Protein–RNA interactions for Protein: Q3V0E1

Uncharacterized protein C9orf131 homolog, mousemouse

Predictions only

Length 1,183 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Q3V0E1 Slc22a12-201ENSMUST00000113451 2213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Q3V0E1 Ociad2-202ENSMUST00000200776 2359 ntTSL 3 BASIC17.17■□□□□ 0.34
Q3V0E1 Abhd10-201ENSMUST00000066983 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Q3V0E1 Fuz-201ENSMUST00000071207 1698 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Q3V0E1 Pdss2-201ENSMUST00000095725 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Q3V0E1 Anapc2-201ENSMUST00000028341 3004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Q3V0E1 Ppdpf-201ENSMUST00000016488 1160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Q3V0E1 Gm6728-201ENSMUST00000178117 1065 ntBASIC17.17■□□□□ 0.34
Q3V0E1 Gm21362-201ENSMUST00000194272 928 ntBASIC17.17■□□□□ 0.34
Q3V0E1 Spata33-206ENSMUST00000212637 569 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
Q3V0E1 Tdh-201ENSMUST00000022522 1881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Q3V0E1 Bcor-206ENSMUST00000124033 6785 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Q3V0E1 Nsmf-202ENSMUST00000074422 2824 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Q3V0E1 Rbpms-213ENSMUST00000191473 2547 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Q3V0E1 Ebf3-201ENSMUST00000033378 4838 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Q3V0E1 Pdap1-201ENSMUST00000031627 2353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Q3V0E1 Scaf11-201ENSMUST00000047835 5766 ntTSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
Q3V0E1 Zbtb24-202ENSMUST00000213797 2734 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Q3V0E1 4933402J07Rik-201ENSMUST00000093342 1304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Q3V0E1 Rasip1-201ENSMUST00000057927 3202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Q3V0E1 Slc2a8-201ENSMUST00000028129 2108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Q3V0E1 Sh2b2-203ENSMUST00000196397 2797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Q3V0E1 Ndufv3-201ENSMUST00000046288 1537 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Q3V0E1 Tcf7l2-203ENSMUST00000111646 2839 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Q3V0E1 Epha10-201ENSMUST00000059343 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Q3V0E1 Galnt17-202ENSMUST00000160609 2875 ntTSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
Q3V0E1 Mark3-202ENSMUST00000084953 3365 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Q3V0E1 Abi1-215ENSMUST00000178908 2239 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
Q3V0E1 Notch4-201ENSMUST00000015612 6591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Q3V0E1 Aldh7a1-201ENSMUST00000066208 1914 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Q3V0E1 March3-202ENSMUST00000102912 1754 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Q3V0E1 Echdc2-203ENSMUST00000116307 893 ntTSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
Q3V0E1 Ramp2-202ENSMUST00000122006 899 ntTSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
Q3V0E1 Asnsd1-202ENSMUST00000123519 983 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Q3V0E1 Gtf3a-204ENSMUST00000146511 1298 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Q3V0E1 Hist1h2br-203ENSMUST00000180288 1256 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Q3V0E1 Sox6os-201ENSMUST00000032900 420 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Q3V0E1 Birc5-201ENSMUST00000081387 947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Q3V0E1 Hist1h2bq-202ENSMUST00000091749 1254 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Q3V0E1 A130014A01Rik-201ENSMUST00000183021 2323 ntBASIC17.16■□□□□ 0.34
Q3V0E1 Atf7-209ENSMUST00000184485 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Q3V0E1 CT010478.1-201ENSMUST00000220747 2787 ntBASIC17.16■□□□□ 0.34
Q3V0E1 Gbp5-201ENSMUST00000090127 3055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Q3V0E1 Col13a1-204ENSMUST00000105453 2935 ntTSL 2 BASIC17.15■□□□□ 0.34
Q3V0E1 3110002H16Rik-201ENSMUST00000025276 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Q3V0E1 Doc2g-201ENSMUST00000025806 1446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Q3V0E1 Gpd1l-201ENSMUST00000084853 1436 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Q3V0E1 Pard3-219ENSMUST00000162309 5659 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Q3V0E1 Car9-201ENSMUST00000030183 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Q3V0E1 Npb-202ENSMUST00000106194 530 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.15■□□□□ 0.34
