Protein–RNA interactions for Protein: Q3V089

Rbm44, RNA-binding protein 44, mousemouse

Predictions only

Length 1,013 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rbm44Q3V089 Nipsnap1-201ENSMUST00000038570 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Rbm44Q3V089 Fam126a-201ENSMUST00000030849 5659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Rbm44Q3V089 Mrpl57-201ENSMUST00000022538 2877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Rbm44Q3V089 Ppfibp1-201ENSMUST00000016631 4851 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Rbm44Q3V089 Taz-208ENSMUST00000132437 768 ntTSL 3 BASIC16.55■□□□□ 0.24
Rbm44Q3V089 Fam98c-203ENSMUST00000134176 1189 ntTSL 2 BASIC16.55■□□□□ 0.24
Rbm44Q3V089 Gm16764-202ENSMUST00000148931 433 ntTSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
Rbm44Q3V089 2610035F20Rik-202ENSMUST00000177306 1149 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Rbm44Q3V089 1110004E09Rik-201ENSMUST00000023694 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Rbm44Q3V089 Bex2-201ENSMUST00000049130 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Rbm44Q3V089 Mtag2-201ENSMUST00000058665 714 ntBASIC16.55■□□□□ 0.24
Rbm44Q3V089 Smn1-202ENSMUST00000091321 223 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Rbm44Q3V089 Nsun5-201ENSMUST00000000940 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Rbm44Q3V089 Abhd5-204ENSMUST00000156520 3157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Rbm44Q3V089 Bcs1l-202ENSMUST00000113732 1679 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
Rbm44Q3V089 Apaf1-202ENSMUST00000159110 6433 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Rbm44Q3V089 Hap1-201ENSMUST00000103124 2120 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Rbm44Q3V089 Cnppd1-208ENSMUST00000190679 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Rbm44Q3V089 Polr3e-203ENSMUST00000207481 2545 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Rbm44Q3V089 Tmem229a-201ENSMUST00000127247 5157 ntAPPRIS P1 BASIC16.55■□□□□ 0.24
Rbm44Q3V089 Adcy7-203ENSMUST00000169037 5198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Rbm44Q3V089 Mboat7-201ENSMUST00000038608 2878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Rbm44Q3V089 Fam57b-201ENSMUST00000079423 2328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Rbm44Q3V089 Gabra5-202ENSMUST00000206382 2607 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
Rbm44Q3V089 Metrn-202ENSMUST00000165838 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Rbm44Q3V089 Susd1-202ENSMUST00000107544 3220 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
Rbm44Q3V089 Matr3-214ENSMUST00000190029 2845 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
Rbm44Q3V089 Adamts19-201ENSMUST00000052907 4666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Rbm44Q3V089 Tead3-201ENSMUST00000114799 2448 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Rbm44Q3V089 Chn1-209ENSMUST00000166199 3876 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Rbm44Q3V089 Stambpl1-201ENSMUST00000054956 2024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Rbm44Q3V089 Slc8a3-202ENSMUST00000085238 4927 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Rbm44Q3V089 Gm16141-201ENSMUST00000152073 790 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Rbm44Q3V089 Cracr2b-207ENSMUST00000170879 1158 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
Rbm44Q3V089 Gm45894-201ENSMUST00000211940 651 ntTSL 2 BASIC16.54■□□□□ 0.24
Rbm44Q3V089 1700067K01Rik-201ENSMUST00000060357 1291 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Rbm44Q3V089 Gm10654-201ENSMUST00000098653 1633 ntBASIC16.54■□□□□ 0.24
Rbm44Q3V089 Sprn-201ENSMUST00000059241 3374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Rbm44Q3V089 Ppp1r36-201ENSMUST00000063977 1515 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
Rbm44Q3V089 Mxd4-201ENSMUST00000042701 3872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Rbm44Q3V089 Zbtb45-201ENSMUST00000051390 2171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Rbm44Q3V089 Hmces-201ENSMUST00000032141 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Rbm44Q3V089 Col18a1-202ENSMUST00000081654 5063 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Rbm44Q3V089 Mycs-201ENSMUST00000058404 2368 ntAPPRIS P1 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Rbm44Q3V089 Ddx39b-201ENSMUST00000068056 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Rbm44Q3V089 Slc5a10-203ENSMUST00000148584 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Rbm44Q3V089 Glis1-201ENSMUST00000046005 2906 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Rbm44Q3V089 Fgfr1-214ENSMUST00000178276 4741 ntTSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Rbm44Q3V089 Gna12-201ENSMUST00000000153 3416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Rbm44Q3V089 