Protein–RNA interactions for Protein: Q3V036

Ccdc27, Coiled-coil domain-containing protein 27, mousemouse

Predictions only

Length 639 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc27Q3V036 Adss-201ENSMUST00000016105 2771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Ccdc27Q3V036 Tbc1d9b-202ENSMUST00000101270 5213 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.61■■□□□ 1.05
Ccdc27Q3V036 Mycs-201ENSMUST00000058404 2368 ntAPPRIS P1 BASIC21.61■■□□□ 1.05
Ccdc27Q3V036 Xiap-203ENSMUST00000115094 6542 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.61■■□□□ 1.05
Ccdc27Q3V036 Dvl2-207ENSMUST00000190940 5037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Ccdc27Q3V036 Mmp11-201ENSMUST00000000924 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Ccdc27Q3V036 Mpig6b-201ENSMUST00000097337 2252 ntTSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Ccdc27Q3V036 Rhobtb1-202ENSMUST00000067908 4422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Ccdc27Q3V036 Larp1b-206ENSMUST00000191872 1505 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Ccdc27Q3V036 App-202ENSMUST00000226232 3120 ntAPPRIS ALT2 BASIC21.6■■□□□ 1.05
Ccdc27Q3V036 Ttc39a-201ENSMUST00000064129 2356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Ccdc27Q3V036 Zfp710-201ENSMUST00000049680 4721 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Ccdc27Q3V036 E2f2-201ENSMUST00000061721 4739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Ccdc27Q3V036 Fgfr2-215ENSMUST00000122054 3323 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Ccdc27Q3V036 1700007L15Rik-201ENSMUST00000180923 737 ntTSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Ccdc27Q3V036 Tmem54-201ENSMUST00000030575 1064 ntTSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Ccdc27Q3V036 4930505A04Rik-201ENSMUST00000041763 904 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.6■■□□□ 1.05
Ccdc27Q3V036 Dmgdh-201ENSMUST00000048001 2992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Ccdc27Q3V036 Bcat2-201ENSMUST00000033098 1772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Ccdc27Q3V036 Fcgrt-201ENSMUST00000003512 1770 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Ccdc27Q3V036 Slc13a3-202ENSMUST00000109279 3131 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Ccdc27Q3V036 Cux1-206ENSMUST00000176172 4882 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Ccdc27Q3V036 Prex1-201ENSMUST00000036719 6533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Ccdc27Q3V036 Specc1-210ENSMUST00000201723 2690 ntTSL 5 BASIC21.6■■□□□ 1.05
Ccdc27Q3V036 Gm10564-201ENSMUST00000097750 3113 ntTSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Ccdc27Q3V036 Hmga1-202ENSMUST00000117254 1328 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.59■■□□□ 1.05
Ccdc27Q3V036 Gm45560-201ENSMUST00000211492 1472 ntBASIC21.59■■□□□ 1.05
Ccdc27Q3V036 Car2-201ENSMUST00000029078 1788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Ccdc27Q3V036 Gm16401-202ENSMUST00000197463 2074 ntBASIC21.59■■□□□ 1.05
Ccdc27Q3V036 Carmil2-201ENSMUST00000062574 2526 ntTSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Ccdc27Q3V036 Gm13401-201ENSMUST00000117074 291 ntBASIC21.59■■□□□ 1.05
Ccdc27Q3V036 Gm13216-201ENSMUST00000117145 591 ntBASIC21.59■■□□□ 1.05
Ccdc27Q3V036 3110082J24Rik-201ENSMUST00000127749 327 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.59■■□□□ 1.05
Ccdc27Q3V036 Guca1b-202ENSMUST00000145462 1556 ntTSL 2 BASIC21.59■■□□□ 1.05
Ccdc27Q3V036 Gm3331-201ENSMUST00000183423 1017 ntTSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Ccdc27Q3V036 Gm43598-201ENSMUST00000202482 2479 ntBASIC21.59■■□□□ 1.05
Ccdc27Q3V036 Gm20049-201ENSMUST00000219950 730 ntBASIC21.59■■□□□ 1.05
Ccdc27Q3V036 Tmem125-201ENSMUST00000060214 1864 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.59■■□□□ 1.05
Ccdc27Q3V036 Dynlt1c-201ENSMUST00000092966 2589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Ccdc27Q3V036 Sept4-205ENSMUST00000107962 1678 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.59■■□□□ 1.05
Ccdc27Q3V036 Nt5dc3-201ENSMUST00000099396 5952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Ccdc27Q3V036 B3galnt2-204ENSMUST00000221300 2397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Ccdc27Q3V036 Higd1a-201ENSMUST00000060251 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Ccdc27Q3V036 Adam22-201ENSMUST00000046838 2773 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Ccdc27Q3V036 Sh3bp2-203ENSMUST00000118545 3034 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
Ccdc27Q3V036 H2afy2-201ENSMUST00000020283 2175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
Ccdc27Q3V036 Fbrsl1-201ENSMUST00000056124 2700 ntTSL 2 BASIC21.58■■□□□ 1.05
Ccdc27Q3V036 Hspa1b-201ENSMUST00000172753 2803 ntAPPRIS P1 BASIC21.58■■□□□ 1.05
Ccdc27Q3V036 Gm43272-201ENSMUST00000200599 1584 ntBASIC21.58■■□□□ 1.05
