm16712-201ENSMUST00000181962 1960 ntTSL 2 BASIC28.77■■■□□ 2.2
Esf1Q3V1V3 Arfip2-202ENSMUST00000084782 2254 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC28.77■■■□□ 2.2
Esf1Q3V1V3 Gm11611-201ENSMUST00000134289 1326 ntTSL 3 BASIC28.77■■■□□ 2.2
Esf1Q3V1V3 Cxadr-201ENSMUST00000023572 5734 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.77■■■□□ 2.2
Esf1Q3V1V3 Vhl-201ENSMUST00000035673 2792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.77■■■□□ 2.2
Esf1Q3V1V3 Dusp13-208ENSMUST00000183698 1019 ntTSL 5 BASIC28.77■■■□□ 2.2
Esf1Q3V1V3 Rgp1-201ENSMUST00000030190 1292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.77■■■□□ 2.2
Esf1Q3V1V3 Mycl-202ENSMUST00000106252 3293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.77■■■□□ 2.2
Esf1Q3V1V3 Iqck-201ENSMUST00000098087 1503 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.76■■■□□ 2.19
Esf1Q3V1V3 Gm1401-201ENSMUST00000122048 772 ntBASIC28.76■■■□□ 2.19
Esf1Q3V1V3 4930477E14Rik-201ENSMUST00000181412 621 ntTSL 1 (best) BASIC28.76■■■□□ 2.19
Esf1Q3V1V3 Wnk2-205ENSMUST00000110097 6882 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.76■■■□□ 2.19
Esf1Q3V1V3 Wnk2-203ENSMUST00000091623 6897 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC28.76■■■□□ 2.19
Esf1Q3V1V3 Pdss2-201ENSMUST00000095725 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.76■■■□□ 2.19
Esf1Q3V1V3 Bfsp2-201ENSMUST00000124310 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.76■■■□□ 2.19
Esf1Q3V1V3 Arrdc1-201ENSMUST00000028349 1666 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.76■■■□□ 2.19
Esf1Q3V1V3 Xkr6-201ENSMUST00000119973 2963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.76■■■□□ 2.19
Esf1Q3V1V3 Ncam2-202ENSMUST00000067602 3563 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.76■■■□□ 2.19
Esf1Q3V1V3 Dnajb9-201ENSMUST00000015049 2461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.76■■■□□ 2.19
Esf1Q3V1V3 Gm12359-201ENSMUST00000139017 1399 ntTSL 1 (best) BASIC28.75■■■□□ 2.19
Esf1Q3V1V3 Trim14-202ENSMUST00000102924 1582 ntTSL 2 BASIC28.75■■■□□ 2.19
Esf1Q3V1V3 Efemp2-204ENSMUST00000165485 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.75■■■□□ 2.19
Esf1Q3V1V3 Zfp24-203ENSMUST00000153337 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.75■■■□□ 2.19
Esf1Q3V1V3 Sdcbp-201ENSMUST00000029912 2745 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.75■■■□□ 2.19
Esf1Q3V1V3 Mfap2-203ENSMUST00000166376 890 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.75■■■□□ 2.19
Esf1Q3V1V3 Gm19345-201ENSMUST00000172815 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.75■■■□□ 2.19
Esf1Q3V1V3 Mir5131-201ENSMUST00000175426 93 ntBASIC28.75■■■□□ 2.19
Esf1Q3V1V3 Gm42802-201ENSMUST00000202475 456 ntTSL 2 BASIC28.75■■■□□ 2.19
Esf1Q3V1V3 Fcnb-201ENSMUST00000028179 1170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.75■■■□□ 2.19
Esf1Q3V1V3 Lrrc43-201ENSMUST00000094327 2046 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.75■■■□□ 2.19
Esf1Q3V1V3 Galnt1-206ENSMUST00000170243 4108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.75■■■□□ 2.19
Esf1Q3V1V3 Atf6b-201ENSMUST00000015605 2566 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.75■■■□□ 2.19
Esf1Q3V1V3 Elavl1-201ENSMUST00000098950 5743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.74■■■□□ 2.19
Esf1Q3V1V3 Rimklb-201ENSMUST00000068242 4725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.74■■■□□ 2.19
Esf1Q3V1V3 Fzd2-201ENSMUST00000057893 3663 ntAPPRIS P1 BASIC28.74■■■□□ 2.19
Esf1Q3V1V3 Dnajc24-201ENSMUST00000102555 1197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.74■■■□□ 2.19
Esf1Q3V1V3 Smarca5-ps-202ENSMUST00000171805 1284 ntBASIC28.74■■■□□ 2.19
Esf1Q3V1V3 Smim22-208ENSMUST00000185147 399 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.74■■■□□ 2.19
Esf1Q3V1V3 Igsf23-201ENSMUST00000043440 1908 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.74■■■□□ 2.19
Esf1Q3V1V3 Eif4a2-201ENSMUST00000023599 2208 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.74■■■□□ 2.19
