Protein–RNA interactions for Protein: Q3V0G7

Garnl3, GTPase-activating Rap/Ran-GAP domain-like protein 3, mousemouse

Predictions only

Length 1,038 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Garnl3Q3V0G7 Akap8l-201ENSMUST00000050214 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Garnl3Q3V0G7 4833418N02Rik-202ENSMUST00000146560 1495 ntTSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Garnl3Q3V0G7 Tnfsf14-201ENSMUST00000005976 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Garnl3Q3V0G7 AC124581.1-201ENSMUST00000225416 1399 ntBASIC17.31■□□□□ 0.36
Garnl3Q3V0G7 Myo5a-214ENSMUST00000155282 6372 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC17.31■□□□□ 0.36
Garnl3Q3V0G7 Psmd4-202ENSMUST00000107237 1332 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Garnl3Q3V0G7 Igsf11-201ENSMUST00000023478 3443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Garnl3Q3V0G7 Plxdc1-202ENSMUST00000107564 619 ntTSL 2 BASIC17.31■□□□□ 0.36
Garnl3Q3V0G7 Gm12382-201ENSMUST00000122005 922 ntBASIC17.31■□□□□ 0.36
Garnl3Q3V0G7 Gm22240-201ENSMUST00000175225 82 ntBASIC17.31■□□□□ 0.36
Garnl3Q3V0G7 Creb1-207ENSMUST00000187811 1255 ntTSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Garnl3Q3V0G7 Map7-205ENSMUST00000214231 675 ntTSL 3 BASIC17.31■□□□□ 0.36
Garnl3Q3V0G7 Iqgap2-201ENSMUST00000068603 5771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Garnl3Q3V0G7 Plppr4-201ENSMUST00000061071 5696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Garnl3Q3V0G7 Zfp804a-201ENSMUST00000047527 4620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Garnl3Q3V0G7 Rhof-201ENSMUST00000031401 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Garnl3Q3V0G7 Ntn1-202ENSMUST00000108674 5874 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.31■□□□□ 0.36
Garnl3Q3V0G7 Mtcl1-201ENSMUST00000086693 7221 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Garnl3Q3V0G7 Mbp-201ENSMUST00000047865 2492 ntTSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Garnl3Q3V0G7 Serac1-201ENSMUST00000024570 2033 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Garnl3Q3V0G7 Ppan-201ENSMUST00000004203 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Garnl3Q3V0G7 Bcor-206ENSMUST00000124033 6785 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Garnl3Q3V0G7 Krt9-201ENSMUST00000059707 2580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Garnl3Q3V0G7 Nipsnap1-201ENSMUST00000038570 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Garnl3Q3V0G7 Aaed1-202ENSMUST00000220895 2858 ntTSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Garnl3Q3V0G7 Crct1-202ENSMUST00000107301 460 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.3■□□□□ 0.36
Garnl3Q3V0G7 Atp8a1-204ENSMUST00000113652 854 ntTSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Garnl3Q3V0G7 D330023K18Rik-201ENSMUST00000133550 920 ntTSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Garnl3Q3V0G7 Gm2990-201ENSMUST00000180662 1118 ntTSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Garnl3Q3V0G7 Gm34933-201ENSMUST00000203245 1067 ntTSL 5 BASIC17.3■□□□□ 0.36
Garnl3Q3V0G7 Aprt-204ENSMUST00000212093 723 ntTSL 2 BASIC17.3■□□□□ 0.36
Garnl3Q3V0G7 Rpl18a-206ENSMUST00000212709 700 ntTSL 2 BASIC17.3■□□□□ 0.36
Garnl3Q3V0G7 Gm45894-202ENSMUST00000212728 1097 ntTSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Garnl3Q3V0G7 A230083G16Rik-201ENSMUST00000069553 991 ntTSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Garnl3Q3V0G7 Eva1c-202ENSMUST00000099543 1554 ntTSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Garnl3Q3V0G7 Rbpms-201ENSMUST00000033994 2375 ntTSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Garnl3Q3V0G7 Clip2-202ENSMUST00000100647 4994 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Garnl3Q3V0G7 Kctd1-202ENSMUST00000168989 3456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Garnl3Q3V0G7 Dcaf5-201ENSMUST00000054145 5706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Garnl3Q3V0G7 Mmd-202ENSMUST00000107887 1654 ntTSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Garnl3Q3V0G7 Nsun5-201ENSMUST00000000940 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Garnl3Q3V0G7 Rhot1-201ENSMUST00000017831 3029 ntTSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Garnl3Q3V0G7 Fam72a-201ENSMUST00000068613 2191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Garnl3Q3V0G7 Susd1-202ENSMUST00000107544 3220 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.29■□□□□ 0.36
Garnl3Q3V0G7 Gpr180-201ENSMUST00000022728 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Garnl3Q3V0G7 Agbl5-208ENSMUST00000201168 3199 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.29■□□□□ 0.36
Garnl3Q3V0G7 Rbm33-204ENSMUST00000114884 6256 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.29■□□□□ 0.36
Garnl3Q3V0G7 Katnbl1-201ENSMUST00000028552 2886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Garnl3Q3V0G7 Tfap2a-209ENSMUST00000225180 1828 ntBASIC17.29■□□□□ 0.36
