Protein–RNA interactions for Protein: Q3V0K5

4930567H17Rik, RIKEN cDNA 4930567H17 gene, mousemouse

Predictions only

Length 233 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
4930567H17RikQ3V0K5 Wdr86-201ENSMUST00000068693 2364 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.46■■□□□ 1.03
4930567H17RikQ3V0K5 Cask-201ENSMUST00000033321 4057 ntTSL 5 BASIC21.46■■□□□ 1.03
4930567H17RikQ3V0K5 Ccdc105-201ENSMUST00000105383 1714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
4930567H17RikQ3V0K5 F2rl3-201ENSMUST00000058099 1751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
4930567H17RikQ3V0K5 Cobl-203ENSMUST00000109651 5541 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.03
4930567H17RikQ3V0K5 Slc22a12-201ENSMUST00000113451 2213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.03
4930567H17RikQ3V0K5 Krt81-201ENSMUST00000061185 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
4930567H17RikQ3V0K5 Lrrn2-201ENSMUST00000027706 3428 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
4930567H17RikQ3V0K5 Lrp12-202ENSMUST00000110305 4244 ntTSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
4930567H17RikQ3V0K5 Gm15743-202ENSMUST00000182690 1901 ntBASIC21.45■■□□□ 1.02
4930567H17RikQ3V0K5 Cdh24-201ENSMUST00000067784 3489 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.45■■□□□ 1.02
4930567H17RikQ3V0K5 Itgav-201ENSMUST00000028499 7054 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
4930567H17RikQ3V0K5 Aurkb-201ENSMUST00000021277 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
4930567H17RikQ3V0K5 Pcsk6-201ENSMUST00000055576 4405 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.45■■□□□ 1.02
4930567H17RikQ3V0K5 Gm16835-201ENSMUST00000140488 2809 ntTSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
4930567H17RikQ3V0K5 Kirrel-202ENSMUST00000107618 7278 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.45■■□□□ 1.02
4930567H17RikQ3V0K5 Snx15-201ENSMUST00000025702 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
4930567H17RikQ3V0K5 Sept4-205ENSMUST00000107962 1678 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.45■■□□□ 1.02
4930567H17RikQ3V0K5 Hist1h4a-201ENSMUST00000102964 539 ntAPPRIS P1 BASIC21.45■■□□□ 1.02
4930567H17RikQ3V0K5 Dok4-201ENSMUST00000046461 2590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
4930567H17RikQ3V0K5 Bicdl1-201ENSMUST00000055408 3026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
4930567H17RikQ3V0K5 Mycl-201ENSMUST00000030407 3501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
4930567H17RikQ3V0K5 Fam57b-201ENSMUST00000079423 2328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
4930567H17RikQ3V0K5 Gm26526-201ENSMUST00000181075 2927 ntTSL 5 BASIC21.45■■□□□ 1.02
4930567H17RikQ3V0K5 9130019P16Rik-202ENSMUST00000145111 4486 ntTSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
4930567H17RikQ3V0K5 Tmem8b-203ENSMUST00000107866 4998 ntTSL 5 BASIC21.45■■□□□ 1.02
4930567H17RikQ3V0K5 Enah-202ENSMUST00000111024 3572 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.45■■□□□ 1.02
4930567H17RikQ3V0K5 Mbtps2-201ENSMUST00000058098 4797 ntTSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
4930567H17RikQ3V0K5 Eefsec-201ENSMUST00000165242 2679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
4930567H17RikQ3V0K5 Capzb-202ENSMUST00000042675 1604 ntTSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
4930567H17RikQ3V0K5 Psip1-201ENSMUST00000030207 3251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
4930567H17RikQ3V0K5 Arhgef10-201ENSMUST00000084207 5528 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
4930567H17RikQ3V0K5 Lrig3-201ENSMUST00000074807 4016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
4930567H17RikQ3V0K5 Glra1-202ENSMUST00000102716 2390 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
4930567H17RikQ3V0K5 Gpr137b-201ENSMUST00000021738 2971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
4930567H17RikQ3V0K5 Gm10649-203ENSMUST00000148066 1812 ntTSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
4930567H17RikQ3V0K5 Zfp467-201ENSMUST00000101443 599 ntTSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
4930567H17RikQ3V0K5 Hspe1-201ENSMUST00000075242 774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
4930567H17RikQ3V0K5 B230219D22Rik-201ENSMUST00000057844 4652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
4930567H17RikQ3V0K5 Ptpn5-201ENSMUST00000033142 3145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
4930567H17RikQ3V0K5 Dennd1a-201ENSMUST00000102787 4342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
4930567H17RikQ3V0K5 Mfsd4b1-201ENSMUST00000163705 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
4930567H17RikQ3V0K5 Slc27a1-207ENSMUST00000212889 2730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
4930567H17RikQ3V0K5 Msmo1-201ENSMUST00000034015 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
4930567H17RikQ3V0K5 Zbtb45-201ENSMUST00000051390 2171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
4930567H17RikQ3V0K5 Snx18-201ENSMUST00000109241 4447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
4930567H17RikQ3V0K5 Ccdc50-203ENSMUST00000100026 7089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
4930567H17RikQ3V0K5 Kctd9-205ENSMUST00000152243 2528 ntTSL 2 BASIC21.43■■□□□ 1.02
4930567H17RikQ3V0K5 Gm11627-202ENSMUST00000107081 818 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.43■■□□□ 1.02