Pigs-201ENSMUST00000048073 2501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Rbm44Q3V089 Anapc7-201ENSMUST00000031422 2751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Rbm44Q3V089 Cnksr1-201ENSMUST00000030645 2468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Rbm44Q3V089 Atp2b2-201ENSMUST00000089003 7067 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Rbm44Q3V089 Slc35g2-201ENSMUST00000093792 1590 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Rbm44Q3V089 Speg-204ENSMUST00000113589 833 ntTSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Rbm44Q3V089 Scamp4-202ENSMUST00000180350 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Rbm44Q3V089 Tmem54-201ENSMUST00000030575 1064 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Rbm44Q3V089 Ick-201ENSMUST00000009972 873 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Rbm44Q3V089 Ebf1-203ENSMUST00000109268 2864 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
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Rbm44Q3V089 Gm19721-201ENSMUST00000195284 1764 ntBASIC16.53■□□□□ 0.24
Rbm44Q3V089 Nfkbid-201ENSMUST00000046177 2039 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Rbm44Q3V089 Rprm-201ENSMUST00000100089 1460 ntAPPRIS P1 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Rbm44Q3V089 Rnf128-201ENSMUST00000113026 2750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Rbm44Q3V089 Ruvbl1-201ENSMUST00000032165 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Rbm44Q3V089 Rap1gap-202ENSMUST00000097837 3168 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Rbm44Q3V089 Nrxn1-206ENSMUST00000160800 5683 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Rbm44Q3V089 Sema6c-214ENSMUST00000202315 2843 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Rbm44Q3V089 Prr5l-201ENSMUST00000043845 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Rbm44Q3V089 Ypel3-204ENSMUST00000106359 469 ntTSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.24
Rbm44Q3V089 Gm11643-201ENSMUST00000119578 864 ntBASIC16.52■□□□□ 0.24
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Rbm44Q3V089 Nnat-210ENSMUST00000173839 1135 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Rbm44Q3V089 Gm3331-201ENSMUST00000183423 1017 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Rbm44Q3V089 Klf13-202ENSMUST00000183817 599 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Rbm44Q3V089 Mtmr12-201ENSMUST00000038172 6840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
Rbm44Q3V089 Gm11620-201ENSMUST00000118770 1845 ntBASIC16.52■□□□□ 0.23
Rbm44Q3V089 Soga3-201ENSMUST00000092629 4105 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
Rbm44Q3V089 Susd1-201ENSMUST00000040166 3295 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Rbm44Q3V089 4430402I18Rik-205ENSMUST00000162110 1559 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
Rbm44Q3V089 Eif1a-202ENSMUST00000168382 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Rbm44Q3V089 Psen2-205ENSMUST00000111108 1997 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Rbm44Q3V089 March2-201ENSMUST00000066121 3400 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Rbm44Q3V089 Smad3-201ENSMUST00000034973 5090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Rbm44Q3V089 Epm2a-201ENSMUST00000069106 3287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Rbm44Q3V089 Ikbke-204ENSMUST00000161764 2867 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Rbm44Q3V089 Gm26821-201ENSMUST00000181954 2652 ntTSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
Rbm44Q3V089 1110004F10Rik-202ENSMUST00000106607 1153 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Rbm44Q3V089 Gtf2h2-201ENSMUST00000066940 1065 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Rbm44Q3V089 1700028I16Rik-201ENSMUST00000076984 1048 ntTSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
Rbm44Q3V089 Shh-201ENSMUST00000002708 2847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Rbm44Q3V089 Ankdd1a-201ENSMUST00000061766 1443 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
Rbm44Q3V089 Ptprj-204ENSMUST00000168621 7634 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Rbm44Q3V089 Neo1-201ENSMUST00000068664 7379 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Rbm44Q3V089 Sox4-201ENSMUST00000067230 4795 ntAPPRIS P1 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Rbm44Q3V089 Prpf40b-212ENSMUST00000145482 3308 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Rbm44Q3V089 Rgs9-201ENSMUST00000020920 2434 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Rbm44Q3V089 Disp3-201ENSMUST00000047720 5282 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Rbm44Q3V089 Lmtk2-201ENSMUST00000041804 8114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
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