Q3V0E1 Npb-203ENSMUST00000106195 542 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Q3V0E1 Gm6345-202ENSMUST00000180900 204 ntBASIC17.15■□□□□ 0.34
Q3V0E1 Gm7367-201ENSMUST00000057611 492 ntBASIC17.15■□□□□ 0.34
Q3V0E1 Arhgef16-201ENSMUST00000030898 2860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Q3V0E1 Cdipt-201ENSMUST00000032920 1974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Q3V0E1 Gpr6-201ENSMUST00000061796 1786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Q3V0E1 Fbxl18-201ENSMUST00000035985 2831 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Q3V0E1 Matn4-202ENSMUST00000103104 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Q3V0E1 Scube2-202ENSMUST00000106728 2890 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.34
Q3V0E1 Tfap2a-209ENSMUST00000225180 1828 ntBASIC17.14■□□□□ 0.34
Q3V0E1 5031425F14Rik-201ENSMUST00000127920 2098 ntTSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Q3V0E1 Ube2d1-201ENSMUST00000020085 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Q3V0E1 Snap91-201ENSMUST00000036347 4237 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
Q3V0E1 Isg20l2-201ENSMUST00000055984 2893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Q3V0E1 St7l-202ENSMUST00000106769 2428 ntTSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Q3V0E1 Sybu-202ENSMUST00000110267 3127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Q3V0E1 Spint2-202ENSMUST00000108236 1211 ntTSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Q3V0E1 Gm15545-203ENSMUST00000150613 1059 ntTSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Q3V0E1 Gm15138-201ENSMUST00000151778 379 ntTSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Q3V0E1 Pfdn6-201ENSMUST00000025163 807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Q3V0E1 Iscu-201ENSMUST00000026937 957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Q3V0E1 Mtnr1b-201ENSMUST00000057920 1095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Q3V0E1 Rplp2-201ENSMUST00000084434 964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Q3V0E1 Apbb1-209ENSMUST00000188368 1970 ntTSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
Q3V0E1 Ttc9-202ENSMUST00000218362 4754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Q3V0E1 Igsf8-201ENSMUST00000039506 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Q3V0E1 Epc2-201ENSMUST00000092123 4697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Q3V0E1 Ngrn-201ENSMUST00000117989 1317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Q3V0E1 Gm9867-201ENSMUST00000192212 2647 ntBASIC17.14■□□□□ 0.33
Q3V0E1 Tnfrsf25-202ENSMUST00000035275 1603 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Q3V0E1 Med18-201ENSMUST00000102567 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Q3V0E1 B4galnt4-201ENSMUST00000048002 3556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Q3V0E1 Nfib-204ENSMUST00000107246 3075 ntTSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Q3V0E1 Gm7609-201ENSMUST00000113402 1538 ntTSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Q3V0E1 Larp1-201ENSMUST00000071487 6614 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
Q3V0E1 Nxt1-202ENSMUST00000109961 1116 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.13■□□□□ 0.33
Q3V0E1 AA414768-201ENSMUST00000121924 1257 ntBASIC17.13■□□□□ 0.33
Q3V0E1 Fbxo9-203ENSMUST00000159099 1201 ntTSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Q3V0E1 Coq7-201ENSMUST00000032887 914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Q3V0E1 Nxt1-201ENSMUST00000047177 956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Q3V0E1 Cdkn2c-201ENSMUST00000063531 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Q3V0E1 Olfr1232-201ENSMUST00000099785 936 ntAPPRIS P1 BASIC17.13■□□□□ 0.33
Q3V0E1 Krt27-201ENSMUST00000017732 1550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Q3V0E1 Fgfr1-215ENSMUST00000179592 5041 ntTSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
Q3V0E1 Phtf1-203ENSMUST00000090685 3006 ntTSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Q3V0E1 Lhx3-202ENSMUST00000054099 2184 ntTSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Q3V0E1 Rasd1-201ENSMUST00000062405 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Q3V0E1 Gm15743-202ENSMUST00000182690 1901 ntBASIC17.13■□□□□ 0.33
Q3V0E1 Nagpa-203ENSMUST00000147567 2230 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Q3V0E1 Scly-201ENSMUST00000027532 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 29.8 ms