Garnl3Q3V0G7 C030014I23Rik-201ENSMUST00000080911 1810 ntBASIC17.29■□□□□ 0.36
Garnl3Q3V0G7 Aim2-204ENSMUST00000166137 2079 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.29■□□□□ 0.36
Garnl3Q3V0G7 Aste1-202ENSMUST00000123807 2349 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.29■□□□□ 0.36
Garnl3Q3V0G7 Naa10-205ENSMUST00000114390 797 ntTSL 5 BASIC17.29■□□□□ 0.36
Garnl3Q3V0G7 Ndufb2-202ENSMUST00000119379 455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Garnl3Q3V0G7 Gm28914-201ENSMUST00000188115 667 ntTSL 2 BASIC17.29■□□□□ 0.36
Garnl3Q3V0G7 Gm4974-201ENSMUST00000209974 875 ntBASIC17.29■□□□□ 0.36
Garnl3Q3V0G7 Fgf22-203ENSMUST00000219981 1070 ntTSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Garnl3Q3V0G7 Ly6g6d-201ENSMUST00000007259 546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Garnl3Q3V0G7 Syngr1-202ENSMUST00000009728 819 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Garnl3Q3V0G7 Eral1-201ENSMUST00000021183 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Garnl3Q3V0G7 Msmo1-201ENSMUST00000034015 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Garnl3Q3V0G7 Agfg1-206ENSMUST00000189220 8044 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Garnl3Q3V0G7 Cnksr1-201ENSMUST00000030645 2468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Garnl3Q3V0G7 Mdfi-202ENSMUST00000066368 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Garnl3Q3V0G7 Pick1-206ENSMUST00000166155 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Garnl3Q3V0G7 Synpo-206ENSMUST00000130360 5159 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Garnl3Q3V0G7 Sars2-201ENSMUST00000094632 1868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Garnl3Q3V0G7 Prkra-201ENSMUST00000002808 1614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Garnl3Q3V0G7 Sphk1-202ENSMUST00000063446 2527 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.28■□□□□ 0.36
Garnl3Q3V0G7 Wscd2-201ENSMUST00000094452 4302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Garnl3Q3V0G7 Sec61a1-201ENSMUST00000032168 3172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Garnl3Q3V0G7 Galnt17-202ENSMUST00000160609 2875 ntTSL 5 BASIC17.28■□□□□ 0.36
Garnl3Q3V0G7 Adrb3-202ENSMUST00000117565 1336 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Garnl3Q3V0G7 Neurl1b-201ENSMUST00000053020 6195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Garnl3Q3V0G7 Zfp467-208ENSMUST00000114564 626 ntTSL 2 BASIC17.28■□□□□ 0.36
Garnl3Q3V0G7 Anapc7-203ENSMUST00000122010 2950 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.28■□□□□ 0.36
Garnl3Q3V0G7 Sart1-201ENSMUST00000044207 5091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Garnl3Q3V0G7 Tm7sf2-202ENSMUST00000113543 1498 ntTSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Garnl3Q3V0G7 Pnpt1-201ENSMUST00000020756 2707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Garnl3Q3V0G7 Nfkbib-201ENSMUST00000032815 2061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Garnl3Q3V0G7 Car9-201ENSMUST00000030183 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Garnl3Q3V0G7 Hif3a-201ENSMUST00000037762 2206 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Garnl3Q3V0G7 Pde8b-208ENSMUST00000162292 4235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Garnl3Q3V0G7 Stam-202ENSMUST00000102960 5000 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Garnl3Q3V0G7 Nfatc3-201ENSMUST00000109308 5984 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Garnl3Q3V0G7 6330411D24Rik-201ENSMUST00000211105 1568 ntTSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Garnl3Q3V0G7 Iqsec2-203ENSMUST00000112605 6017 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.27■□□□□ 0.36
Garnl3Q3V0G7 Rev1-201ENSMUST00000027251 4262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
Garnl3Q3V0G7 Add1-204ENSMUST00000114338 4007 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
Garnl3Q3V0G7 Relt-201ENSMUST00000008462 2851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
Garnl3Q3V0G7 Asph-204ENSMUST00000084915 2884 ntTSL 5 BASIC17.27■□□□□ 0.36
Garnl3Q3V0G7 Lrp8-201ENSMUST00000030356 4555 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC17.27■□□□□ 0.36
Garnl3Q3V0G7 Wnt1-201ENSMUST00000023734 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
Garnl3Q3V0G7 Atp5g1-203ENSMUST00000107686 691 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.27■□□□□ 0.36
Garnl3Q3V0G7 Ccdc107-202ENSMUST00000107922 865 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.27■□□□□ 0.36
Garnl3Q3V0G7 Gm21863-201ENSMUST00000179133 336 ntAPPRIS P1 BASIC17.27■□□□□ 0.36
Garnl3Q3V0G7 Gm10517-202ENSMUST00000192970 758 ntBASIC17.27■□□□□ 0.36
Garnl3Q3V0G7 AC154649.1-201ENSMUST00000227392 384 ntBASIC17.27■□□□□ 0.36
Garnl3Q3V0G7 AC112142.1-201ENSMUST00000228796 918 ntBASIC17.27■□□□□ 0.36
Garnl3Q3V0G7 Ccdc107-201ENSMUST00000030181 817 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 35.3 ms