Ccdc27Q3V036 Tmem87b-201ENSMUST00000110325 4807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
Ccdc27Q3V036 Rapgef3-207ENSMUST00000134885 1422 ntTSL 5 BASIC21.58■■□□□ 1.05
Ccdc27Q3V036 Ptprn-201ENSMUST00000027404 3554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
Ccdc27Q3V036 Vps53-202ENSMUST00000094015 2645 ntTSL 5 BASIC21.58■■□□□ 1.05
Ccdc27Q3V036 Gm13158-201ENSMUST00000122007 736 ntBASIC21.58■■□□□ 1.05
Ccdc27Q3V036 Fam50b-201ENSMUST00000039605 1229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
Ccdc27Q3V036 Dhx30-224ENSMUST00000200066 4623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
Ccdc27Q3V036 Phf7-201ENSMUST00000022459 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
Ccdc27Q3V036 Abcd4-201ENSMUST00000021666 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
Ccdc27Q3V036 A530016L24Rik-202ENSMUST00000223266 1547 ntTSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
Ccdc27Q3V036 Ctnna2-204ENSMUST00000160894 4162 ntTSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
Ccdc27Q3V036 Gas2-201ENSMUST00000051912 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
Ccdc27Q3V036 Matr3-214ENSMUST00000190029 2845 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.58■■□□□ 1.04
Ccdc27Q3V036 Rab35-201ENSMUST00000031492 2820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
Ccdc27Q3V036 Ehmt2-204ENSMUST00000114033 3882 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
Ccdc27Q3V036 Lrg1-201ENSMUST00000041357 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
Ccdc27Q3V036 Mob2-201ENSMUST00000084418 1490 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
Ccdc27Q3V036 Hmces-202ENSMUST00000113606 1572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Ccdc27Q3V036 Artn-202ENSMUST00000097913 1568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Ccdc27Q3V036 Bend5-201ENSMUST00000030274 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Ccdc27Q3V036 Fam171a1-203ENSMUST00000091505 3449 ntTSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Ccdc27Q3V036 Foxp4-202ENSMUST00000113262 3198 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Ccdc27Q3V036 Fam135a-201ENSMUST00000027337 5536 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.57■■□□□ 1.04
Ccdc27Q3V036 Mink1-202ENSMUST00000072873 4610 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.57■■□□□ 1.04
Ccdc27Q3V036 Ddx19a-201ENSMUST00000040416 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Ccdc27Q3V036 Ppt1-201ENSMUST00000030412 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Ccdc27Q3V036 Hist1h4a-201ENSMUST00000102964 539 ntAPPRIS P1 BASIC21.57■■□□□ 1.04
Ccdc27Q3V036 Svbp-203ENSMUST00000106345 684 ntTSL 2 BASIC21.57■■□□□ 1.04
Ccdc27Q3V036 Hsbp1-202ENSMUST00000212468 638 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.57■■□□□ 1.04
Ccdc27Q3V036 Tmem42-202ENSMUST00000213514 631 ntTSL 3 BASIC21.57■■□□□ 1.04
Ccdc27Q3V036 Gm46218-201ENSMUST00000215448 801 ntTSL 5 BASIC21.57■■□□□ 1.04
Ccdc27Q3V036 Cachd1-202ENSMUST00000097955 4277 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Ccdc27Q3V036 Pde8b-202ENSMUST00000067082 2598 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.57■■□□□ 1.04
Ccdc27Q3V036 Tsc22d2-203ENSMUST00000199164 4659 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Ccdc27Q3V036 Cacna1a-202ENSMUST00000122053 7589 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Ccdc27Q3V036 Ttll11-202ENSMUST00000112976 3077 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.57■■□□□ 1.04
Ccdc27Q3V036 Slmap-212ENSMUST00000139075 4508 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Ccdc27Q3V036 Tpm2-202ENSMUST00000107913 2098 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Ccdc27Q3V036 5031425F14Rik-201ENSMUST00000127920 2098 ntTSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Ccdc27Q3V036 Nos1ap-207ENSMUST00000161966 1607 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Ccdc27Q3V036 Ptprf-201ENSMUST00000049074 7656 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.56■■□□□ 1.04
Ccdc27Q3V036 Arhgef17-204ENSMUST00000209041 4516 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Ccdc27Q3V036 Ddx51-201ENSMUST00000031478 4846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Ccdc27Q3V036 Gm16764-202ENSMUST00000148931 433 ntTSL 5 BASIC21.56■■□□□ 1.04
Ccdc27Q3V036 Fdxr-201ENSMUST00000021078 1948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Ccdc27Q3V036 Tcf3-206ENSMUST00000105342 2928 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Ccdc27Q3V036 Klf3-201ENSMUST00000165536 5221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Ccdc27Q3V036 Gm27275-201ENSMUST00000184318 272 ntBASIC21.55■■□□□ 1.04
Ccdc27Q3V036 Clybl-201ENSMUST00000026625 1231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Ccdc27Q3V036 Tmem126a-201ENSMUST00000032844 799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Ccdc27Q3V036 A930018P22Rik-201ENSMUST00000040374 822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 47.3 ms