Esf1Q3V1V3 Casp8-204ENSMUST00000191201 1849 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.73■■■□□ 2.19
Esf1Q3V1V3 Mfsd6-205ENSMUST00000156876 4932 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC28.73■■■□□ 2.19
Esf1Q3V1V3 Cyb561d2-201ENSMUST00000041459 1786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.73■■■□□ 2.19
Esf1Q3V1V3 Gm43073-201ENSMUST00000198200 1189 ntBASIC28.73■■■□□ 2.19
Esf1Q3V1V3 Gm44202-201ENSMUST00000203549 532 ntTSL 3 BASIC28.73■■■□□ 2.19
Esf1Q3V1V3 Creb3l1-201ENSMUST00000028663 2603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.73■■■□□ 2.19
Esf1Q3V1V3 Mrpl34-201ENSMUST00000048914 607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.73■■■□□ 2.19
Esf1Q3V1V3 Ube2f-201ENSMUST00000059743 1154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.73■■■□□ 2.19
Esf1Q3V1V3 Vrk2-201ENSMUST00000078362 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.73■■■□□ 2.19
Esf1Q3V1V3 Dcun1d1-201ENSMUST00000108182 4980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.73■■■□□ 2.19
Esf1Q3V1V3 Abcd4-210ENSMUST00000223107 2410 ntTSL 1 (best) BASIC28.73■■■□□ 2.19
Esf1Q3V1V3 Nus1-201ENSMUST00000023830 4605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.73■■■□□ 2.19
Esf1Q3V1V3 Cdh4-201ENSMUST00000000314 6388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.73■■■□□ 2.19
Esf1Q3V1V3 Secisbp2-202ENSMUST00000110044 1915 ntTSL 2 BASIC28.73■■■□□ 2.19
Esf1Q3V1V3 Laptm4b-201ENSMUST00000022867 1902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.73■■■□□ 2.19
Esf1Q3V1V3 Lmo1-203ENSMUST00000208136 772 ntTSL 2 BASIC28.72■■■□□ 2.19
Esf1Q3V1V3 Psmg3-201ENSMUST00000031531 883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.72■■■□□ 2.19
Esf1Q3V1V3 Hpca-203ENSMUST00000116442 1568 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC28.71■■■□□ 2.19
Esf1Q3V1V3 Pacsin1-202ENSMUST00000097360 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.71■■■□□ 2.19
Esf1Q3V1V3 Adam22-205ENSMUST00000115385 2318 ntTSL 2 BASIC28.71■■■□□ 2.19
Esf1Q3V1V3 Gapvd1-201ENSMUST00000028224 5695 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.71■■■□□ 2.19
Esf1Q3V1V3 Ino80e-201ENSMUST00000050833 1944 ntTSL 1 (best) BASIC28.71■■■□□ 2.19
Esf1Q3V1V3 Zfp746-203ENSMUST00000203609 3648 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.71■■■□□ 2.19
Esf1Q3V1V3 Chchd7-205ENSMUST00000120732 711 ntTSL 1 (best) BASIC28.71■■■□□ 2.19
Esf1Q3V1V3 4930442P19Rik-201ENSMUST00000193163 1240 ntBASIC28.71■■■□□ 2.19
Esf1Q3V1V3 Gm44357-201ENSMUST00000195897 142 ntBASIC28.71■■■□□ 2.19
Esf1Q3V1V3 Gm19658-201ENSMUST00000196231 138 ntBASIC28.71■■■□□ 2.19
Esf1Q3V1V3 Gm44367-201ENSMUST00000196836 138 ntBASIC28.71■■■□□ 2.19
Esf1Q3V1V3 Gm44350-201ENSMUST00000197197 138 ntBASIC28.71■■■□□ 2.19
Esf1Q3V1V3 Gm44390-201ENSMUST00000197533 144 ntBASIC28.71■■■□□ 2.19
Esf1Q3V1V3 Gm44313-201ENSMUST00000198018 138 ntBASIC28.71■■■□□ 2.19
Esf1Q3V1V3 Gm44486-201ENSMUST00000198508 138 ntBASIC28.71■■■□□ 2.19
Esf1Q3V1V3 Gm44454-201ENSMUST00000198541 138 ntBASIC28.71■■■□□ 2.19
Esf1Q3V1V3 Gm44314-201ENSMUST00000199263 138 ntBASIC28.71■■■□□ 2.19
Esf1Q3V1V3 Gm44394-201ENSMUST00000199558 138 ntBASIC28.71■■■□□ 2.19
Esf1Q3V1V3 Gm44484-201ENSMUST00000199873 138 ntBASIC28.71■■■□□ 2.19
Esf1Q3V1V3 Gm44466-201ENSMUST00000200264 138 ntBASIC28.71■■■□□ 2.19
Esf1Q3V1V3 Gm44359-201ENSMUST00000200671 138 ntBASIC28.71■■■□□ 2.19
Esf1Q3V1V3 Gm45890-204ENSMUST00000212356 545 ntTSL 2 BASIC28.71■■■□□ 2.19
Esf1Q3V1V3 Pts-206ENSMUST00000214873 511 ntTSL 5 BASIC28.71■■■□□ 2.19
Esf1Q3V1V3 Notch4-201ENSMUST00000015612 6591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.71■■■□□ 2.19
Esf1Q3V1V3 Nr1h3-202ENSMUST00000111354 1738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.71■■■□□ 2.19
Esf1Q3V1V3 Gss-203ENSMUST00000130881 1724 ntTSL 1 (best) BASIC28.71■■■□□ 2.19
Esf1Q3V1V3 Tbc1d25-204ENSMUST00000172020 2441 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.71■■■□□ 2.19
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 22.2 ms