4930567H17RikQ3V0K5 Slc7a6os-201ENSMUST00000035925 1246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
4930567H17RikQ3V0K5 Hist2h2aa2-201ENSMUST00000074976 528 ntAPPRIS P1 BASIC21.43■■□□□ 1.02
4930567H17RikQ3V0K5 Hist2h2aa1-201ENSMUST00000078756 586 ntAPPRIS P1 BASIC21.43■■□□□ 1.02
4930567H17RikQ3V0K5 Zfp783-201ENSMUST00000095946 670 ntBASIC21.43■■□□□ 1.02
4930567H17RikQ3V0K5 Rab37-202ENSMUST00000067754 2577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
4930567H17RikQ3V0K5 Espn-211ENSMUST00000105657 1375 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
4930567H17RikQ3V0K5 Reps2-202ENSMUST00000112334 7675 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
4930567H17RikQ3V0K5 Pex5-202ENSMUST00000080557 3073 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
4930567H17RikQ3V0K5 Hps5-202ENSMUST00000107653 4702 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
4930567H17RikQ3V0K5 Ttc32-202ENSMUST00000219470 1645 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
4930567H17RikQ3V0K5 Golim4-201ENSMUST00000038563 5546 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
4930567H17RikQ3V0K5 Glmn-201ENSMUST00000078021 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
4930567H17RikQ3V0K5 Tacc1-202ENSMUST00000084512 6471 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
4930567H17RikQ3V0K5 Ccdc184-201ENSMUST00000031914 2329 ntAPPRIS P1 BASIC21.43■■□□□ 1.02
4930567H17RikQ3V0K5 Actr3-201ENSMUST00000027579 2554 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
4930567H17RikQ3V0K5 Susd1-202ENSMUST00000107544 3220 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.42■■□□□ 1.02
4930567H17RikQ3V0K5 Dgkz-202ENSMUST00000099709 3512 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.42■■□□□ 1.02
4930567H17RikQ3V0K5 H6pd-201ENSMUST00000030830 4745 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
4930567H17RikQ3V0K5 Sgsm1-204ENSMUST00000112325 2274 ntTSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
4930567H17RikQ3V0K5 Josd2-205ENSMUST00000120852 727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.42■■□□□ 1.02
4930567H17RikQ3V0K5 Kctd1-202ENSMUST00000168989 3456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
4930567H17RikQ3V0K5 Il6st-206ENSMUST00000183886 3004 ntTSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
4930567H17RikQ3V0K5 Mrpl9-202ENSMUST00000196143 1657 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
4930567H17RikQ3V0K5 C1qtnf12-201ENSMUST00000024338 1315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
4930567H17RikQ3V0K5 Pacsin3-201ENSMUST00000028694 1862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
4930567H17RikQ3V0K5 Rab35-201ENSMUST00000031492 2820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
4930567H17RikQ3V0K5 Pomp-201ENSMUST00000031654 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
4930567H17RikQ3V0K5 Zfp764-201ENSMUST00000059199 2508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
4930567H17RikQ3V0K5 Ttc32-201ENSMUST00000085741 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
4930567H17RikQ3V0K5 Nsun5-201ENSMUST00000000940 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
4930567H17RikQ3V0K5 Rsph3a-201ENSMUST00000097423 2189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
4930567H17RikQ3V0K5 F12-201ENSMUST00000021948 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
4930567H17RikQ3V0K5 AW011738-201ENSMUST00000105140 1848 ntAPPRIS P1 BASIC21.41■■□□□ 1.02
4930567H17RikQ3V0K5 Sapcd2-202ENSMUST00000100323 1761 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.41■■□□□ 1.02
4930567H17RikQ3V0K5 Hpn-209ENSMUST00000168884 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
4930567H17RikQ3V0K5 Arrb2-202ENSMUST00000084954 1732 ntTSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
4930567H17RikQ3V0K5 Nos1ap-207ENSMUST00000161966 1607 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
4930567H17RikQ3V0K5 Edem3-201ENSMUST00000059498 6327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
4930567H17RikQ3V0K5 Spred1-201ENSMUST00000028829 6016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
4930567H17RikQ3V0K5 F830208F22Rik-202ENSMUST00000143732 2891 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
4930567H17RikQ3V0K5 Snx3-202ENSMUST00000105499 1057 ntTSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
4930567H17RikQ3V0K5 Rpusd3-202ENSMUST00000113092 1269 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
4930567H17RikQ3V0K5 Gm13401-201ENSMUST00000117074 291 ntBASIC21.41■■□□□ 1.02
4930567H17RikQ3V0K5 Wnt10b-205ENSMUST00000226846 1204 ntBASIC21.41■■□□□ 1.02
4930567H17RikQ3V0K5 B230217C12Rik-201ENSMUST00000054783 1189 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
4930567H17RikQ3V0K5 Csnk1a1-206ENSMUST00000165721 2323 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
4930567H17RikQ3V0K5 Slc4a4-207ENSMUST00000148750 7931 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
4930567H17RikQ3V0K5 Gm1043-204ENSMUST00000207866 4296 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
4930567H17RikQ3V0K5 Ern1-204ENSMUST00000106801 1957 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
4930567H17RikQ3V0K5 Zscan25-201ENSMUST00000094116 1796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
4930567H17RikQ3V0K5 Syt6-202ENSMUST00000117221 4394 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 27.2 ms